基本信息
刘青  女  硕导  中国科学院华南植物园
电子邮件: liuqing@scib.ac.cn
通信地址: 广州市天河区兴科路723号
邮政编码: 510650

研究领域

    面向作物遗传资源发掘的国家需求,聚焦植物进化生物学研究领域,开展植物基因组学和分子细胞遗传学研究,建立作物及近缘种亲缘关系鉴定体系。

招生信息

         主要从事植物基因组学和分子细胞遗传学研究。近期成果有:绘制燕麦野生种基因密码图谱 (Scientific Data, 2024, 4:11);重构禾本科早熟禾亚科的进化史 (BMC Plant Biol, 2023, 23:627);确证燕麦野生种核基因组与线粒体基因组间存在基因交流 (BMC Plant Biology, 2023 23:218)评述多倍体植物进化和生态学研究进展 (Annals of Botany, 2023, 131: 1–10);发布首个象腿蕉染色体级别基因组序列 (GigaScience, 2022, 11:giac027);解析燕麦属叶绿体基因组变异的三大动力 (BMC Plant Biology, 2020, 20: 406);鉴定燕麦D基因组特异重复探针Ast-R116 Ast-R171 (BMC Plant Biology, 2019,19:226)与欧洲和美国相关领域的专家具有广泛的联系和长期合作关系,招生事宜请与刘青老师直接联系。

招生专业
071007-遗传学
071001-植物学
招生方向
植物学,植物遗传育种学
植物学
园艺学

教育背景

2002-03--2005-03   中国科学院华南植物园   博士
1998-09--2001-07   中国科学院华南植物园   硕士
学历

-- 研究生

学位

-- 博士

工作经历

2001.07-2005.07

中国科学院华南植物园

研究实习员、助理研究员

2006.07-09  

美国史密森学会 (Smithsonian   Institution)

访问学者

2009.07-2010.07

美国史密森学会 (Smithsonian   Institution)

访问学者

2012.08-2013.02 

美国史密森学会 (Smithsonian   Institution)

访问学者

2016.11-2017.10  

英国莱斯特大学 (University of   Leicester)

访问学者

2005.08-至今

中国科学院华南植物园

副研究员、陈焕镛研究员

工作简历
2016-11~2017-10,莱斯特大学University of Leicester, 访问学者
2012-08~2013-01,史密森学会Smithsonian Institution, 访问学者
2009-07~2010-07,史密森学会Smithsonian Institution, 访问学者
2001-07~现在, 中国科学院华南植物园, 助理研究员,副研究员,青年研究员,陈焕镛研究员
社会兼职
2024-06-18-今,《作物育种,遗传学和基因组学》, 编委
2024-03-29-2024-12-28,Frontiers in Genetics专刊Applied Research on Plant Organelle Genomes and Key Genes, 客座编辑
2022-11-28-2022-12-30,Annals of Botany专刊Polyploidy in Ecology and Evolution, 客座编辑
2022-06-15-今,广东省农业农村厅, 会议评委
2021-06-27-2024-04-21,《热带亚热带学报学报》, 编委
2016-04-08-今,国家自然科学基金项目, 通讯评委
2016-03-26-今,中国农业国际合作促进会(农促会, CAPIAC), 专家顾问团顾问
2015-03-29-今,广东省科技厅, 会议评委

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 优秀研究生导师, , 院级, 2018
(2) 美国史密森学会访问学者奖, , 其他, 2006

出版信息

1.     Cui Dongli, Xiong Gui, Ye Lyuhan, Richard Gornall, Trude Schwarzacher, John Seymour (Pat) Heslop-Harrison*, Liu Qing*. Genome-wide analysis of flavonoid biosynthetic genes in Musaceae (Ensete, Musella, and Musa species) reveals amplification of flavonoid 3’5’-hydroxylase. AoB Plants, 2024,16(5), plae049.

2.     Liu Qing*, Xiong Gui, Wang Ziwei, Wu Yongxing, Tu Tieyao, Trude Schwarzacher, John Seymour (Pat) Heslop-Harrison*. Chromosome-level genome assembly of the diploid oat species Avena longiglumis. Scientific Data, 2024, 11, 421.

