071005-微生物学

合成生物学，代谢通路设计，微生物细胞工厂开发

   

071005-微生物学

合成生物学，代谢通路设计，微生物细胞工厂开发

2024-06--中国科学院天津工业生物技术研究所   副研究员
2021-06--2024-06   中国科学院天津工业生物技术研究所   博士后
2018-09--2021-06   中国科学院大学   博士
2016-07--2018-08   中国科学院天津工业生物技术研究所   助理研究员
2013-01--2016-06   中国科学院天津工业生物技术研究所   研究实习员
2009-09--2013-01   天津大学   硕士
2004-09--2008-06   天津大学   学士

   

   

[1] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过乙醛脱氢酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325751A, 2024-07-12.

[2] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118006479B, 2024-06-14.

[3] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过异柠檬酸裂合酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325750A, 2024-07-12.

[4] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过丙氨酸-乙醛酸转氨酶获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325753A, 2024-07-12.

[5] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过双功能的乙酰-CoA水解酶/琥珀酰-CoA:乙酸-CoA转移酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325754A, 2024-07-12.

[6] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过丝氨酸脱氨酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118308231A, 2024-07-09.

[7] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过甲酸脱氢酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118308232A, 2024-07-09.

[8] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过苏氨酸醛缩酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118308230A, 2024-07-09.

[9] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过丙酮酸羧化酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325752A, 2024-07-12.

[10] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118006479A, 2024-05-10.

[11] 马红武, 杨雪, 袁倩倩, 江会锋. 利用乙醇醛合成乙酰辅酶A及其衍生产品的新途径. CN: CN106755172A, 2017-05-31.

[12] 利用乙醇醛合成乙酰辅酶A及其衍生产品的新途径. 2020-07-28.

[13] 张燕飞, 杨雪, 马雨悦, 闫军军. 一种人工二氧化碳固定的方法及其应用. 202511428225.1, 2025-09-30.

（1） 三好学生标兵, , 院级, 2021

（2） 院长奖学金优秀奖, 院级, 2021

（3） 朱李月华奖学金, 院级, 2019

（4） 全国中学生生物学联赛一等奖, 一等奖, 省级, 2003

[1] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过乙醛脱氢酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325751A, 2024-07-12.

[2] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118006479B, 2024-06-14.

[3] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过异柠檬酸裂合酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325750A, 2024-07-12.

[4] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过丙氨酸-乙醛酸转氨酶获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325753A, 2024-07-12.

[5] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过双功能的乙酰-CoA水解酶/琥珀酰-CoA:乙酸-CoA转移酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325754A, 2024-07-12.

[6] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过丝氨酸脱氨酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118308231A, 2024-07-09.

[7] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过甲酸脱氢酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118308232A, 2024-07-09.

[8] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过苏氨酸醛缩酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118308230A, 2024-07-09.

[9] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种通过丙酮酸羧化酶过表达获得的甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118325752A, 2024-07-12.

[10] 张燕飞, 杨雪, 陈倩, 马雨悦. 一种甲酸利用的解脂耶氏酵母及其制备方法. CN: CN118006479A, 2024-05-10.

[11] 马红武, 杨雪, 袁倩倩, 江会锋. 利用乙醇醛合成乙酰辅酶A及其衍生产品的新途径. CN: CN106755172A, 2017-05-31.

[12] 利用乙醇醛合成乙酰辅酶A及其衍生产品的新途径. 2020-07-28.

[13] 张燕飞, 杨雪, 马雨悦, 闫军军. 一种人工二氧化碳固定的方法及其应用. 202511428225.1, 2025-09-30.

   

