颜海飞 研究员 博导 中国科学院华南植物园
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研究领域
1. 物种多样性格局的形成机制研究
全球的物种多样性呈现出不均衡分布的格局,东亚物种多样性明显高于北半球的其他地区(尤其是北美和欧洲),是什么原因导致了这种分布格局的形成一直是生物学家关注的重要课题。物种形成净速率和起源时间是物种多样性形成的最直接原因。我们可利用不同植物(或动物)类群在全球不平衡的物种多样性格局,结合其系统发育关系和分化时间,估算出不同地区的物种形成净速率和起源时间,进而推算物种多样性格局的形成机制。此外,在东亚内部,可进一步将东亚地区细分(如依据区系、纬度、经度、海拔等),结合多个类群(植物类群)的系统发育关系,及其的重要性状(如花的结构、种子形态等)和生态因子(如温度、降水、土壤类型等)等性状,开展宏观的比较系统发育学研究,探讨东亚物种多样性形成机制。
2. 植物系统发育与进化研究
随着高通量测序和生物信息技术的快速发展,利用高通量数据手段开展植物系统发育和进化研究属于研究热点。我们正利用转录组测序(RNA-seq)、基因组浅层测序技术(Genome Skimming)、同源基因杂交测序法(Target enrichment combined with genome skimming: Hyb-Seq)获取大量直系同源核基因或细胞器基因组信息,并结合形态、细胞学、生境因子等数据探讨植物类群(如报春花科)的系统发育关系和物种形成的地理模式。另外,以特定植物类群(如植物复合体)为例,利用简化基因组测序(RAD-seq)或转录组测序开展群体遗传学方面的研究,并结合植物地理学和古生物、古地理和古气候的资料,探讨其起源、演化和分布历史,揭示物种间的进化规律和机制。
3. 植物DNA条形码研究
DNA条形码是采用标准的DNA片段对物种进行有效鉴定的技术。在植物中,由于存在较为频繁的杂交和基因渐渗,该技术在植物中可能存在较多问题。当前,我们正利用基因组浅层测序技术(Genome Skimming)等高通量测序方法构建超级条形码(细胞器基因组及核糖体基因),以解决近缘类群的物种鉴定问题,进而发现其中的生物学问题。除DNA条形码的选择标准和鉴定能力的评估外,我们试图探讨如何将DNA条形码技术有效地应用于种下品系的鉴定中(如鉴定重要中药材的道地性)。
热切期待有兴趣的同学加入我们团队,共同进步!
招生信息
招生专业
招生方向
教育背景
工作经历
指导学生
已指导学生
肖凯伦 硕士研究生 085238-生物工程
杨涛 硕士研究生 071001-植物学
黄少溶 硕士研究生 085238-生物工程
魏磊 硕士研究生 071001-植物学
李敏 硕士研究生 071001-植物学
现指导学生
冯湉 硕士研究生 086000-生物与医药
王一冰 硕士研究生 071001-植物学
刘凯 硕士研究生 071001-植物学