3.     Zhou Shuyu, Katja R. Richert-Poggeler, Wang Ziwei, Trude Schwarzacher, John Seymour (Pat) Heslop-Harrison*, Liu Qing*. High throughput RNA sequencing discovers symptomatic and latent viruses: an example from ornamental Hibiscus. Acta Horticulturae, 2024, 1392, 25–36.

4.     Liu Qing*, Ye Lyuhan, Li Mingzhi, Wang Ziwei, Gui Xiong, Ye Yushi, Tu Tieyao, Trude Schwarzacher, John Seymour (Pat) Heslop-Harrison*. Genome-wide expansion and reorganization during grass evolution: from 30 Mb chromosomes in rice and Brachypodium to 550 Mb in Avena. BMC Plant Biology, 2023, 23(1): 627.

5.     Liu Qing*, Yuan Hongyu, Xu Jiaxin, Cui Dongli, Xiong Gui, Trude Schwarzacher, John Seymour Heslop-Harrison*. The mitochondrial genome of the diploid oat Avena longiglumis. BMC Plant Biology, 2023, 23(1): 218.

6.     John Seymour Heslop-Harrison, Trude Schwarzacher, Liu Qing*. Polyploidy: its consequences and enabling role in plant diversification and evolution. Annals of Botany, 2023, 131(1): 110.

7.     Wang Ziwei, Mathieu Rouard, Manosh Kumar Biswas, Gaetan Droc, Cui Dongli, Nicolas Roux, Franc-Christophe Baurens, Ge Xuejun, Trude Schwarzacher, Pat (J.S.) Heslop-Harrison*, Liu Qing*. A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity and chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae. GigaScience, 2022, 11(1): giac027.

8.     Liu Qing*, Li Xiaoyu, Li Mingzhi, Xu Wenkui, Trude Schwarzacher, John Seymour Heslop-Harrison*. Comparative chloroplast genome analyses of Avena: insights into evolutionary dynamics and phylogeny. BMC Plant Biology, 2020, 20(1): 406.

9.     Liu Qing*, Li Xiaoyu, Zhou Xiangying, Li Mingzhi, Zhang Fengjiao, Trude Schwarzacher, John Seymour Heslop-Harrison*. 2019. The DNA landscape in Avena: chromosome and genome evolution defined by major repetitive DNA classes in whole-genome sequence reads. BMC Plant Biology, 2019, 19(1): 226.

10.  Frontiers in Genetics专刊Applied Research on Plant Organelle Genomes and Key Genes客座编辑, https://www.frontiersin.org/research- topics/63785/?utm_source=wechat&utm_medium=social&utm_content=CindyRT07&utm _campaign=rtopinchn. 截止日期11 Oct 2024.



