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真菌基因组与转录组、基因功能、代谢途径的解析与进化研究。

简介：研究团队致力于理解真菌基因组和基因是如何工作的，研究对象为最受关注的毒蘑菇——鹅膏（Amanita）和兰茂牛肝菌（Lanmaoa asiatica）。获取重要相关物种的基因组序列是研究的基础，在此基础上研究聚焦并解析生源合成途径、毒素结构与功能，以及毒素的分子作用机制，通过前沿基因操纵与宿主表达，探讨与人类健康相关的应用，特别是确定重要先导化合物并对其成药性进行深入研究。

基因组：多基因组与转录组的有机结合，准确标定基因簇与合成基因岛等。

基因功能：应用遗传学、生物化学、分子生物学等方法对基因功能进行研究。

毒素结构与功能：利用冷冻电镜、x晶体射线衍射、核磁共振等方法确定重要毒素的结构，通过动物模型研究其功能与作用机制。

代谢途径解析与进化研究：综合应用各种方法确定基因在代谢中的功能与地位，确定代谢途径的整体运行规律，通过比较基因组与系统发育方法研究代谢途径的演化。

人工环肽库：通过人工改变前体基因、操纵后修饰基因等方法构建大型功能环肽库，在此基础上筛选功能环肽。

欢迎对基因组、基因、进化有浓厚兴趣的同学踊跃报考！

071001-植物学

真菌基因组
基因功能
代谢途径解析

2001-09--2006-07   云南大学   博士
1994-09--1998-07   四川大学   学士

研究生

博士

2015.09-至今       中国科学院昆明植物研究所   副研究员

2007.01-2015.07 美国密歇根州立大学能源部植物研究所  资深助理研究员

   

[1] 罗宏, 王伊潇, 吕李云娇, 李萱, 杨祝良. 从兰茂牛肝菌中提取的生物碱类化合物及其制备方法与用途. CN: CN115947724A, 2023-04-11.
[2] 罗宏, 李萱, 乔治文, 杨祝良. 一种剧毒蘑菇的快速检测方法. CN: CN106568769A, 2017-04-19.

   

