主要从事复杂网络智能分析方法研究及其在生物信息方面的应用，建立了复杂网络智能分析的系列模型，取得了一系列创新的结果。目前已在IEEE系列汇刊、Briefings in Bioinformatics、自动化学报（英文版）和AAAI等国际重要期刊和会议上累计发表百余篇论文，包括ESI 高被引论文4篇、热点论文1篇。撰写专著1部、申请发明专利10余项。先后主持国家自然科学基金项目（面上、青年）、国家重点研发计划子课题以及省部级基金项目。入选斯坦福大学全球前2%顶尖科学家、中国科学院高层次人才择优支持、新疆天山英才-科技创新领军人才、新疆杰出青年科技人才等人才项目支持。先后获得了省级自然科学奖一等奖（第1完成人）、智能计算国际会议（ICIC 2023）最佳论文等奖励。担任多个国际期刊的编委和客座编辑、多个国际会议的分会主席以及IEEE BIBM 2021-2024程序委员会委员。

   

081203-计算机应用技术

人工智能、深度学习、生物信息

2011-02--2015-05   香港理工大学   博士研究生
2007-09--2008-10   香港理工大学   硕士研究生
2002-09--2006-06   华中科技大学   学士

研究生

博士

   

2020-07~现在, 中国科学院新疆理化技术研究所, 研究员
2017-08~2018-01,香港城市大学, 高级研究助理
2015-07~2020-06,武汉理工大学, 副教授

2021-12-31-今,BMC Bioinformatics, 编委
2020-04-01-今,Frontiers in Neurorobotics, 编委

   

（1） 自治区科学技术奖, 一等奖, 省级, 2023

   

（1） A Distributed Framework for Large-scale Protein-protein Interaction Data Analysis and Prediction Using MapReduce, IEEE-CAA JOURNAL OF AUTOMATICA SINICA, 2022, 第 1 作者
（2） A Novel Method to Predict Drug-Target Interactions Based on Large-Scale Graph Representation Learning, CANCERS, 2021, 第 3 作者
（3） Predicting HIV-1 Protease Cleavage Sites With Positive-Unlabeled Learning, FRONTIERS IN GENETICS, 2021, 第 11 作者
（4） A survey on computational models for predicting protein-protein interactions, BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2021, 第 1 作者
（5） Exploiting higher-order patterns for community detection in attributed graphs, INTEGRATED COMPUTER-AIDED ENGINEERING, 2021, 第 1 作者
（6） HiSCF: leveraging higher-order structures for clustering analysis in biological networks, BIOINFORMATICS, 2021, 第 11 作者
（7） Automatic Detection of Melanins and Sebums from Skin Images Using a Generative Adversarial Network, COGNITIVE COMPUTATION, 2021, 第 11 作者
（8） An Efficient Computational Model for Large-Scale Prediction of Protein-Protein Interactions Based on Accurate and Scalable Graph Embedding, FRONTIERS IN GENETICS, 2021, 第 3 作者
（9） Generalized Nesterov’s Acceleration-incorporated, Non-negative and Adaptive Latent Factor Analysis, IEEE Transactions on Services Computing, 2021, 
（10） An Experimental Investigation into Promoting Mental Health Service Use on Social Media: Effects of Source and Comments, INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL RESEARCH AND PUBLIC HEALTH, 2020, 第 11 作者
（11） A Variational Bayesian Framework for Cluster Analysis in a Complex Network, IEEE TRANSACTIONS ON KNOWLEDGE AND DATA ENGINEERING, 2020, 第 1 作者
（12） Non-Negativity Constrained Missing Data Estimation for High-Dimensional and Sparse Matrices from Industrial Applications., IEEE TRANSACTIONS ON CYBERNETICS, 2020, 第 4 作者
（13） Efficiently Detecting Protein Complexes from Protein Interaction Networks via Alternating Direction Method of Multipliers, IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2019, 第 1 作者
（14） Incorporating the Coevolving Information of Substrates in Predicting HIV-1 Protease Cleavage Sites., IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2019, 
（15） Automatic hierarchy classification in venation networks using directional morphological filtering for hierarchical structure traits extraction, COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, 2019, 第 4 作者
（16） Phenotype Extraction Extraction Based on Word Embedding to Sentence Embedding Cascaded Approach, IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, 2018, 第 4 作者
（17） A gene-phenotype relationship extraction pipeline from the biomedical literature using a representation learning approach, BIOINFORMATICS, 2018, 第 8 作者
（18） Learning Latent Factors for Community Identification and Summarization, IEEEACCESS, 2018, 第 2 作者
（19） Efficiently predicting large-scale protein-protein interactions using MapReduce, COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, 2017, 第 11 作者
（20） Extracting Coevolutionary Features from Protein Sequences for Predicting Protein-Protein Interactions, IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2017, 第 11 作者

（1） 面向数字传播的云计算理论与技术, Theory and Technology of Cloud Computing for Digital Communication, 武汉大学出版社, 2022-06, 第 1 作者

   

（ 1 ） 知识驱动的可解释性药物重定位方法及作用机制研究, 负责人, 国家任务, 2024-01--2027-12
（ 2 ） 中国科学院率先行动"****"（B类）, 负责人, 中国科学院计划, 2022-01--2024-12
（ 3 ） 大规模复杂网络的可解释性社团发现方法研究, 负责人, 地方任务, 2021-07--2025-06
（ 4 ） 藏文文献资源数字化技术集成与应用, 参与, 国家任务, 2017-12--2020-12
（ 5 ） 大规模蛋白质相互作用网络中可重叠复合物的识别算法研究, 负责人, 国家任务, 2017-01--2019-12
（ 6 ） 基于生成式概率模型的大规模复杂网络聚类分析, 负责人, 地方任务, 2016-01--2017-12

已指导学生

苏小芮  博士研究生  081203-计算机应用技术  

张瀚元  博士研究生  081203-计算机应用技术  

张梦龙  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

赵博伟  博士研究生  081203-计算机应用技术  

现指导学生

邓迅  硕士研究生  085404-计算机技术  

李国栋  博士研究生  081203-计算机应用技术  

李东旭  硕士研究生  085400-电子信息  

杨月  博士研究生  081203-计算机应用技术  

常颖  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

张铭健  硕士研究生  085404-计算机技术