本课题组主要研究方向是以机会性致病菌—铜绿假单胞菌为研究对象，利用跨学科的交叉研究手段，研究细菌生物被膜形成的机制、绿脓杆菌基因回路以及病菌与宿主间的互相作用；利用光遗传学在假单胞菌属的生物底盘中实现基于环鸟苷二磷酸通用基因调控线路的创建；利用我们创建的可控生物底盘以及新型的基因线路去尝试解决和环境、健康直接相关的重大问题。

本实课题组长期招收对合成生物学感兴趣的博士后，研究助理，及客座学生，不限专业背景（数学、物理、化学、生物、工程）。

同时欢迎想继续深造的应往届本科生申请本课题组的研究生。

课题组主页：http://jin.isynbio.siat.ac.cn

2003-08--2007-07   香港中文大学   博士
1997-09--2002-07   中国科学技术大学   学士

2019-04~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院, 研究员

2011-08~2019-04,中国科学技术大学, 教授

2009-11~2011-07,美国加州大学洛杉矶分校, 博士后

2009-01~2009-11,美国伊利诺伊州大学香槟分校, 博士后

2007-08~2009-01,香港中文大学, 博士后

（ 1 ） 一种应用于细胞体的多色荧光蛋白浓度的检测方法及设备, 发明, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN201910808830. X

在 Science、Nat. Matt.、 Nat. Commu.、 PNAS、 Elife、 Acs Synth. Biol. 等国际主流学术刊物上发表论文四十余篇。

[1] Zhaohui Cao, Wenlong Zuo, Lanxiang Wang, Junyu Chen, Zepeng Qu, Fan Jin, Lei Dai. Spatial profiling of microbial communities by sequential FISH with error-robust encoding. NATURE COMMUNICATIONS[J]. 2023, 第 6 作者14(1): 1-15, http://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-37188-3.
[2] Armbruster, Catherine R, Lee, Calvin K, ParkerGilham, Jessica, de Anda, Jaime, Xia, Aiguo, Zhao, Kun, Murakami, Keiji, Tseng, Boo Shan, Hoffman, Lucas R, Jin, Fan, Harwood, Caroline S, Wong, Gerard C L, Parsek, Matthew R. Heterogeneity in surface sensing suggests a division of labor in Pseudomonas aeruginosa populations. ELIFE[J]. 2019, 第 10 作者8: 
[3] Xia, Aiguo, Yang, Shuai, Zhang, Rongrong, Ni, Lei, Xing, Xiaochen, Jin, Fan. Imaging the Separation Distance between the Attached Bacterial Cells and the Surface with a Total Internal Reflection Dark-Field Microscope. LANGMUIR[J]. 2019, 第 6 作者  通讯作者  35(26): 8860-8866, 
[4] Wang, Congcong, Chen, Wenhui, Xia, Aiguo, Zhang, Rongrong, Huang, Yajia, Yang, Shuai, Ni, Lei, Jin, Fan. Carbon Starvation Induces the Expression of PprB-Regulated Genes in Pseudomonas aeruginosa. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY[J]. 2019, 第 8 作者  通讯作者  85(22): 
[5] Han, Jundong, Xia, Aiguo, Huang, Yajia, Ni, Lei, Chen, Wenhui, Jin, Zhenyu, Yang, Shuai, Jin, Fan. Simultaneous Visualization of Multiple Gene Expression in Single Cells Using an Engineered Multicolor Reporter Toolbox and Approach of Spectral Crosstalk Correction. ACS SYNTHETIC BIOLOGY[J]. 2019, 第 8 作者  通讯作者  8(11): 2536-2546, 
[6] Ernest Y Lee, Changsheng Zhang, Jeremy Di Domizio, Fan Jin, Will Connell, Mandy Hung, Nicolas Malkoff, Veronica Veksler, Michel Gilliet, Pengyu Ren, Gerard C L Wong. Helical antimicrobial peptides assemble into protofibril scaffolds that present ordered dsDNA to TLR9. NATURE COMMUNICATIONS[J]. 2019, 第 4 作者10(1): 1-10, https://doaj.org/article/0cfa78d072484607acce93542e7e8977.
[7] Zhenyu Jin, Jiahong Li, Lei Ni, Rongrong Zhang, Aiguo Xia, Fan Jin. Conditional privatization of a public siderophore enables Pseudomonas aeruginosa to resist cheater invasion. NATURE COMMUNICATIONS[J]. 2018, 第 6 作者  通讯作者  9(1): https://doaj.org/article/40016504d0ba42548a2482f8f473707c.
[8] Huang, Yajia, Xia, Aiguo, Yang, Guang, Jin, Fan. Bioprinting Living Biofilms through Optogenetic Manipulation. ACS SYNTHETIC BIOLOGY[J]. 2018, 第 4 作者  通讯作者  7(5): 1195-1200, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000432901300003.
[9] 金帆. Differential production of Psl in planktonic cells leads to two distinctive attaching phenotypes in Pseudomonas aeruginosa. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY. 2018, 第 1 作者  通讯作者  
[10] Pu, Lu, Yang, Shuai, Xia, Aiguo, Jin, Fan. Optogenetics Manipulation Enables Prevention of Biofilm Formation of Engineered Pseudomonas aeruginosa on Surfaces. ACS SYNTHETIC BIOLOGY[J]. 2018, 第 4 作者  通讯作者  7(1): 200-208, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000423252800021.
[11] 金帆. Dual-color fluorescent timer enables detection of growth-arrested pathogentic bacterium. ACS Infectious Diseases. 2018, 第 1 作者  通讯作者  
[12] 金帆. Strong shear flow persister bacteria resist mechanical washing on the surfaces of various polymer materials. Advanced Biosystems. 2017, 第 1 作者  通讯作者  
[13] Ni, Lei, Yang, Shuai, Zhang, Rongrong, Jin, Zhenyu, Chen, Hao, Conrad, Jacinta C, Jin, Fan. Bacteria differently deploy type-IV pili on surfaces to adapt to nutrient availability. NPJ BIOFILMS AND MICROBIOMES[J]. 2016, 第 7 作者  通讯作者  2: https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000419466300009.
[14] Schmidt, Nathan W, Jin, Fan, Lande, Roberto, Curk, Tine, Xian, Wujing, Lee, Calvin, Frasca, Loredana, Frenkel, Daan, Dobnikar, Jure, Gilliet, Michel, Wong, Gerard C L. Liquid-crystalline ordering of antimicrobial peptide-DNA complexes controls TLR9 activation. NATURE MATERIALS[J]. 2015, 第 2 作者14(7): 696-+, http://dx.doi.org/10.1038/NMAT4298.

曾主持6项国家级基金项目，含1项国家优秀青年科学基金，目前5项已结题，1项在研。

（ 1 ） 新显微活细胞微操方法的建立以及在细菌生物被膜研究中的应用, 主持, 国家级, 2018-01--2021-12
（ 2 ） 抗瘤菌基因线路设计与合成, 参与, 国家级, 2019-07--2024-06