基本信息

齐美芳 女 中国科学院上海营养与健康研究所
电子邮件: mfqi@sinh.ac.cn
通信地址: 上海市徐汇区岳阳路320号
邮政编码: 200031
电子邮件: mfqi@sinh.ac.cn
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研究领域
通过开发和整合各种组学技术,实验室聚焦于分析基因组变异对癌症等疾病的影响;分析癌症性别差异的分子机理以及探索可能的治疗方案。
主要的研究方向为:
(1)整合多种组学数据,分析Y染色体丢失对癌症以及克隆性造血进程的影响;
(2)通过基因组变异以及转录组等数据,分析癌症中不同性别差异的分子机理;
(3)探索癌症新型治疗方案和开发新药;
(4)开发二代测序以及单细胞测序染色体变异相关的计算方法,衡量染色体变异的进化以及对疾病的影响。
招生信息
招生专业
0710Z1-基因组学
0710J3-生物信息学
0710Z2-计算生物学
0710J3-生物信息学
0710Z2-计算生物学
招生方向
基因组学,生物信息学,计算生物学
教育背景
2013-09--2019-01 中国科学院大学 遗传学博士学位
2009-09--2013-07 华东理工大学 生命科学学士学位
2009-09--2013-07 华东理工大学 生命科学学士学位
工作经历
工作简历
2024-01~现在, 中国科学院上海营养与健康研究所, 研究员
2019-08~2023-11,美国哈佛医学院附属麻省总医院, 博士后研究员
2019-08~2023-11,美国哈佛医学院附属麻省总医院, 博士后研究员
专利与奖励
专利成果
( 1 ) 基于表观组信息低成本组装解析生物核心基因组信息, 2023, 第 2 作者, 专利号: CN110317856B
出版信息
发表论文
(1) Loss of chromosome Y in primary tumors, CELL, 2023, 第 1 作者
(2) Genomics of PDGFR-rearranged hypereosinophilic syndrome, BLOOD ADVANCES, 2023, 第 2 作者
(3) cDNA-detector: detection and removal of cDNA contamination in DNA sequencing libraries, BMC BIOINFORMATICS, 2021, 第 1 作者
(4) Plant Regulomics: a data-driven interface for retrieving upstream regulators from plant multi-omics data, PLANT JOURNAL, 2020, 第 7 作者
(5) Polycomb repressive complex 2 attenuates ABA-induced senescence in Arabidopsis, PLANT JOURNAL, 2019, 第 7 作者
(6) CGT-seq: epigenome-guided de novo assembly of the core genome for divergent populations with large genome, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2018, 第 1 作者
(7) GSHR, a Web-Based Platform Provides Gene Set-Level Analyses of Hormone Responses in Arabidopsis, FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2018, 第 3 作者
(8) Divergent regeneration‐competent cells adopt a common mechanism for callus initiation in angiosperms, REGENERATION, 2017, 第 6 作者
(9) CARMO: a comprehensive annotation platform for functional exploration of rice multi-omics data, PLANT JOURNAL, 2015, 第 2 作者
(2) Genomics of PDGFR-rearranged hypereosinophilic syndrome, BLOOD ADVANCES, 2023, 第 2 作者
(3) cDNA-detector: detection and removal of cDNA contamination in DNA sequencing libraries, BMC BIOINFORMATICS, 2021, 第 1 作者
(4) Plant Regulomics: a data-driven interface for retrieving upstream regulators from plant multi-omics data, PLANT JOURNAL, 2020, 第 7 作者
(5) Polycomb repressive complex 2 attenuates ABA-induced senescence in Arabidopsis, PLANT JOURNAL, 2019, 第 7 作者
(6) CGT-seq: epigenome-guided de novo assembly of the core genome for divergent populations with large genome, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2018, 第 1 作者
(7) GSHR, a Web-Based Platform Provides Gene Set-Level Analyses of Hormone Responses in Arabidopsis, FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2018, 第 3 作者
(8) Divergent regeneration‐competent cells adopt a common mechanism for callus initiation in angiosperms, REGENERATION, 2017, 第 6 作者
(9) CARMO: a comprehensive annotation platform for functional exploration of rice multi-omics data, PLANT JOURNAL, 2015, 第 2 作者