基本信息
朱忠旭  男  硕导  杭州医学研究所
电子邮件: zhuzhongxu@him.cas.cn
通信地址: 浙江省杭州市钱塘区福城路
邮政编码:

教育背景

2019-05--2023-10   香港城市大学   博士学位
2012-09--2015-06   浙江大学   硕士学位
2008-09--2012-06   山东农业大学   学士学位

教育背景

2019-05--2023-10   香港城市大学   博士学位
2012-09--2015-06   浙江大学   硕士学位
2008-09--2012-06   山东农业大学   学士学位

工作经历

   
工作简历
2023-11~现在, 中国科学院杭州医学研究所, 助理研究员
2016-11~2019-04,杭州迈迪科生物科技有限公司, 生信部主管
2015-09~2016-11,杭州基智基因科技有限公司, 研发工程师

工作经历

   
工作简历
2023-11~现在, 中国科学院杭州医学研究所, 助理研究员
2016-11~2019-04,杭州迈迪科生物科技有限公司, 生信部主管
2015-09~2016-11,杭州基智基因科技有限公司, 研发工程师

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 一种乳腺癌辅助治疗预测模型及其应用, 发明专利, 2025, 第 2 作者, 专利号: 202511009635.2

( 2 ) 一种基于肿瘤衰老基因的肾透明细胞癌分子亚型和预后模型构建方法及装置, 发明专利, 2024, 第 1 作者, 专利号: 202411004013.6

( 3 ) 一种基于目标区域测序的单个外显子拷贝数变异预测方法, 发明专利, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201810591504.3

( 4 ) 一种伴随实验生成样本ID的方法, 发明专利, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201810468822.0

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 一种乳腺癌辅助治疗预测模型及其应用, 发明专利, 2025, 第 2 作者, 专利号: 202511009635.2

( 2 ) 一种基于肿瘤衰老基因的肾透明细胞癌分子亚型和预后模型构建方法及装置, 发明专利, 2024, 第 1 作者, 专利号: 202411004013.6

( 3 ) 一种基于目标区域测序的单个外显子拷贝数变异预测方法, 发明专利, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201810591504.3

( 4 ) 一种伴随实验生成样本ID的方法, 发明专利, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201810468822.0

出版信息

   
发表论文
(1) The consensus molecular subtypes of esophageal squamous cell carcinoma, Signal Transduction and Targeted Therapy, 2026, 第 2 作者
(2) PCsRNAdb: a comprehensive resource of small noncodingRNAs across cancers, Nucleic Acids Research, 2026, 第 16 作者  通讯作者
(3) SqueezeCall: nanopore basecalling using a Squeezeformer network, gigabyte, 2025, 第 1 作者  通讯作者
(4) Expression pattern of cancer-associated cellular senescence genes in clear cell renal cell carcinoma distinguishes tumor subclasses with clinical implications, Scientific Reports, 2025, 第 1 作者
(5) Effects of local domestication warrant attention in honey bee population genetics, Science Advances, 2023, 第 2 作者
(6) An exosome-based transcriptomic signature for noninvasive, early detection of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma: A multicenter cohort study, Gastroenterology, 2022, 第 2 作者

出版信息

   
发表论文
(1) The consensus molecular subtypes of esophageal squamous cell carcinoma, Signal Transduction and Targeted Therapy, 2026, 第 2 作者
(2) PCsRNAdb: a comprehensive resource of small noncodingRNAs across cancers, Nucleic Acids Research, 2026, 第 16 作者  通讯作者
(3) SqueezeCall: nanopore basecalling using a Squeezeformer network, gigabyte, 2025, 第 1 作者  通讯作者
(4) Expression pattern of cancer-associated cellular senescence genes in clear cell renal cell carcinoma distinguishes tumor subclasses with clinical implications, Scientific Reports, 2025, 第 1 作者
(5) Effects of local domestication warrant attention in honey bee population genetics, Science Advances, 2023, 第 2 作者
(6) An exosome-based transcriptomic signature for noninvasive, early detection of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma: A multicenter cohort study, Gastroenterology, 2022, 第 2 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 非编码小RNA在胰腺癌精准诊疗中的机制解析与临床转化, 负责人, 地方任务, 2026-01--2027-12
( 2 ) 胰腺癌发病机制和临床精准诊治新范式研究, 参与, 国家任务, 2025-11--2029-10
( 3 ) 消化系统肿瘤防治新技术集成推广研究, 参与, 国家任务, 2025-08--2029-07

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 非编码小RNA在胰腺癌精准诊疗中的机制解析与临床转化, 负责人, 地方任务, 2026-01--2027-12
( 2 ) 胰腺癌发病机制和临床精准诊治新范式研究, 参与, 国家任务, 2025-11--2029-10
( 3 ) 消化系统肿瘤防治新技术集成推广研究, 参与, 国家任务, 2025-08--2029-07