基本信息
沈义栋  男  博导  中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)
电子邮件: yidong.shen@sibcb.ac.cn
通信地址: 上海市岳阳路320号
邮政编码: 200031

研究领域

衰老及衰老相关疾病的机理研究

        衰老不仅是每个人必经的生命过程,它更会引起包括癌症、心血管疾病、神经退行性疾病和肥胖等一系列衰老相关的疾病,所以衰老与我们每个人的健康生活以及整个社会的发展都息息相关。所幸的是,衰老并不是一个无法干预的过程。在线虫等模式生物中的研究表明衰老的进程受着多条保守的信号通路(长寿通路)的调控。这就使得人为的延缓衰老、防治衰老相关疾病成为可能。例如通过广为人知的“限制饮食”的方法,线虫的寿命可以被延长约一倍。同时这些长寿的线虫在其老年期依旧十分健康,不仅保持着良好的运动能力而且针对神经退行性疾病的致病因素具有更强的抵抗性。虽然具体的分子机理还不太清楚,但是在线虫中已经确定两个相关的转录调控因子,skn-1/NRF和pha-4/FOXA,对于“限制饮食”能够延缓衰老至关重要。目前已知的长寿通路还包括胰岛素通路,生殖腺通路等。尽管早期的遗传学研究找到了若干条长寿通路,但是关于衰老机理的研究依旧刚刚起步。这些通路是如何增长寿命、减缓伴随衰老的代谢衰减以及与衰老相关疾病之间的关系都还不清楚。
        使用包括线虫和小鼠等多个模式生物,本实验室致力于阐明调控衰老的分子机制,目前的主要研究内容包括:
        (1) 筛选衰老相关的重要基因并研究其作用机理:
        我们利用线虫寿命短(约3-4周),分子机理保守的特点,以其为模式生物分析衰老相关基因的表达并筛选出确实影响衰老的基因。除了蛋白编码基因外,我们也关注microRNA,这一类非编码的小RNA在衰老中的作用。
        (2) 探索长寿基因与衰老相关疾病(如神经退行性疾病等)之间的关系:
        长寿的个体一般较少罹患衰老相关疾病。这就为应对相关疾病提供了一条崭新的思路,即通过调控长寿通路来预防或治疗包括神经退行性疾病等衰老相关疾病。本实验室使用包括线虫、培养细胞、以及小鼠等多种模型来检验我们筛选得到的长寿基因在衰老相关疾病中的作用及机理,以期为这些疾病的防治寻找新的方法。

招生信息

   
招生专业
071008-发育生物学
071007-遗传学
071010-生物化学与分子生物学
招生方向
衰老机理研究

教育背景

2002-09--2008-01   中国科学院上海生命科学研究院   博士
1998-09--2002-07   复旦大学   学士
学历

博士研究生

学位
博士

工作经历

   
工作简历
2014-05~现在, 中国科学院上海生命科学研究院, 研究员
2009-09~2014-04,德国马普衰老研究所, 博士后
2009-04~2009-08,美国贝勒医学院, 博士后
2008-02~2009-03,中国科学院上海生命科学研究院, 助理研究员

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 第十一批“****”人才计划项目, 国家级, 2015
(2) 上海市浦江人才计划项目, 省级, 2014
(3) CECAD/MPI-AGE高级博士后奖学金, 国家级, 2013
(4) 上海市自然科学奖, 一等奖, 省级, 2012
(5) 欧洲分子生物组织(EMBO)"Long-Term Fellowship", 其他, 2010
(6) 中国科学院院长奖, 国家级, 2008

