长期聚焦东亚植物区系的起源与格局形成机制，整合植物分类学、生物地理学和生物信息学等多学科手段，从全球的视野较为系统地开展了东亚植物多样性调查与分类、区系来源和时空格局形成机制研究。具体包括：

     i）东亚植物区系重要热点地区植物多样性调查和系统分类学研究，解决长期有争议的物种系统演化问题；

     ii）重点关注我国特有或东亚植物区系重要特征类群，开展系统发育重建、性状进化、分化时间、起源地和多样性进化分析，并结合化石、古地理和古气候变迁，探讨它们的起源、分化历史和可能的散布途径；

    iii）东亚植物区系植物多样性分布格局及其形成机制，预测未来全球气候变化下植物多样性演变趋势。

        迄今，在PNAS、National Science Review、Research、Science China Life Science、Journal of Integrative Plant Biology、Global Ecology and Biogeography、Ecography、Biological Conservation、Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences、Journal of Biogeography、Diversity and Distributions、Plant Diversity、Molecular Phylogenetics and Evolution、Taxon等刊物上发表论文100余篇，主编专著4部。

        发表新属2个、新种23个。

071001-植物学

植物分类学，植物系统学，生物地理学，宏生态学，保护基因组学
宏生态学，保护基因组学

2021-02~现在, 中国科学院昆明植物研究所, 研究员
2020-07~现在, 中国科学院昆明植物研究所, 标本馆馆长（主管）
2018-11~2020-7, 中国科学院昆明植物研究所, 标本馆主管
2018-01~2021-02, 中国科学院昆明植物研究所, 副研究员
2015-07~2017-12,中国科学院昆明植物研究所, 工程师
2010-07~2012-09,中国科学院昆明植物研究所, 实习研究员

2024-01-01-2025-12-31,中国科学：生命科学, 青年编委
2024-01-01-2025-12-31,SCIENCE CHINA Life Science, 青年编委
2023-03-01-2025-12-31,Plant Diversit, 编委
2021-11-02-今,Frontiers in Genetics, Associate Editor
2020-09-30-今,云南省植物学会, 理事
2019-12-01-今,云南省植物学会植物系统分类学与生物地理专业委员会, 委员

2024, 青藏高原青年科技奖

2024, 云南省自然科学一等奖（2/6）

2024, 湖北省科技进步三等奖（2/15）

2020, 湖南省自然科学三等奖(5/5)

2014, 湖北省科技进步二等奖（4/10）

近3年代表论文（^#co-first authors, *Corresponding authors）

2025年

Fu QS^#, Michalet R ^#, Volis S, Huang XH, Chen JT, Zhang XJ, Liu Q, Zhang JW, Ma XG, Yue JP, Zhang DC, Peng DL, Niu Y, Chen JG, Song B, Luo D, Yang Y, Luo PR, Kuai XY, Shi G, Li ZM, Sun H*, Deng T*. 2025. Cushion presence and species pools mitigate the effect of climate on species richness in alpine communities. Research 8: Article 0975.

He SL^#, Hu J^#, Peng JY, Qu S, Sun H, Deng T*, Chen JT*. 2025. Corydalis xideensis (Papaveraceae), a new species from Sichuan, China. Phytotaxa 721:81-86.

Peng JY^#, Huang XH^#, Jung J, Kim C, Kim TH, Tanaka N, Kim JH*, Sun H*, Deng T*. 2025. Reconstructing the evolutionary trajectory of Chamaelirium through phylogenomics: Integrating evidence from plastome dynamics and historical biogeography. BMC Plant Biology 25: 1315.

Lin N, Wang YK, Landis JB, Wang XK, Wang HC, Huang XH, Liu Q, Xu TT, Shang FD*, Deng T*, Liu YP*. 2025. Genomic insights into convergent evolution in endangered trees and the collapse of a Tertiary relict tree in East Asia. The Plant Journal 123: e70425.

Lin N, Wang YK, Huang XH, Liu Q, Liu YP, Wang XK, He YX, Wang HC*, Deng T*. 2025. Genomic insights into local adaption across heterogenous habitats and climate change vulnerability. Molecular Ecology 34: e70068.

Liu Q, Lin N, Zhang DG, Huang XH,  Li YB, Zheng YY, Tojibaeva U, Zhang JW*, Deng T*. 2025. Revised phylogeny of the Inula complex group (Asteraceae: Inuleae) with a recircumscription of Carpesium and establishment of a new genus Cladocarpesium. Journal of Systematics and Evolution 64: 95-105.

Huang XH^#, Deng T^#*, Chen JT, Fu QC, Zhang XJ, Lin N, Luo PR, Liu Q, Kuai XY, Peng JY, Landis JB, Wei YT, Wang HC*, Sun H *. 2025. Spatial distribution patterns and formation of global spermatophytes. Journal of Integrative Plant Biology 67: 2668-2685.

Huang XH^#, Peng JY^#, Lin N^#, Liu J, Chen JT, Liu Q, Zhang XJ, Fu QS, Luo PR, Wang ZY, Lee SY, Zhou Q, Sun H*, Deng T*. 2025. Climatic niche divergence and long-distance dispersal contributed to the pantropical intercontinental disjunctions of a liana lineage (Uncaria, Rubiaceae). Plant Diversity 47: 772-783.