（1） LATCH: a Linear Autocatalytic cycle Tailored for Carbon Harvesting, Green Carbon, 2025, 第 1 作者  通讯作者
（2） Efficient ergothioneine production through reconstruction of the methyl and sulfur supply systems in Escherichia coli, Trends in Biotechnology, 2025, 第 4 作者
（3） Artificial carbon assimilation: From unnatural reactions and pathways to synthetic autotrophic systems, BIOTECHNOLOGY ADVANCES, 2024, 第 1 作者
（4） ATP-free in vitro biotransformation of starch-derived maltodextrin into poly-3-hydroxybutyrate via acetyl-CoA, Nature Communications, 2024, 第 2 作者
（5） Unlocking the formate utilization of wild-type Yarrowia lipolytica through adaptive laboratory evolution, BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2024, 第 8 作者  通讯作者
（6） Improving pathway prediction accuracy of constraints-based metabolic network models by treating enzymes as microcompartments, Improving pathway prediction accuracy of constraints-based metabolic network models by treating enzymes as microcompartments, SYNTHETIC AND SYSTEMS BIOTECHNOLOGY, 2023, 第 1 作者  通讯作者
（7） Exploring the Feasibility of Cell-Free Synthesis as a Platform for Polyhydroxyalkanoate (PHA) Production: Opportunities and Challenges, Polymers, 2023, 第 2 作者
（8） 多约束代谢网络模型的研究进展, Development of metabolic models with multiple constraints: a review, 生物工程学报, 2022, 第 1 作者
（9） 基于图论的代谢网络中流通代谢物处理新方法, A graph-theory-based method for processing of currency metabolites in metabolic networks, 生物工程学报, 2022, 第 3 作者
（10） 数字细胞模型的研究及应用, Digital cell models and their applications: a review, 生物工程学报, 2022, 第 3 作者
（11） ECMpy, a Simplified Workflow for Constructing Enzymatic Constrained Metabolic Network Model, BIOMOLECULES, 2022, 第 3 作者
（12） Integrating thermodynamic and enzymatic constraints into genome-scale metabolic models, METABOLIC ENGINEERING, 2021, 第 1 作者
（13） Non-natural Aldol Reactions Enable the Design and Construction of Novel One-Carbon Assimilation Pathways in vitro, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2021, 第 3 作者
（14） Cell-free chemoenzymatic starch synthesis from carbon dioxide, SCIENCE, 2021, 第 12 作者
（15） Constructing a synthetic pathway for acetyl-coenzyme A from one-carbon through enzyme design, NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 第 10 作者
（16） 基于酶约束的代谢网络模型研究进展及其应用, Progress and application of metabolic network model based on enzyme constraints, 生物工程学报, 2019, 第 2 作者
（17） Systematic design and in vitro validation of novel one-carbon assimilation pathways, METABOLIC ENGINEERING, 2019, 第 1 作者
（18） Engineering NOG-pathway in Escherichia coli for poly-(3-hydroxybutyrate) production from low cost carbon sources, BIOENGINEERED, 2018, 第 4 作者
（19） Semicontinuous sophorolipid fermentation using a novel bioreactor with dual ventilation pipes and dual sieve-plates coupled with a novel separation system, MICROBIAL BIOTECHNOLOGY, 2018, 第 4 作者
（20） 一碳化合物利用新途径的设计和体外构建, A computationally designed pathway for one carbon compounds utilization and its in vitro construction, 生物加工过程, 2017, 第 2 作者
（21） Computational fluid dynamics simulation of a novel bioreactor for sophorolipids production, Chinese Journal of Chemical Engineering, 2017, 第 4 作者
（22） 通过体外代谢途径构建确定乳酸合成关键酶, Determination of key enzymes for lactate synthesis through in vitro metabolic pathway construction, 中国酿造, 2016, 第 3 作者
（23） 大肠杆菌苏氨酸合成途径动力学模型的构建与分析, Development and analysis of a kinetic model for Escherichia coli threonine biosynthesis, 生物工程学报, 2014, 第 1 作者
（24） 铜绿假单胞杆菌O-2-2产鼠李糖脂的发酵培养基优化及LC-MS/MS分析, Medium Optimization for Rhamnolipids Production byPseudomonas aeruginosaO-2-2 and LC-MS/MS Analysis, 中国生物工程杂志, 2013, 第 3 作者
（25） Recovery of purified lactonic sophorolipids by spontaneous crystallization during the fermentation of sugarcane molasses with Candida albicans O-13-1, ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY, 2012, 第 1 作者
（26） Enhanced rhamnolipids production by Pseudomonas aeruginosa based on a pH stage-controlled fed-batch fermentation process, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 2012, 第 2 作者

   