出版信息

   
发表论文
[1] Xueqing Wang, Quanlong Jiang, Hongdao Zhang, Zhidong He, Yuanyuan Song, Yifan Chen, Na Tang, Yifei Zhou, Yiping Li, Adam Antebi, Ligang Wu, JingDong J Han, Yidong Shen. Tissue-specific profiling of age-dependent miRNAomic changes in Caenorhabditis elegans. NATURE COMMUNICATIONS. 2024, 15: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10834975/.
[2] Wang, Xueqing, Jiang, Quanlong, Song, Yuanyuan, He, Zhidong, Zhang, Hongdao, Song, Mengjiao, Zhang, Xiaona, Dai, Yumin, Karalay, Oezlem, Dieterich, Christoph, Antebi, Adam, Wu, Ligang, Han, JingDong J, Shen, Yidong. Ageing induces tissue-specific transcriptomic changes in Caenorhabditis elegans. EMBO JOURNAL[J]. 2022, 41(8): http://dx.doi.org/10.15252/embj.2021109633.
[3] Yincong Zhang, Xiaona Zhang, Yumin Dai, Mengjiao Song, Yifei Zhou, Jun Zhou, Xiumin Yan, Yidong Shen. The decrease of intraflagellar transport impairs sensory perception and metabolism in ageing. NATURE COMMUNICATIONS[J]. 2021, 12(1): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7979750/.
[4] Yifei Zhou, Xueqing Wang, Mengjiao Song, Zhidong He, Guizhong Cui, Guangdun Peng, Christoph Dieterich, Adam Antebi, Naihe Jing, Yidong Shen. A secreted microRNA disrupts autophagy in distinct tissues of Caenorhabditis elegans upon ageing. NATURE COMMUNICATIONS[J]. 2019, 10(1): http://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-12821-2.
[5] Xu, Yunpeng, He, Zhidong, Song, Mengjiao, Zhou, Yifei, Shen, Yidong. A microRNA switch controls dietary restriction-induced longevity through Wnt signaling. EMBO REPORTS[J]. 2019, 20(5): https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000471318600006.
[6] 张银聪, 鄢秀敏, 沈义栋. 细胞“天线”——纤毛研究的前世今生. 中国细胞生物学学报[J]. 2019, 41(11): 2190-2200, https://d.wanfangdata.com.cn/periodical/xbswxzz201911017.
[7] Heestand, Bree N, Shen, Yidong, Liu, Wei, Magner, Daniel B, Storm, Nadia, Meharg, Caroline, Habermann, Bianca, Antebi, Adam. Dietary Restriction Induced Longevity Is Mediated by Nuclear Receptor NHR-62 in Caenorhabditis elegans. PLOS GENETICS[J]. 2013, 9(7): https://doaj.org/article/f5d500f3dcd848a5bc9c5dec3d755b57.
[8] Magner, Daniel B, Wollam, Joshua, Shen, Yidong, Hoppe, Caroline, Li, Dongling, Latza, Christian, Rottiers, Veerle, Hutter, Harald, Antebi, Adam. The NHR-8 Nuclear Receptor Regulates Cholesterol and Bile Acid Homeostasis in C. elegans. CELLMETABOLISM[J]. 2013, 18(2): 212-224, http://dx.doi.org/10.1016/j.cmet.2013.07.007.
[9] Shen, Yidong, Wollam, Joshua, Magner, Daniel, Karalay, Oezlem, Antebi, Adam. A Steroid Receptor-MicroRNA Switch Regulates Life Span in Response to Signals from the Gonad. SCIENCE[J]. 2012, 338(6113): 1472-1476, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000312250800049.
[10] Wollam, Joshua, Magner, Daniel B, Magomedova, Lilia, Rass, Elisabeth, Shen, Yidong, Rottiers, Veerle, Habermann, Bianca, Cummins, Carolyn L, Antebi, Adam. A Novel 3-Hydroxysteroid Dehydrogenase That Regulates Reproductive Development and Longevity. PLOS BIOLOGY[J]. 2012, 10(4): [11] Cao, Jingli, Shen, Yidong, Zhu, Lei, Xu, Yanan, Zhou, Yizhuo, Wu, Zhili, Li, Yiping, Yan, Xiumin, Zhu, Xueliang. miR-129-3p controls cilia assembly by regulating CP110 and actin dynamics. NATURE CELL BIOLOGY[J]. 2012, 14(7): 697-706, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000305921200009.
[12] Wollam, Joshua, Magomedova, Lilia, Magner, Daniel B, Shen, Yidong, Rottiers, Veerle, Motola, Daniel L, Mangelsdorf, David J, Cummins, Carolyn L, Antebi, Adam. The Rieske oxygenase DAF-36 functions as a cholesterol 7-desaturase in steroidogenic pathways governing longevity. AGING CELL[J]. 2011, 10(5): 879-884, https://www.doi.org/10.1111/j.1474-9726.2011.00733.x.
[13] Yan, Xiumin, Shen, Yidong, Zhu, Xueliang. Live Show of Rho GTPases in Cell Migration. JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY[J]. 2010, 2(2): 68-69, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000286427100004.
[14] Zhang, Qiangge, Wang, Fubin, Cao, Jingli, Shen, Yidong, Huang, Qiongping, Bao, Lan, Zhu, Xueliang. Nudel Promotes Axonal Lysosome Clearance and Endo-lysosome Formation via Dynein-Mediated Transport. TRAFFIC[J]. 2009, 10(9): 1337-1349, http://dx.doi.org/10.1111/j.1600-0854.2009.00945.x.
[15] Shen, Yidong, Li, Ning, Wu, Shuang, Zhou, Yizhuo, Shan, Yongli, Zhang, Qiangge, Ding, Chong, Yuan, Quan, Zhao, Fukun, Zeng, Rong, Zhu, Xueliang. Nudel binds Cdc42GAP to modulate Cdc42 activity at the leading edge of migrating cells. DEVELOPMENTAL CELL[J]. 2008, 14(3): 342-353, http://dx.doi.org/10.1016/j.devcel.2008.01.001.
[16] Yan, XM, Li, F, Liang, Y, Shen, YD, Zhao, XS, Huang, QP, Zhu, XL. Human nudel and NudE as regulators of cytoplasmic dynein in poleward protein transport along the mitotic spindle. MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY[J]. 2003, 23(4): 1239-1250, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000180792100011.