[1] 罗宏. Pulvinic acid derivative pigments in Lanmaoa asiatica and L. macrocarpa. Chemistry and Biodiversity. Chem Biodivers[J]. 2024, 第 1 作者  通讯作者  e202301996- e202301996, 
[2] Hong Luo, Heather E. Hallen-Adams, Yunjiao Luli, R. Michael Sgambelluri, Xuan Li, Miranda Smith, Zhu L. Yang, Francis M. Martin. Genes and evolutionary fates of the amanitin biosynthesis pathway in poisonous mushrooms. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.[J]. 2022, 第 1 作者119(20): e2201113119, 
[3] Zhou, Shengwen, Li, Xincan, Luli, Yunjiao, Li, Xuan, Chen, Zuo H, Yuan, Pengcheng, Yang, Zhu L, Li, Guohong, Luo, Hong. Novel Cyclic Peptides from Lethal Amanita Mushrooms through a Genome-Guided Approach. JOURNAL OF FUNGI[J]. 2021, 第 9 作者  通讯作者  7(3): http://dx.doi.org/10.3390/jof7030204.
[4] Luli, Yunjiao, Zhou, Shengwen, Li, Xuan, Chen, Zuohong, Yang, Zhuliang, Luo, Hong. Differential Expression of Amanitin Biosynthetic Genes and Novel Cyclic Peptides in Amanita molliuscula. JOURNAL OF FUNGI[J]. 2021, 第 6 作者  通讯作者  7(5): http://dx.doi.org/10.3390/jof7050384.
[5] Codjia, Jean Evans I, Cai, Qing, Zhou, Sheng Wen, Luo, Hong, Ryberg, Martin, Yorou, Nourou S, Yang, Zhu L. Morphology, Multilocus Phylogeny, and Toxin Analysis Reveal Amanita albolimbata, the First Lethal Amanita Species From Benin, West Africa. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY[J]. 2020, 第 4 作者11: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7714729/.
[6] 罗宏. 鹅膏环肽毒素生源合成的研究进展. 菌物学报[J]. 2020, 第 1 作者  通讯作者  39(9): 1651-1660, http://lib.cqvip.com/Qikan/Article/Detail?id=7102998702.
[7] 罗宏. 毒蘑菇的组学研究. 菌物学报[J]. 2019, 第 1 作者  通讯作者  38(12): 2087-2098, http://lib.cqvip.com/Qikan/Article/Detail?id=7101005989.
[8] Luli, Yunjiao, Cai, Qing, Chen, Zuo H, Sun, Hu, Zhu, XueTai, Li, Xuan, Yang, Zhu L, Luo, Hong. Genome of lethal Lepiota venenata and insights into the evolution of toxin-biosynthetic genes. BMC GENOMICS[J]. 2019, 第 8 作者  通讯作者  20(1): http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/64144.
[9] Luo, Hong, Cai, Qing, Luli, Yunjiao, Li, Xuan, Sinha, Rohita, HallenAdams, Heather E, Yang, Zhu L. The MSDIN family in amanitin-producing mushrooms and evolution of the prolyl oligopeptidase genes. IMAFUNGUS[J]. 2018, 第 1 作者  通讯作者  9(2): 225-242, http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/64210.
[10] Hong Luo, Brandon DuBois, R. Michael Sgambelluri, Evan R. Angelos, Xuan Li, Daniel Holmes, Jonathan D. Walton. Production of 15N-labeled α-amanitin in Galerina marginata. TOXICON. 2015, 第 1 作者103: 60-64, http://dx.doi.org/10.1016/j.toxicon.2015.06.018.
[11] Luo, Hong, DuBois, Brandon, Sgambelluri, R Michael, Angelos, Evan R, Li, Xuan, Holmes, Daniel, Walton, Jonathan D. Production of N-15-labeled alpha-amanitin in Galerina marginata. TOXICON[J]. 2015, 第 1 作者  通讯作者  103: 60-64, http://www.irgrid.ac.cn/handle/1471x/1029028.
[12] Riley, Robert, Salamov, Asaf A, Brown, Daren W, Nagy, Laszlo G, Floudas, Dimitrios, Held, Benjamin W, Levasseur, Anthony, Lombard, Vincent, Morin, Emmanuelle, Otillar, Robert, Lindquist, Erika A, Sun, Hui, LaButti, Kurt M, Schmutz, Jeremy, Jabbour, Dina, Luo, Hong, Baker, Scott E, Pisabarro, Antonio G, Walton, Jonathan D, Blanchette, Robert A, Henrissat, Bernard, Martin, Francis, Cullen, Dan, Hibbett, David S, Grigoriev, Igor V. Extensive sampling of basidiomycete genomes demonstrates inadequacy of the white-rot/brown-rot paradigm for wood decay fungi. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA[J]. 2014, 第 16 作者111(27): 9923-9928, http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1400592111.
[13] Luo Hong, Hong Sung-Yong, Sgambelluri R Michael, Angelos Evan, Li Xuan, Walton Jonathan D. Peptide Macrocyclization Catalyzed by a Prolyl Oligopeptidase Involved in α-Amanitin Biosynthesis. CHEMISTRY & BIOLOGY[J]. 2014, 第 1 作者21(12): 1610-1617, http://dx.doi.org/10.1016/j.chembiol.2014.10.015.
[14] Luo, Hong, LenAdams, Heather E Hal, ScottCraig, John S, Walton, Jonathan D. Ribosomal biosynthesis of alpha-amanitin in Galerina marginata. FUNGAL GENETICS AND BIOLOGY[J]. 2012, 第 1 作者49(2): 123-129, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000300749000004.
[15] 罗宏. Cyclic peptides from poisonous mushrooms. Method Enzymol. 2012, 第 1 作者
[16] Luo, Hong, HallenAdams, Heather E, ScottCraig, John S, Walton, Jonathan D. Colocalization of Amanitin and a Candidate Toxin-Processing Prolyl Oligopeptidase in Amanita Basidiocarps. EUKARYOTIC CELL[J]. 2010, 第 1 作者9(12): 1891-1900, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000284879700009.
[17] Luo, Hong, Liu, Yajun, Fang, Lin, Li, Xuan, Tang, Ninghua, Zhang, Keqin. Coprinus comatus damages nematode cuticles mechanically with spiny balls and produces potent toxins to immobilize nematodes. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY[J]. 2007, 第 1 作者73(12): 3916-3923, http://dx.doi.org/10.1128/AEM.02770-06.
[18] Li, Lei, Mo, Minghe, Qu, Qing, Luo, Hong, Zhang, Keqin. Compounds inhibitory to nematophagous fungi produced by Bacillus sp strain H6 isolated from fungistatic soil. EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY[J]. 2007, 第 4 作者117(4): 329-340, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000245551100002.
[19] Hallen, Heather E, Luo, Hong, ScottCraig, John S, Walton, Jonathan D. Gene family encoding the major toxins of lethal Amanita mushrooms. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA[J]. 2007, 第 2 作者104(48): 19097-19101, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000251498700043.
[20] Luo, H, Li, X, Li, GH, Pan, YB, Zhang, KQ. Acanthocytes of Stropharia rugosoannulata function as a nematode-attacking device. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY[J]. 2006, 72(4): 2982-2987, http://dx.doi.org/10.1128/AEM.72.4.2982-2987.2006.
[21] Li, X, Luo, H, Zhang, KQ. A new species of Harposporium parasitic on nematodes. CANADIAN JOURNAL OF BOTANY-REVUE CANADIENNE DE BOTANIQUE[J]. 2005, 83(5): 558-562, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000229784300013.
[22] Luo, H, Mo, MH, Huang, XW, Li, X, Zhang, KQ. Coprinus comatus: A basidiomycete fungus forms novel spiny structures and infects nematode. MYCOLOGIA[J]. 2004, 96(6): 1218-1224, http://dx.doi.org/10.2307/3762137.
[23] Luo Hong, Hallen-Adams Heather E., Walton Jonathan D.. Processing of the Phalloidin Proprotein by Prolyl Oligopeptidase from the Mushroom Conocybe albipes *. THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 第 1 作者284(27): 18070-18077, http://dx.doi.org/10.1074/jbc.M109.006460.

