1、   微生物天然产物药物生物合成；

2、   P450单加氧酶的酶学与酶工程研究；

3、   液体生物燃料；

4、   丝状真菌纤维素酶；

5、   工业微生物菌株遗传改造。

1、学科专业：生物化学与分子生物学；招生人数：1

2、学科专业：微生物学；招生人数：1

071010-生物化学与分子生物学
070321-化学生物学
071005-微生物学

酶学，酶工程，生物能源
生物合成，合成生物学，生物制药
微生物遗传工程，代谢工程

2010-01--2012-05   密歇根大学生命科学学院   博士后
2004-08--2009-12   密歇根大学药学院药物化学系   博士
2000-09--2003-08   厦门大学生命科学学院   硕士
1996-09--2000-06   厦门大学生命科学学院   学士

博士

博士

2010-2012年继续在密歇根大学生命科学研究所从事博士后研究，兼任Alluvium Biosciences Inc.研究科学家。

2012年加入中国科学院青岛生物能源与过程研究所，任研究员，博士生导师，酶工程团队负责人。

2012年入选中组部“青年****”引进人才。

现任山东省合成生物学省级重点实验室主任，酶工程技术研究中心主任。

2012-06~现在, 中科院青岛生物能源与过程研究所, 研究员

   

（ 1 ） 一种利用偶联生产脂肪酶的方式催化生产生物柴油的方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: 201410138507.3
（ 2 ） 一种生产脂肪端烯的方法及其应用, 发明, 2014, 第 1 作者, 专利号: 201410660346.4
（ 3 ） 一种基于脂肪酶与P450脂肪酸脱羧酶偶联催化的脂肪烯烃催化合成方法, 发明, 2015, 第 2 作者, 专利号: 201510003451.5
（ 4 ） 一种制备毛发生长促进剂的生物转化方法, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: 201510346350.8
（ 5 ） 一种酚类化合物催化氧化系统及其应用, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: 201610015698.3
（ 6 ） 高效分泌表达黑曲霉α-半乳糖苷酶AGA的工程菌及其构建和应用, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: 2015107066150
（ 7 ） 支撑P450脂肪酸脱羧酶活性的还原伴侣蛋白组合及其应用, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: 201610151612.X
（ 8 ） 1. Chimeric Cytochrome P450 Proteins and Methods of Use, 发明, 2009, 第 1 作者, 专利号: US 20090081758A3
（ 9 ） 2. A Method for Selective Oxidation of C-H Bonds by an Engineered P450 Enzyme, 发明, 2011, 第 1 作者, 专利号: WO 2011038313A2
（ 10 ） 3. Biosynthetic Systems Producing Fungal Indole Alkaloids, 发明, 2013, 第 1 作者, 专利号: WO 2013152110A1

   