科研活动

   
科研项目
( 1 ) microRNA在衰老过程中的作用及其机制, 主持, 省级, 2014-07--2016-06
( 2 ) 第十一批“****”人才计划项目, 主持, 研究所(学校), 2015-05--2018-04
( 3 ) mir-83在衰老及衰老相关疾病中的作用及机理研究, 主持, 国家级, 2016-01--2019-12
( 4 ) 细胞增殖与分化可塑性的结构基础及功能, 参与, 部委级, 2017-01--2017-12
( 5 ) Wnt信号通路在限制饮食所引起的长寿中的作用与机理研究, 主持, 国家级, 2018-01--2021-12
( 6 ) 衰老对感觉纤毛的影响及其机制, 主持, 国家级, 2018-01--2020-12
( 7 ) 生殖腺调控衰老的机理研究, 主持, 国家级, 2021-01--2024-12
参与会议
(1)线虫不同组织间的microRNA衰老信号流   中国细胞生物学会2023全国学术大会   2023-04-10
(2)The interplay between Ageing and Sensory Cilia   2019-10-14
(3)The interplay between Ageing and Sensory Cilia   2019-09-23
(4)An age-regulated microRNA is responsible for the declining autophagy with ageing in C. elegans   2017-11-06
(5)Wnt signaling regulates diet-restriction induced longevity of C.elegans   第7届亚太线虫会议   2016-06-25
(6)一个微小RNA激素通过胰岛素信号通路调控衰老进程   中国细胞生物学学会2015年学术大会   2015-04-01
(7)A microRNA hormone modulates lifespan through insulin/IGF signaling   2013-09-09
(8)A steroid receptor-microRNA switch that regulates lifespan in response to signals from the gonad   2012-06-27

指导学生

已指导学生

周一飞  博士研究生  071008-发育生物学  

徐云鹏  博士研究生  071008-发育生物学  

张银聪  博士研究生  071008-发育生物学  

何志东  博士研究生  071008-发育生物学  

王雪晴  博士研究生  071008-发育生物学  

刘梦  博士研究生  071008-发育生物学  

张晓娜  博士研究生  071008-发育生物学  

现指导学生

胡清源  博士研究生  071008-发育生物学  

王晓杰  博士研究生  071008-发育生物学  

唐娜  博士研究生  071008-发育生物学  

陈一凡  博士研究生  071008-发育生物学  

白雅卿  硕士研究生  071008-发育生物学  

何诗雨  硕士研究生  071008-发育生物学  

董世明  博士研究生  071008-发育生物学  

孙沣震  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学