0710Z2-计算生物学

计算生物学

2013-09--2020-06   同济大学生命科学与技术学院   理学博士
2009-08--2013-06   合肥工业大学生物与食品工程学院   工学学士

   

2020-07~2023-01,上海交通大学电子信息与电气工程学院, 博士后
2013-09~2020-06,同济大学生命科学与技术学院, 理学博士
2009-08~2013-06,合肥工业大学生物与食品工程学院, 工学学士

   

（1） 一个领域自适应预训练语言模型对中文电子病历进行句子分类, A domain adaptive pre-training language model for sentence classification of Chinese electronic medical record, BIBM, 2023, 第 2 作者
（2） 一个双通道深度学习方法连续预测重症监护室中急性肾损伤的风险, A dual-channel deep learning approach to continuous prediction of acute kidney injury in the intensive care unit, BIBM, 2023, 第 2 作者
（3） MGAE-DC：通过多通道图自动编码器预测药物组合的协同性作用, MGAE-DC: predicting the synergistic effects of drug combinations through multi-channel graph autoencoders, Plos computational biology, 2023, 第 1 作者
（4） 一个基于知识图谱表征的方法预测药物组合的协同性作用, A knowledge graph embedding-based method for predicting the synergistic effects of drug combinations, BIBM, 2022, 第 1 作者
（5） 通过一个结合注意力机制的图神经网络框架预测细胞系特异性的协同性药物组合, Predicting cell line-specific synergistic drug combinations through a relational graph convolutional network with attention mechanism, Briefings in Bioinformatics, 2022, 第 1 作者
（6） DeepBSI: 一个多模态深度学习框架预测转录因子结合位点和强度, DeepBSI: a multimodal deep learning framework for predicting the transcription factor binding site and intensity, BIBM, 2021, 第 1 作者
（7） 综合系统研究人类组织转录组中选择性反向剪接, Comprehensive identification of alternative back-splicing in human tissue transcriptomes, Nucleic Acids Research, 2020, 第 1 作者

   

（ 1 ） 构建分枝杆菌临床分离株多组学数据库及分析平台, 参与, 国家任务, 2023-12--2026-11
（ 2 ） 基于时空变异演化网络的病原微生物大模型构建及应用, 参与, 地方任务, 2023-12--2026-11
（ 3 ） 全国代表性结核病原体基因序列数据库及其分析工具的创建, 参与, 国家任务, 2022-12--2025-11
（ 4 ） 我国结核病传播网络及其分子分析工具的研发及应用, 参与, 国家任务, 2022-12--2025-11