基本信息
王永翠 女 博导 中国科学院昆明植物研究所
电子邮件： wangyongcui@mail.kib.ac.cn
通信地址： 云南省昆明市盘龙区中国科学院昆明植物研究所
邮政编码：
招生信息
招生专业
100706-药理学
招生方向
计算机辅助药物设计，大数据医疗
教育背景
2005-09--2010-06 中国农业大学理学院 理学博士
2001-09--2005-06 山东大学数学与系统科学学院 理学学士
2001-09--2005-06 山东大学数学与系统科学学院 理学学士
工作经历
工作简历
2022-12~现在, 中国科学院昆明植物研究所, 研究员
2013-12~2014-12,美国维克尔森林医学院, 博士后
2013-10~2022-11,中国科学院西北高原生物研究所, 副研究员
2013-06~2013-12,美国国立卫生院癌症研究中心, 访问学者
2013-01~2013-06,美国堪萨斯大学, 访问学者
2010-07~2013-10,中国科学院西北高原生物研究所, 助理研究员
2013-12~2014-12,美国维克尔森林医学院, 博士后
2013-10~2022-11,中国科学院西北高原生物研究所, 副研究员
2013-06~2013-12,美国国立卫生院癌症研究中心, 访问学者
2013-01~2013-06,美国堪萨斯大学, 访问学者
2010-07~2013-10,中国科学院西北高原生物研究所, 助理研究员
专利与奖励
专利成果
（ 1 ） 中甸艾内酯B1-B17及其药物组合物和其制备方法与应用, 发明专利, 2023, 第 7 作者, 专利号: CN116478185A
（ 2 ） 一种药物的长非编码RNA靶点预测方法和系统, 2020, 第 1 作者, 专利号: CN107038350B
（ 2 ） 一种药物的长非编码RNA靶点预测方法和系统, 2020, 第 1 作者, 专利号: CN107038350B
出版信息
发表论文
（1） Systematic prediction of synergistic drug combinations through network-based deep learning framework, Expert Systems With Applications, 2025, 第 3 作者 通讯作者
（2） Compound-protein interaction prediction based on heterogeneous network reveals potential antihepatoma agents, iSciences, 2024, 第 1 作者
（3） Identification of drug responsive enhancers by predicting chromatin accessibility change from perturbed gene expression profiles, npj Systems Biology and Applications, 2024, 第 1 作者
（4） Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Artemyrianolide H Derivatives as Potential Antihepatoma Agents, BIOORGANIC CHEMISTRY, 2023, 第 6 作者
（5） 基于核方法的协同药物组合预测方法, 中国科学. 生命科学, 2023, 第 4 作者 通讯作者
（6） The genetic diversity, replication, and transmission of 2009 pandemic H1N1 viruses in China, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2023, 第 2 作者
（7） TCGA数据库四种消化系统癌症分子特征的比较, 中国免疫学杂志, 2022, 第 4 作者 通讯作者
（8） The molecular characteristics of gastric cancer patients living in Qinghai-Tibetan Plateau, BMC GASTROENTEROLOGY, 2022, 第 3 作者 通讯作者
（9） Computational Probing the Methylation Sites Related to EGFR Inhibitor-Responsive Genes, BIOMOLECULES, 2021, 第 3 作者 通讯作者
（10） DeepDRK: a deep learning framework for drug repurposing through kernel-based multi-omics integration, BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2021, 第 1 作者
（11） The Clinical and Molecular Characterization of Gastric Cancer Patients in Qinghai-Tibetan Plateau, FRONTIERS IN ONCOLOGY, 2020, 第 5 作者 通讯作者
（12） Associating lncRNAs with small molecules via bilevel optimization reveals cancer-related lncRNAs, PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2019, 第 1 作者
（13） Deep learning of the splicing (epi) genetic code reveals a novel candidate mechanism linking histone modifications to ESC fate decision, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2017, 第 2 作者
（14） Computational probing protein-protein interactions targeting small molecules, BIOINFORMATICS, 2016, 第 1 作者
（15） Network predicting drug's anatomical therapeutic chemical code, BIOINFORMATICS, 2013, 第 1 作者
（2） Compound-protein interaction prediction based on heterogeneous network reveals potential antihepatoma agents, iSciences, 2024, 第 1 作者