发表论文
(1) 植物凝集素类受体激酶研究进展, 热带亚热带植物学报, 2024, 
(2) Chromosome-level genome assembly of the diploid oat species Avena longiglumis, Scientific Data, 2024, 
(3) High throughput RNA sequencing discovers symptomatic and latent viruses: an example from ornamental hibiscus, Acta Horticulturae, 2024, 
(4) The mitochondrial genome of the diploid oat Avena longiglumis, BMC Plant Biology, 2023, 
(5) Polyploidy: its consequences and enabling role in plant diversification and evolution, Annals of Botany, 2023, 
(6) 谷类作物β-葡聚糖合成酶基因家族的研究进展, 热带亚热带植物学报, 2023, 
(7) Genome-wide expansion and reorganization during grass evolution: from 30 Mb chromosomes in rice and Brachypodium to 550 Mb in Avena, BMC Plant Biology, 2023, 
(8) 植物染色体分子核型技术研究进展, 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2022, 
(9) A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity and chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae, GigaScience, 2022, 
(10) High throughput RNA sequencing discovers symptomatic and latent viruses: an example from ornamental Hibiscus, biorxiv, 2022, 
(11) High throughput RNA sequencing discovers symptomatic and latent viruses: an example from ornamental Hibiscus preprint, bioRxiv, 2022, 
(12) A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity, chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae, bioRxiv, 2021, 
(13) 植物基因组重复序列研究进展, 扬州大学学报(农业与生命科学版), 2019, 
(14) The repetitive DNA landscape in Avena (Poaceae): chromosome and genome evolution defined by major repeat classes in whole-genome sequence reads, BMC Plant Biology, 2019, 
(15) 第27届国际动植物基因组学大会要事记, 扬州大学学报(农业与生命科学版), 2019, 
(16) Unraveling the evolutionary dynamics of ancient and recent polypoidization events in Avena (Poaceae), Scientific Report, 2017, 
(17) Relationships between Sorghum bicolor (Poaceae) and its close relatives based on genomic in situ hybridization evidence, Turkish Journal of Botany, 2017, 
(18) 燕麦属颖果微形态特征及其分类学意义, 热带亚热带植物学报, 2016, 
(19) Caryopsis micromorphological survey of Sorghum (Poaceae)���taxonomic implications, South African Journal of Botany, 2015, 
(20) 植物着丝粒结构及进化的研究进展, 热带亚热带植物学报, 2015, 
(21) Genomic in situ hybridization identifies genomic relationships of Sorghum bicolor and closely related species (Poaceae), Chromosome Research, 2015, 
(22) 禾本科燕麦属植物的地理分布, 热带亚热带植物学报, 2015, 
(23) Caryopsis micromorphological survey of Sorghum (Poaceae)���Taxonomic implications, South African Journal of Botany, 2015, 
(24) 高梁属植物的地理分布, 热带亚热带植物学报, 2014, 
(25) Low-copy nuclear gene and McGISH resolves polyploid history of Eleusine coracana and morphological character evolution in Eleusine, Turkish Journal of Botany, 2014, 
(26) Infrageneric phylogeny and temporal divergence of Sorghum (Andropogoneae, Poaceae) based on low-copy nuclear and plastid sequences, PLoS One, 2014, 
(27) 燕麦属系统学研究进展, 热带亚热带植物学报, 2014, 
(28) Caryopsis micromorphological survey of the genus Themeda (Poaceae) and allied spathaceous genera in the Andropogoneae, Turkish Journal of Botany, 2014, 
(29) 高粱属植物的地理分布, 热带亚热带植物学报, 2014, 
(30) 基因组原位杂交鉴定牛筋草AA基因组在穇子染色体上的分布及探针长度优化方法, 热带亚热带植物学报, 2012, 
(31) 菅属植物的地理分布, 热带亚热带植物学报, 2012, 
(32) Phylogenetic signals in the realized climate niches of Chinese grasses (Poaceae), Plant Ecology, 2011, 
(33) 基因组原位杂交鉴定牛筋草AA基因组在染色体上分布及探针长度优化方法, 2011年全国系统与进化植物学暨第十届青年学术研讨会论文集, 2011, 
(34) 菅属 (Themeda Forssk.) 植物地理分布, 2011年全国系统与进化植物学暨第十届青年学术研讨会论文集, 2011, 
(35) Allotetraploid origin and divergence in Eleusine (Chloridoideae, Poaceae): evidence from low-copy nuclear gene phylogenies and a plastid gene chronogram, Annals of Botany, 2011, 
(36) 穇属颖果微形态及其系统学意义, 热带亚热带植物学报, 2011, 
(37) 适应辐射类群穇属的系统学研究进展, 热带亚热带植物学报, 2010, 
(38) Lemma micromorphological characters in the Chloridoideae (Poaceae) optimized on a molecular phylogeny, South African Journal of Botany, 2010, 
(39) Grass (Poaceae) richness patterns across China's nature reserves, Plant Ecology, 2009, 
(40) Inflorescence development of Chloris barbata (Chloridoideae, Poaceae), 热带亚热带植物学报, 2008, 
(41) Phylogenetics of Calamagrostis (Poaceae: Agrostidinae) and related genera, Abstracts Collection on the Fourth International Conference: the Comparative Biology of the Monocotyledons and the fifth International Symposium: Grass Systematics and Evolution, 2008, 
(42) Lemma micromorphology of the Chloridoideae (Poaceae), Abstract Collections on the Fourth International Conference: the Comparative Biology of the Monocotyledons and the fifth International Symposium: Grass Systematics and Evolution, 2008, 
(43) Inflorescence diversification in the "finger millet clade" (Chloridoiedeae, Poaceae): A comparison of molecular phylogeny and developmental morphology, American Journal of Botany, 2007, 
(44) 禾本科虎尾草亚科细胞学研究分析, 热带亚热带植物学报, 2006, 
(45) 虎尾草亚科系统发育关系的初步研究, 热带亚热带植物学报, 2005, 
(46) Caryopsis morphology of the Chloridoideae (Gramineae) and its systematic implications, Botanical Journal of the Linnean Society, 2005, 
(47) Inflorescence structures and evolution in subfamily Chloridoideae (Gramineae), Plant Systematics and Evolution, 2005, 
(48) 禾本科系统学与演化研究的进展, 热带亚热带植物学报, 2004, 
(49) 虎尾草亚科(Chloridoideae)的分类系统述评, 热带亚热带植物学报, 2004, 
(50) Pollen morphology of the Chloridoideae (Gramineae), Grana, 2004, 
(51) 中国禾本科一新记录种—灰穗画眉草, 热带亚热带植物学报, 2001, 
发表著作
(1) 广东植物志第九卷禾亚科, Flora of Guangdong Vol IX Pooideae, 广东科技出版社, 2009-11, 第 1 作者
(2) 南岭植物名录, A Checklist of Vascular Plants of Nanling Mountains, 科学出版社, 2011-01, 第 其他 作者
(3) 深圳植物志, Flora of ShenZhen Vol. 4, 中国林业出版社, 2015-01, 第 其他 作者
(4) 广州入侵植物, Guangzhou Invasive Plants, 广东科技出版社, 2019-01, 第 其他 作者
(5) 中国热带海岸带野生果蔬资源, Wild Fruit and Vegetable Plants in Tropical Coastal Zone of China, 广东科技出版社, 2019-01, 第 其他 作者
(6) 植物细胞遗传学:从染色体到细胞基因组学, Plant cytogenetics: from chromosomes to cytogenomics, Humana Press, New York, Vol. 2672: 3–21. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-3226-0 (562 pages), 2023-06, 第 2 作者
(7) 染色体制备方案: 分子细胞遗传学和咖啡基因组结构, Protocols for chromosome preparations: molecular cytogenetics and studying genome organization in coffee, Springer Nature, Germany, Pages 291–314. https://doi.org/10.1007/978-3-662-67273-0_21 (314 pages), 2023-10, 第 4 作者
核心期刊


