计算机系统结构、可重构计算、人工智能、生物信息学、生命健康大数据智能分析

   

081201-计算机系统结构

计算机系统结构

2000-09--2005-06   中国科学院计算技术研究所   获工学硕士学位
1985-09--1989-07   南开大学电子科学系微电子专业   获理学学士学位

中科院计算所 20000901--20050730 研究生毕业

中科院计算所 20000901--20050730 工学硕士学位

   

2019-01~现在, 中国科学院计算技术研究所苏州智能计算产业技术研究院, 副院长
2017-01~现在, 中国科学院计算技术研究所系统结构部, 总工
2011-09~2016-12,中国科学院计算技术研究所高性能计算机研究中心, 主任
2005-12~2007-06,美国特拉华大学计算机体系结构与并行系统实验室, 国家公派访问学者
2005-08~2011-08,国家智能计算机研究开发中心, 副主任
1996-03~现在, 中国科学院计算技术研究所, 正研究员级高级工程师
1989-07~1996-03,交通部科学研究院, 任助理研究员

2019-10-30-今,北京中科晶上科技股份有限公司, 董事
2019-07-30-今,中科算智（苏州）资产管理有限公司, 董事
2019-01-09-今,中科驭数（北京）科技有限公司, 董事
2018-12-29-今,苏州智能计算产业技术研究院, 副院长
2017-08-14-今,北京中科寒武纪科技有限公司, 董事
2017-08-14-今,天津中科蓝鲸信息技术有限公司, 董事
2017-08-14-今,北京神州龙芯集成电路设计有限公司, 董事
2017-05-15-今,北京中科图灵基金管理有限公司, 董事

   

（1） 曙光高效能计算机系统关键技术及应用, 二等奖, 国家级, 2013
（2） 曙光4000”系列高性能计算机系统, 二等奖, 国家级, 2007
（3） 曙光4000”系列高性能计算机系统, , 部委级, 2006
（4） 大规模机群管理系统, 二等奖, 部委级, 2005
（5） 曙光3000”和可扩展并行计算机系统, 二等奖, 国家级, 2004
（6） 曙光2000”超级服务器系统, 二等奖, 国家级, 2001
（7） 曙光2000”超级服务器系统, 一等奖, 部委级, 2000

（ 1 ） 使能单根I/O设备多根共享的适配装置、系统及方法, 发明, 2015, 第 5 作者, 专利号: CN201510751898
（ 2 ） 一种基于网卡直连的全互连通信方法及装置, 发明, 2015, 第 5 作者, 专利号: CN201510427329
（ 3 ） 一种面向高维度网络的路由器及路由方法, 发明, 2014, 第 5 作者, 专利号: CN201410319245
（ 4 ） 一种集成网络路由器的众核处理器系统及其集成方法和实现方法, 发明, 2014, 第 5 作者, 专利号: CN201410302494
（ 5 ） 一种支持I/O功能动态分配的虚拟热插拔系统及其工作方法, 发明, 2013, 第 5 作者, 专利号: CN201310697592
（ 6 ） 一种基板多芯片集成的大端口互连类芯片及实现方法, 发明, 2013, 第 4 作者, 专利号: CN201310298425
（ 7 ） 实现分布式I/O资源池化的方法及装置, 发明, 2013, 第 5 作者, 专利号: CN201310240608
（ 8 ） 一种基于PCIe数据交换的通信方法及系统, 发明, 2013, 第 5 作者, 专利号: CN201310038675
（ 9 ） 一种用于多根共享系统的I/O重映射方法和装置, 发明, 2012, 第 3 作者, 专利号: CN201210172844
（ 10 ） 一种用于多根共享系统的直接I/O虚拟化方法和装置, 发明, 2012, 第 3 作者, 专利号: CN201210171920
（ 11 ） 用于多根I/O 虚拟化共享系统的I/O 资源管理方法, 发明, 2012, 第 4 作者, 专利号: CN201210160593
（ 12 ） 多根I/O虚拟化共享方法和系统, 发明, 2012, 第 4 作者, 专利号: CN201210153862
（ 13 ） 一种支持单根IO虚拟化用户级接口控制装置及其方法, 发明, 2012, 第 5 作者, 专利号: CN201210096454
（ 14 ） 具有硬件加速功能的智能以太网卡, 发明, 2005, 第 2 作者, 专利号: CN200510135496
（ 15 ） 一种多IO扩展接口的服务器主板装置, 发明, 2005, 第 4 作者, 专利号: CN200510066315
（ 16 ） 长距离视频图形阵列信号传输装置, 发明, 2004, 第 1 作者, 专利号: CN200410042720
（ 17 ） 基于双8b/10b编码器的16b/20b编码器逻辑实现方法, 发明, 2004, 第 5 作者, 专利号: CN200410002290
（ 18 ） 一种光神经元结构和包含该结构的神经网络处理系统, 发明, 2018, 第 5 作者, 专利号: CN201811532813
（ 19 ） 一种针对基因数据的取样字典树索引的压缩方法和系统, 发明, 2018, 第 5 作者, 专利号: CN201811427459
（ 20 ） 一种用于可调谐光装置的控制装置与方法, 发明, 2018, 第 5 作者, 专利号: CN201810795776
（ 21 ） 一种用于光网络的拓扑重构控制方法, 发明, 2017, 第 5 作者, 专利号: CN201710767900

