基本信息
李琳琳 女 中国科学院自动化研究所
电子邮件： lilinlin@ia.ac.cn
通信地址： 北京市海淀区中关村东路95号
邮政编码：
电子邮件： lilinlin@ia.ac.cn
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研究领域
微观脑图谱技术研究
招生信息
硕士研究生1名
招生专业
081104-模式识别与智能系统
招生方向
智能生物医学影像
教育背景
2009-09--2015-06 北京大学 理学博士
工作经历
工作简历
2021-05~现在, 中国科学院自动化研究所, 副研究员
2018-09~2021-04,中国科学院自动化研究所, 助理研究员
2015-07~2018-08,北京大学, 讲师
2018-09~2021-04,中国科学院自动化研究所, 助理研究员
2015-07~2018-08,北京大学, 讲师
专利与奖励
专利成果
（ 1 ） 离子源结构装置, 发明专利, 2023, 第 4 作者, 专利号: CN116598179A
（ 2 ） 离子束刻蚀电极装置, 发明专利, 2023, 第 4 作者, 专利号: CN116525399A
（ 3 ） 塑料条带承载生物超薄切片快速成像方法、系统、装置, 专利授权, 2021, 第 3 作者, 专利号: CN112213343A
（ 4 ） 基于X光图像的生物组织电镜图像校正方法、系统和装置, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112396608A
（ 5 ） 扫描电镜透射模式与透射电镜联用的病毒快速检测系统, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112381817A
（ 6 ） 基于线扫描的条带序列切片光学成像装置及成像方法, 专利授权, 2019, 第 4 作者, 专利号: CN110596068A
（ 7 ） 用于镀膜仪制备连续导电薄膜的装置, 专利授权, 2019, 第 3 作者, 专利号: CN110541156A
（ 8 ） 基于生物组织序列切片刻蚀减薄的三维图像库获取方法, 专利授权, 2019, 第 2 作者, 专利号: CN110533772A
（ 9 ） 刀刃位置切换方法、装置及包括该装置的超薄切片机, 发明专利, 2019, 第 3 作者, 专利号: CN110328712A
（ 10 ） 超薄切片机及其刀台, 发明专利, 2019, 第 3 作者, 专利号: CN209132009U
（ 11 ） 超薄切片机及其刀台, 实用新型, 2019, 第 3 作者, 专利号: CN209132009U
（ 2 ） 离子束刻蚀电极装置, 发明专利, 2023, 第 4 作者, 专利号: CN116525399A
（ 3 ） 塑料条带承载生物超薄切片快速成像方法、系统、装置, 专利授权, 2021, 第 3 作者, 专利号: CN112213343A
（ 4 ） 基于X光图像的生物组织电镜图像校正方法、系统和装置, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112396608A
（ 5 ） 扫描电镜透射模式与透射电镜联用的病毒快速检测系统, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112381817A
（ 6 ） 基于线扫描的条带序列切片光学成像装置及成像方法, 专利授权, 2019, 第 4 作者, 专利号: CN110596068A
（ 7 ） 用于镀膜仪制备连续导电薄膜的装置, 专利授权, 2019, 第 3 作者, 专利号: CN110541156A
（ 8 ） 基于生物组织序列切片刻蚀减薄的三维图像库获取方法, 专利授权, 2019, 第 2 作者, 专利号: CN110533772A
（ 9 ） 刀刃位置切换方法、装置及包括该装置的超薄切片机, 发明专利, 2019, 第 3 作者, 专利号: CN110328712A
（ 10 ） 超薄切片机及其刀台, 发明专利, 2019, 第 3 作者, 专利号: CN209132009U
（ 11 ） 超薄切片机及其刀台, 实用新型, 2019, 第 3 作者, 专利号: CN209132009U
出版信息
发表论文
（1） An intelligent workflow for sub-nanoscale 3D reconstruction of intact synapses from serial section electron tomography, BMC BIOLOGY, 2023, 第 2 作者
（2） A novel registration method for long-serial section images of EM with a serial split technique based on unsupervised optical flow network, BIOINFORMATICS, 2023, 第 4 作者
（3） Denoising of scanning electron microscope images for biological ultrastructure enhancement, JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2022, 第 3 作者
（4） Three-dimensional ATUM-SEM reconstruction and analysis of hepatic endoplasmic reticulum-organelle interactions, Three-dimensional ATUM-SEM reconstruction and analysis of hepatic endoplasmic reticulum-organelle interactions, JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY(COVER), 2021, 第 2 作者
（5） Nanobar Array Assay Revealed Complementary Roles of BIN1 Splice Isoforms in Cardiac T-Tubule Morphogenesis, NANO LETTERS, 2021, 第 1 作者
（6） Automatic Reconstruction of Mitochondria and Endoplasmic Reticulum in Electron Microscopy Volumes by Deep Learning, FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, 2020, 第 2 作者
