基本信息
程曦  女  硕导  中国科学院上海药物研究所
电子邮件: xicheng@simm.ac.cn
通信地址: 上海市浦东张江祖冲之路555号
邮政编码: 201203

研究领域

药物靶标的功能机制研究
新药发现与设计
深度学习算法开发

招生信息

   
招生专业
1007Z1-药物设计学
招生方向
计算机辅助药物设计方法开发与应用
药物靶标机制研究
新药发现与设计

教育背景

2010-09--2015-05   堪萨斯大学   博士
2006-09--2010-06   华中科技大学   学士

工作经历

   
工作简历
2021-10~现在, 中国科学院上海药物研究所, 研究员
2017-10~2021-09,中国科学院上海药物研究所, 副研究员
2015-09~2017-09,中国科学院上海药物研究所, 博士后

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 247种化合物及其组合物在抗新型冠状病毒感染中的应用, 发明专利, 2022, 第 6 作者, 专利号: CN113893345A

( 2 ) 1869种化合物及其组合物在抗新型冠状病毒感染中的应用, 发明专利, 2022, 第 6 作者, 专利号: CN113893347A

( 3 ) 一类嘧啶类化合物及其作为TRPV2抑制剂的用途, 发明专利, 2019, 第 5 作者, 专利号: CN110563709A

出版信息

   
代表性论文
(1) Highly accurate carbohydrate-binding site prediction with DeepGlycanSite, Nature Communications, 2024, 第 14 作者  通讯作者
(2) Direct Identification of Complex Glycans via a Highly Sensitive Engineered Nanopore, Journal of the American Chemical Society, 2024, 第 7 作者  通讯作者
(3) Mapping the Acetylamino and Carboxyl Groups on Glycans by Engineered alpha-Hemolysin Nanopores, Journal of the American Chemical Society, 2023, 第 7 作者  通讯作者
(4) Identification of a carbohydrate recognition motif of purinergic receptors, eLife, 2023, 第 8 作者  通讯作者
(5) Loops Mediate Agonist-Induced Activation of the Stimulator of Interferon Genes Protein, Journal of Chemical Information and Modeling, 2023, 第 8 作者  通讯作者
(6) Hinge region mediates signal transmission of luteining hormone and chorionic gonadotropin receptor, Computational and Structural Biotechnology Journal, 2022, 第 8 作者  通讯作者
(7) Structural basis of leukotriene B4 receptor 1 activation, Nature Communications, 2022, 第 5 作者
(8) Structures of the Omicron spike trimer with ACE2 and an anti-Omicron antibody, Science, 2022, 第 23 作者
(9) Structural insights into ligand binding and activation of the human thyrotropin-releasing hormone receptor, Cell Research, 2022, 第 7 作者
(10) Molecular basis for allosteric agonism and G protein subtype selectivity of galanin receptors, Nature Communications, 2022, 第 14 作者
(11) Why is the SARS-CoV-2 Omicron variant milder?, The Innovation, 2022, 第 4 作者
(12) Discovery of SARS-CoV-2-E channel inhibitors as antiviral candidates, Acta Pharmacology Sinica, 2022, 第 4 作者
(13) Insights into divalent cation regulation and G(13)-coupling of orphan receptor GPR35, Cell Discovery, 2022, 第 10 作者
(14) Structures of adenosine receptor A(2B)R bound to endogenous and synthetic agonists, Cell Discovery, 2022, 第 9 作者
(15) Hormone- and antibody-mediated activation of the thyrotropin receptor, Nature, 2022, 第 9 作者
(16) Structural identification of lysophosphatidylcholines as activating ligands for orphan receptor GPR119, Nature Structure & Molecular Biology, 2022, 第 5 作者
(17) AlphaFold2 versus experimental structures: evaluation on G protein-coupled receptors, Acta Pharmacology Sinica, 2022, 第 6 作者  通讯作者
(18) Molecular recognition of morphine and fentanyl by the human mu-opioid receptor, Cell, 2022, 第 21 作者
(19) Structural insights into the lipid and ligand regulation of serotonin receptors, Nature, 2021, 第 6 作者
(20) Mechanism of dopamine binding and allosteric modulation of the human D1 dopamine receptor, Cell Research, 2021, 第 8 作者
(21) SARS-CoV-2 envelope protein causes acute respiratory distress syndrome (ARDS)-like pathological damages and constitutes an antiviral target, Cell Research, 2021, 第 20 作者
(22) Structural insights into the human D1 and D2 dopamine receptor signaling complexes, Cell, 2021, 第 9 作者
(23) Allosteric Modulators Enhancing GLP-1 Binding to GLP-1R via a Transmembrane Site, ACS Chemical Biology, 2021, 第 3 作者
(24) Constitutive signal bias mediated by the human GHRHR splice variant 1, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 第 20 作者  通讯作者
(25) Structures of full-length glycoprotein hormone receptor signalling complexes, Nature, 2021, 第 3 作者
(26) Structures of the human dopamine D3 receptor-G(i) complexes, Molecular Cell, 2021, 第 15 作者  通讯作者
(27) Molecular insights into differentiated ligand recognition of the human parathyroid hormone receptor 2, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 第 2 作者
(28) Structural basis for activation of the growth hormone-releasing hormone receptor, Nature Communications, 2020, 第 7 作者
(29) CHARMM-GUI DEER facilitator for spin-pair distance distribution calculations and preparation of restrained-ensemble molecular dynamics simulations, Journal of Computational Chemistry, 2020, 第 3 作者
(30) Structure-based design of antiviral drug candidates targeting the SARS-CoV-2 main protease, Science, 2020, 第 15 作者
(31) Structure-Based Discovery of a Subtype-Selective Inhibitor Targeting a Transient Receptor Potential Vanilloid Channel, Journal of Medicinal Chemistry, 2019, 第 2 作者
(32) Allostery in Drug Development, Protein Allostery in Drug Discovery, 2019, 第 1 作者
(33) An allosteric ligand-binding site in the extracellular cap of K2P channels, Nature Communications, 2017, 第 3 作者
(34) Molecular dynamics simulation strategies for protein-micelle complexes, Biochimica et Biophysica Acta, 2016, 第 1 作者
(35) Solid-State NMR-Restrained Ensemble Dynamics of a Membrane Protein in Explicit Membranes, Biophysical Journal, 2015, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 基于动态构象的膜受体靶标机制研究及靶向药物设计, 负责人, 中国科学院计划, 2023-01--2025-12
( 2 ) 糖类药物及测序纳米孔设计, 负责人, 地方任务, 2021-01--2022-07
( 3 ) A类GPCR偏向调控机制的研究与小分子设计, 负责人, 中国科学院计划, 2018-03--2021-03
( 4 ) β2肾上腺素受体的选择性G蛋白偶联机制研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12
( 5 ) GPCR变构调节和偏向调节动态构象技术, 负责人, 国家任务, 2018-01--2020-01
参与会议
(1)人工智能及计算机辅助药物设计   第二十届全国神经精神药理学会学术交流会   2023-07-14