基本信息
张超 男 中国科学院昆明动物研究所
电子邮件： zhangc3@pku.edu.cn
通信地址： 云南省昆明市盘龙区茨坝街道龙欣路17号
邮政编码：
电子邮件： zhangc3@pku.edu.cn
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研究领域
1.大脑功能的分子机制
借助单细胞转录组和空间转录组学，结合生物信息学，研究哺乳动物大脑进化与功能。借助云南丰富的遗传样本资源，构建多物种数字化空间细胞图谱，识别大脑细胞组织结构、细胞间的相互作用和通信机制，解析大脑功能的分子基础。
2.生物信息学
开发基于机器学习和人工智能技术的单细胞和空间转录组数据整合生物信息学算法工具；开发高效准确的跨物种单细胞图谱整合算法和工具。
招生信息
招生专业
071006-神经生物学
招生方向
大脑进化与生物信息学
教育背景
2016-09--2021-06 北京大学生命科学学院 博士学位
2010-09--2014-06 电子科技大学 学士学位
2010-09--2014-06 电子科技大学 学士学位
工作经历
工作简历
2021-08~现在, 哈佛大学医学院, 博士后
2014-09~2016-06,北京大学生物信息平台, 研究助理
2014-09~2016-06,北京大学生物信息平台, 研究助理
出版信息
发表论文
（1） Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain, NATURE NEUROSCIENCE, 2023, 第 2 作者
（2） Exogenous artificial DNA forms chromatin structure with active transcription in yeast, Exogenous artificial DNA forms chromatin structure with active transcription in yeast, SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES, 2022, 第 2 作者
（3） Accurate inference of genome-wide spatial expression with iSpatial, SCIENCE ADVANCES, 2022, 第 1 作者
（4） Gene body methylation safeguards ribosomal DNA transcription by preventing PHF6-mediated enrichment of repressive histone mark H4K20me3, THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2021, 第 5 作者
（5） ATF3 drives senescence by reconstructing accessible chromatin profiles, AGING CELL, 2021, 第 1 作者
（6） Tissue-specific 5-hydroxymethylcytosine landscape of the human genome, NATURE COMMUNICATIONS, 2021, 第 2 作者
（7） tagHi-C Reveals 3D Chromatin Architecture Dynamics during Mouse Hematopoiesis, CELL REPORTS, 2020, 第 1 作者
（8） Mixed secondary chromatin structure revealed by modeling radiation-induced DNA fragment length distribution, Mixed secondary chromatin structure revealed by modeling radiation-induced DNA fragment length distribution, SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES, 2020, 第 5 作者
（9） Senescence-activated enhancer landscape orchestrates the senescence-associated secretory phenotype in murine fibroblasts, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2020, 第 2 作者
（10） Metastasis-related methyltransferase 1 (Merm1) represses the methyltransferase activity of Dnmt3a and facilitates RNA polymerase I transcriptional elongation, JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY, 2019, 第 3 作者
（11） Genome and epigenome analysis of monozygotic twins discordant for congenital heart disease, BMC GENOMICS, 2018, 第 2 作者
（12） CCGD-ESCC: A Comprehensive Database for Genetic Variants Associated with Esophageal Squamous Cell Carcinoma in Chinese Population, GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2018, 第 14 作者
（13） TGF-β signaling alters H4K20me3 status via miR-29 and contributes to cellular senescence and cardiac aging, NATURE COMMUNICATIONS, 2018, 第 3 作者
（14） Genetic variant repressing ADH1A expression confers susceptibility to esophageal squamous-cell carcinoma, CANCER LETTERS, 2018, 其他（合作组作者）
（2） Exogenous artificial DNA forms chromatin structure with active transcription in yeast, Exogenous artificial DNA forms chromatin structure with active transcription in yeast, SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES, 2022, 第 2 作者
（3） Accurate inference of genome-wide spatial expression with iSpatial, SCIENCE ADVANCES, 2022, 第 1 作者
（4） Gene body methylation safeguards ribosomal DNA transcription by preventing PHF6-mediated enrichment of repressive histone mark H4K20me3, THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2021, 第 5 作者
（5） ATF3 drives senescence by reconstructing accessible chromatin profiles, AGING CELL, 2021, 第 1 作者
（6） Tissue-specific 5-hydroxymethylcytosine landscape of the human genome, NATURE COMMUNICATIONS, 2021, 第 2 作者
（7） tagHi-C Reveals 3D Chromatin Architecture Dynamics during Mouse Hematopoiesis, CELL REPORTS, 2020, 第 1 作者
（8） Mixed secondary chromatin structure revealed by modeling radiation-induced DNA fragment length distribution, Mixed secondary chromatin structure revealed by modeling radiation-induced DNA fragment length distribution, SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES, 2020, 第 5 作者
（9） Senescence-activated enhancer landscape orchestrates the senescence-associated secretory phenotype in murine fibroblasts, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2020, 第 2 作者
（10） Metastasis-related methyltransferase 1 (Merm1) represses the methyltransferase activity of Dnmt3a and facilitates RNA polymerase I transcriptional elongation, JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY, 2019, 第 3 作者
（11） Genome and epigenome analysis of monozygotic twins discordant for congenital heart disease, BMC GENOMICS, 2018, 第 2 作者
（12） CCGD-ESCC: A Comprehensive Database for Genetic Variants Associated with Esophageal Squamous Cell Carcinoma in Chinese Population, GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2018, 第 14 作者
（13） TGF-β signaling alters H4K20me3 status via miR-29 and contributes to cellular senescence and cardiac aging, NATURE COMMUNICATIONS, 2018, 第 3 作者
（14） Genetic variant repressing ADH1A expression confers susceptibility to esophageal squamous-cell carcinoma, CANCER LETTERS, 2018, 其他（合作组作者）