（3） Identification of drug responsive enhancers by predicting chromatin accessibility change from perturbed gene expression profiles, npj Systems Biology and Applications, 2024, 第 1 作者
（4） Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Artemyrianolide H Derivatives as Potential Antihepatoma Agents, BIOORGANIC CHEMISTRY, 2023, 第 6 作者
（5） 基于核方法的协同药物组合预测方法, 中国科学. 生命科学, 2023, 第 4 作者 通讯作者
（6） The genetic diversity, replication, and transmission of 2009 pandemic H1N1 viruses in China, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2023, 第 2 作者
（7） TCGA数据库四种消化系统癌症分子特征的比较, 中国免疫学杂志, 2022, 第 4 作者 通讯作者
（8） The molecular characteristics of gastric cancer patients living in Qinghai-Tibetan Plateau, BMC GASTROENTEROLOGY, 2022, 第 3 作者 通讯作者
（9） Computational Probing the Methylation Sites Related to EGFR Inhibitor-Responsive Genes, BIOMOLECULES, 2021, 第 3 作者 通讯作者
（10） DeepDRK: a deep learning framework for drug repurposing through kernel-based multi-omics integration, BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2021, 第 1 作者
（11） The Clinical and Molecular Characterization of Gastric Cancer Patients in Qinghai-Tibetan Plateau, FRONTIERS IN ONCOLOGY, 2020, 第 5 作者 通讯作者
（12） Associating lncRNAs with small molecules via bilevel optimization reveals cancer-related lncRNAs, PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2019, 第 1 作者
（13） Deep learning of the splicing (epi) genetic code reveals a novel candidate mechanism linking histone modifications to ESC fate decision, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2017, 第 2 作者
（14） Computational probing protein-protein interactions targeting small molecules, BIOINFORMATICS, 2016, 第 1 作者
（15） Network predicting drug's anatomical therapeutic chemical code, BIOINFORMATICS, 2013, 第 1 作者
科研活动
科研项目
（ 1 ） 基于机器学习的抗肝癌靶标预测及新颖倍半萜二聚体筛选, 负责人, 地方任务, 2024-03--2027-02
（ 2 ） 基于天然产物的抗肝癌与肝纤维化药物研发, 负责人, 中国科学院计划, 2022-12--2027-11
（ 3 ） 基于单细胞转录组数据重定位阿尔兹海默症药物, 负责人, 其他国际合作项目, 2022-05--2023-08
（ 4 ） 三江源国家公园澜沧江园区植物多样性调查, 负责人, 其他国际合作项目, 2022-01--2023-12
（ 5 ） 基于最优化方法预测长非编码RNA调控基因和其致癌机制的计算模型和算法研究, 负责人, 其他国际合作项目, 2020-01--2021-12
（ 6 ） 药物基因组学数据的整合和深度学习模型与算法研究, 负责人, 国家任务, 2017-01--2020-12
（ 7 ） 基于深度学习网络预测癌细胞对药物敏感度的计算模型和算法研究, 负责人, 地方任务, 2016-01--2018-12
（ 2 ） 基于天然产物的抗肝癌与肝纤维化药物研发, 负责人, 中国科学院计划, 2022-12--2027-11
（ 3 ） 基于单细胞转录组数据重定位阿尔兹海默症药物, 负责人, 其他国际合作项目, 2022-05--2023-08
（ 4 ） 三江源国家公园澜沧江园区植物多样性调查, 负责人, 其他国际合作项目, 2022-01--2023-12
（ 5 ） 基于最优化方法预测长非编码RNA调控基因和其致癌机制的计算模型和算法研究, 负责人, 其他国际合作项目, 2020-01--2021-12
（ 6 ） 药物基因组学数据的整合和深度学习模型与算法研究, 负责人, 国家任务, 2017-01--2020-12
（ 7 ） 基于深度学习网络预测癌细胞对药物敏感度的计算模型和算法研究, 负责人, 地方任务, 2016-01--2018-12
参与会议
（1）基于计算方法的植物天然产物候选药物分子筛选 第三届全国系统生物学大会会议 2023-09-24
（2）基于计算方法的药物研究 第二届高原生物学青年论坛 2021-01-14
（3）Drug study based on computational integration multi-source data 第十三届国际计算系统生物学会 2020-09-18
（2）基于计算方法的药物研究 第二届高原生物学青年论坛 2021-01-14
（3）Drug study based on computational integration multi-source data 第十三届国际计算系统生物学会 2020-09-18
指导学生
已指导学生
袁锐 硕士研究生 071002-动物学
刘菲 硕士研究生 071002-动物学
张竣 硕士研究生 071001-植物学
现指导学生
李盛珍 硕士研究生 105500-药学
和丽琴 硕士研究生 105500-药学