（1）植物系统发育基因组学；

（2）比较与功能基因组学；

（3）药用植物特征次生代谢物生物合成途径解析及其起源与演化；

（4）生物地理学。

2002-09--2006-08   中国科学院昆明植物研究所   理学博士
1997-09--2000-07   中国科学院昆明植物研究所   理学硕士
1991-09--1995-06   西南大学（原西南师范大学）   理学学士

研究生

博士

1995年7月—1997年9月：四川省会理县民族中学，中学二级教师

2000年8月—今：中国科学院昆明植物研究所，历任研究实习员、助理研究员、副研究员、研究员（2011年1月任研究组长）

2005年2月—2005年5月：Department of Botany, Califonia Academy of Science, 访问学者

2011年8月—2013年2月：Department of Ecology and Evulutionary Biology, University of Toronto, 访问学者

2022-03-30-今,国际遗传学期刊Frontiers in Genetics编委, Review Editor
2020-11-29-今,国际植物学期刊BMC Plant Biology编委, Associate Editor
2018-12-29-2023-12-31,九三学社中央委员会科普工作委员会, 委员

生物地理学

   

[1] 杨俊波, 李德铢, 纪运恒, 王红, 杨静, 贺正山, 王磊. 一种基于二代测序开发用于人参药材真伪检测的引物、探针及其检测方法. CN: CN116426680A, 2023-07-14.

[2] 纪运恒, 李德铢, 张志荣, 王红, 杨志云, 王磊. 鉴别滇重楼遗传纯合个体的方法、引物、探针及应用. CN: CN117925904B, 2024-06-07.

[3] 纪运恒, 李德铢, 杨俊波, 王红, 杨志云, 贺正山, 王磊. 一种基于二代测序开发用于三七药材真伪检测鉴定的引物、探针及其检测方法. CN: CN116287412B, 2023-11-03.

