基本信息

资治科  男  博导  中国科学院深圳先进技术研究院
电子邮件： zk.zi@siat.ac.cn
通信地址： 深圳市南山区西丽大学城学苑大道1068号
邮政编码：

研究领域

系统生物学；生物信息学


招生信息

招生专业
071010-生物化学与分子生物学
0710J3-生物信息学
招生方向

系统生物学；定量生物学；生物信息学；细胞与分子生物学

教育背景

2005-08--2008-10   德国洪堡大学   博士
2002-09--2005-07   清华大学   硕士
1998-09--2002-06   中南民族大学   学士

工作经历

   
工作简历
2022-07~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院, 研究员
2019-01~2022-06,德国联邦风险评估研究所, 终身科学研究员
2014-05~2018-12,德国马克斯普朗克分子遗传所, 研究员、课题组长 (Group Leader, PI)
2009-11~2014-04,德国弗莱堡大学, 项目组长（Project Leader）
2009-01~2009-10,德国洪堡大学, 博士后
社会兼职
2025-11-20-今,Science Signaling, 编委
2023-09-01-今,IET Systems Biology, 副主编

出版信息

   
发表论文选摘
（1） Extrachromosomal DNA replication and maintenance couple with DNA damage pathway in tumors, Cell, 2025, 第 31 作者
（2） Liebig's law of the minimum in the TGF-beta/SMAD pathway, PLOS Computational Biology, 2024, 第 8 作者  通讯作者
（3） Machine learning unveils RNA polymerase II binding as a predictor for SMAD2-dependent transcription dynamics in response to Actvin signalling, IET Systems Biology, 2024, 第 3 作者  通讯作者
（4） HTAD: a human-in-the-loop framework for supervised chromatin domain detection, GENOME BIOLOGY, 2024, 第 5 作者  通讯作者
（5） COCOA: A Framework for Fine-scale Mapping Cell-type-specific Chromatin Compartments with Epigenomic Information, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2024, 第 6 作者  通讯作者
（6） PhyloVelo enhances transcriptomic velocity field mapping using monotonically expressed genes, Nature Biotechnology, 2023, 第 6 作者
（7） Programmable Extracellular Vesicles for Macromolecule Delivery and Genome Modifications, DEVELOPMENTAL CELL, 2020, 第 3 作者
（8） Cell-type-specific role of CHK2 in mediating DNA damage-induced G2 cell cycle arrest, ONCOGENESIS, 2020, 第 6 作者  通讯作者
（9） Molecular Engineering of the TGF-beta Signaling Pathway, JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2019, 第 1 作者  通讯作者
（10） eDetect: A Fast Error Detection and Correction Tool for Live Cell Imaging Data Analysis, ISCIENCE, 2019, 第 4 作者  通讯作者
（11） Tissue-Specific Chk1 Activation Determines Apoptosis by Regulating the Balance of p53 and p21, ISCIENCE, 2019, 第 4 作者  通讯作者
（12） Spatiotemporal Control of TGF-beta Signaling with Light, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2018, 第 9 作者  通讯作者
（13） SBML-PET-MPI: a parallel parameter estimation tool for Systems Biology Markup Language based models, BIOINFORMATICS, 2011, 第 1 作者  通讯作者
（14） Time-Dependent Quantitative Multicomponent Control of the G(1)-S Network by the Stress-Activated Protein Kinase Hog1 upon Osmostress, SCIENCE SIGNALING, 2011, 第 2 作者
（15） Quantitative analysis of transient and sustained transforming growth factor-beta signaling dynamics, MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY, 2011, 第 1 作者  通讯作者