基本信息
李茹姣 女 博士生导师 中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）
电子邮件： lirj@big.ac.cn
通信地址： 北京市朝阳区北辰西路一号院，中国科学院奥运科技园区104号楼
邮政编码： 100101
研究领域
生物信息学
基因组学
招生信息
招生专业
0710J3-生物信息学
0710Z1-基因组学
0710Z1-基因组学
招生方向
生物信息学
基因组学
表观遗传学
基因组学
表观遗传学
教育背景
2000-09--2005-07 吉林大学 博士
1996-09--2000-07 吉林大学 学士
1996-09--2000-07 吉林大学 学士
学历
研究生学历
学位
理学博士学位
工作经历
工作简历
2023-05~现在, 中科院北京基因组研究所（国家生物信息中心）, 教授级高级工程师
2008-04~2023-05,中科院北京基因组研究所, 助理研究员、高级工程师
2005-07~2007-10,北京宏剑讯科软件技术有限公司, 工程师
2008-04~2023-05,中科院北京基因组研究所, 助理研究员、高级工程师
2005-07~2007-10,北京宏剑讯科软件技术有限公司, 工程师
社会兼职
2023-07-01-2027-08-31,中国医药教育协会医学基因组学与生物信息学专业委员会, 委员
2023-04-01-今,生物信息学会（筹）表观遗传信息学委员会, 委员
2021-12-01-2023-12-31,中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会肿瘤测序与大数据分析专家委员会, 委员
2023-04-01-今,生物信息学会（筹）表观遗传信息学委员会, 委员
2021-12-01-2023-12-31,中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会肿瘤测序与大数据分析专家委员会, 委员
教授课程
生物信息学前沿讲座
基因组学原理与技术
基因组学原理与技术
出版信息
发表论文
（1） PPGR: a comprehensive perennial plant genomes and regulation database, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2023, 第 16 作者 通讯作者
（2） Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2023, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2023,
（3） MethBank 4.0: an updated database of DNA methylation across a variety of species, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2023, 第 14 作者 通讯作者
（4） EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit for epigenome-wide association study, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2022, 第 13 作者 通讯作者
（5） scMethBank: a database for single-cell whole genome DNA methylation maps, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2022, 第 12 作者 通讯作者
（6） Identification of COVID-19-Associated DNA Methylation Variations by Integrating Methylation Array and scRNA-Seq Data at Cell-Type Resolution, GENES, 2022, 第 6 作者 通讯作者
（7） Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2022, Nucleic Acids Research, 2022, 第 99 作者
（8） ASCancer Atlas: a comprehensive knowledgebase of alternative splicing in human cancers, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2022, 第 10 作者 通讯作者
（9） Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 第 31 作者
（10） Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2020, 第 44 作者
（11） NucMap: a database of genome-wide nucleosome positioning map across species, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2019, 第 14 作者 通讯作者
（12） MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2018, 第 1 作者 通讯作者
（13） Database Resources of the BIG Data Center in 2018, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2018, 第 44 作者
（14） Transcriptome analysis reveals dynamic changes in coxsackievirus A16 infected HEK 293T cells, BMC GENOMICS, 2017, 第 2 作者
（15） The BIG Data Center: from deposition to integration to translation, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2017, 第 6 作者
（16） BS-RNA: An efficient mapping and annotation tool for RNA bisulfite sequencing data, COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, 2016, 第 6 作者 通讯作者
（17） F^-（H2O）n（n=1～4）体系的结构、偶极矩、极化率和一阶超极化率的从头计算, Ab initio Study on the Dipole Moments, Polarizabilities and First Hyperpolarizabilities of Fluoride-water Clusters F-(H2O)n(n=1-4), 高等学校化学学报, 2005, 第 2 作者
（18） Proton transfer of NH3-HCl catalyzed by only one molecule, JOURNALOFPHYSICALCHEMISTRYA, 2005,
（19） Ab initio study of the interaction hyperpolarizabilities of HCN-HF and HNC-HF complexes, JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, 2003,
（20） Density functional study of structures and interaction hyperpolarizabilities of NH 3���HCl���(H 2O) n ( n=0���4) clusters, CHEMICAL PHYSICS LETTERS, 2003,
（2） Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2023, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2023,
（3） MethBank 4.0: an updated database of DNA methylation across a variety of species, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2023, 第 14 作者 通讯作者
（4） EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit for epigenome-wide association study, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2022, 第 13 作者 通讯作者
（5） scMethBank: a database for single-cell whole genome DNA methylation maps, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2022, 第 12 作者 通讯作者
（6） Identification of COVID-19-Associated DNA Methylation Variations by Integrating Methylation Array and scRNA-Seq Data at Cell-Type Resolution, GENES, 2022, 第 6 作者 通讯作者
（7） Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2022, Nucleic Acids Research, 2022, 第 99 作者
（8） ASCancer Atlas: a comprehensive knowledgebase of alternative splicing in human cancers, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2022, 第 10 作者 通讯作者
（9） Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 第 31 作者
（10） Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2020, 第 44 作者
（11） NucMap: a database of genome-wide nucleosome positioning map across species, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2019, 第 14 作者 通讯作者
（12） MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2018, 第 1 作者 通讯作者
（13） Database Resources of the BIG Data Center in 2018, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2018, 第 44 作者
（14） Transcriptome analysis reveals dynamic changes in coxsackievirus A16 infected HEK 293T cells, BMC GENOMICS, 2017, 第 2 作者
（15） The BIG Data Center: from deposition to integration to translation, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2017, 第 6 作者
（16） BS-RNA: An efficient mapping and annotation tool for RNA bisulfite sequencing data, COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, 2016, 第 6 作者 通讯作者
（17） F^-（H2O）n（n=1～4）体系的结构、偶极矩、极化率和一阶超极化率的从头计算, Ab initio Study on the Dipole Moments, Polarizabilities and First Hyperpolarizabilities of Fluoride-water Clusters F-(H2O)n(n=1-4), 高等学校化学学报, 2005, 第 2 作者
（18） Proton transfer of NH3-HCl catalyzed by only one molecule, JOURNALOFPHYSICALCHEMISTRYA, 2005,
（19） Ab initio study of the interaction hyperpolarizabilities of HCN-HF and HNC-HF complexes, JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, 2003,
（20） Density functional study of structures and interaction hyperpolarizabilities of NH 3���HCl���(H 2O) n ( n=0���4) clusters, CHEMICAL PHYSICS LETTERS, 2003,
指导学生
现指导学生
张怡然 硕士研究生 0710J3-生物信息学
郭栩彤 硕士研究生 0710J3-生物信息学