大数据+AI+数理模型探索跨尺度生命系统的底层原理和理性设计原则；

抗生素耐药基因传播的遗传决定因子和生态学规律；

原核生命体系的长期演化。

   

071005-微生物学
083100-生物医学工程
0710J3-生物信息学

微生物群落，细菌耐药性
数学物理模型，系统生物学，定量合成生物学
生物信息学

2017-08--2022-12   杜克大学   生物医学工程博士
2011-09--2015-07   北京大学   生物科学学士

博士研究生

生物医学工程博士

   

2023-02~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所, 副研究员
2015-07~2017-08,北京大学定量生物中心, 研究助理

   

（1） Horizontal gene transfer is predicted to overcome the diversity limit of competing microbial species, NATURE COMMUNICATIONS, 2024, 通讯作者
（2） A generic approach to infer community-level fitness of microbial genes, Proceedings of the National Academy of Sciences, 2024, 第 1 作者
（3） Duplicated antibiotic resistance genes reveal ongoing selection and horizontal gene transfer in bacteria, Nature Communications, 2024, 第 3 作者
（4） Mapping single-cell responses to population-level dynamics during antibiotic treatment, MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY, 2023, 第 2 作者
（5） Promotion of plasmid maintenance by heterogeneous partitioning of microbial communities, CELL SYSTEMS, 2023, 第 2 作者
（6） Intra- and interpopulation transposition of mobile genetic elements driven by antibiotic selection, NATURE ECOLOGY & EVOLUTION, 2022, 第 5 作者
（7） Bringing cells to the edge, ELIFE, 2022, 第 1 作者
（8） Horizontal gene transfer enables programmable gene stability in synthetic microbiota, NATURE CHEMICAL BIOLOGY, 2022, 第 1 作者
（9） Predicting plasmid persistence in microbial communities by coarse-grained modeling, BIOESSAYS, 2021, 第 1 作者
（10） The persistence potential of transferable plasmids, NATURE COMMUNICATIONS, 2020, 第 1 作者

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（1）基因交换菌群中多样性与稳定性的涌现机制   2024年微生物与合成生物学交流研讨会   2024-01-06
（2）Survival game of selfish genetic elements in microbiome   2023-08-05
（3）Occupancy-abundance scaling disentangles deterministic and stochastic forces underlying microbiota assembly   2023-08-01
（4）Occupancy-abundance scaling disentangles deterministic and stochastic forces underlying microbiota assembly   Qbio国际定量生物学会议   2023-07-29
（5）复杂菌群内水平基因流动的定量规律与定向调控   中国肠道大会2023   2023-05-21