（1） Characterization of a Unique Pathway for 4-Cresol Catabolism Initiated by Phosphorylation in Corynebacterium glutamicum, J. Biol. Chem., 2016, 通讯作者
（2） Cytochrome P450 enzymes and microbial drug development – A review, Acta Microbiologica Sinica, 2016, 通讯作者
（3） Improving the Secretory Expression of an α-Galactosidase from Aspergillus niger in Pichia pastoris., PLoS ONE, 2016, 通讯作者
（4） In Vitro reconstitution of the cyclosporine specific P450 hydroxylases using heterologous redox partner proteins., J. Ind. Micro. Biot., 2016, 通讯作者
（5） Identification of an unexpected shunt pathway product provides new insights into tirandamycin biosynthesis., Tetrahedron Lett., 2016, 通讯作者
（6） Functional Characterization of MpaG’, the O-Methyltransferase Involved in the Biosynthesis of Mycophenolic Acid, Chembiochem, 2015, 通讯作者
（7） Assembly of lipase and P450 fatty acid decarboxylase to constitute a novel biosynthetic pathway for production of 1-alkenes from renewable triacylglycerols and oils, Biotechnol. Biofuels, 2015, 通讯作者
（8） Reconstitution of the in vitro activity of the cyclosporine-specific P450 hydroxylase from Sebekia benihana and development of a heterologous whole cell biotransformation system, Appl. Environ. Microbiol., 2015, 通讯作者
（9） A novel and robust recombinant Pichia pastoris yeast whole cell biocatalyst with intracellular overexpression of a Thermomyces lanuginosus lipase: preparation, characterization and application in biodiesel production, Bioresour. Technol., 2014, 通讯作者
（10） Hydrogen peroxide-independent production of α-alkenes by OleTJE P450 fatty acid decarboxylase, Biotechnol. Biofuels, 2014, 通讯作者
（11） New reactions and products resulting from alternative interactions between the P450 enzyme and redox partners, J. Am. Chem. Soc., 2014, 通讯作者
（12） Integrated lipase production and in situ biodiesel synthesis in a recombinant Pichia pastoris yeast: an efficient dual biocatalytic system composed of cell free enzymes and whole cell catalysts, Biotechnol. Biofuels, 2014, 通讯作者
（13） Polydimethylsiloxane: A General Matrix for High-Performance Chromatographic NMR Spectroscopy, Angew. Chem. Intl. Ed., 2014, 第 4 作者
（14） Characterization of the bafilomycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces lohii, Chembiochem, 2013, 通讯作者
（15） Substrate recognition by the multifunctional cytochrome P450 MycG in mycinamicin hydroxylation and epoxidation reactions, J. Biol. Chem., 2012, 第 1 作者
（16） Comparative analysis of the biosynthetic systems for fungal bicyclo[2.2.2]diazaoctane indole alkaloids: the (+)/(-)-notoamide, paraherquamide and malbrancheamide pathways, MedChemComm, 2012, 第 1 作者
（17） Biochemical Characterization of NotB as an FAD-Dependent Oxidase in the Biosynthesis of Notoamide Indole Alkaloids, J. Am. Chem. Soc., 2012, 第 1 作者
（18） A New Structural Form in the SAM/Metal-Dependent O-methyltransferase Family: MycE from the Mycinamycin Biosynthetic Pathway, J. Mol. Biol., 2011, 第 2 作者
（19） Tirandamycin Biosynthesis is Mediated by Co-dependent Oxidative Enzymes., Nature Chemistry, 2011, 第 1 作者
（20） Genome-Based Characterization of Two Prenylation Steps in the Assembly of the Stephacidin and Notoamide Anticancer Agents in a Marine-Derived Aspergillus sp. , J. Am. Chem. Soc., 2010, 第 4 作者
（21） Stephacidins and Notoamides. Total Synthesis of Notoamides, Heterocycles, 2010, 第 2 作者
（22） Gene targeting for O-methyltransferase genes, mycE and mycF, on the chromosome of Micromonospora griseorubida producing mycinamicin with a disruption cassette containing the bacteriophage φC31 attB attachment site. , FEMS Microbiol. Lett. , 2010, 第 3 作者
（23）  Identification of the tirandamycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces sp. 307-9., ChemBioChem, 2010, 第 4 作者
（24） Selective oxidation of carbolide C-H bonds by an engineered macrolide P450 monooxygenase. , Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2009, 第 1 作者
（25） Isolation and characterization of tirandamycins from a marine-derived Streptomyces sp. , J. Nat. Prod., 2009, 第 1 作者
（26） Functional analysis of MycE and MycF, two O-methyltransferases involved in the biosynthesis of mycinamicin macrolide antibiotics., ChemBioChem, 2009, 第 1 作者
（27） Analysis of transient and catalytic desosamine-binding pockets in cytochrome P-450 PikC from Streptomyces venezuelae., J. Biol. Chem., 2009, 第 1 作者
（28） Functional analysis of MycCI and MycG, cytochrome P450 enzymes involved in biosynthesis of mycinamicin macrolide antibiotics., Chem. Biol., 2008, 第 1 作者
（29） Engineering and analysis of a self-sufficient biosynthetic cytochrome P450 PikC fused to the RhFRED reductase domain., J. Am. Chem. Soc., 2007, 第 1 作者
（30） Molecular analysis of the role of tyrosine 224 in the active site of Streptomyces coelicolor RppA, a bacterial type III polyketide synthase. , J. Biol. Chem., 2007, 第 1 作者
（31） The structural basis for substrate anchoring, active site selectivity, and product formation by P450 PikC from Streptomyces venezuelae. , J. Biol. Chem., 2006, 第 2 作者
（32） 海藻真菌抗肿瘤活性的初步研究, Preliminary research on antitumor activities of natural products from algal fungi, 厦门大学学报（自然科学版）, 2004, 第 3 作者
（33） 1-(2,4-Dihydroxy-3,5-Dimethylphenyl)-ethanone (Clavatol)., Acta. Cryst. E, 2003, 第 1 作者
（34） 国外海洋抗肿瘤活性物质的研究与开发, Discovery and Development of Marine Antitumor Products, 海洋通报, 2003, 第 1 作者