主持2016年“剧毒蘑菇基因组与功能解析学术研讨会”

（ 1 ） 盔孢伞环肽生源合成基因簇及基因功能研究, 负责人, 研究所自主部署, 2016-10--2020-09
（ 2 ） 剧毒鹅膏环肽合成基因簇的研究, 负责人, 地方任务, 2016-11--2019-11
（ 3 ） 剧毒鹅膏"毒素基因岛"及毒素合成关键基因功能研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12
（ 4 ） 中国口蘑科的系统发育与属种多样性研究, 参与, 国家任务, 2018-01--2021-12
（ 5 ） 蘑菇目真菌鹅膏环肽生源合成的基因组架构与进化研究, 负责人, 国家任务, 2020-01--2023-12
（ 6 ） 剧毒鹅膏蘑菇基因组Hi-C测序, 负责人, 研究所自主部署, 2018-05--2020-12
（ 7 ） 生物多样性的演化历史与格局, 参与, 中国科学院计划, 2018-08--2023-07

（1）鹅膏环肽的关键合成基因与合成机制研究   2023中国∙楚雄蘑菇中毒临床防控大会   罗宏   2023-08-26
（2）蘑菇目的鹅膏环肽生源合成   中国菌物学会2023年学术年会   2023-08-18
（3）蘑菇目鹅膏环肽的生源合成   2023野生菌资源及可持续利用研讨会   2023-06-16
（4）The amanitin-biosynthetic pathway in Amanita, Galerina and Lepiota   2019亚太真菌国际大会   2019-10-01
（5）鹅膏的多基因组研究进展   菌物学年会   2018-08-10
（6）多基因组在鹅膏研究中的应用   菌物学年会   罗宏 杨祝良 Jonathan D. Walton   2017-08-18
（7）剧毒鹅膏环肽的生物合成   菌物学年会   罗宏 Jonathan D. Walton Heather Hallen-Adams   2016-08-18
（8）Biosynthesis of peptide Amanita toxins   2014-06-09
（9）Engineering cycle peptide Biosynthesis in Poisonous Mushrooms   2013-03-15

谅解备忘录（MoU）: 与美国密歇根州立大学植物研究院Walton实验室签订5年合作协议。

美国密歇根州立大学植物研究院