致力于生物制造过程的自动化、数字化与智能化，聚焦于生物过程工程研究，研究内容包括发酵过程优化与放大、生物过程大数据可视化及数据科学研究、生物反应器流场模拟、生物反应器设计、生物发酵过程的数值模拟与理性放大技术开发等。具体的研究方向包括：

• 生物过程数据科学
• 生物过程数据采集与数据可视化
• 生物反应器流场研究
• 新型反应器开发与应用
• 发酵过程优化与放大技术
• 发酵过程的数值模拟与智能控制技术
• 发酵过程的组学大数据分析及建模
• 发酵过程数字孪生系统与智能控制

   

086000-生物与医药

发酵工程，系统生物技术，生物过程工程，发酵优化与放大

2021-06--中国科学院天津工业生物技术研究所   研究员
2008-07--2021-04   华东理工大学   副研究员
2003-09--2008-06   华东理工大学   工学博士

2021.7-至今 中国科学院天津工业生物技术研究所 研究员

2015.9-2021.6 华东理工大学生物工程学院 副教授

2016.1-2017.1 瑞典查尔姆斯理工大学Jens Nielsen教授课题组访问学者

2014.9-2014.10  代尔夫特理工大学 短期访问学者

2008.7-2015.8 华东理工大学生物工程学院 讲师

2003.9-2008.7  华东理工大学生物工程学院 博士

2021-09-30-2026-09-30,中国微生物学会生化工程模型化与控制专委会, 副主任委员

   

（1） Allosteric Effectors Outcompete Transcript Levels and Substrate Concentration in Regulating Central Carbon Flux During the Crabtree Effect Transition, Biotechnology Journal, 2025, 第 5 作者  通讯作者
（2） Optimization of Isoamylase Production in Escherichia coli Under Different Nutrient Limitation Conditions, Biotechnology Journal, 2025, 第 4 作者  通讯作者
（3） Efficient Production of Unspecific Peroxygenases Using Continuous Culture of Komagataella phaffii, Chemical Engineering Journal Advances, 2025, 第 4 作者  通讯作者
（4） Optimization of Chemical Defined Medium for Lactobacillus brevis Based on Artificial Intelligence, Engineering in Life Sciences, 2025, 第 4 作者  通讯作者
（5） Transcriptional Downregulation of Methanol Metabolism Key Genes During Yeast Death in Engineered Pichia pastoris., Biotechnology Journal, 2024, 第 4 作者  通讯作者
（6） Biofuser: a multi-source data fusion platform for fusing the data of fermentation process devices, Frontiers in Digital Health, 2024, 第 5 作者  通讯作者
（7） A Hybrid Model Simulating Multi-Stage Continuous Fermentation of Saccharomyces cerevisiae, Biotechnology Journal, 2024, 第 2 作者  通讯作者
（8） 13 C-MFA helps to identify metabolic bottlenecks for improving malic acid production in Myceliophthora thermophila, Microbial Cell Factories, 2024, 第 6 作者  通讯作者
（9） Yeast increases glycolytic flux to support higher growth rates accompanied by decreased metabolite regulation and lower protein phosphorylation, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2023, 第 11 作者
（10） Flux regulation through glycolysis and respiration is balanced by inositol pyrophosphates in yeast, CELL, 2023, 第 17 作者
（11） Micro-electrochemical DO sensor with ultra-micropore matrix fabricated with femtosecond laser processing successfully applied in on-line DO monitoring for yeast culture, BIOTECHNOLOGY LETTERS, 2023, 第 11 作者
（12） 基于热力学原理约束的代谢网络模型研究进展及其应用, 中国生物工程杂志, 2022, 第 11 作者
（13） gamma-PGA Fermentation by Bacillus subtilis PG-001 with Glucose Feedback Control pH-stat Strategy, APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY, 2022, 第 11 作者
（14） Multi-omics analysis of the transition to the Crabtree effect in S. cerevisiae reveals a key role for the citric acid shuttle, FEMS Yeast Research, 2022, 第 11 作者
（15） 人工智能时代发酵优化与放大技术的机遇与挑战, Opportunities and challenges for fermentation optimization and scale-up technology in the artificial intelligence era, 生物工程学报, 2022, 第 1 作者
（16） Proteome allocations change linearly with the specific growth rate of Saccharomyces cerevisiae under glucose limitation, NATURE COMMUNICATIONS, 2022, 第 1 作者
（17） 带档板摇瓶中流场数值模拟及克拉维酸发酵培养研究, Numerical Simulation of Baffled Flask Flow Field and Study on Clavulanic Acid Fermentation Culture, 华东理工大学学报:自然科学版, 2021, 第 11 作者
（18） Integration of enzyme constraints in a genome-scale metabolic model of Aspergillus niger improves phenotype predictions, MICROBIAL CELL FACTORIES, 2021, 第 11 作者
（19） 基于约束的基因组规模代谢网络模型构建方法研究进展, 生物工程学报, 2021, 第 11 作者
（20） Understanding the scale-up of fermentation processes from the viewpoint of the flow field in bioreactors and the physiological response of strains, Understanding the scale-up of fermentation processes from the viewpoint of the flow field in bioreactors and the physiological response of strains, CHINESE JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING, 2021, 第 1 作者
（21） Impact of Altered Trehalose Metabolism on Physiological Response of Penicillium chrysogenum Chemostat Cultures during Industrially Relevant Rapid Feast/Famine Conditions, PROCESSES, 2021, 第 3 作者
（22） A new strategy for dynamic metabolic flux estimation by integrating transient metabolome data into genome-scale metabolic models, BIOPROCESS AND BIOSYSTEMS ENGINEERING, 2021, 第 11 作者
（23） Dynamic response of Aspergillus niger to periodical glucose pulse stimuli in chemostat cultures, BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING, 2021, 第 11 作者
（24） Novel scale-up strategy based on three-dimensional shear space for animal cell culture, CHEMICAL ENGINEERING SCIENCE, 2020, 第 11 作者
（25） 人工智能时代的智能生物制造, Intelligent biological manufacturing in the age of artificial intelligence, 生物加工过程, 2020, 第 1 作者
（26） Numerical and experimental assessment of a miniature bioreactor equipped with a mechanical agitator and non-invasive biosensors, JOURNAL OF CHEMICAL TECHNOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2019, 第 11 作者
（27） Dynamic response of Aspergillus niger to single pulses of glucose with high and low concentrations, BIORESOURCES AND BIOPROCESSING, 2019, 第 11 作者
（28） Dynamic metabolic response of Aspergillus niger to glucose perturbation: evidence of regulatory mechanism for reduced glucoamylase production, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2018, 第 11 作者

   

（ 1 ） 基于数据驱动的智能发酵关键技术开发与应用, 负责人, 地方任务, 2025-10--2028-09
（ 2 ） 微生物反应器系统集成与应用验证, 负责人, 中国科学院计划, 2024-10--2027-09
（ 3 ） 基于工业物联网的智能生物制造工业化示范应用, 负责人, 国家任务, 2021-07--2024-06
（ 4 ） 新型工业微生物全基因组代谢网络模型的优化设计和构建研究, 参与, 国家任务, 2020-01--2024-12
（ 5 ） 多组学整合下酿酒酵母酶磷酸化修饰与异构调节对代谢流调控机制的基础研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12