基本信息
张昭军  男  硕导  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
电子邮件: zhangzhaojun@big.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号院104号楼中科院北京基因组研究所
邮政编码: 100101

招生信息

   
招生专业
071007-遗传学
071009-细胞生物学
招生方向
血液发育相关疾病致病机理与基因组学研究

教育背景

2003-09--2008-06   南开大学生命科学学院微生物系   博士研究生学位
2001-10--2002-12   中科院上海生物化学研究所   研究助理
2000-09--2003-07   沈阳农业大学食品科学学院   硕士研究生学位
1995-09--1999-07   沈阳农业大学食品科学学院   本科学士学位

工作经历

   
工作简历
2016-09~现在, 中科院北京基因组研究所, 硕士生导师
2015-10~现在, 中国科学院大学, 岗位教师
2014-01~现在, 中国科学院北京基因组研究所, 副研究员
2009-04~2013-12,中国科学院北京基因组研究所, 助理研究员
2004-07~2008-07,香港科技大学生物化学系, 访问学者
2003-09~2008-06,南开大学生命科学学院微生物系, 博士研究生学位
2001-10~2002-12,中科院上海生物化学研究所, 研究助理
2000-09~2003-07,沈阳农业大学食品科学学院, 硕士研究生学位
1995-09~1999-07,沈阳农业大学食品科学学院, 本科学士学位
社会兼职
2021-08-06-今,World Journal of Surgical Oncology, Reviewer
2016-12-31-今,北京市科技专家库成员,
2016-12-31-今,遗传期刊审稿人,
2016-12-09-今,国家科技专家库成员,
2014-12-30-今,中国生理学会会员(血液学),

教授课程

分析生物化学及样品制备
基因组学中的核心技术
核心组学技术实验课
分析生物化学与样本制备(实验课)
核心组学技术(实验课)
组学回顾
核心组学技术(实验课)

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 一种氧化磷酸化通路缺陷的DBA细胞模型及其构建方法, 2021, 第 2 作者, 专利号: ZL 2021 1 0238919.4