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（1） Historical biogeography and evolutionary diversification of Lilium (Liliaceae): New insights from plastome phylogenomics, 植物多样性, 2024, 第 7 作者  通讯作者
（2） Plastid phylogenomics and fossil evidence provide new insights into the evolutionary complexity of the "woody clade" in Saxifragales, BMC Plant Biology, 2024, 第 6 作者  通讯作者
（3） Comparative and phylogenetic analyses of Loranthaceae plastomes provide insights into the evolutionary trajectories of plastome degradation in hemiparasitic plants, BMC PLANT BIOLOGY, 2024, 第 7 作者  通讯作者
（4） A haplotype-resolved genome assembly of Coptis teeta, an endangered plant of significant medicinal value, Scientific Data, 2024, 第 6 作者  通讯作者
（5） Haplotype-resolved genome assembly of the upas tree (Antiaris toxicaria), Scientific Data, 2024, 第 6 作者  通讯作者
（6） Establishing the first reference library for utilizing high-throughput sequencing technologies in identifying medicinal and endangered Paris species (Melanthiaceae), INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS, 2024, 第 5 作者  通讯作者
（7） Phylogeny and evolution of Asparagaceae subfamily Nolinoideae: new insights from plastid phylogenomics, ANNALS OF BOTANY, 2023, 第 1 作者  通讯作者
（8） Miocene Dipteronia (Sapindaceae) samaras from South Korea and their biogeographical implications, iScience, 2023, 第 6 作者  通讯作者
（9） Genome skimming as an efficient tool for authenticating commercial products of the pharmaceutically important Paris yunnanensis (Melanthiaceae), BMC PLANT BIOLOGY, 2023, 第 7 作者  通讯作者
（10） Testing and using complete plastomes for authentication of medicinal Polygonatum species (Asparagaceae), INDUSTRIAL CROPS & PRODUCTS, 2023, 第 7 作者  通讯作者
（11） Unraveling the serial glycosylation in the biosynthesis of steroidal saponins in the medicinal plant Paris polyphylla and their antifungal action, Unraveling the serial glycosylation in the biosynthesis of steroidal saponins in the medicinal plant Paris polyphylla and their antifungal action, ACTA PHARMACEUTICA SINICA B, 2023, 第 3 作者
（12） Genome Skimming Contributes to Clarifying Species Limits in Paris Section Axiparis (Melanthiaceae), FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2022, 第 1 作者  通讯作者
（13） 横断山南段上新世的植被多样性与分布格局, 生物多样性, 2022, 第 6 作者
（14） Steroidal saponins with cytotoxic activity from the stems and leaves of Paris fargesii, NEW JOURNAL OF CHEMISTRY, 2022, 第 6 作者
（15） Plastome sequencing for accurate and effective authentication of Polygonatum kingianum (Asparagaceae), INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS, 2022, 第 6 作者  通讯作者
（16） Plastome phylogenomics of the East Asian endemic genus Dobinea, Plastome phylogenomics of the East Asian endemic genus Dobinea, PLANT DIVERSITY, 2021, 第 6 作者  通讯作者
（17） Deciphering the Taxonomic Delimitation of Ottelia acuminata (Hydrocharitaceae) Using Complete Plastomes as Super-Barcodes, FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2021, 第 1 作者  通讯作者
（18） Plastome phylogenomics of Cephalotaxus (Cephalotaxaceae) and allied genera, ANNALS OF BOTANY, 2021, 第 1 作者  通讯作者
（19） Highly degenerate plastomes in two hemiparasitic dwarf mistletoes: Arceuthobium chinense and A. pini (Viscaceae), PLANTA, 2021, 第 5 作者  通讯作者
（20） The complete plastomes of two flowering epiparasites (Phacellaria glomerata and P. compressa): Gene content, organization, and plastome degradation, GENOMICS, 2021, 第 8 作者  通讯作者
（21） Ultra-Barcoding Discovers a Cryptic Species in Paris yunnanensis (Melanthiaceae), a Medicinally Important Plant, FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2020, 第 1 作者  通讯作者
（22） Genetic characterization of the entire range of Cycas panzhihuaensis (Cycadaceae), PLANT DIVERSITY, 2020, 第 2 作者
（23） Molecular networking uncovers steroidal saponins of Paris tengchongensis, FITOTERAPIA, 2020, 第 8 作者
