基本信息
谭生军  男    中国科学院动物研究所
电子邮件: tanshengjun@ioz.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号院5号A625
邮政编码: 100101

研究领域

主要围绕转座子驱动基因组进化的机制进行了系统研究:发现逆转座子和DNA转座子都能介导产生嵌合的重复基因,并提出了两个新模型(Genome Research 2016,Nature Communications 2021,JGG 2023);系统挖掘100多个动物基因组中的DNA转座子,筛选到40个在人源细胞中具有转座活性的新型元件,拓展了相关基因编辑工具(Cell 2024);通过合作开发基于转座酶Tn5的三代测序建库技术,实现了无需扩增、100纳克DNA的测序方法,完成了单只果蝇及共生菌的组装,并发现了转座子介导结构变异的新机制(Nature Communications 2024);对高通量测序的错误率进行综述(GPB 2024)。

 

目前进行的研究:开发检测串联重复变异的算法,鉴定复杂重复机制的新模型,解析突变机制如何影响重复序列的演化,尝试发展新的突变理论;研发可高效敲入外源基因的DNA转座子载体工具及具有位点特异性的RNA转座子载体。


招生信息

生物信息学,遗传与进化,基因组学

教育背景

2007-09--2012-06   南京大学   博士
2003-09--2007-06   南京大学   学士

工作经历

   
工作简历
2020-08~现在, 中国科学院动物研究所, 副研究员
2012-06~2020-08,中国科学院动物研究所, 助理研究员

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 活性DNA转座子系统及其使用方法, 发明专利, 2023, 第 3 作者, 专利号: CN115698301A

( 2 ) ACTIVE DNA TRANSPOSON SYSTEMS AND METHODS FOR USE THEREOF, 发明专利, 2021, 第 3 作者, 专利号: WO/2021/197342

( 3 ) 一种用于PacBio测序的文库构建方法, 发明专利, 2021, 第 3 作者, 专利号: CN113136416A

出版信息

   
发表论文
[1] 贾行星, 谭生军, 张勇. Chasing Sequencing Perfection: Marching Toward Higher Accuracy and Lower Costs. Genomics, Proteomics & Bioinformatics[J]. 2024, 第 2 作者qzae024: 
[2] Huijing Ma, Mengxia Wang, Yong E Zhang, Shengjun Tan. The power of "controllers": Transposon-mediated duplicated genes evolve towards neofunctionalization. JOURNAL OF GENETICS AND GENOMICS[J]. 2023, 第 4 作者  通讯作者  http://dx.doi.org/10.1016/j.jgg.2023.04.003.
[3] Shengjun Tan, Huijing Ma, Jinbo Wang, Man Wang, Mengxia Wang, Haodong Yin, Yaqiong Zhang, Xinying Zhang, Jieyu Shen, Danyang Wang, Graham L Banes, Zhihua Zhang, Jianmin Wu, Xun Huang, Hua Chen, Siqin Ge, ChunLong Chen, Yong E Zhang. DNA transposons mediate duplications via transposition-independent and -dependent mechanisms in metazoans. NATURE COMMUNICATIONS[J]. 2021, 第 1 作者12(1): http://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-24585-9.
[4] Tan, Shengjun, CardosoMoreira, Margarida, Shi, Wenwen, Zhang, Dan, Huang, Jiawei, Mao, Yanan, Jia, Hangxing, Zhang, Yaqiong, Chen, Chunyan, Shao, Yi, Leng, Liang, Liu, Zhonghua, Huang, Xun, Long, Manyuan, Zhang, Yong E. LTR-mediated retroposition as a mechanism of RNA-based duplication in metazoans. GENOME RESEARCH[J]. 2016, 第 1 作者26(12): 1663-1675, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000389563000004.
[5] Zhu, Zhenglin, Tan, Shengjun, Zhang, Yaqiong, Zhang, Yong E. LINE-1-like retrotransposons contribute to RNA-based gene duplication in dicots. SCIENTIFIC REPORTS[J]. 2016, 第 2 作者6: https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000374500700001.
[6] Li, Luolan, Memon, Shabana, Fan, Yuanchu, Yang, Sihai, Tan, Shengjun. Recent duplications drive rapid diversification of trypsin genes in 12 Drosophila. GENETICA[J]. 2012, 第 5 作者  通讯作者  140(7-9): 297-305, http://dx.doi.org/10.1007/s10709-012-9682-5.