   

（1） Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine, Nature Biotechnology, 2018, 其他（合作组作者）
（2） STrieGD: A Sampling Trie Indexed Compression Algorithm for Large Scale Gene Data, NPC 2018: 15th Annual IFIP International Conference on Network and Parallel Computing, 2018, 其他（合作组作者）
（3） Deep Sequencing Big Data Oriented Computing Model and Architecture Research, Science & Technology Innovation Herald, 2016, 第 1 作者
（4） Accelerating Irregular Computation in Massive Short Reads Mapping on FPGA Co-processor, IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems, 2016, 第 4 作者
（5） SuperDragon:A Heterogeneous Parallel System for Accelerating 3D Reconstruction of Cryo-Electron Microscopy Images, ACM Transactions on Reconfigurable Technology and Systems, 2015, 第 4 作者
（6） Accelerating Millions of Short Reads Mapping on a Heterogeneous Architecture with FPGA Accelerator, FCCM '12 Proceedings of the 2012 IEEE 20th International Symposium on Field-Programmable Custom Computing Machines, 2012, 第 6 作者
（7） Short read DNA fragment anchoring algorithm, Bmc Bioinformatics, 2009, 第 2 作者
（8） Implementation of the Smith-Waterman algorithm on a reconfigurable supercomputing platform, HPRCTA '07 Proceedings of the 1st international workshop on High-performance reconfigurable computing technology and applications: held in conjunction with SC07, 2007, 第 1 作者
（9） A Reconfigurable Accelerator for Smith–Waterman Algorithm, IEEE Transactions on Circuits and Systems II: Express Briefs, 2007, 第 4 作者
（10） 一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现, 计算机研究与发展, 2005, 第 1 作者

   

（ 1 ） 面向新一代测序大数据量的计算模型与体系结构研究, 主持, 国家级, 2012-01--2016-12
（ 2 ） 云计算服务器关键技术研究, 主持, 市地级, 2011-01--2015-12
（ 3 ） 大规模光子集成芯片专项之项目五：大规模光子集成芯片验证系统, 主持, 部委级, 2016-07--2020-12
（ 4 ） 光互连集成芯片技术, 主持, 国家级, 2020-01--2021-12
（ 5 ） E级高性能计算机系统研制—系统软件及应用支持环境研制, 主持, 国家级, 2019-01--2022-12

已指导学生

杨佳  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

李兴建  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

李想  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

戴福鑫  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

王田  硕士研究生  085211-计算机技术  

包小圳  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

金堰安  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

王炳琛  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

邵慧子  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

郑华杰  硕士研究生  085211-计算机技术  

隽鹏辉  硕士研究生  085212-软件工程  

宋佳  硕士研究生  085211-计算机技术  

张少龙  硕士研究生  085211-计算机技术  

张宁  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

曹旭  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

程任清  硕士研究生  085211-计算机技术  

何平  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

李然  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

杨宇昊  硕士研究生  085211-计算机技术  

陈尧麟  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

贺恒逸  硕士研究生  085211-计算机技术  

现指导学生

张家珲  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

黄茂雷  硕士研究生  081201-计算机系统结构