（1） LATCH: a Linear Autocatalytic cycle Tailored for Carbon Harvesting, Green Carbon, 2025, 第 1 作者  通讯作者
（2） Efficient ergothioneine production through reconstruction of the methyl and sulfur supply systems in Escherichia coli, Trends in Biotechnology, 2025, 第 4 作者
（3） Artificial carbon assimilation: From unnatural reactions and pathways to synthetic autotrophic systems, BIOTECHNOLOGY ADVANCES, 2024, 第 1 作者
（4） ATP-free in vitro biotransformation of starch-derived maltodextrin into poly-3-hydroxybutyrate via acetyl-CoA, Nature Communications, 2024, 第 2 作者
（5） Unlocking the formate utilization of wild-type Yarrowia lipolytica through adaptive laboratory evolution, BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2024, 第 8 作者  通讯作者
（6） Improving pathway prediction accuracy of constraints-based metabolic network models by treating enzymes as microcompartments, Improving pathway prediction accuracy of constraints-based metabolic network models by treating enzymes as microcompartments, SYNTHETIC AND SYSTEMS BIOTECHNOLOGY, 2023, 第 1 作者  通讯作者
（7） Exploring the Feasibility of Cell-Free Synthesis as a Platform for Polyhydroxyalkanoate (PHA) Production: Opportunities and Challenges, Polymers, 2023, 第 2 作者
（8） 多约束代谢网络模型的研究进展, Development of metabolic models with multiple constraints: a review, 生物工程学报, 2022, 第 1 作者
（9） 基于图论的代谢网络中流通代谢物处理新方法, A graph-theory-based method for processing of currency metabolites in metabolic networks, 生物工程学报, 2022, 第 3 作者
（10） 数字细胞模型的研究及应用, Digital cell models and their applications: a review, 生物工程学报, 2022, 第 3 作者
（11） ECMpy, a Simplified Workflow for Constructing Enzymatic Constrained Metabolic Network Model, BIOMOLECULES, 2022, 第 3 作者
（12） Integrating thermodynamic and enzymatic constraints into genome-scale metabolic models, METABOLIC ENGINEERING, 2021, 第 1 作者
（13） Non-natural Aldol Reactions Enable the Design and Construction of Novel One-Carbon Assimilation Pathways in vitro, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2021, 第 3 作者
（14） Cell-free chemoenzymatic starch synthesis from carbon dioxide, SCIENCE, 2021, 第 12 作者
（15） Constructing a synthetic pathway for acetyl-coenzyme A from one-carbon through enzyme design, NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 第 10 作者
（16） 基于酶约束的代谢网络模型研究进展及其应用, Progress and application of metabolic network model based on enzyme constraints, 生物工程学报, 2019, 第 2 作者
（17） Systematic design and in vitro validation of novel one-carbon assimilation pathways, METABOLIC ENGINEERING, 2019, 第 1 作者
（18） Engineering NOG-pathway in Escherichia coli for poly-(3-hydroxybutyrate) production from low cost carbon sources, BIOENGINEERED, 2018, 第 4 作者
（19） Semicontinuous sophorolipid fermentation using a novel bioreactor with dual ventilation pipes and dual sieve-plates coupled with a novel separation system, MICROBIAL BIOTECHNOLOGY, 2018, 第 4 作者
（20） 一碳化合物利用新途径的设计和体外构建, A computationally designed pathway for one carbon compounds utilization and its in vitro construction, 生物加工过程, 2017, 第 2 作者
（21） Computational fluid dynamics simulation of a novel bioreactor for sophorolipids production, Chinese Journal of Chemical Engineering, 2017, 第 4 作者
（22） 通过体外代谢途径构建确定乳酸合成关键酶, Determination of key enzymes for lactate synthesis through in vitro metabolic pathway construction, 中国酿造, 2016, 第 3 作者
（23） 大肠杆菌苏氨酸合成途径动力学模型的构建与分析, Development and analysis of a kinetic model for Escherichia coli threonine biosynthesis, 生物工程学报, 2014, 第 1 作者
（24） 铜绿假单胞杆菌O-2-2产鼠李糖脂的发酵培养基优化及LC-MS/MS分析, Medium Optimization for Rhamnolipids Production byPseudomonas aeruginosaO-2-2 and LC-MS/MS Analysis, 中国生物工程杂志, 2013, 第 3 作者
（25） Recovery of purified lactonic sophorolipids by spontaneous crystallization during the fermentation of sugarcane molasses with Candida albicans O-13-1, ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY, 2012, 第 1 作者
（26） Enhanced rhamnolipids production by Pseudomonas aeruginosa based on a pH stage-controlled fed-batch fermentation process, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 2012, 第 2 作者

   

（ 1 ） 重编程解脂耶氏酵母甲酸中心代谢通路, 负责人, 研究所自主部署, 2024-10--2025-09
（ 2 ） 线粒体α-酮异戊酸转运载体蛋白的鉴定与机理研究, 参与, 国家任务, 2024-01--2027-12
（ 3 ） 指导固碳底盘菌株开发的多约束代谢网络模型构建, 负责人, 国家任务, 2023-01--2025-12
（ 4 ） 基于多约束模型开展氨基酸合成途径及靶点的系统分析与验证, 负责人, 国家任务, 2023-01--2024-04
（ 5 ） 耦合碳一利用和脂肪酸代谢生产mcl-PHA等产品, 负责人, 地方任务, 2021-12--2024-11

   

（ 1 ） 重编程解脂耶氏酵母甲酸中心代谢通路, 负责人, 研究所自主部署, 2024-10--2025-09
（ 2 ） 线粒体α-酮异戊酸转运载体蛋白的鉴定与机理研究, 参与, 国家任务, 2024-01--2027-12
（ 3 ） 指导固碳底盘菌株开发的多约束代谢网络模型构建, 负责人, 国家任务, 2023-01--2025-12
（ 4 ） 基于多约束模型开展氨基酸合成途径及靶点的系统分析与验证, 负责人, 国家任务, 2023-01--2024-04
（ 5 ） 耦合碳一利用和脂肪酸代谢生产mcl-PHA等产品, 负责人, 地方任务, 2021-12--2024-11

合成生物学，代谢工程

欢迎具有微生物学、生物化学、分子生物学和生物信息学等背景的学生报考。