（24） The Complete Plastomes of Five Hemiparasitic Plants ( Osyris wightiana , Pyrularia edulis , Santalum album , Viscum liquidambaricolum , and V. ovalifolium ): Comparative and Evolutionary Analyses Within Santalales, FRONTIERS IN GENETICS, 2020, 第 8 作者  通讯作者
（25） Plastome phylogenomics of Saussurea (Asteraceae: Cardueae), BMC PLANT BIOLOGY, 2019, 第 4 作者
（26） Testing and using complete plastomes and ribosomal DNA sequences as the next generation DNA barcodes in Panax (Araliaceae), MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, 2019, 第 1 作者  通讯作者
（27） Paris variabilis (Melanthiaceae), a new species from southwestern China, PHYTOTAXA, 2019, 第 3 作者  通讯作者
（28） Plastome phylogenomics, biogeography, and clade diversification of Paris (Melanthiaceae), BMC PLANT BIOLOGY, 2019, 第 1 作者  通讯作者
（29） Genome-wide analysis of Cushion willow provides insights into alpine plant divergence in a biodiversity hotspot, NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 第 14 作者
（30） Chloroplast phylogenomic analysis provides insights into the evolution of the largest eukaryotic genome holder, Paris japonica (Melanthiaceae), BMC PLANT BIOLOGY, 2019, 第 9 作者  通讯作者
（31） Complete chloroplast genome of the economically important crop, Amorphophallus konjac (Araceae), MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2019, 第 4 作者  通讯作者
（32） Characterization of the whole plastome of Dipentodon Sinicus (Dipentodontaceae), MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2019, 第 5 作者  通讯作者
（33） Complete plastome of Toricellia tiliifolia (Toricelliaceae), a relict plant, MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2019, 第 4 作者  通讯作者
（34） Transcriptome analyses of Paris polyphylla var. chinensis, Ypsilandra thibetica, and Polygonatum kingianum characterize their steroidal saponin biosynthesis pathway, FITOTERAPIA, 2019, 第 7 作者  通讯作者
（35） The complete plastome of Panax stipuleanatus:Comparative and phylogenetic analyses of the genus Panax(Araliaceae), The complete plastome of Panax stipuleanatus: Comparative and phylogenetic analyses of the genus Panax (Araliaceae), PLANTDIVERSITY, 2018, 第 5 作者  通讯作者
（36） he Complete Chloroplast Genome of Panax stipuleanutus: Comparative and Phylogenetic Analyses of the Genus Panax (Araliaceae), Plant Diversity, 2018, 第 1 作者  通讯作者
（37） The complete chloroplast genome of Pleione bulbocodioides (Orchidaceae), CONSERVATION GENETICS RESOURCES, 2018, 第 4 作者  通讯作者
（38） A new species of Paris, section Axiparis (Melanthiaceae) from Yunnan, China, Phytotaxa, 2017, 第 1 作者  通讯作者
（39） Cytotoxic steroidal saponins from Trillium kamtschaticum., Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2017, 第 8 作者
（40） Spirostanol saponins from Ypsilandra parviflora induce platelet aggregation., STEROIDS, 2017, 第 5 作者
（41） Comparative and Phylogenetic Analyses of the Complete Chloroplast Genomes of Three Arcto-Tertiary Relicts: Camptotheca acuminata, Davidia involucrata, and Nyssa sinensis, FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2017, 第 2 作者  通讯作者
（42） Cytotoxic steroidal saponins from Trillium kamtschaticum, BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS, 2017, 第 8 作者
（43） A new species of Paris sect. Axiparis (Melanthiaceae) from Yunnan, China, PHYTOTAXA, 2017, 第 1 作者  通讯作者
（44） Analysis of Complete Chloroplast Genome Sequences Improves Phylogenetic Resolution in Paris (Melanthiaceae ), FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2016, 第 6 作者  通讯作者
（45） Complete chloroplast genome of the medicinal plant Paris polyphylla var. chinensis (Melanthiaceae), Journal of Tropical and Subtropical Botany, 2015, 第 1 作者  通讯作者
（46） Chloroplast phylogeography of the East Asian Arcto-Tertiary relict Tetracentron sinense (Trochodendraceae), JOURNAL OF BIOGEOGRAPHY, 2014, 第 7 作者
