基本信息

资治科  男  博导  中国科学院深圳先进技术研究院
电子邮件: zk.zi@siat.ac.cn
通信地址: 深圳市南山区西丽大学城学苑大道1068号
邮政编码:

研究领域

系统生物学;生物信息学


招生信息

招生专业
071010-生物化学与分子生物学
071005-微生物学
0710J3-生物信息学
招生方向

系统生物学;定量生物学;生物信息学;细胞与分子生物学

教育背景

2005-08--2008-10   德国洪堡大学   博士
2002-09--2005-07   清华大学   硕士
1998-09--2002-06   中南民族大学   学士

工作经历

   
工作简历
2022-07~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院, 研究员
2019-01~2022-06,德国联邦风险评估研究所, 终身科学研究员
2014-05~2018-12,德国马克斯普朗克分子遗传所, 研究员、课题组长 (Group Leader, PI)
2009-11~2014-04,德国弗莱堡大学, 项目组长(Project Leader)
2009-01~2009-10,德国洪堡大学, 博士后

出版信息

   
发表论文
[1] PLOS Computational Biology. 2024,   通讯作者  
[2] IET Systems Biology. 2024,   通讯作者  
[3] Nature Biotechnology. 2023, 第 6 作者
[4] Xiaojuan Zhang, Quanbin Xu, Zhike Zi, Zeyu Liu, Chun Wan, Lauren Crisman, Jingshi Shen, Xuedong Liu. Programmable Extracellular Vesicles for Macromolecule Delivery and Genome Modifications. DEVELOPMENTAL CELL. 2020, 第 3 作者55(6): 784-801.e9, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9719439/.
[5] van Jaarsveld, Marijn T M, Deng, Difan, OrdonezRueda, Diana, Paulsen, Malte, Wiemer, Erik A C, Zi, Zhike. Cell-type-specific role of CHK2 in mediating DNA damage-induced G2 cell cycle arrest. ONCOGENESIS[J]. 2020, 第 6 作者  通讯作者  9(3): http://dx.doi.org/10.1038/s41389-020-0219-y.
[6] Zhike Zi. Molecular Engineering of the TGF-β Signaling Pathway. JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY. 2019, 第 1 作者  通讯作者  431(15): 2644-2654, http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2019.05.022.
[7] Han, Hongqing, Wu, Guoyu, Li, Yuchao, Zi, Zhike. eDetect: A Fast Error Detection and Correction Tool for Live Cell Imaging Data Analysis. ISCIENCE[J]. 2019, 第 4 作者  通讯作者  13: 1-+, http://dx.doi.org/10.1016/j.isci.2019.02.004.
[8] van Jaarsveld, Marijn T M, Deng, Difan, Wiemer, Erik A C, Zi, Zhike. Tissue-Specific Chk1 Activation Determines Apoptosis by Regulating the Balance of p53 and p21. ISCIENCE[J]. 2019, 第 4 作者  通讯作者  12: 27-+, http://dx.doi.org/10.1016/j.isci.2019.01.001.
[9] Yuchao Li, Minji Lee, Nury Kim, Guoyu Wu, Difan Deng, Jin Man Kim, Xuedong Liu, Won Do Heo, Zhike Zi. Spatiotemporal Control of TGF- β Signaling with Light. ACS SYNTHETIC BIOLOGY[J]. 2018, 第 9 作者  通讯作者  7(2): 443-451, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6116903/.
[10] Zhike Zi, Zipei Feng, Douglas A Chapnick, Markus Dahl, Difan Deng, Edda Klipp, Aristidis Moustakas, Xuedong Liu. Quantitative analysis of transient and sustained transforming growth factor‐β signaling dynamics. MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY[J]. 2011, 第 1 作者  通讯作者  http://oa.las.ac.cn/oainone/service/browseall/read1?ptype=JA&workid=JA202107150008120ZK.
[11] Zi, Zhike. SBML-PET-MPI: a parallel parameter estimation tool for Systems Biology Markup Language based models. BIOINFORMATICS[J]. 2011, 第 1 作者  通讯作者  27(7): 1028-1029, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000289162000027.
[12] Adrover, Miquel Angel, Zi, Zhike, Duch, Alba, Schaber, Joerg, GonzalezNovo, Alberto, Jimenez, Javier, NadalRibelles, Mariona, Clotet, Josep, Klipp, Edda, Posas, Francesc. Time-Dependent Quantitative Multicomponent Control of the G(1)-S Network by the Stress-Activated Protein Kinase Hog1 upon Osmostress. SCIENCE SIGNALING[J]. 2011, 第 2 作者4(192): http://dx.doi.org/10.1126/scisignal.2002204.

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 肿瘤组织原位细胞工程化改造及应用, 参与, 国家任务, 2023-12--2028-11