基本信息
司光伟  男  博导  中国科学院生物物理研究所
电子邮件: si@ibp.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区大屯路15号2315房间
邮政编码: 100101

研究领域

系统神经科学、神经编码、嗅觉

招生信息

我们探索生物神经系统在网络层面上的定量规律,包括神经元群体编码、网络动态结构、及其发育过程。

实验研究对象为果蝇幼虫的嗅觉系统,其汇集了系统神经科学研究所需的多种优势:

  • 神经元数量较少;

  • 拥有几乎全脑的连接组学数据;

  • 通体透明,方便在体全脑成像和长期追踪;

  • 丰富的转基因品系和遗传操作工具。

我们在这个体系上具体研究:

  • 动物体内外的信息如何被神经元的群体活动编码;

  • 神经编码如何在网络中传播、整合和变换;

  • 编码的变换如何通过特定的神经网络结构来实现;

  • 网络的结构如何调整以适应环境及自身发育;

  • 以上过程又如何影响动物的行为。

我们综合运用行为学、钙成像、光遗传学和微流控等实验手段,并结合建模和模拟开展研究。

我们将提供学科交叉融合、鼓励创新且支持合作的学术环境。

欢迎有共同兴趣的青年才俊,不限专业背景联系、访问和加入我们!

招生专业
071006-神经生物学
招生方向
系统神经科学、神经编码、嗅觉

教育背景

2008-09--2013-07   北京大学前沿交叉学科研究院   凝聚态物理博士
2004-09--2008-07   吉林大学物理学院   理学学士

工作经历

   
工作简历
2020-08~现在, 中国科学院生物物理研究所, 研究员
2013-07~2020-07,哈佛大学物理系及脑科学中心, 博士后

教授课程

神经科学
Fundamental Biomedical Signal Processing

出版信息

   
发表论文
[1] Wu, YuBin, Zhang, RenChang, Li, DaGuang, Qi, KeXin, Chai, YuMing, Shen, Chen, Si, GuangWei, Wen, Quan. Whole Brain Imaging of Larval Zebrafish during Rheotaxis br. PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS[J]. 2022, 49(9): 1731-1740, [2] Eschbach, Claire, Fushiki, Akira, Winding, Michael, Afonso, Bruno, Andrade, Ingrid, V, Cocanougher, Benjamin T, Eichler, Katharina, Gepner, Ruben, Si, Guangwei, ValdesAleman, Javier, Fetter, Richard D, Gershow, Marc, Jefferis, Gregory S X E, Samuel, Aravinthan D T, Truman, James W, Cardona, Albert, Zlatic, Marta. Circuits for integrating learned and innate valences in the insect brain. ELIFE[J]. 2021, 10: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.62567.sa2.
[3] Si, Guangwei, Kanwal, Jessleen K, Hu, Yu, Tabone, Christopher J, Baron, Jacob, Berck, Matthew, Vignoud, Gaetan, Samuel, Aravinthan D T. Structured Odorant Response Patterns across a Complete Olfactory Receptor Neuron Population. NEURON[J]. 2019, 101(5): 950-+, http://dx.doi.org/10.1016/j.neuron.2018.12.030.
[4] Zhang, Xuanqi, Si, Guangwei, Dong, Yiming, Chen, Kaiyue, Ouyang, Qi, Luo, Chunxiong, Tu, Yuhai. Escape band in Escherichia coli chemotaxis in opposing attractant and nutrient gradients. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA[J]. 2019, 116(6): 2253-2258, [5] Li He, Guangwei Si, Jiuhong Huang, Aravinthan DT Samuel, Norbert Perrimon. Mechanical regulation of stem cell differentiation through stretch-activated Piezo channel. NATURE. 2018, 555(7694): 103-106, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6101000/.
[6] Li, Zhaojun, Cai, Qiuxian, Zhang, Xuanqi, Si, Guangwei, Ouyang, Qi, Luo, Chunxiong, Tu, Yuhai. Barrier Crossing in Escherichia coli Chemotaxis. PHYSICAL REVIEW LETTERS[J]. 2017, 118(9): 098101-098101, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000400782700002.
