基本信息
周金秋  男  博导  中国科学院分子细胞科学卓越创新中心
电子邮件: jqzhou@sibcb.ac.cn
通信地址: 岳阳路320号生化所新大楼515室
邮政编码: 200031

研究领域

        实验室的长远目标是探索真核细胞维持染色体稳定性的机制和细胞衰老的机理。真核细胞中的染色质分为常染色质和异染色质,处于常染色质区的基因表达活跃,而处于异染色质区的基因保持沉默。由于异染色质会扩展,常、异染色质之间会形成特异的“边界”。该边界的形成既有特异的DNA元件,也有染色质的修饰因子参与。在酿酒酵母中,位于染色体末端的端粒是研究染色质结构/功能、沉默、染色质边界形成/调节、以及DNA复制/重组等表观遗传调控的很好的模型。端粒是由简单的DNA重复序列及其结合蛋白组成。端粒对于维持染色体的稳定性,维持细胞连续分裂和防止细胞衰老具有非常重要的作用。在大多数真核生物中,端粒DNA是由特异性的反转录酶、即端粒酶合成的,在端粒酶缺失的情况下也可以由同源的重组途径合成。另外,端粒也是一种典型的异染色质结构,能抑制相邻的基因表达。
        鉴于端粒的异染色质的特性,以及酵母基因组具有灵活的遗传操作性,我们用酵母端粒作为特别的切入点来研究一些基础问题,比如端粒是如何保持染色体稳定性的;在常染色质和异染色质之间的边界是如何建立的;DNA双链损伤或端粒复制发生时所产生的表观遗传信息是什么;细胞衰老的分子基础又是什么。

招生信息

   
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
招生方向
染色质与细胞衰老

教育背景

1992-08--1997-05   美国迈阿密大学医学院   博士
1984-09--1988-06   南京大学   本科
学历


工作经历

   
工作简历
2020-04~现在, 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心, 副主任,研究员
2001-09~2020-04,中科院上海生化细胞所, 研究员
1998-07~2001-09,美国普林斯顿大学, 博士后
1997-06~1998-05,美国迈阿密大学医学院, 博士后
1988-07~1992-07,中科院上海生化所, 研究助理
社会兼职
2020-04-30-今,中国科学院杭州高等研究院, 兼职教授
2014-08-21-2018-08-20,中国生物化学与分子生物学会, 常务理事
2014-07-01-今,Journal of Genetics and Genomics, 编委
2013-01-01-今,上海科技大学, 兼职教授
2012-07-01-2017-06-30,Journal of Biological Chemistry, 编委
2011-07-01-2016-06-30,PLoS Genetics, 副主编(Associate Editor)
2009-06-01-今,Journal of Molecular and Cellular Biology, 副主编
2007-01-01-2010-12-31,“Mechanisms of Aging and Development”杂志的编辑顾问委员会委员,
2003-01-01-今,中国生物化学与分子生物学会理事,
2003-01-01-今,中国遗传学会理事,
2003-01-01-今,中国细胞生物学会理事,
2002-02-01-2007-01-30,中国科学院与德国马普学会合作的青年科学家小组组长,

教授课程

实验生物学
分子生物学
bio2000 分子生物学
bio2000,分子生物学
Bio2000, 分子生物学
染色体,染色质和端粒
细胞周期调控的分子机制
细胞衰老

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 中科院朱李月华优秀教师奖, 一等奖, 省级, 2011
专利成果
( 1 ) 一种人Pif1基因、其编码蛋白及其应用, 发明专利, 2008, 第 1 作者, 专利号: ZL 200410047385.3