   

（ 1 ） 青年****, 主持, 国家级, 2012-06--2015-05
（ 2 ） 青年****, 主持, 省级, 2012-06--2015-05
（ 3 ） 一种P450脂肪酸脱羧酶的酶学、酶工程及组合生物合成研究, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
（ 4 ） Production of α-alkenes with aviation fuel properties in Escherichia coli, BOEING, QIBEBT Collaboration Agreement for a Joint Research Laboratory for Sustainable Aviation Biofuels, 主持, 研究所（学校）, 2013-10--2014-09
（ 5 ） Microbial Biosynthesis, 主持, 省级, 2015-01--2017-12
（ 6 ） Biosynthetic Mechanisms and Synthetic Biology of Fungal Alkaloid Brevianamides, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12
（ 7 ） Biosynthesis of Microbial Secondary Metabolites, 主持, 国家级, 2015-01--2017-12
（ 8 ） Improving C12 activity of new decarboxylase encoding sequences, TOTAL, Research Program Agreement between TOTAL Marketing Services and QIBEBT, 主持, 研究所（学校）, 2015-10--2017-03

（1）Redox Partner Proteins: Underexplored Function Modulators for Cytochrome P450 Enzymes from Actinomycetes   2015-06-25
（2）Multifunctional biosynthetic P450 enzymes from actinomycetes   2014-12-09
（3）Alternative interactions between cytochrome P450 enzymes and redox partner proteins   2014-08-17
（4）The Bafilomycin Biosynthetic Pathway of A Marine Streptomyces Strain   2014-08-07
（5）Uncovering the broader roles of redox partner proteins for cytochrome P450 enzymes   2014-07-16
（6）A new microbial cell factory for production of 1-alkenes   2014-05-28
（7）Harnessing The Native Substrate Flexibility of Biosynthetic P450 Enzymes for Natural Product Structural Diversification   美国化学会2012春季年会   Shengying Li, Mani R. Chaulagain, Allison R. Knauff, Larissa M. Podust, John Montgomery, David H. Sherman   2012-03-26

1、2013年10月-2014年9月 Production of α-alkenes with aviation fuel properties in Escherichia coli, BOEING, QIBEBT Collaboration Agreement for a Joint Research Laboratory for Sustainable Aviation Biofuels (国际合作项目​)

2、2015年10月-2017年3月： Improving C12 activity of new decarboxylase encoding sequences, TOTAL, Research Program Agreement between TOTAL Marketing Services and QIBEBT (国际合作项目)

已指导学生

刘奕  01  19183  

房博  02  63228  

现指导学生

郑贤良  01  19183  

李众  02  19183  

宁琳琳  02  63228  

杜磊  01  19178  

曲泽鹏  02  63228  

蒋媛媛   01  19178