[7] Berck, Matthew E, Khandelwal, Avinash, Claus, Lindsey, HernandezNunez, Luis, Si, Guangwei, Tabone, Christopher J, Li, Feng, Truman, James W, Fetter, Rick D, Louis, Matthieu, Samuel, Aravinthan D T, Cardona, Albert. The wiring diagram of a glomerular olfactory system. ELIFE[J]. 2016, 5: https://doaj.org/article/596f2169fc2b49abbec0101dc4d59ab5.
[8] HernandezNunez, Luis, Belina, Jonas, Klein, Mason, Si, Guangwei, Claus, Lindsey, Carlson, John R, Samuel, Aravinthan D T. Reverse-correlation analysis of navigation dynamics in Drosophila larva using optogenetics. ELIFE[J]. 2015, 4: [9] Si, Guangwei, Tang, Min, Yang, Xu. A PATHWAY-BASED MEAN-FIELD MODEL FOR E. COLI CHEMOTAXIS: MATHEMATICAL DERIVATION AND ITS HYPERBOLIC AND PARABOLIC LIMITS. MULTISCALE MODELING & SIMULATION[J]. 2014, 12(2): 907-926, http://dx.doi.org/10.1137/130944199.
[10] Bi, Shuangyu, Yu, Daqi, Si, Guangwei, Luo, Chunxiong, Li, Tongqing, Ouyang, Qi, Jakovljevic, Vladimir, Sourjik, Victor, Tu, Yuhai, Lai, Luhua. Discovery of novel chemoeffectors and rational design of Escherichia coli chemoreceptor specificity. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA[J]. 2013, 110(42): 16814-16819, http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1306811110.
[11] Si, Guangwei, Wu, Tailin, Ouyang, Qi, Tu, Yuhai. Pathway-Based Mean-Field Model for Escherichia coli Chemotaxis. PHYSICAL REVIEW LETTERS[J]. 2012, 109(4): http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.109.048101.
[12] Si, Guangwei, Yang, Wei, Bi, Shuangyu, Luo, Chunxiong, Ouyang, Qi. A parallel diffusion-based microfluidic device for bacterial chemotaxis analysis. LAB ON A CHIP[J]. 2012, 12(7): 1389-1394, http://dx.doi.org/10.1039/c2lc21219f.
[13] Zhu, Xuejun, Si, Guangwei, Deng, Nianpei, Ouyang, Qi, Wu, Tailin, He, Zhuoran, Jiang, Lili, Luo, Chunxiong, Tu, Yuhai, Zhu, XJ reprint author, Peking Univ, Ctr Microfluid Nanotechnol, State Key Lab Artificial Microstruct Mesoscop P, Sch Phys, Beijing , Peoples R China. Frequency-Dependent Escherichia coli Chemotaxis Behavior. PHYSICAL REVIEW LETTERS[J]. 2012, 108(12): http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.108.128101.
[14] Si, Guangwei, Zhu, Xuejun, Kang, Yangsen, Luo, Chunxiong, Ouyang, Qi, Chen, Yong. Diffusion-based concentration control in microcavities during long time period by programmed syringe pumps. MICROELECTRONIC ENGINEERING[J]. 2010, 87(5-8): 793-797, http://dx.doi.org/10.1016/j.mee.2009.11.090.

指导学生

现指导学生

张露涵  博士研究生  071006-神经生物学  

李月白  硕士研究生  071006-神经生物学  

叶琛  博士研究生  071006-神经生物学  

陈叶无霜  硕士研究生  0771Z2-认知神经科学  

纪潇航  博士研究生  071006-神经生物学  

陈诗瀚  硕士研究生  071006-神经生物学  

杨瑞初  博士研究生  071006-神经生物学  

李维汉  博士研究生  071006-神经生物学