出版信息

   
发表论文
[1] Can Hu, Xue-Ting Zhu, Ming-Hong He, Yangyang Shao, Zhongjun Qin, Zhi-Jing Wu, Jin-Qiu Zhou. Elimination of subtelomeric repeat sequences exerts little effect on telomere functions in Saccharomyces cerevisiae. eLife[J]. 2024, 12: RP91223-, [2] Yuang Wang, Zhen Qu, Yi Fang, Yulong Chen, Jiayin Peng, Jiawen Song, Jinsong Li, Jiantao Shi, Jin-Qiu Zhou, Yun Zhao. Chromosome territory reorganization through artificial chromosome fusion is compatible with cell fate determination and mouse development. CELL DISCOVERY[J]. 2023, 9(1): 1-14, http://dx.doi.org/10.1038/s41421-022-00511-1.
[3] Pan, Yue, Hu, Can, Hou, LinJun, Chen, YuLong, Shi, Jiantao, Liu, JiaCheng, Zhou, JinQiu. Swc4 protects nucleosome-free rDNA, tDNA and telomere loci to inhibit genome instability. DNA REPAIR[J]. 2023, 127: http://dx.doi.org/10.1016/j.dnarep.2023.103512.
[4] Gu, Xin, Ye, Tiantian, Zhang, XiaoRan, Nie, Lingyun, Wang, Huan, Li, Wei, Lu, Rui, Fu, Chuanhai, Du, LiLin, Zhou, JinQiu. Single-chromosome fission yeast models reveal the configuration robustness of a functional genome. CELL REPORTS[J]. 2022, 40(8): http://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2022.111237.
[5] Li, QianXi, Liu, JiaCheng, He, MingHong, Zhou, JinQiu. Kae1 of Saccharomyces cerevisiae KEOPS complex possesses ADP/GDP nucleotidase activity. BIOCHEMICAL JOURNAL[J]. 2022, 479(23): 2433-2447, [6] Gong, Ting, Gu, Xin, Liu, YuTing, Zhou, Zhen, Zhang, LingLi, Wen, Yang, Zhong, WeiLi, Xu, GuoLiang, Zhou, JinQiu. Both combinatorial K4me0-K36me3 marks on sister histone H3s of a nucleosome are required for Dnmt3a-Dnmt3L mediated de novo DNA methylation. JOURNAL OF GENETICS AND GENOMICS[J]. 2020, 47(2): 105-114, http://lib.cqvip.com/Qikan/Article/Detail?id=7101658604.
[7] Wu, ZhiJing, Liu, JiaCheng, Man, Xin, Gu, Xin, Li, TingYi, Cai, Chen, He, MingHong, Shao, Yangyang, Lu, Ning, Xue, Xiaoli, Qin, Zhongjun, Zhou, JinQiu. Cdc13 is predominant over Stn1 and Ten1 in preventing chromosome end fusions. ELIFE[J]. 2020, 9: https://doaj.org/article/d1d0382480b540a39cf37dfecaca48d3.
[8] Liu, JiaCheng, Li, QianJin, He, MingHong, Hu, Can, Dai, Pengfei, Meng, FeiLong, Zhou, Bo O, Zhou, JinQiu. Swc4 positively regulates telomere length independently of its roles in NuA4 and SWR1 complexes. NUCLEIC ACIDS RESEARCH[J]. 2020, 48(22): 12792-12803, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7736797/.
[9] He, MingHong, Liu, JiaCheng, Lu, YiSi, Wu, ZhiJing, Liu, YingYing, Wu, Zhenfang, Peng, Jing, Zhou, JinQiu. KEOPS complex promotes homologous recombination via DNA resection. NUCLEIC ACIDS RESEARCH[J]. 2019, 47(11): 5684-5697, http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz228.
[10] Shao, Yangyang, Lu, Ning, Wu, Zhenfang, Cai, Chen, Wang, Shanshan, Zhang, LingLi, Zhou, Fan, Xiao, Shijun, Liu, Lin, Zeng, Xiaofei, Zheng, Huajun, Yang, Chen, Zhao, Zhihu, Zhao, Guoping, Zhou, JinQiu, Xue, Xiaoli, Qin, Zhongjun. Creating a functional single-chromosome yeast. NATURE[J]. 2018, 560(7718): 331-+, http://202.127.25.143/handle/331003/3385.
[11] LingLi Zhang, Zhenfang Wu, JinQiu Zhou. Tell and Rif2 oppositely regulate telomere protection at uncapped telomeres in Saccharomyces cerevisiae. 遗传学报:英文版[J]. 2018, 45(9): 467-476, http://lib.cqvip.com/Qikan/Article/Detail?id=676684538.
[12] Wu, Zhenfang, He, MingHong, Zhang, LingLi, Liu, Jun, Zhang, QiongDi, Zhou, JinQiu. Rad6-Bre1 mediated histone H2Bub1 protects uncapped telomeres from exonuclease Exo1 in Saccharomyces cerevisiae. DNA REPAIR[J]. 2018, 72: 64-76, http://dx.doi.org/10.1016/j.dnarep.2018.09.007.
[13] Yangyang Shao, Ning Lu, Chen Cai, Fan Zhou, Shanshan Wang, Zhihu Zhao, Guoping Zhao, JinQiu Zhou, Xiaoli Xue, Zhongjun Qin. A single circular chromosome yeast. CELL RESEARCH[J]. 2018, 29(1): 87-89, [14] Zhang, LingLi, Wu, Zhenfang, Zhou, JinQiu. Tel1 and Rif2 oppositely regulate telomere protection at uncapped telomeres in Saccharomyces cerevisiae. JOURNAL OF GENETICS AND GENOMICS[J]. 2018, 45(9): 467-476, http://sciencechina.cn/gw.jsp?action=detail.jsp&internal_id=6353422&detailType=1.
发表著作
(1) 抗衰老革命, The Telomerase Revolution, 上海科学技术出版社, 2017-07, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 干细胞编程与重编程中表观遗传密码建立和维持的分子机制和结构基础, 参与, 国家任务, 2011-01--2015-08
( 2 ) 组蛋白H4的K5/8/12乙酰化“密码”的建立和解读, 负责人, 国家任务, 2009-01--2012-12
( 3 ) 干细胞编程与重编程中表观遗传密码建立和维持的分子机制和结构基础, 参与, 国家任务, 2011-01--2015-12
( 4 ) 端粒与染色体稳定性, 负责人, 国家任务, 2013-01--2017-08
( 5 ) 染色质共价修饰在表观遗传调控中的机制研究(表观遗传学), 负责人, 国家任务, 2013-01--2015-12
( 6 ) 端粒异染色质形成的分子基础, 负责人, 国家任务, 2013-01--2017-12
( 7 ) 端粒长度的遗传调控机制, 负责人, 国家任务, 2014-10--2016-09
