基本信息
田晨曦  女  博导  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
电子邮件: tiancx@big.ac.cn
通信地址: 中国科学院北京基因组研究所
邮政编码:

研究领域

田晨曦长期从事肿瘤微环境细胞-环境互作的生物信息和基础转化研究,主要研究成果包括:(1)开发针对微环境胞外基质蛋白(ECM)的质谱方法,在胰腺导管腺癌患者样本中首次揭示了肿瘤发生发展过程中的ECM蛋白的丰度变化,为疾病的早期诊断和治疗提供了靶点;进一步利用ECM靶点筛选纳米抗体用于肿瘤的靶向(PNAS, 2019a; PNAS,2019b;Cancer Res, 2023); (2)揭示肿瘤上皮细胞来源ECM的促癌及癌转移的功能(Cancer Res, 2020); (3)针对ECM蛋白酶切检测技术的困难,开发基于质谱的多肽分析方法 (Nature Commun 2021) 田晨曦课题组以解析肿瘤中免疫细胞与所在组织细胞与非细胞微环境互作为出发点,专注于空间多组学方法、不同平台数据整合算法的开发以及多组学在解构肿瘤微环境的应用。


招生信息

   
招生专业
0710Z1-基因组学
0710J3-生物信息学
招生方向
肿瘤微环境,ECM
空间多组学
纳米抗体,生物工程

教育背景

2006-08--2013-01   康奈尔大学(Cornell University)   博士学位
2002-08--2006-07   清华大学   学士学位

工作经历

   
工作简历
2018-01~2020-11,麻省理工学院(MIT), 研究科学家
2013-01~2018-01,麻省理工学院(MIT), 博士后

教授课程

分子细胞生物学

专利与奖励

   
奖励信息
(1) AACR-Bristol-Myers-Squibb Oncology Scholar-in-Training Award, 国家级, 2015
(2) Damon Runyon Cancer Research Foundation Postdoctoral Award, 国家级, 2014
(3) Ludwig Foundation Postdoctoral Award, , 国家级, 2013

出版信息

   
发表论文
[1] Hong, Ting, Su, Wei, Pan, Yitong, Tian, Chenxi, Lei, Guang. Aging-related features predict prognosis and immunotherapy efficacy in hepatocellular carcinoma. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY[J]. 2022, 第 4 作者  通讯作者  13: http://dx.doi.org/10.3389/fimmu.2022.951459.
[2] Tian, Chenxi, Huang, Ying, Clauser, Karl R, Rickelt, Steffen, Lau, Allison N, Carr, Steven A, Vander Heiden, Matthew G, Hynes, Richard O. Suppression of pancreatic ductal adenocarcinoma growth and metastasis by fibrillar collagens produced selectively by tumor cells. NATURE COMMUNICATIONS[J]. 2021, 第 1 作者12(1): https://doaj.org/article/cbed56b38aff4504b548e616901c398d.
[3] Tian, Chenxi, Ohlund, Daniel, Rickelt, Steffen, Lidstrom, Tommy, Huang, Ying, Hao, Liangliang, Zhao, Renee T, Franklin, Oskar, Bhatia, Sangeeta N, Tuveson, David A, Hynes, Richard O. Cancer Cell-Derived Matrisome Proteins Promote Metastasis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma. CANCER RESEARCH[J]. 2020, 第 1 作者80(7): 1461-1474, http://dx.doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-19-2578.
[4] Tian Chenxi. Proteomic study of ECM during pancreatic cancer progression reveals different contributions by tumor and stromal cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 具有空间位置信息的单细胞转录组与染色质可及性技术与分析方法开发, 负责人, 国家任务, 2023-12--2028-11
( 2 ) 肿瘤细胞簇基质微环境的功能解析, 负责人, 国家任务, 2024-01--2027-12
( 3 ) 免疫治疗效应相关肿瘤胞外基质微环境的发现与 解构, 负责人, 地方任务, 2023-11--2026-11

指导学生

现指导学生

王志文  硕士研究生  0710Z1-基因组学  

龚锦钰  硕士研究生  0710Z1-基因组学  

潘钇橦  博士研究生  0710Z1-基因组学  

李俊  博士研究生  0710Z1-基因组学