1.  真菌生物钟调控机制
    生物钟是指生物生命活动的内在节律性，并通过生化反应、细胞、发育和行为等层面表现出来，对于生物有效适应地球环境具有重要意义。生物钟基因突变会引发睡眠障碍、情绪低落、代谢综合症等人类疾病。 课题组利用粗糙脉孢菌和病原真菌为材料，研究生物钟调控机制以及生物钟对病原真菌与宿主互作的调控作用。研究内容包括：（1）生物钟系统感应光、温度和营养等信号的机制；（2）表观遗传调控因子对生物钟基因表达的调控作用；（3）生物钟的温度补偿机制；（4）生物钟对真菌发育及其与宿主互作的调控作用。相关研究不仅解析生物钟对真菌遗传发育和致病性的调控机制，还促进理解不同物种保守的生物钟运行机制。
2. 真菌表观遗传调控机制
    表观遗传调控是基因表达调控的重要环节，包括DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑等。表观遗传调控与人类发育、代谢、免疫和肿瘤疾病等密切相关。课题组以粗糙脉孢菌和病原真菌为材料，研究表观遗传调控因子如何感应外界光照、温度、营养等环境信号和耐药、DNA损伤和真菌病毒等压力胁迫，通过调控基因表达帮助真菌更好的适应环境变化。相关研究致力于揭示微生物适应环境胁迫以及药物耐受等过程中的表观遗传调控作用和不同物种保守的表观遗传调控机制。
3. 真菌与病毒的相互作用机制
    真菌病毒包括RNA病毒和DNA病毒，感染真菌并在其体内增殖。真菌病毒侵染真菌并影响真菌的生长发育，例如造成蘑菇等真菌的减产或减弱植物病原真菌病害。在长期进化过程中，真菌体内形成拮抗病毒感染的宿主防御系统。课题组一方面研究病毒如何侵染病原真菌，为病原真菌的生物防治提供理论基础；另一方面，研究真菌体内的新型宿主防御系统，为开发新型基因编辑工具奠定理论基础。

   

071005-微生物学

真菌分子遗传学
真菌与病毒互作机制

2009-09--2014-07   中国农业大学   博士
2005-09--2009-07   山东农业大学   本科

2014年博士毕业于中国农业大学，2014-2019年在美国德克萨斯大学西南医学中心进行博士后研究工作。2019年3月入职中国科学院微生物研究所，担任研究组长。兼任中国菌物学会菌物遗传及分子生物学专业委员会副主任，中国菌物学会青年工作委员会副主任，中国细胞生物学会生物节律分会委员，以及Mycology、Mycosphere、Fungal Genet Biol、微生物学通报等期刊的编委。主要从事真菌分子遗传与环境适应机制的研究，包括真菌表观遗传、真菌生物钟调控以及真菌与病毒互作的机制。研究成果以第一或通讯（含共同）作者发表于Mol Cell、 Nat Commun、 Sci Adv、Nucleic Acids Res、PNAS、Cell Host Microbe、Trends Cell Biol 等国际主流学术期刊。

2019-03~现在, 中国科学院微生物研究所, 研究组长
2014-10~2019-03,美国德克萨斯大学西南医学中心, 博士后

2026-01-01-今,Mycosphere, 编委
2025-04-01-今,菌物研究, 编委
2025-02-01-今,菌物学报, 编委
2024-03-01-今,Fungal Genetics and Biology, 编委
2022-05-01-今,Frontiers in Fungal Biology, Review Editor
2021-12-01-今,中国菌物学会菌物遗传及分子生物学专业委员会, 副主任
2021-10-01-今,微生物学通报, 编委
2020-04-01-今,中国菌物学会青年工作委员会, 副主任
2019-09-01-今,中国细胞学会生物节律分会, 委员
2019-03-05-今,Mycology, Associate Editor

已指导学生

杨钰琳  博士研究生  071005-微生物学  

卢悄佳  硕士研究生  085238-生物工程  

吴京京  硕士研究生  071005-微生物学  

张亚豪  硕士研究生  071005-微生物学  

宋淋浩  博士研究生  071005-微生物学  

卢悄佳  博士研究生  071005-微生物学  

李文丽  硕士研究生  086000-生物与医药  

王泽宇  硕士研究生  071005-微生物学  

现指导学生

罗鑫  博士研究生  071005-微生物学  

李春波  硕士研究生  071005-微生物学  

赵相东  博士研究生  071005-微生物学  

袁光玉  博士研究生  071005-微生物学  

程铄淇  硕士研究生  071005-微生物学