1        熊圭, John Seymour Heslop-Harrison, 刘青*. 植物凝集素类受体激酶研究进展. 热带亚热带植物学报, 2024, 中国知网(录用定稿)网络首发.

2.       袁泓宇, 崔冬丽, John Seymour Heslop-Harrison, 刘青*. 谷类作物β-葡聚糖合成酶基因家族的研究进展. 热带亚热带植物学报, 2023, 31(2): 295–304.

3.       刘青, 周书玉, 崔冬丽, John Seymour Heslop-Harrison*. 高通量测序技术及其在植物病毒检测中的应用案例. 西南大学学报(自然科学版)2022, 44(7): 1–9.

4.       刘青, 潘浩研, 黄家丽, John Seymour Heslop-Harrison. 植物染色体分子核型技术研究进展. 西北农林科技大学学报(自然科学版)2022, 50(2): 82–89.

5.       李晓宇, 徐文魁, Pat Heslop-Harrison, 刘青*. 植物基因组重复序列研究进展. 扬州大学学报(农业与生命科学版), 2019, 40(5): 9–19.

6.       刘青*, 李晓宇, 徐文魁, John Seymour Heslop Harrison. 第27届国际动植物基因组学大会要事记. 扬州大学学报(农业与生命科学版), 2019, 40(4): 1–9.