( 8 ) 染色质共价修饰在表观遗传调控中的机制研究(表观遗传学), 负责人, 国家任务, 2016-01--2018-12
( 9 ) 表观遗传调控中关键蛋白质机器的结构功能研究, 参与, 国家任务, 2016-07--2020-12
( 10 ) 单染色体酵母细胞染色体遗传机制研究, 负责人, 地方任务, 2018-12--2021-11
( 11 ) 染色体改造单倍体干细胞的构建及应用, 负责人, 国家任务, 2019-10--2023-12
( 12 ) 创建单条染色体小鼠研究, 负责人, 中国科学院计划, 2019-09--2023-12
( 13 ) 构建基因组无内含子的酵母细胞, 负责人, 国家任务, 2022-01--2024-12
参与会议
(1)Chromosome reorganization reveals high plasticity of eukaryotic genome   第十四届中国模式真菌研讨会   2023-05-13
(2)Single-chromosome Yeast Models Reveal the Configuration Robustness of Functional Eukaryotic Genomes   2022生物物理大会   2022-12-04
(3)Independent manipulation of histone H3 modifications in individual nucleosomes reveals the contributions of sister histones to transcription   第三届遗传学和基因组学前沿会议   2017-10-09
(4)KEOPS Complex Affects DNA Double-Strand Break Repair by Promotion DNA End Resection   第十届中国模式真菌研讨会   2017-06-09
(5)Modifications on both sister histone H3s coordinate to regulate chromatin structure and transcription   第十二次全国基因功能与表观遗传调控学术研讨会   2017-06-01
(6)Asymmetrically modified nucleosomes poise genes for activation or repression   2016年度全国生化大会   2016-10-20
(7)Inhibition of telomere recombination promotes yeast cell longevity   2016-09-09
(8)Rad6-Bre1 mediated H2B ubiquitination regulates telomere replication by promoting telomere-end resection   苏州冷泉港   2016-09-05
(9)Rad6-Bre1 mediated H2B ubiquitination regulates telomere replication by promoting telomere-end resection   苏州冷泉港   2016-09-05
(10)Asymmetrically modified nucleosomes poise genes for activation/repression in yeast   第七届全国微生物遗传学学术研讨会   2016-08-05
(11)无   第九届中国模式真菌研讨会   2016-06-17
(12)The KEOPS complex regulates telomere replication and recombination independently of tRNA modification   苏州冷泉港   2016-06-13
(13)Asymmetrically modified nucleosomes poise gene activation/repression in yeast   苏州冷泉港   2016-05-09
(14)Inhibition of Telomere Recombination Promotes Cell Longevity   第十五屆美洲華人生物科學學會學術研討會   2015-06-26
(15)无   第八届中国模式真菌研讨会   2015-06-12
(16)Hmt1 dimer fulfills methylation of histone H3 arginine 2 in trans   第七届中国模式真菌研讨会   李宏韬   2014-05-30
(17)无   无   2014-04-30
(18)Histone H4 lysine 12 acetylation regulates telomere dynamics in Saccharomyces cerevisiae   染色质与表观遗传研讨会   Bo Zhou   2010-05-16
(19)The function of Est1p and Est3p in regulation of telomerase activity in Saccharomyces cerevisiae   第66届日本癌症学会年会   Jinqiu Zhou   2007-10-05

指导学生

已指导学生

张登宏  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

陈勇彬  博士研究生  071009-细胞生物学  

付晓虹  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

廖新化  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

杨翠萍  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张明亮  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

钱慰  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

黄妤  硕士研究生  071009-细胞生物学  

孟飞龙  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

陈小芬  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

周波  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

童夏静  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

胡琰  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王珊珊  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

刘宁宁  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

彭晶  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

段一民  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

周振  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

刘雨婷  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

何明洪  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张伶俐  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

刘颖颖  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

蔡琛  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

吴年凤  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

李亭宜  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张琼娣  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

刘家程  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

温洋  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

吴至竞  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

顾欣  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

任巧盈  硕士研究生  086000-生物与医药  

现指导学生

叶添添  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

胡粲  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

满鑫  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

朱雪婷  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

屈珍  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

陈依纯  硕士研究生  086000-生物与医药  

田晓骏  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

刘军军  硕士研究生  071009-细胞生物学