医疗人工智能/大数据挖掘/生物信息学

   

081203-计算机应用技术
0812J3-生物信息学

医学人工智能
生物信息

2013-09--2016-07   清华大学   博士学位
1997-09--2000-07   北京大学   硕士学位

   

（1） 北京市科学技术奖-自然科学奖, 一等奖, 省级, 2023
（2） 中科院计算所-卓越之星, 一等奖, 研究所（学校）, 2023
（3） 中科院计算所-卓越之星, 一等奖, 研究所（学校）, 2017

（ 1 ） 一种用于挖掘肿瘤标志物的方法以及肿瘤风险筛查方法, 发明专利, 2023, 第 2 作者, 专利号: CN115602326A

（ 2 ） 一种基于深度学习的染色体极性识别方法和系统, 2022, 第 2 作者, 专利号: CN113408505B

（ 3 ） 基于深度学习的分裂中期染色体图像质量筛选方法和系统, 发明专利, 2021, 第 2 作者, 专利号: CN113393461A

（ 4 ） 基于深度学习的分裂中期染色体图像质量筛选方法和系统, 2021, 第 2 作者, 专利号: CN113393461B

（ 5 ） 基于深度学习的分裂中期染色体图像质量筛选方法和系统, 发明专利, 2021, 第 2 作者, 专利号: CN113393461A

（ 6 ） 用于构建用于预测蛋白质-RNA相互作用结合位点模型的方法和系统, 发明专利, 2020, 第 3 作者, 专利号: CN111192631A

（ 7 ） 用于构建用于预测蛋白质-RNA相互作用结合位点模型的方法和系统, 2023, 第 3 作者, 专利号: CN111192631B

（ 8 ） 一种基于深度学习的染色体自动计数方法, 2020, 第 2 作者, 专利号: CN109523520B

（ 9 ） 一种基于深度学习的染色体自动计数方法, 专利授权, 2019, 第 2 作者, 专利号: CN109523520A

（ 10 ） 一种区分蛋白编码基因和非编码基因的方法及系统, 发明专利, 2013, 第 1 作者, 专利号: CN103218543A

（ 11 ） 一种区分蛋白编码基因和非编码基因的方法及系统, 2016, 第 1 作者, 专利号: CN103218543B

   

   

（ 1 ） 非编码RNA调控网络及功能研究, 负责人, 中国科学院计划, 2011-10--2013-10
（ 2 ） 蛋白质组海量质谱数据的解析及其在人类基因组注释中的应用, 负责人, 国家任务, 2010-01--2014-12
（ 3 ） 病毒性肝炎恶性转化的多元调控网络研究, 负责人, 国家任务, 2013-01--2015-12
（ 4 ） 非编码RNA参与的生物网络分析, 负责人, 国家任务, 2011-01--2013-12
（ 5 ） siRNA药物设计软件研发, 负责人, 国家任务, 2012-11--2015-12
（ 6 ） 基于高通量测序数据的长非编码RNA调控网络及在癌症中的应用, 负责人, 国家任务, 2014-01--2017-12
（ 7 ） 基础医学科学数据中心共建项目, 负责人, 国家任务, 2016-06--2017-06
（ 8 ） 肝癌极高危人群队列的建立及早期诊断与预警研究, 参与, 国家任务, 2015-04--2016-12
（ 9 ） 基于不同测序策略的长非编码RNA拼接、鉴定算法和功能注释的系统性研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2020-12
（ 10 ） 后基因组时代的高通量生命多组学数据分析算法研究, 负责人, 研究所自主部署, 2018-01--2019-12
（ 11 ） 特色经济林重要性状形成与调控-NGS数据分析算法研究, 负责人, 国家任务, 2019-01--2021-12
（ 12 ） 多模态数据智能整合算法及在医疗中的应用研究, 负责人, 研究所自主部署, 2021-05--2023-04
（ 13 ） 慢性肾脏病发生、发展及预后的风险预测体系, 负责人, 国家任务, 2022-01--2024-12
（ 14 ） 生物多维认知智能大模型MultiFormer解析基因调控核心机制（联合申请B）, 负责人, 国家任务, 2024-01--2026-12

已指导学生

余鲲涛  硕士研究生  081202-计算机软件与理论  

解朝勇  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

谭程夫  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

李明  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

杨瑞  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

朱城  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

李慧  博士研究生  081201-计算机系统结构  

罗纯龙  博士研究生  081203-计算机应用技术  

刘阳  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

洪剑伟  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

现指导学生

乔艺璇  博士研究生  081203-计算机应用技术  

罗宇凡  博士研究生  081203-计算机应用技术  

齐晓宁  博士研究生  081203-计算机应用技术  

张泽源  硕士研究生  081200-计算机科学与技术  

赵方圆  博士研究生  081200-计算机科学与技术  

林森林  博士研究生  081200-计算机科学与技术  

覃佳馨  硕士研究生  081200-计算机科学与技术  

王胜  博士研究生  081200-计算机科学与技术