1. 复杂生物合成机器的机制解析、重构与应用

  脂肪酸合酶（FAS）与迭代式I型聚酮合酶（iT1PKS）演化同源，均为多结构域、多功能、超大分子合成机器。由于二者采用不同的迭代机理，导致合成的产物结构迥异。迭代机理主要包括迭代次数和迭代规则，前者控制链长，后者决定链修饰程度。本课题组重点研究迭代规则，即各结构域如何决定在特定迭代步骤中的“开/关”，最终实现可控重编程，合成定制分子。

2. 微生物活性分子生物合成基因簇资源开发

  微生物次级代谢蕴含种类丰富、数量巨大的生物合成基因簇，然而绝大部分基因簇常规条件下都是沉默不表达的，因此急需强大的技术、策略和方法予以激活，获得药用研发的先导活性分子，对抗日益严峻的全球化病菌耐药性。本课题组将利用超大片段DNA克隆技术激活沉默基因簇，发掘新颖结构天然产物，同时克隆并改造已有重要抗生素基因簇以期提高抗生素及其衍生物的产量。

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071010-生物化学与分子生物学

基因簇克隆激活与天然产物发现
脂肽类药物的合成生物学改造

2009-09--2016-01   中国科学院大学   博士学位
2005-09--2009-06   烟台大学   学士学位

   

2021-04~现在, 中国科学院微生物研究所, 研究员课题组长
2016-03~2021-03,美国伊利诺伊大学香槟分校, 博士后研究助理

   

（1） 中国科学院大学研究生国家奖学金, 国家级, 2015
（2） 中国科学院大学地奥奖学金一等奖, 一等奖, 研究所（学校）, 2015
（3） 中国科学院大学“三好学生标兵”荣誉称号, 研究所（学校）, 2015
（4） 中国科学院微生物研究所伊品生物奖学金, 研究所（学校）, 2015

   

（1） Cas12a-assisted precise targeted cloning using in vivo Cre-lox recombination, NATURE COMMUNICATIONS, 2021, 第 5 作者
（2） Unraveling the iterative type I polyketide synthases hidden in Streptomyces, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2020, 第 1 作者
（3） Activation of silent biosynthetic gene clusters using transcription factor decoys, NATURE CHEMICAL BIOLOGY, 2019, 第 1 作者
（4） Structure and Function of a C-C Bond Cleaving Oxygenase in Atypical Angucycline Biosynthesis, ACS CHEMICAL BIOLOGY, 2017, 第 7 作者
（5） Discovery of a Phosphonoacetic Acid Derived Natural Product by Pathway Refactoring, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2017, 第 3 作者
（6） Breaking the silence: new strategies for discovering novel natural products, CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY, 2017, 第 2 作者

（1） 6.07 - Activation of silent natural product biosynthetic gene clusters using synthetic biology tools, Elsevier, 2020-01, 第 1 作者

   

（ 1 ） 微生物天然产物药物, 负责人, 国家任务, 2023-03--2026-12
（ 2 ） 解析β,γ-脱水反应的酶学机制及其分子基础, 负责人, 国家任务, 2023-01--2026-12
（ 3 ） 新发、突发和耐药病原体的新型微生物药物创制, 参与, 国家任务, 2023-01--2024-12
（ 4 ） 黏细菌基因编辑技术开发与资源挖掘, 负责人, 研究所自主部署, 2022-07--2024-06
（ 5 ） β,γ-脱水机理研究与DHA产量提高, 负责人, 研究所自主部署, 2021-01--2023-12
（ 6 ） 微生物天然产物药物, 负责人, 中国科学院计划, 2023-03--2026-12

（1）A Targeted Genome-Mining Strategy in Natural Product Discovery   2024-04-18
（2）A Transcription Factor Decoy Strategy for Activation of Streptomyces Polyketide and Non-Ribosomal Peptide Gene Clusters    2018-10-28
（3）A study of the B-ring contraction mechanism in the kinamycin class antibiotics   2014-12-04
（4）A study of the mechanism of kinamycin biosynthesis   2013-04-09