主要研究高性能计算机系统结构，包括：近存计算芯片与系统（PIM），RISC-V AI领域专用架构（DSA），算法-架构-工艺跨层优化

081201-计算机系统结构

高性能计算机系统结构，领域专用架构，近存并行计算架构，大模型并行计算架构，算法-架构-工艺跨层性能优化

2018-10--2022-08   美国加州大学圣塔芭芭拉分校   公派联合培养博士生
2014-09--2021-06   中国科学院计算技术研究所   工学博士
2010-09--2014-06   中国地质大学（武汉）（李四光计划）   工学学士

2024-01~2025-01,中国科学院重大科技任务局信息科技处, 业务主管（借调）
2023-09~现在, 中国科学院计算技术研究所, 副研究员，硕士生导师（2024年1月起），课题组长
2021-07~2023-07,中国科学院计算技术研究所, 助理研究员（特别研究助理），助理研究员（2023年7月起），课题组长

2023-12-31-2027-12-30,中国计算机学会高性能计算专委会, 执行委员

（1） BlockPIM: Optimizing Memory Management for PIM-enabled Long-Context LLM Inference, DAC'25: Design Automation Conference, 2025, 
（2） FuHsi: Shifting Base-calling Closer to Sequencer via In-Cache Acceleration, JCST: Journal of Computer Science and Technology, 2025, 
（3） BeeZip: Towards An Organized and Scalable Architecture for Data Compression, ASPLOS'24: Proceedings of the 29th ACM International Conference on Architectural Support for Programming Languages and Operating Systems, 2024, 
（4） ProXplore: A GPU-Enhanced Protein Discovery Engine, BIBM'24: International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, 2024, 
（5） CoPIM: A Collaborative Scheduling Framework for Commodity Processing-in-memory Systems, ICCD'24: IEEE International Conference on Computer Design, 2024, 
（6） LazyCAT: Efficient Fine-Grained Cache Partitioning with Two Boundaries, HPCC'24: IEEE International Conference on High Performance Computing and Communications, 2024, 第 2 作者
（7） Accelerating k-Shape Time Series Clustering Algorithm Using GPU, TPDS: IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems, 2023, 
（8） TransCaller: An End-to-end Accelerated Transformer-based Nanopore Basecaller on GPUs., BIBM'23: IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, 2023, 
（9） NvWa: Enhancing Sequence Alignment Accelerator Throughput via Hardware Scheduling, HPCA'23: IEEE International Symposium on High-Performance Computer Architecture, 2023, 
（10） MetaZip: a high-throughput and efficient accelerator for DEFLATE, DAC'22: Design Automation Conference, 2022, 
（11） AlphaSparse: Generating High Performance SpMV Codes Directly from Sparse Matrices, SC'22: International Conference for High Performance Computing, Networking, Storage, and Analysis, 2022, 第 4 作者
（12） PIM-Align: A Processing-in-Memory Architecture for FM-Index Search Algorithm, JCST: Journal of Computer Science and Technology, 2021, 第 1 作者
（13） MEDAL: Scalable DIMM based Near Data Processing Accelerator for DNA Seeding Algorithm, MICRO'19: IEEE/ACM International Symposium on Microarchitecture, 2019, 第 2 作者
（14） Efficient System Architecture in the Era of Monolithic 3D: Dynamic Inter-tier Interconnect and Processing-in-Memory, DAC'19: Design Automation Conference, 2019, 第 5 作者
（15） High-performance genomic analysis framework with in-memory computing, PPoPP'18: Proceedings of the 23rd ACM SIGPLAN Symposium on Principles and Practice of Parallel Programming, 2018, 第 1 作者
（16） Accelerating FM-index Search for Genomic Data Processing, ICPP'18: International Conference on Parallel Processing, 2018, 第 2 作者

（1） 院士解锁中国科技：看得见的信息世界, 中国少年儿童出版社, 2023-01, 第 其他 作者

（ 1 ） 存储与计算融合之课题：架构与系统, 参与, 国家任务, 2025-01--2029-12
（ 2 ） 混合精度高能效存算一体芯片架构及关键技术之课题：面向存算一体架构的EDA方法研究, 参与, 国家任务, 2025-01--2029-12
（ 3 ） 制高点R专项, 参与, 国家任务, 2024-01--2030-12
（ 4 ） 面向基因比对的存算一体架构关键技术研究, 负责人, 国家任务, 2023-01--2025-12
（ 5 ） 超异构软硬件协同计算统一框架之子课题：领域专用加速器跨层优化关键技术研究, 负责人, 国家任务, 2022-10--2025-10
（ 6 ） 面向基因组学大数据的存算一体关键技术研究（博新计划）, 负责人, 国家任务, 2021-07--2023-07

现指导学生

聂鑫磊  硕士研究生  085400-电子信息  

杨帆  硕士研究生  085400-电子信息  

1. 2024年，高睿昊，国家奖学金

2. 2024年，高睿昊，所长特别奖

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