基本信息
黄涛 男 博导 中国科学院上海营养与健康研究所
电子邮件: huangtao@sibs.ac.cn
通信地址: 上海市徐汇区岳阳路320号
邮政编码: 200031
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招生信息
招生专业
0710Z2-计算生物学
招生方向
计算生物学-生物医学大数据的机器学习和网络分析
教育背景
2007-09--2012-07 中国科学院上海生命科学研究院 博士2003-09--2007-07 华中科技大学 学士
工作经历
工作简历
2022-11~现在, 中国科学院上海营养与健康研究所, 研究员2014-11~2022-11,中国科学院上海营养与健康研究所, 副研究员2012-08~2014-08,美国纽约西奈山伊坎医学院, 博士后2007-09~2012-07,中国科学院上海生命科学研究院, 博士2003-09~2007-07,华中科技大学, 学士
社会兼职
2019-10-29-今,中国科学院青年创新促进会生命分会, 副会长
专利与奖励
奖励信息
(1) 2023 Highly Cited Chinese Researchers, Elsevier, 特等奖, 国家级, 2023(2) Research.com Best Biology and Biochemistry Scientists in China, 328th, 特等奖, 其他, 2023(3) Research.com Best Biology and Biochemistry Scientists in China, 350th, 特等奖, 其他, 2022(4) 2022 Highly Cited Chinese Researchers, Elsevier, 特等奖, 国家级, 2022(5) World’s Top 2% Scientists 2022, Stanford University, 特等奖, 其他, 2022(6) 2021 Highly Cited Chinese Researchers, Elsevier, 特等奖, 国家级, 2021(7) World’s Top 2% Scientists 2021, Stanford University, 特等奖, 其他, 2021(8) The Top 25 Voices in Precision Medicine Asia, 特等奖, 其他, 2020(9) 2020 Highly Cited Chinese Researchers, Elsevier, 特等奖, 国家级, 2020(10) World’s Top 2% Scientists 2020, Stanford University, 特等奖, 其他, 2020(11) Big Data Research Top Cited Articles Award Winner, 特等奖, 其他, 2019
出版信息
发表论文
(1) Analyzing domain features of small proteins using a machine���learning method, Proteomics, 2024, (2) Integrating multi-omics data of childhood asthma using a deep association model, Fundamental Research, 2024, (3) Identification of key genes associated with persistent immune changes and secondary immune activation responses induced by influenza vaccination after COVID-19 recovery by machine learning methods, Computers in Biology and Medicine, 2024, (4) Identification of Protein���Protein Interaction Associated Functions Based on Gene Ontology, The Protein Journal, 2024, (5) Investigate the Epigenetic Connections of Obesity Between Mother and Child With Machine Learning Methods, Current Bioinformatics, 2023, (6) Seq-RBPPred: Predicting RNA-Binding Proteins from Sequence, ACS Omega, 2023, (7) Anomaly Detection Models for SARS-CoV-2 Surveillance Based on Genome k-mers, Microorganisms, 2023, (8) Analysis and prediction of protein stability based on interaction network, gene ontology, and KEGG pathway enrichment scores, BBA Proteins and Proteomics, 2023, (9) A cell marker-based clustering strategy (cmCluster) for precise cell type identification of scRNA-seq data, Quantitative Biology, 2022, (10) Comparative analysis of NovaSeq 6000 and MGISEQ 2000 single-cell RNA sequencing data, Quantitative Biology, 2022,
