基本信息
金钟  男  博导  中国科学院计算机网络信息中心
电子邮件: zjin@sccas.cn
通信地址: 北京市海淀区中关村南四街四号
邮政编码: 100190

研究领域

高性能计算

教育背景

2001-08--2006-08   美国Emory University   理学博士
1992-09--1997-08   北京大学   理学学士

工作经历

   

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 首届“中国科学院超级计算应用奖”最佳应用奖, 一等奖, 院级, 2013
专利成果
( 1 ) 基于网格的计算化学应用整合系统, 发明, 2011, 第 1 作者, 专利号: 201110023949.X
( 2 ) 基于网格的计算化学过程可视化系统及控制方法, 发明, 2011, 第 1 作者, 专利号: 201110023957.4

出版信息

   
发表论文
(1) iProX: an Integrated proteome resource, Nucleic Acids Research, 2019, 第 9 作者
(2) 异构计算量子化学软件的研发恰逢其时, 中国科学基金, 2018, 通讯作者
(3) PGAweb: A Web Server for Bacterial Pan-Genome Analysis, Frontiers in Microbiology, 2018, 通讯作者
(4) 基于Intel MIC平台大规模耗散粒子动力学模拟的设计与优化, 计算机工程与科学, 2017, 通讯作者
(5) 小分子配体模拟水分子: 计算模拟相同配体与不同蛋白之间的作用模式, 科研信息化应用, 2017, 第 5 作者
(6) 基于高性能计算环境的科学计算应用平台设计与实现, 科研信息化应用, 2017, 第 4 作者
(7) 基于云服务的计算化学社区, 科研信息化应用, 2016, 第 5 作者
(8) 一种生物大分子自动分片程序设计技术, 科研信息化应用, 2016, 第 4 作者
(9) Three-dimensional Numerical Simulation of Viscoelastic Phase Separation under Shear: the Roles of Bulk and Shear Relaxation Moduli, Chinese J. Polym. Sci., 2015, 第 2 作者
(10) Differential structural dynamics and antigenicity of two similar influenza H5N1 virus HA-specific HLA-A*0201-restricted CLT epitopes, RSC Adv., 2015, 第 3 作者
(11) The formation and evolution of the high surface energy facets of anatase TiO2, J. Phys. Chem. C, 2015, 通讯作者
(12) Systematic study on G-protein couple receptor prototypes: did they really evolve from prokaryotic genes?, IET Systems Biology, 2014, 第 1 作者
(13) VCGDB: a dynamic genome database of the Chinese population, BMC Genomics, 2014, 第 1 作者
(14) International Conference on Theoretical and High-Performance Computational Chemistry, J. Phys. Chem. A, 2014, 第 1 作者
(15) HSA: A Heuristic Splice Alignment Tool, BMC Systems Biology, 2013, 通讯作者
(16) The challenge to the rule of homology modeling: folding mechanism study of protein G(A) and G(B) with high sequence identity but different native structures, Curr Pharm Des, 2013, 第 2 作者
(17) Binding free energy estimation for protein-ligand complex based on MM-PBSA with various partial charge models, Curr Pharm Des, 2013, 第 2 作者
(18) BAsplice: Bi-direction Alignment for detecting splice junctions., IEEE Intl. Conference on Systems Biology, 2012, 通讯作者
(19) The International Exascale Software Roadmap, International Journal of High Performance Computing Applications, 2011, 第 4 作者
(20) The rate constants of the H+FO reaction and its isotope variant on two electronic states, Chemical Physics, 2011, 通讯作者
(21) 基于CNGrid的GridMol中作业管理器的设计与实现, 计算机应用研究, 2011, 第 3 作者
(22) 基于深腾7000的NAMD千核性能分析, 科研信息化技术与应用, 2011, 第 2 作者
(23) 基于网格的计算化学应用整合系统, 华中科技大学学报, 2011, 第 3 作者
(24) An Integrated and Grid Based Solution of Chemical Application, International Conference of Information Computation and Applications 2010, 2010, 第 3 作者
(25) GridMol系统中蛋白质显示与建模的性能优化, 计算机工程, 2009, 第 4 作者
(26) GridMol: A Grid Application for Molecular Modeling and Visualization, Journal of Computer-Aided Molecular Design, 2008, 第 4 作者
(27) GridMol:基于网格的分子可视化建模应用系统, 微电子学与计算机, 2007, 第 4 作者
(28) Quasiclassical Trajectory Study of the CH3+ + HD → CH2D+ + H2 Reaction, Journal of Physical Chemistry A, 2007, 第 2 作者
(29) An ab initio-Based Global Potential Energy Surface: Describing CH5+ → CH3+ +H2, Journal of Physical Chemistry A, 2006, 第 1 作者
发表著作
(1) 《高性能计算应用概览》第3章 高性能计算应用之生物学研究, 清华大学出版社, 2018-06, 第 1 作者

指导学生

已指导学生

卜景德  02  19581  

万波  02  19261  

王今晨  02  19261  

邱英秋  02  19261  

现指导学生

户忠哲  02  63236  

陈新宇  02  63236  

田英齐  02  19261  

张帅  02  63236  

贺雨晴   02  19261