尽管在小麦抗病育种领域已经有大量的抗病基因被挖掘和利用，但大部分抗病基因随着使用范围的扩大会逐步丧失抗性。病原菌编码的无毒基因在选择压力下会变异，导致抗病基因失效。也有可能在病原菌群体中原本就存在低频率的毒性菌株，在抗病基因的选择下频率增加，最终导致抗病基因失效。这个植物和病原菌的军备竞赛过程被称为boom-and-bust。本课题组以小麦抗病育种的历史过程为对象，解析小麦与病原菌之间的协同进化规律。一方面，我们研究植物抗病基因如果通过远缘杂交实现跨物种的抗性改良。另一方面，我们研究病原菌如何适应和逃逸植物寄主的识别。我们从这两个方面同时入手，综合利用基因组学、生物信息学、分子生物学等手段，解析小麦育种改良的遗传机制。我们希望将这些机制应用到未来种质资源创制过程中：以基因组学挖掘结果为依据设计杂交组配策略，与育种家合作培育持久抗病、产量稳定的小麦新品种。

0710J3-生物信息学

农作物与病原菌的协同进化
小麦群体遗传学
农作物病原真菌的基因组进化

2006-09--2011-06   中国农业大学   理学博士 （生物信息学）
2002-09--2006-06   西南大学   理学学士 （生物学）

   

2016-06~2021-06,堪萨斯州立大学 （美国）, 博士后 (Postdoc Follow)
2015-07~2016-06,伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校 （美国）, 访问学者 (Visiting scholar)
2012-08~2016-06,布鲁克海文国家实验室（美国）, 博士后 (Research Associate)
2011-07~2012-07,纪念斯隆凯特琳癌症中心 （美国）, 博士后 （Research Fellow）

RNAseq data analysis

现指导学生

张志蒙  博士研究生  0710J3-生物信息学  

尹谋  博士研究生  0710J3-生物信息学  

陈昭庚  博士研究生  0710J3-生物信息学  

王豪杰  博士研究生  0710J3-生物信息学  

李轩照  博士研究生  0710J3-生物信息学  

王一波  硕士研究生  071007-遗传学  

赵彩虹  博士研究生  0710J3-生物信息学  

张婧  博士研究生  0710J3-生物信息学  

王世捷  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

刘亚苓  博士研究生  071007-遗传学  

侯玥瑄  博士研究生  0710J3-生物信息学  

田阳阳  博士研究生  071007-遗传学  

刘则  博士研究生  071007-遗传学