植物分子系统学和分子进化、物种形成和多倍体进化、植物群体遗传学和保护遗传学

博士后、博士生和硕士生

071001-植物学

植物系统和进化
分子系统学
保护遗传学

1993-09--1996-07 中科院植物所 博士
1983-09--1986-07 南京林业大学 硕士
1978-09--1982-07 南京林业大学 学士

-- 研究生

-- 博士

1986.9-1990.7：在西南林学院任教, 历任助教、讲师, 遗传育种教研室副主任；

1993.8-至今：中国科学院植物研究所助理研究员、副研究员、研究员；

1996.4-1996.10：在美国Washington University，访问学者；

1998.5-1999.5：美国Michigan State University，合作研究；

2003.2-2003.5：美国University of California at Irvine，合作研究。

1996-08~现在, 中科院植物所, 助研、副研、研究员
1986-09~1990-08,西南林学院, 讲师

2018-10-10-今,中国植物学会第一届监事会, 监事长
2013-10-20-2018-10-19,中国植物学会副理事长兼秘书长,
2013-09-30-2019-06-25,国际生物科学联合会(IUBS)中国委员会委员, 副主席
2003-10-01-2016-09-30,中国遗传学会理事,
2001-05-01-2015-04-30,中国科学院生物多样性委员会委员, 委员

系统与进化生物学
进化生物学的基本原理和方法
系统与进化植物学

中国科学院院长奖学金优秀奖，1993年。

国家杰出青年科学基金获得者，2000年。

中国科学院青年科学家奖，2001年。

国务院颁发“政府特殊津贴，2002年。

中国科学院“****”入选者，2005年。

上海市科学技术奖一等奖（排名第五），2009年。

美国植物学会（Botanical Society of America）通讯会员（Corresponding Member），2017年。

中国植物学会IBC 2017杰出贡献奖，2018年。

（1） 中国植物学会IBC 2017杰出贡献奖, 其他, 2018
（2） 上海市科学技术奖, 一等奖, 部委级, 2009
（3） 中国科学院青年科学家奖, 一等奖, 部委级, 2001

（ 1 ） 一种野生稻的杂交方法, 发明, 2019, 第 4 作者, 专利号: ZL 2017 1 0845523.X

   

（1） Population genetics and evolutionary history of Miscanthus species in China, Journal of Systematics and Evolution, 2019-11, 通讯作者
（2） Resequencing 545 ginkgo genomes across the world reveals evolutionary history of the living fossil, Nature Communications, 2019-09, 通讯作者
（3） Parallel speciation of wild rice associated with habitat shifts, Molecular Biology and Evolution, 2019, 通讯作者
（4） Transposable elements drive rapid adaptation in Capsella rubella, PNAS, 2019, 其他（合作组作者）
（5） A selfish genetic element confers non-Mendelian inheritance in rice, Science, 2018, 其他（合作组作者）
（6） Population genetics and evolutionary history of Oryza rufipogon and O. nivara in Sri Lanka, Ecology and Evolution, 2018, 通讯作者
（7） 什么决定了物种的多样性, 科学通报, 2017, 通讯作者
（8） Machine learning algorithms improve the power of phytolith analysis: A case study of the tribe Oryzeae (Poaceae), Journal of Systematics and Evolution, 2017, 通讯作者
（9） Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication, Nature Communications, 2017, 第 10 作者
（10） Widespread and adaptive alterations in genome-wide gene expression associated with ecological divergence of two Oryza species, Molecular Biology and Evolution, 2016, 通讯作者
（11） Draft genome of the living fossil Ginkgo biloba, GigaScience, 2016, 通讯作者
（12） The whole chloroplast genome of wild rice (Oryza australiensis), Mitochondrial DNA, 2016, 第 2 作者
（13） On the origin of de novo genes in Arabidopsis thaliana populations, Genome Biology and Evolution, 2016, 第 7 作者
（14） Population genetic structure of Oryza rufipogon and Oryza nivara: implications for the origin of O. nivara, Molecular Ecology, 2015, 通讯作者
（15） Multiple origins of BBCC allopolyploid species in the rice genus (Oryza), Scientific Report, 2015, 通讯作者
（16） Multilocus species tree analyses resolve the ancient radiation of the subtribe Zizaniinae (Poaceae), Molecular Phylogenetics and Evolution, 2015, 通讯作者
（17） Genetic diversity and classification of Oryza sativa with emphasis on Chinese rice germplasm, Heredity, 2014, 通讯作者
（18） The association of functional nucleotide polymorphisms at DTH2 with the northward expansion of rice cultivation in Asia, PNAS, 2013, 通讯作者
（19） Multilocus estimation of divergence times and ancestral population sizes of Oryza species and implications for the diversification of the genus,  New Phytologist , 2013, 通讯作者
（20） Resequencing 50 accessions of cultivated and wild rice yields markers for identifying agronomically important genes, Nature Biotechnology, 2012, 第 3 作者
（21） Genome size is not correlated with effective population size in the Oryza species, Evolution, 2012, 通讯作者
（22） Centres of plant endemism in China: places for survival or for speciation, Journal of Biogeography , 2011, 通讯作者
（23） Ecological divergence in the presence of gene flow in two closely related Oryza species (Oryza rufipogon and O. nivara), Molecular Ecology, 2010, 通讯作者
（24） Molecular evolution of the duplicated TFIIAγ genes in Oryzeae and its relatives, BMC Evolutionary Biology , 2010, 通讯作者
（25） Phylogeny and biogeography of the rice tribe (Oryzeae): Evidence from combined analysis of 20 chloroplast fragments, Molecular Phylogenetics and Evolution , 2010, 通讯作者
（26） Selection on grain shattering genes and rates of rice domestication, New Phytologist , 2009, 通讯作者