Kuai XY^#, Fu QS^#, Sun H*, Deng T*. 2024. Expeditionplus: the application of a gridded system in the integration of multidimensional environmental factors. Plant Diversity 47: 702-708.

2024年

Zhang XJ, Huang XH, Landis JB, Fu QS, Chen JT, Luo PR, Li LJ, Lu HY, Sun H*,  Deng T*. 2024. Shifts in reproductive strategies in the evolutionary trajectory of plant lineages. SCIENCE CHINA Life Sciences 67: 2499-2510.

Rana S, Rana H, Landis J, Kuang TH, Chen JT, Wang HC, Deng T*, Davis C*, Sun H*. 2024. Pleistocene glaciation advances the cryptic speciation of Stellera chamaejasme L. in a major biodiversity hotspot. Journal of Integrative Plant Biology 66: 1192-1205.

Ye YJ^#, Fu QS^#, Volis S, Li ZM, Sun H*, Deng T*. 2024. Evolutionary correlates of extinction risk in Chinese angiosperm. Biological Conservation 292 :110549.

Liu Q^#, Zhang T^#, Zhang DG, Huang XH, Yang JY, Tojibaev U, Zhang JW*, Deng T*. 2024. Rediscovery of  Youngia longipes  reveals a new species of  Youngia  (Asteraceae) in China. Phytotaxa 655: 21-36.

Chen JT^#, Lidén M^#, Huang XH, Yang SQ, Zhang XJ, Liu Q, Su QL, Hua GJ, Luo J*,  Deng T*. 2024. Corydalis sunhangii (Papaveraceae): a new species from Xizang, China, based on plastome and morphological data. Ecology and Evolution 14: e11225.

Zhang XJ, Jiang KZ, Kuai XY, Chen JT, Luo PR, Deng T^*, Sun H^*. 2024. Taxonomic resurrection of Saxifraga lancangensis (Saxifragaceae). Botanical Study 65:12.

Yang SQ^#, Chen JT^#, Li ZM, Huang XH, Zhang X, Liu Q, Tojibaev K, Sun H*, Deng T*. 2024. Comparative chloroplast genomes of Dactylicapnos: insights into phylogenetic relationships. BMC Plant Biology 24: 350.

Juramurodov I, Makhmudjanov D, Yusupova Z, Nikitina E, Deng T*, Sun H*, Tojibaev K*. 2024. Phylogenetic relationships and biogeography in Hedysarum (Hedysareae, Fabaceae) with a focus on Central Asian taxa. Taxon 72: 1262-1284.

Makhmudjanova D, Volis S, Yusupov Z, Juramurodov I, Tojibaev K*, Deng T*, Sun H*. 2024. Central Asia revealed as a key area in evolution of Eremurus (Asphodelaceae). Plant Diversity 46: 333-343.

（1） 长江中上游兰科植物图鉴, 云南科技出版社, 2024-03, 第 3 作者
（2） 湖北五峰后河国家级自然保护区植物志（上中下卷）, 云南科技出版社, 2023-08, 第 1 作者
（3） 神农架国家公园植物多样性研究及编目, 中国林业出版社, 2020-12, 第 1 作者
（4） Flora of Dzhizak Province, Uzbekistan, China Forestry Publishing House, 2020-10, 第 5 作者
（5） 神农架植物志（第四卷）, Flora of Shennongjia (Volume 4), 中国林业出版社, 2018-05, 第 1 作者
（6） 神农架植物志（第二卷）, Flora of Shennongjia (Volume 2), 中国林业出版社, 2018-03, 第 1 作者
（7） 神农架植物志（第一卷）, Flora of Shennongjia (Volume 1), 中国林业出版社, 2018-01, 第 1 作者
（8） 神农架植物志（第三卷）, Flora of Shennongjia (Volume 3), 中国林业出版社, 2017-08, 第 1 作者

1.  西南山地河谷生物资源持续利用与绿色产业协同提升技术体系，主持, 国家重点研发计划重点专项项目, 1370万, 2024-12--2027-11

2.  数字植物标本资源研发与应用，课题主持, 云南省重点研发计划重点专项项目, 185万, 2024-06--2026-06

3.  植物分类与区系地理学, 主持, 国家自然科学基金委优秀青年基金项目, 200万, 2024-01--2026-12

4.  整合形态和简化基因组测序对菊科天名精属的分类修订, 主持, 国家自然科学基金委面上项目, 58万, 2022-01--2025-12

5.  神农架国家公园维管植物资源调查与研究, 主持,  210万, 2022-01--2025-12

6.  标准化群落调查及植被资源清查与评估，共同主持，云南省基础研究专项重大项目课题，3415万，2021-08--2024-07

7.  植物多样性变化调查, 主持, 第二次青藏高原综合科学考察研究-课题, 2991万, 2019-11--2024-10

8.  东亚植物区系调查、分类及其起源与进化研究, 主持, 中国科学院青年促进会, 80万, 2019-01--2021-06

已指导学生

黄先寒  博士研究生  071001-植物学  

陈俊通  博士研究生  071001-植物学  

匡田辉  硕士研究生  071001-植物学  

现指导学生

仝瑞  硕士研究生  071001-植物学  

郑滢颖  博士研究生  071001-植物学  

曾理  硕士研究生  086000-生物与医药  

陈思颖  硕士研究生  071001-植物学