7.       周湘英, 贺文琪, John Seymour Heslop-Harision, 刘青*. 燕麦属细胞遗传学研究进展. 热带亚热带植物学报, 2017, 25(4): 409–418.

8.       林磊曾飞燕刘青*.燕麦属颖果微形态特征及其分类学意义热带亚热带植物学报, 2016, 24(1): 1–13.

9.       林磊刘青*禾本科燕麦属植物的地理分布热带亚热带植物学报, 2015, 23(2): 111–122.

10.    刘青*植物着丝粒结构及进化的研究进展热带亚热带植物学报, 2015, 23(5): 576–586.

11.    刘青*刘欢林磊燕麦属系统学研究进展热带亚热带植物学报, 2014, 22(5): 516–524.

12.    刘欢曾飞燕刘青*.高粱属植物的地理分布热带亚热带植物学报, 2014, 22(1): 1–11.

13.    姜斌刘利勤胡晓颖刘青*基因组原位杂交鉴定牛筋草AA基因组在穇子染色体上分布热带亚热带植物学报, 2012, 20(1): 44–50.

14.    张煜刘青*菅属植物的地理分布热带亚热带植物学报, 2012, 20(3): 221–228.

15.    姜斌, Peterson Paul M, 刘青*穇属颖果微形态及其系统学意义热带亚热带植物学报, 2011, 19(3): 195–204.

16.    刘青*, Paul M. Peterson. 适应辐射类群穇属的系统学研究进展热带亚热带植物学报, 2010, 18(3): 335–342.

17.    刘青*. Inflorescence development of Chloris barbata (Chloridoideae, Poaceae). 热带亚热带植物学报, 2008, 16(4): 357–362 (英文).

18.    刘青*赵南先郝刚禾本科虎尾草亚科细胞学研究分析热带亚热带植物学报, 2006, 14(4): 347–353.

19.    刘青赵南先*郝刚虎尾草亚科系统发育关系的初步研究热带亚热带植物学报, 2005, 13(5): 432–442.

20.    刘青赵南先*禾本科系统系统学与演化研究的进展热带亚热带植物学报, 2004, 12(4): 388–392.

 