（7） A Noniterative Simultaneous Rigid Registration Method for Serial Sections of Biological Tissues, APPLIED SCIENCES-BASEL, 2020, 第 2 作者
（8） Nanobar Array Assay Revealed Complementary Roles of BIN1 Splice Isoforms in Cardiac T-Tubule Morphogenesis, NANO LETTERS, 2020, 第 1 作者
（9） Brain activity regulates loose coupling between mitochondrial and cytosolic Ca 2+ transients, NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 第 2 作者
（10） Automatic Mitochondria Segmentation for EM Data Using a 3D Supervised Convolutional Network, FRONTIERS IN NEUROANATOMY, 2018, 第 4 作者
（2） A novel registration method for long-serial section images of EM with a serial split technique based on unsupervised optical flow network, BIOINFORMATICS, 2023, 第 4 作者
（3） Denoising of scanning electron microscope images for biological ultrastructure enhancement, JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2022, 第 3 作者
（4） Three-dimensional ATUM-SEM reconstruction and analysis of hepatic endoplasmic reticulum-organelle interactions, Three-dimensional ATUM-SEM reconstruction and analysis of hepatic endoplasmic reticulum-organelle interactions, JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY(COVER), 2021, 第 2 作者
（5） Nanobar Array Assay Revealed Complementary Roles of BIN1 Splice Isoforms in Cardiac T-Tubule Morphogenesis, NANO LETTERS, 2021, 第 1 作者
（6） Automatic Reconstruction of Mitochondria and Endoplasmic Reticulum in Electron Microscopy Volumes by Deep Learning, FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, 2020, 第 2 作者
（7） A Noniterative Simultaneous Rigid Registration Method for Serial Sections of Biological Tissues, APPLIED SCIENCES-BASEL, 2020, 第 2 作者
（8） Nanobar Array Assay Revealed Complementary Roles of BIN1 Splice Isoforms in Cardiac T-Tubule Morphogenesis, NANO LETTERS, 2020, 第 1 作者
（9） Brain activity regulates loose coupling between mitochondrial and cytosolic Ca 2+ transients, NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 第 2 作者
（10） Automatic Mitochondria Segmentation for EM Data Using a 3D Supervised Convolutional Network, FRONTIERS IN NEUROANATOMY, 2018, 第 4 作者
科研活动
科研项目
（ 1 ） 2021年度中科院技术支撑人才项目, 负责人, 中国科学院计划, 2022-01--2024-12
（ 2 ） 斑马鱼全脑介观神经联接成像与追踪新方法的建立, 负责人, 国家任务, 2021-12--2026-11
（ 3 ） 大脑皮层纳米尺度成像, 负责人, 境内委托项目, 2021-10--2023-12
（ 4 ） 拟南芥雄蕊微观结构图谱绘制, 负责人, 境内委托项目, 2019-12--2024-12
（ 5 ） 高真空镀膜仪的连续薄膜条带镀膜功能开发, 负责人, 中国科学院计划, 2019-08--2023-08
（ 6 ） 微介观脑图谱成像平台（一期）, 负责人, 中国科学院计划, 2019-01--2019-12
（ 7 ） 纳米尺度超微精细结构显微分析技术研究, 负责人, 中国科学院计划, 2019-01--2024-12
（ 2 ） 斑马鱼全脑介观神经联接成像与追踪新方法的建立, 负责人, 国家任务, 2021-12--2026-11
（ 3 ） 大脑皮层纳米尺度成像, 负责人, 境内委托项目, 2021-10--2023-12
（ 4 ） 拟南芥雄蕊微观结构图谱绘制, 负责人, 境内委托项目, 2019-12--2024-12
（ 5 ） 高真空镀膜仪的连续薄膜条带镀膜功能开发, 负责人, 中国科学院计划, 2019-08--2023-08
（ 6 ） 微介观脑图谱成像平台（一期）, 负责人, 中国科学院计划, 2019-01--2019-12
（ 7 ） 纳米尺度超微精细结构显微分析技术研究, 负责人, 中国科学院计划, 2019-01--2024-12