（1） 生物进化（中译本）, Evolution, 高教出版社, 2017-03, 第 1 作者

   

（ 1 ） 禾本科植物的适应性辐射及其进化机制, 主持, 国家级, 2010-01--2014-12
（ 2 ） 家养动物和栽培植物的起源, 主持, 国家级, 2007-07--2011-07
（ 3 ） 人工选择在水稻驯化过程中的作用和机制, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
（ 4 ） 经典植物分类特殊学科点项目, 主持, 国家级, 2014-01--2016-12
（ 5 ） 水稻耐旱性状分子模块系统解析, 主持, 国家级, 2013-08--2016-12
（ 6 ） 植物响应干旱环境的策略及其分子机制, 主持, 部委级, 2018-08--2022-07

（1）物种形成-我们到底知道多少？   ”自然杂交与生物多样性”学术研讨会   2019-10-26
（2）基因组时代的进化生物学研究-机遇和挑战   测序技术和应用高峰论坛   葛颂   2019-06-21
（3）植物多倍体研究的思考—以稻属为例   2018全国系统与进化植物学研讨会暨第十三届青年学术研讨会   2018-11-24
（4）从JSE 的成长看系统与进化植物学的发展   中国植物学会八十五周年学术年会   2018-10-11
（5）植物多倍化的起源及其进化意义   香山科学会议第637次学术讨论会   2018-10-09

已指导学生

陈进勇  博士研究生  071001-植物学  

杨艳华  博士研究生  071001-植物学  

邹新慧  博士研究生  071001-植物学  

郭亚龙  博士研究生  071001-植物学  

孙红正  博士研究生  071001-植物学  

朱其慧  博士研究生  071001-植物学  

徐新伟  博士研究生  071001-植物学  

周海飞  博士研究生  071001-植物学  

张林斌  博士研究生  071001-植物学  

夏涛  博士研究生  071001-植物学  

张富民  博士研究生  071001-植物学  

宋春凤  博士研究生  071001-植物学  

李志明  博士研究生  071001-植物学  

韦若勋  博士研究生  071001-植物学  

金辉  博士研究生  071001-植物学  

臧丽丽  博士研究生  071001-植物学  

郑晓明  博士研究生  071001-植物学  

王兆山  博士研究生  071001-植物学  

武志强  博士研究生  071001-植物学  

黄蕾  博士研究生  071001-植物学  

艾斌  博士研究生  071001-植物学  

李珊珊  博士研究生  071001-植物学  

蔡喆  博士研究生  071001-植物学  

刘荣  博士研究生  071001-植物学  

周廉  博士研究生  071001-植物学  

杨雪  硕士研究生  071001-植物学  

杜豫苏  博士研究生  071001-植物学  

任宁宁  博士研究生  071001-植物学  

景春艳  博士研究生  071001-植物学  

姜帅  硕士研究生  071001-植物学  

现指导学生

王美霞  博士研究生  071001-植物学  

徐迅  博士研究生  071001-植物学  

王秀花  博士研究生  071001-植物学  

孟庆霖  博士研究生  071001-植物学  

王新  博士研究生  071001-植物学  

耿牧帆  博士研究生  071001-植物学  

张红祥  硕士研究生  071001-植物学  

陈美  硕士研究生  071001-植物学  

强成根  博士研究生  071001-植物学  

李宁  博士研究生  071001-植物学  

焦子惠  硕士研究生  071001-植物学