高远 男 研究员,博士生导师
中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
电子邮件: gaoy@big.ac.cn
通信地址: 北京朝阳区北辰西路一号院104号楼
邮政编码:100101
研究领域
高远研究员于2016年在中国科学院大学获得遗传学博士学位,之后在美国宾夕法尼亚大学和费城儿童医院进行博士后研究,2021年加入中国科学院北京基因组研究所任研究员、博士生导师,近年来以通讯或第一作者在Nature Methods、Science Advances、Trends in Genetics、Nature Communications、Advanced Science、Genome Biology及Briefings in Bioinformatics 等国际著名期刊上发表多篇论文。
课题组聚焦生物信息学算法开发及数据资源整合,并通过挖掘组学数据探究生命与健康前沿问题,研究方向主要包括:1.疾病及营养相关的功能微生物组学研究;2.人体及模式动物的空间组学研究;3.长读段高通量测序组学数据整合、分析及相关算法开发。其他详情请浏览实验室主页。
招生信息
欢迎具有计算机科学、数学/统计、生物信息学及其他生物相关背景的考生报考!
0710J3-生物信息学
0710Z1-基因组学
生物信息学
基因组学
教育背景
2013-09--2016-07 中国科学院大学 博士学位
2006-09--2009-07 中国科学院海洋研究所 硕士学位
2002-09--2006-07 中国海洋大学 学士学位
工作经历
2021-06~现在, 中国科学院北京基因组所(国家生物信息中心), 研究员
2018-10~2021-03,Children’s Hospital of Philadelphia, 博士后
2016-11~2018-09,University of Pennsylvania, 博士后
教授课程
Bioinformatics and Systems Biology
Emerging Metabolic Engineering Strategies
论文代表作
1. Zhou Z†, Zhang J†, Zheng X, Pan Z, Zhao F*, Gao Y*. CIRI-deep enables single-cell and spatial transcriptomic analysis of circular RNAs with deep learning [J]. Advanced Science, 2024, DOI: 10.1002/advs.202308115.
2. Gao Y, Li H*. Quantifying and comparing bacterial growth dynamics in multiple metagenomic samples [J]. Nature Methods, 2018, 15(12): 1041.
3. Gao Y†*, Wang F†, Wang R†, Kutschera E, Xu Y, Xie S, Wang Y, Kadash-Edmondson K, Lin L, Xing Y*. ESPRESSO: Robust discovery and quantification of transcript isoforms from error-prone long-read RNA-seq data [J]. Science Advances, 2023, 9(3), eabq5072.
4. Gao Y†, Wang J†, Zhao F*. CIRI: an efficient and unbiased algorithm for de novo circular RNA identification [J]. Genome Biology, 2015, 16(1): 4.
5. Gao Y†, Wang J†, Zheng Y†, Zhang J, Chen S & Zhao F*. Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing events in circular RNAs [J]. Nature Communications, 2016, DOI: 10.1038/ncomms12060.
6. Gao Y, Zhao F*. Computational strategies for exploring circular RNAs [J]. Trends in Genetics, 2018, 34(5): 389-400.
7. Gao Y, Zhang J, Zhao F*. Circular RNA identification based on multiple seed matching [J]. Briefings in Bioinformatics, 2018, 19(5): 803-810.
8. Wang J†, Gao Y†, Zhao F*. Phage–bacteria interaction network in human oral microbiome [J]. Environmental Microbiology, 2016, 7(18): 2143-2158.
9. Xin R†, Gao Y†, Gao Y, Wang R, Kadash-Edmondson K & Xing Y*. isoCirc catalogs full-length circular RNA isoforms in human transcriptomes[J]. Nature Communications, 2021, 12(1): 1-11.
10. Tanes C†, Bittinger K†, Gao Y, Friedman S E, Nessel L, RoyPaladhi U, Chau L, Panfen E, Fischbach M A, Braun J, Xavier R J, Clish C B, Li H, Bushman F D, Lewis J D* & Wu G D*. Role of dietary fiber in the recovery of the human gut microbiome and its metabolome[J]. Cell Host & Microbe, 2021, 29(3): 394-407. e5.
科研项目
科学数据自主应用软件研发,主持,国家重点研发(青年),2021-12--2025-11
微生物组菌株识别及其生长动力学量化的高精度计算方法研发,主持,自然科学基金(面上),2023-01--2026-12
多组学算法驱动的肿瘤微生物组与宿主互作效应解析,北京市“杰出青年”科学基金,主持,2023.10-2026.12
人才经费,主持,2023-01--2025-12
职位招聘(HOT!)
因科研工作需要,现公开招聘生物信息学方向助理研究员1名、工程师/助理工程师1名、特别研究助理(博士后)1-2名;实验生物学方向特别研究助理(博士后)1-2名。
有意者请将个人简历(包括教育和研究经历、反映本人科研能力的成果或奖励)以电子邮件形式发送到:gaoy(at)big.ac.cn,邮件主题请注明“应聘-岗位-姓名”。收到材料后,实验室将与合适的应聘者取得联系。
应聘条件
1.年龄不超过35周岁;近3年内获得或即将获得生物、数学/统计或计算机相关专业博士学位(申请助理工程师需计算机或数学/统计相关专业硕士学位)。
2.计算领域申请者要求具有基因组学数据分析经验,且熟悉linux开发环境并熟练掌握至少一门编程语言(python/java/c++/perl等)及R绘图,具备生物信息学算法开发经验者优先;实验领域申请者要求熟练掌握分子生物学实验技能,具备高通量测序建库经验或实验室管理经验者优先。
3.诚实稳重、责任心强,具有较好的组织、沟通和协调能力,富有团队合作精神,对科研工作充满热情。
4.以第一作者在国际期刊发表过论文,具备良好的专业英文读写能力,能独立开展科研工作。
5.申请助理研究员的,根据中科院规定需具有至少一个聘期的博士后研究经历。
福利待遇
根据申请者研究背景,提供具有竞争力的薪酬待遇:
1.特别研究助理(博士后)年薪25-35万(入选中科院特别资助项目的可获最高年薪40万);
2.助理研究员/工程师 25-30万,助理工程师16-25万。
助理研究员及工程师为中级职称事业编制人员,助理工程师为初级职称事业编制人员,享受中科院正式员工福利(例如,根据人事政策应届生一般可获得北京户口),表现优秀者可获得推荐晋升高级职称或申请人才项目;特别研究助理(博士后)表现优秀者,聘期结束后可获得推荐留所长聘、出国深造及其他后续支持。