（47） Microsatellite primer development for Ottelia accuminata (Hydrocharitaceae), a submerged macrophyte endemic to southwestern China, Guihaia, 2014, 第 1 作者  通讯作者
（48） Chloroplast phylogeography of the East Asian Arcto-Tertiarny relic Tetracentron sinensis (Trochodendraceae), JORNALOFBIOGEOGRAPHY, 2014, 第 1 作者
（49） MICROSATELLITES FOR TETRACENTRON SINENSE (TROCHODENDRACEAE), A TERTIARY RELICT ENDEMIC TO EAST ASIA, AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, 2012, 第 5 作者
（50） Molecular authentication of the medicinal plant Paris polyphylla Smith var. yunnanensis (Melanthiaceae) and its related species by polymerase chain reaction���, Journal of Medicinal Plants Research, 2012, 第 1 作者  通讯作者
（51） MICROSATELLITE MARKERS FOR THE RELICTUAL DOVE TREE, DAVIDIA INVOLUCRATA (CORNACEAE), AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, 2012, 第 6 作者
（52） Detection of Valeriana jatamansi as an Adulterant of Medicinal Paris by Length Variation of Chloroplast psbA-trnH Region, PLANTA MEDICA, 2011, 第 5 作者  通讯作者
（53） DEVELOPMENT OF TEN POLYMORPHIC MICROSATELLITE LOCI FOR FOSBERGIA SHWELIENSIS (RUBIACEAE), A POTENTIALLY CRISIS ENDANGERED TREE, AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, 2011, 第 2 作者
（54） Isolation and Characterization of Microsatellite Loci in Pistacia weinmannifolia (Anacardiaceae), INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2011, 第 3 作者  通讯作者
（55） 云贵高原多星韭二倍体—四倍体分布格局研究, Diploid and Tetraploid Distribution ofAlliumwallichiiKunth(Ailiaceae) in the Yunnan-Guizhou Plateau, 植物科学学报, 2011, 第 4 作者
（56） Development of seven novel EST-SSR makers from Cycas panzhihuaensis (Cycadaceae), American Journal of Botany, 2010, 第 1 作者  通讯作者
（57） PsbA-trnH sequence analysis from chloroplast on medicinal plants of Artemisia (Asteraceae), Chinese Agricultural Science Bulletin, 2009, 第 1 作者  通讯作者
（58） 高黎贡山东西坡种子植物区系的比较研究, 云南植物研究, 2008, 第 1 作者
（59） 高黎贡山北段东西坡种子植物区系的比较研究, A Comparative Floristic Study on the Seed Plants of the East Side and the West Side of the Northern Gaoligong, 云南植物研究, 2008, 第 2 作者
（60） Four new synonyms in the genus Paris (Trilliaceae), ACTA PHYTOTAXONOMICA SINICA, 2007, 第 1 作者
（61） 高黎贡山北段种子植物区系研究, A Floristic Study on the Seed Plants of the Northern Gaoligong Mountains in Western Yunnan, China, 云南植物研究, 2007, 第 3 作者
（62） 中国滇西天南星科一新种——保山犁头尖, Typhonium baoshanense Z. L. Dao ��� H. Li, a new species of Araceae from western Yunnan, China, 植物分类学报, 2007, 第 3 作者
（63） 西畴青冈——贵州壳斗科一新记录种, Cyclobalanopsis sichourensis, a New Record Species of Fagaceae in Gnizhou, 云南植物研究, 2007, 第 2 作者
（64） Typhonium baoshanense Z. L. Dao & H. Li, a new species of Araceae from western Yunnan, China, ACTA PHYTOTAXONOMICA SINICA, 2007, 第 3 作者
（65） Paris caobangensis Y. H. Ji, H. Li & Z. K. Zhou (Trilliaceae), a new species from northern Vietnam, ACTA PHYTOTAXONOMICA SINICA, 2006, 第 1 作者
（66） Paris xichouensis, a new combination of Trilliaceae from China, ACTA PHYTOTAXONOMICA SINICA, 2006, 第 1 作者
（67） Phylogeny and classification of Paris (Melanthiaceae) inferred from DNA sequence data, ANNALS OF BOTANY, 2006, 第 1 作者
（68） Paris xichouensis, a new combination of Trilliaceae from China, ACTA PHYTOTAXONOMICA SINICA, 2006, 第 1 作者
（69） Paris caobangensis Y. H. Ji, H. Li & Z. K. Zhou (Trilliaceae), a new species from northern Vietnam, ACTA PHYTOTAXONOMICA SINICA, 2006, 第 1 作者
（70） Paris xichougensis, a new combination of Trilliaceae, Acta Phytotaxonomica Sinica, 2006, 第 1 作者
（71） Arisaema menglaense (Araceae: Arisaemateae), a new species from southern Yunnan, China, ANNALESBOTANICIFENNICI, 2004, 第 1 作者
（72） Traditional utilization of Chinese chellera (Stellera chamaejasme L.) in northwest Yunnan, China, Ethnobotany, 2000, 第 1 作者
（73） Historical biogeography and evolutionary diversification of Lilium (Liliaceae): New insights from plastome phylogenomics, PLANT DIVERSITY, 第 7 作者

（1） A Monograph of Paris (Melanthiaceae), Springer, 2021-01, 第 1 作者