基本信息
罗小舟  男  博导  中国科学院深圳先进技术研究院
电子邮件: xz.luo@siat.ac.cn
通信地址: 广东省深圳市南山区西丽大学城学苑大道1068号
邮政编码:

研究领域

酶的定向化、蛋白质工程、高通量筛选以及天然及非天然化合物的生物全合成


招生信息

   
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
071005-微生物学
071009-细胞生物学
招生方向
合成生物学,定向进化,蛋白质工程,高通量筛选,生物合成

教育背景

2010-08--2016-05   斯克里普斯研究所   博士
2006-08--2010-05   南洋理工大学   学士

工作经历

   
工作简历
2019-09~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院, 研究员
2016-09~2019-09,斯克里普斯研究所, 博士后
2016-09~2019-09,加州大学伯克利分校, 博士后

教授课程

合成生物学导论
合成生物学

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 合成启动子及其构建方法和应用, 发明专利, 2023, 第 4 作者, 专利号: CN202011284753.1

( 2 ) 谷氨酸脱羧酶突变体及在生产γ-氨基丁酸中的应用, 发明专利, 2022, 第 4 作者, 专利号: CN202210677091.7

( 3 ) 一步法生产γ-氨基丁酸的方法及其菌株构建, 发明专利, 2022, 第 4 作者, 专利号: CN202210677092.1

( 4 ) 一种改造谷氨酸棒杆菌启动子的重组菌株及其构建方法与产L-氨基酸的应用, 发明专利, 2023, 第 1 作者, 专利号: CN202110256579.8

( 5 ) 一种提高酿酒酵母中异源蛋白分泌或表面展示表达的方法, 发明专利, 2023, 第 2 作者, 专利号: CN202010261091.X

( 6 ) 制备具有梯度活性的半乳糖诱导合成启动子的方法、及其制备的启动子、应用, 发明专利, 2023, 第 4 作者, 专利号: CN202010235332.3

出版信息

   
发表论文
(1) Elucidation of genes enhancing natural product biosynthesis through co - evolution analysis, Nature Metabolism, 2024, 通讯作者
(2) Co-evolved genes improve the biosynthesis of secondary metabolites, Nature Metabolism, Nature Metabolism, 2024, 第 2 作者
(3) Engineering yeast for the de novo synthesis of jasmonates, Nature Synthesis, 2024, 通讯作者
(4) Pathway Evolution Through a Bottlenecking ‐ Debottlenecking Strategy and Machine Learning ‐Aided Flux Balancing, Advanced Science, 2024, 通讯作者
(5) UniKP: a unified framework for the prediction of enzyme kinetic parameters, Nature Communications, 2023, 通讯作者
(6) One-pot selective biosynthesis of Tyrian purple in Escherichia coli, Metabolic Engineering, 2023, 通讯作者
(7) Dynamic upregulation of the rate -limiting enzyme for valerolactam biosynthesis in Corynebacterium glutamicum, Metabolic Engineering, 2023, 通讯作者
(8) Systematic genetic modifications of cell wall biosynthesis enhanced the secretion and surface -display of polysaccharide degrading enzymes in Saccharomyces cerevisiae, Metabolic Engineering, 2023, 通讯作者
(9) Development of an efficient yeast platform for cannabigerolic acid biosynthesis, Metabolic Engineering, 2023, 通讯作者
(10) IPPF-FE: an integrated peptide and protein function prediction framework based on fused features and ensemble models, Briefings in Bioinformatics, 2023, 通讯作者
(11) Creation of a Yeast Strain with Co - Translationally Acylated Nucleosomes, Angewandte Chemie International Edition, 2022, 通讯作者
(12) Harnessing nature's biosynthetic capacity to facilitate total synthesis, National Science Review, 2022, 通讯作者
(13) 面向合成生物学的机器学习方法及应用, Machine learning for synthetic biology:Methods and applications, 科学通报, 2021, 第 6 作者
(14) 代谢工程改造酿酒酵母底盘细胞, Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae chassis, 科学通报, 2021, 第 5 作者
(15) Expanding the Structural Diversity of Protein Building Blocks with Noncanonical Amino Acids Biosynthesized from Aromatic Thiols, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2021, 第 10 作者
(16) Promoter Architecture and Promoter Engineering in Saccharomyces cerevisiae, METABOLITES, 2020, 通讯作者
(17) Promoter Architecture and Promoter Engineering in Saccharomyces cerevisiae, Metabolites, 2020, 第 7 作者
(18) Complete biosynthesis of cannabinoids and their unnatural analogues in yeast, NATURE, 2019, 第 1 作者
(19) Genetically encoding phosphotyrosine and its nonhydrolyzable analog in bacteria, NATURE CHEMICAL BIOLOGY, 2017, 第 1 作者
(20) Recombinant thiopeptides containing noncanonical amino acids, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2016, 第 1 作者
(21) Stabilizing Protein Motifs with a Genetically Encoded Metal-Ion Chelator, CELL CHEMICAL BIOLOGY, 2016, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 抗肿瘤、抗感染等活性天然产物的微生物高效制造, 负责人, 国家任务, 2019-07--2024-06
( 2 ) 非天然原核生物的构建, 参与, 国家任务, 2020-01--2024-12
( 3 ) 杂萜类化合物结构多样性的产生机制及其生物合成, 负责人, 国家任务, 2021-01--2024-12
( 4 ) 基于定向进化构建高产大麻萜酚的酿酒酵母菌株(广东省杰青项目), 负责人, 地方任务, 2021-01--2024-12
( 5 ) 大肠杆菌中牛磺酸的高效合成及其代谢调控机理的研究(深圳市优青项目), 负责人, 地方任务, 2021-04--2024-04
( 6 ) 国家重大人才工程专家-青年项目, 负责人, 国家任务, 2022-01--2024-12
( 7 ) 2021年国家引才计划青年项目-中科院配套, 负责人, 中国科学院计划, 2022-01--2024-12
( 8 ) 深圳市微生物药物智能制造重点实验室, 参与, 地方任务, 2022-04--2024-04
( 9 ) 微生物制造联合实验室, 负责人, 境内委托项目, 2018-12--2021-12
( 10 ) 合成生物化学应用联合创新中心, 负责人, 境内委托项目, 2022-11--2024-11
( 11 ) 中国科学院深圳先进技术研究院-荟来生物科技(深圳)有限公司联合实验室, 负责人, 境内委托项目, 2022-08--2025-08

指导学生

已指导学生

余函  硕士研究生  086000-生物与医药  

现指导学生

吴燕玲  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

陈燕  硕士研究生  071000-生物学  

林淑敏  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学