发表著作
Computational Systems Biology: Methods and Protocols, Springer, 2018-03, 第 1 作者Precision Medicine, Springer, 2020-07, 第 1 作者Liquid Biopsies: Methods and Protocols, Springer, 2023-07, 第 1 作者Epigenetics - Regulation and New Perspectives, IntechOpen, 2023-11, 第 1 作者
科研活动
科研项目
( 1 ) 广州国家实验室专项项目 AI驱动的病毒感染和预警预防的大数据挖掘体系研究, 参与, 国家任务, 2024-01--2028-09( 2 ) 东方英才计划青年项目(原上海市青年拔尖人才), 负责人, 地方任务, 2023-08--2026-08( 3 ) 病毒基因组未来演化趋势突变预测模型建立与验证, 负责人, 国家任务, 2022-11--2025-10( 4 ) 创建生态草牧业科技体系, 参与, 中国科学院计划, 2020-11--2024-12( 5 ) 多维大数据驱动的中国人群精准健康研究, 参与, 中国科学院计划, 2020-01--2024-12( 6 ) 上海市科技重大“国际表型组计划”开放课题 基于深度学习与网络向量化的疾病基因与表型研究, 负责人, 地方任务, 2019-01--2020-12( 7 ) 精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发, 参与, 国家任务, 2018-06--2021-06( 8 ) 基于转录组测序大数据的肺癌PDX模型评估方法研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2020-12
参与会议
(1)人工智能在生物医学领域的应用 首届CCF公益日暨技术公益大会 2024-05-12(2)生物医学大数据的智能分析与应用 2023生物信息与计算生物青年人才前沿论坛 2023-10-22(3)生物医学大数据的智能化分析系统 第362期 东方科技论坛 “AI for Science” 2023-05-05(4)生物医学大数据的智能分析与应用 第二届“专病数据库、样本库、知识库”临床三库建设与生物信息技术应用研讨会 2023-04-01(5)癌症大数据的机器学习和网络分析 复旦中山肿瘤防治中心年会 2021-10-29(6)精准医学大数据整合分析 中国科学院青年创新促进会2020年学术年会 2020-10-27(7)可解释机器学习和多组学网络整合分析在精准医学中的应用 中国科学院青年创新促进会第二届青年生命科学论坛 2020-09-24(8)Accelerate Precision Medicine with Machine Learning and Network Analysis of Biomedical Big Data 2020-09-11(9)精准医学中的机器学习和网络分析 生物信息、精准医疗与大数据分析国际会议 2019-11-29(10)生物信息学在生物医学新技术发展中的应用 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心青年科学家论坛 2019-11-02(11)多组学数据整合分析在癌症研究中的应用 中国科学院青年创新促进会2019年学术年会 2019-10-16(12)生物信息学在免疫性疾病中的应用 江苏省医学会风湿病学分会青年委员会临床科研学术论坛 2019-08-25(13)肝癌基因及其分子调控网络研究 第九届全国肝脏疾病新观念新技术学习班 2019-07-05(14)精准医学生物信息分析与应用 中国科学院青年创新促进会首届青年生命科学论坛 2019-04-25(15)精准医学中的机器学习和网络分析方法 中国科学院青年创新促进会上海分会生命科学前沿交叉与创新论坛 2019-01-12(16)肺癌大数据开发与转化 中国肿瘤精准检测与靶向治疗峰会 2018-11-10(17)精准医学中的计算方法研究 中国科学院青年创新促进会2018年学术年会 2018-11-05(18)The applications of deep learning in biomedicine 2018-10-11(19)深度学习技术在生物医学中的应用 NVIDIA HPC & AI GPU技术研讨会 2018-07-12(20)机器学习和网络分析在肿瘤研究中的应用 常州市医学会肿瘤分会医学统计及生物信息学组成立大会 2018-04-21(21)预测模型在生命科学中的应用 中国科学院青年创新促进会2017年学术年会 2017-11-05(22)Machine Learning and Graph Theory in Health Sciences 2017-08-22(23)Deciphering the mechanisms of complex diseases using machine learning and network analysis approaches 2017-06-20(24)利用机器学习方法研究扰动对生物系统的影响 合成生物学青年论坛 2017-02-21(25)整合多组学大数据从网络角度揭示复杂疾病致病机制 中国科学院青年创新促进会2016年学术年会 2016-11-15(26)Identification of novel candidate drivers connecting different dysfunctional levels for lung adenocarcinoma 2016-08-18