科研活动

国家自然科学基金

2024.01–2027.12

主持

国家自然科学基金

2021.01–2024.12

主持

国家自然科学基金

2013.01–2016.12

主持

国家自然科学基金

2008.01–2010.12

主持

广东省自然科学基金  

2021.01–2013.12

主持

科学技术部高端外国专家引进计划

2021.01–2022.12

主持

科学技术部高端外国专家引进计划

2020.01–2020.12

主持

科学技术部高端外国专家引进计划

2016.01–2016.12

主持

中国科学院国际会议项目

2021.01–2021.12

主持

中国科学院国际人才计划

2024.01–2025.12

主持

中国科学院国际人才计划

2016.01–2016.12

主持

大学生创新实践训练计划

2023.07–2024.06

主持

大学生创新实践训练计划

2022.07–2023.06

主持

大学生创新实践训练计划

2021.07–2022.06

主持

大学生创新实践训练计划

2016.07–2017.06

主持

国家留学基金

2016.11–2017.10

主持

国家留学基

2009.07–2010.07

主持

中国科学院公派留学

2012.08–2013.01

主持

史密森学会访问学者奖

2006.07–2006.08

主持



科研项目
( 1 ) 构建燕麦D基因组单染色体技术体系, 负责人, 中国科学院计划, 2024-01--2024-12
( 2 ) 基于寡核苷酸荧光原位杂交技术探究燕麦D基因组起源和染色体进化, 负责人, 国家任务, 2024-01--2027-12
( 3 ) 植物多倍体演化国际学术研讨会, 负责人, 中国科学院计划, 2021-09--2021-12
( 4 ) 燕麦野生种单拷贝和特异标记染色体定位研究(科学技术部高端外国专家引进计划), 负责人, 国家任务, 2021-01--2022-12
( 5 ) 长颖燕麦单染色体图谱构建, 负责人, 地方任务, 2021-01--2023-12
( 6 ) 燕麦单染色 体特异标记开发和 A基因组起源的研究, 负责人, 国家任务, 2021-01--2024-12
( 7 ) 长颖燕麦染色体特异细胞遗传学标记开发(科学技术部高端外国专家引进计划), 负责人, 国家任务, 2020-01--2020-12
( 8 ) 海外知名学者项目子课题普通栽培燕麦基因组多样性和演化, 参与, 研究所自主部署, 2018-05--2023-08
( 9 ) 普通栽培燕麦重复序列组学特征研究, 负责人, 国家任务, 2016-11--2017-11
( 10 ) 中国科学院国际人才计划(CAS President’s International Fellowship Initiative), 负责人, 中国科学院计划, 2016-09--2016-10
( 11 ) 六倍体普通栽培燕麦重复序列生物信息学研究(国家外国专家局重点外国专家项目), 负责人, 国家任务, 2016-09--2016-10
( 12 ) 《泛喜马拉雅地区植物综合考察与植物志编研》虎尾草亚科, 负责人, 国家任务, 2016-06--2018-05
( 13 ) 六倍体普通栽培燕麦重复序列生物信息学研究, 负责人, 国家任务, 2016-01--2016-12
( 14 ) 高粱属分子系统学研究, 负责人, 国家任务, 2013-08--2013-12
( 15 ) 泛喜马拉雅地区植物综合考察与植物志编研, 负责人, 国家任务, 2013-06--2018-05
( 16 ) 高粱属分子系统学及栽培高粱和约翰逊草基因组起源的研究, 负责人, 国家任务, 2013-01--2016-12
( 17 ) 高粱属分子系统学及栽培高粱和约翰逊草基因组起源的研究,中国科学院重点实验室重点基金, 负责人, 中国科学院计划, 2012-05--2015-04
( 18 ) 《穇属系统发育和谷物穇子杂交起源的研究》,教育部第42批留学回国人员科研启动基金, 负责人, 国家任务, 2011-10--2013-09
( 19 ) 虎尾草族核心群Chloris group的系统演化研究, 负责人, 国家任务, 2008-01--2010-12
参与会议
(1)Mitochondrial genome of the Diploid Oat Avena longiglumis   第二十届国际植物学大会   Liu Qing*,Cui Dongli, Xiong Gui, Trude Schwarzacher, Pat Heslop-Harrison   2024-07-21
(2)Genome landscape and chromosome evolution in Avena (Poaceae)   植物学年鉴国际学术年会   Liu Qing*, Li Xiaoyu, Zhou XY, Li Mingzhi, Zhang Fengjiao, Trude Schwarzacher, John Seymour Heslop-Harrison*   2021-09-10
(3)The repetitive DNA landscape in Avena (Poaceae): chromosome and genome evolution defined by major repeat classes in whole-genome sequence reads   国际动物植物基因组大会   Qing Liu*, Xiaoyu Li, Xiangying Zhou, Mingzhi Li, Fengjiao Zhang, Trude Schwarzacher, Pat Heslop Harrison.    2019-01-12
(4)Multicolor Genomic in situ hybridization identifies genomic relationships of Sorghum bicolor and closely related species (Poaceae)   第10界欧洲细胞遗传学协会   Qing Liu   2015-07-04

指导学生

已指导学生

姜斌  硕士研究生  071001-植物学  

刘欢  硕士研究生  085238-生物工程  

林磊  硕士研究生  071001-植物学  

周湘英  硕士研究生  085238-生物工程  

李晓宇  硕士研究生  085238-生物工程  

潘浩研  硕士研究生  085238-生物工程  

王梓维  博士研究生  071007-遗传学  

崔冬丽  博士研究生  071007-遗传学  

周书玉  硕士研究生  071007-遗传学  

袁泓宇  硕士研究生  086000-生物与医药  

现指导学生

熊圭  硕士研究生  071001-植物学  

叶绿涵  硕士研究生  071001-植物学  

田雅琪  硕士研究生  086000-生物与医药