0710Z2-计算生物学

计算生物学-慢性肝病系统生物学

2014-09--2019-06   中国科学院上海生命科学研究院   博士
2010-09--2014-06   华中科技大学   学士

   

2025-05~现在, 中国科学院上海营养与健康研究所, 副研究员
2020-09~2024-05,中国科学院上海营养与健康研究所, 博士后
2014-09~2019-06,中国科学院上海生命科学研究院, 博士
2010-09~2014-06,华中科技大学, 学士

   

（1） Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology., Hepatology, 2023, 第 1 作者
（2） Kupffer-cell-derived IL-6 is repurposed for hepatocyte dedifferentiation via activating progenitor genes from injury-specific enhancers., Cell Stem Cell, 2023, 第 1 作者
（3） A systematic assessment of deep learning methods for drug response prediction: from in vitro to clinical applications., Briefings in bioinformatics, 2022, 第 3 作者
（4） Integrated genomic and transcriptomic analysis reveals unique characteristics of hepatic metastases and pro-metastatic role of complement C1q in pancreatic ductal adenocarcinoma., Genome Biology, 2021, 第 1 作者
（5） PDXliver: a database of liver cancer patient derived xenograft mouse models., BMC Cancer, 2018, 第 3 作者
（6） Noninvasive diagnosis and monitoring of mutations by deep sequencing of circulating tumor DNA in esophageal squamous cell carcinoma, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2016, 第 7 作者

   

（ 1 ） 构建肝再生单细胞图谱研究类肝前体细胞行程的关键因子, 负责人, 国家任务, 2024-01--2026-12
（ 2 ） 构建基于基因组标签的重要器官精准蛋白质图谱, 参与, 地方任务, 2023-01--2027-12
（ 3 ） 稳态及疾病下肝脏单细胞时空图谱的构建, 负责人, 其他, 2022-04--2025-04
（ 4 ） 肿瘤系统生物学研究, 参与, 国家任务, 2022-01--2024-12
（ 5 ） 肿瘤个体化用药的智能分析体系, 参与, 中国科学院计划, 2022-01--2024-12