主要从事高精度模拟底盘细胞重要生理过程的数据模型构建和指导细胞设计的网站工具开发等研究，在细胞模型的构建和分析，特定菌种知识库开发、途径和代谢改造靶点设计等方面取得了一系列成果。

   

071005-微生物学

细胞模型构建；知识库构建

2013-09--2020-01   中国科学院大学   博士
2008-09--2013-07   哈尔滨医科大学   学士

   

2023-09~现在, 中国科学院天津工业生物技术研究所, 副研究员
2022-07~2023-09,中国科学院天津工业生物技术研究所, 助理研究员
2020-01~2022-07,中国科学院天津工业生物技术研究所, 博士后

   

（1） DeepSub: Utilizing Deep Learning for Predicting the Number of Subunits in Homo-Oligomeric Protein Complexes, International Journal of Molecular Science, 2024, 通讯作者
（2） Construction of an enzyme-constrained metabolic network model for Myceliophthora thermophila using machine learning-based k(cat) data, Microbial Cell Factories, 2024, 第 1 作者
（3） ECMpy 2.0: A Python package for automated construction and analysis of enzyme-constrained models, Synthetic and Systems Biotechnology, 2024, 通讯作者
（4） Omics data analysis reveals the system-level constraint on cellular amino acid composition. Synthetic and Systems Biotechnology, Synthetic and Systems Biotechnology, 2024, 通讯作者
（5） ecBSU1: A Genome-Scale Enzyme-Constrained Model of Bacillus subtilis Based on the ECMpy Workflow, Microorganisms, 2023, 第 1 作者
（6） CAVE: a cloud-based platform for analysis and visualization of metabolic pathways, Nucleic Acids Research, 2023, 第 1 作者
（7） ERMer: a serverless platform for navigating, analyzing, and visualizing Escherichia coli regulatory landscape through graph database, Nucleic Acids Research, 2022, 第 1 作者
（8） Construction and Analysis of an Enzyme-Constrained Metabolic Model of Corynebacterium glutamicum, Biomolecules, 2022, 通讯作者
（9） ECMpy, a Simplified Workflow for Constructing Enzymatic Constrained Metabolic Network Model, Biomolecules, 2022, 第 1 作者
（10） Integrating thermodynamic and enzymatic constraints into genome-scale metabolic models, Metabolic Engineering,, 2021, 第 1 作者

   

（ 1 ） 数据驱动的高精度多约束代谢网络模型构建, 负责人, 国家任务, 2024-01--2026-12
（ 2 ） 固碳酶元件数据库与智能设计, 负责人, 国家任务, 2023-02--2026-01