0710J3-生物信息学
071005-微生物学

生物信息学，微生物学

2009-09--2014-12   香港中文大学   博士研究生
2002-09--2006-07   上海交通大学   理学学士

   

2016-06~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院, 副研究员
2014-12~2016-06,香港中文大学, 博士后
2009-09~2014-12,香港中文大学, 博士研究生
2002-09~2006-07,上海交通大学, 理学学士

   

（ 1 ） 基于高通量测序技术的基因组代谢模型构建、优化及可视化的方法, 2021, 第 3 作者, 专利号: CN113035269A

   

（1） Natural products from plants and microorganisms: Novel therapeutics for chronic kidney disease via gut microbiota regulation, FRONTIERS IN PHARMACOLOGY, 2023, 第 3 作者
（2） A recently evolved diflavin-containing monomeric nitrate reductase is responsible for highly efficient bacterial nitrate assimilation, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2020, 第 6 作者
（3） Integrated metabolomics and gut microbiome to the effects and mechanisms of naoxintong capsule on type 2 diabetes in rats, SCIENTIFICREPORTS, 2020, 第 3 作者
（4） Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2020, 第 58 作者
（5） Genome recovery and metatranscriptomic confirmation of functional acetate-oxidizing bacteria from enriched anaerobic biogas digesters, ENVIRONMENTAL POLLUTION, 2020, 第 5 作者  通讯作者
（6） Distinct Responses of Gut Microbiota to Jian-Pi-Yi-Shen Decoction Are Associated With Improved Clinical Outcomes in 5/6 Nephrectomized Rats, FRONTIERS IN PHARMACOLOGY, 2020, 第 7 作者
（7） Gut Microbiome Alterations Precede Cerebral Amyloidosis and Microglial Pathology in a Mouse Model of Alzheimer's Disease, BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL, 2020, 第 4 作者
（8） tmap : an integrative framework based on topological data analysis for population-scale microbiome stratification and association studies, GENOME BIOLOGY, 2019, 第 5 作者  通讯作者

   

（ 1 ） 功能性核酸酶元件的发掘与优化, 负责人, 国家任务, 2023-12--2028-11
（ 2 ） 建立微生物组动态分析的新技术及其在肠道菌群干预研究中的应用, 负责人, 国家任务, 2021-01--2024-12