( 2 ) Vc衍生物在促进红细胞再生中的应用及产品, 2021, 第 2 作者, 专利号: 202110286612.1

( 3 ) 辅酶Q10在制备缓解红系分化障碍药物中的用途, 2021, 第 2 作者, 专利号: 202110238767.8

( 4 ) 人脐带血间充质干细胞基因组稳定性相关的miRNA及其应用, 2019, 第 2 作者, 专利号: 201610230708.5

( 5 ) M5型急性髓系白血病相关的特异miRNA及其应用, 2018, 第 2 作者, 专利号: 201610015109.1

出版信息

   
发表论文
(1) Mapping Human Pluripotent Stem Cell-derived Erythroid Differentiation by Single-cell Transcriptome Analysis, Mapping Human Pluripotent Stem Cell-derived Erythroid Differentiation by Single-cell Transcriptome Analysis, GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2021, 通讯作者
(2) Regulatory association of long noncoding RNAs and chromatin accessibility facilitates erythroid differentiation, BLOOD ADVANCES, 2021, 通讯作者
(3) 单细胞转录组测序与人工智能在发育生物学中的作用, 发育医学电子杂志, 2020, 第 1 作者
(4) Long noncoding RNA PCED1B-AS1 promotes erythroid differentiation via coordination with GATA1 and chromatin remodeling, Blood science, 2019, 通讯作者
(5) KLF1和KLF9对K562细胞红系分化的协同调控作用, Synergistic regulation of the erythroid differentiation of K562 cells by KLF1 and KLF9, 遗传, 2018, 第 5 作者
(6) 基因编辑在镰状细胞贫血症治疗中的研究进展, 发育医学电子杂志, 2018, 第 3 作者
(7) Transcriptome Analysis of Monozygotic Twin Brothers with Childhood Primary Myelofibrosis, GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2017, 第 2 作者
(8) Hsa-miR-200a inhibits erythroid differentiation by targeting PDCD4 and THRB, Brit J Haematol, 2017, 第 1 作者
(9) 急性单核细胞白血病特异性miRNA分子标志物的鉴定, Characterization of specific miRNAs in acute monocytic leukemia, 温州医科大学学报, 2016, 第 7 作者
(10) Transcriptome analysis reveals a ribosome constituents disorder involved in the RPL5 downregulated zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia, BMC MEDICAL GENOMICS, 2016, 第 3 作者
(11) 磷脂酰肌醇蛋白聚糖3真核表达载体的构建及在细胞中的表达, Construction of Eukaryotic Expression Vector for Glypican-3 and Its Expression in Cell, 生物技术通报, 2016, 第 5 作者
(12) Global transcriptome analysis for identification of interactions between coding and noncoding RNAs during human erythroid differentiation, FRONTIERS OF MEDICINE, 2016, 第 6 作者
(13) miR-218 Inhibits Erythroid Differentiation and Alters Iron Metabolism by Targeting ALAS2 in K562 Cells, mdpi, 2015, 第 10 作者
(14) Knockdown of transcription factor forkhead box O3 (FOXO3) suppresses erythroid differentiation in human cells and zebrafish, BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 2015, 第 9 作者
(15) Regulatory roles of KLF3 in hematopoiesis of K562 leukemia cells, J Stem Cell Res Ther, 2015, 通讯作者
(16) Systematic transcriptome analysis of the zebrafish model of diamond-blackfan anemia induced by RPS24 deficiency, BMC GENOMICS, 2014, 第 3 作者
(17) Transcriptome analysis of Rpl11-deficient zebrafish model of Diamond-Blackfan Anemia, GENOMICS DATA, 2014, 第 1 作者
(18) Assessment of hematopoietic failure due to Rpl11 deficiency in a zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia by deep sequencing, BMC GENOMICS, 2013, 第 1 作者
(19) Complete Genome Analysis of Three Acinetobacter baumannii Clinical Isolates in China for Insight into the Diversification of Drug Resistance Elements, PLOS ONE, 2013, 第 3 作者
(20) Long-term cultured mesenchymal stem cells frequently develop genomic mutations but do not undergo malignant transformation, CELL DEATH & DISEASE, 2013, 
(21) Comprehensive characterization of erythroid-specific enhancers in the genomic regions of human Krüppel-like factors, BMC Genomics, 2013, 第 2 作者
(22) Transcriptome Analysis of the Zebrafish Model of Diamond-Blackfan Anemia from RPS19 Deficiency via p53-Dependent and -Independent Pathways, PLOS ONE, 2013, 第 3 作者
(23) KLFs对珠蛋白基因表达和红系分化的调控作用, Regulation of KLFs on Globin Expression and Erythroid Differentiation, 中国生物化学与分子生物学报, 2011, 第 2 作者
(24) 染色质构象调控真核基因的表达, Role of chromatin conformation in eukaryotic gene regulation, 遗传, 2011, 第 2 作者
(25) The neuronal p35 activator of Cdk5 is a novel F-actin binding and bundling protein, CELLULAR AND MOLECULAR LIFE SCIENCES, 2011, 第 2 作者
发表著作
( 1 ) 转录组学与精准医学, Transcriptomics and Precision Medicine, 上海交通大学出版社, 2017-12, 第 其他 作者
( 2 ) 2018中国生物技术基地平台报告, 2018 China Biotechnology Base adn Platform Report, 科学技术文献出版社, 2018-10, 第 其他 作者
( 3 ) 2018 中国生物技术人才报告, 2018 China Biotechnology Talents Report, 科学技术文献出版社, 2018-10, 第 其他 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 组学大数据中心和知识库构建与服务技术, 参与, 国家任务, 2015-01--2017-12
( 2 ) 利用高通量组学平台和系统生物学分析技术筛选肿瘤干细胞的特异性标记物和治疗靶点, 参与, 中国科学院计划, 2012-07--2016-12
( 3 ) 高通量细胞分选多模式检测检测分析仪器及应用研究, 参与, 国家任务, 2011-10--2016-09
( 4 ) 全基因组外显子组学数据分析中国人皮肤黑素瘤治疗靶点的研究, 负责人, 研究所自选, 2017-01--2018-12
( 5 ) 东北区域自然人群队列研究, 负责人, 国家任务, 2017-07--2020-12
( 6 ) 儿童原发性骨髓纤维化发病机制的转录组学研究, 负责人, 研究所自选, 2014-01--2015-12
( 7 ) 调控造血干细胞向红系细胞分化的作用机制研究, 负责人, 国家任务, 2014-01--2014-12
( 8 ) 功能血细胞体外再生的关键技术(功能红细胞的体外再生), 负责人, 中国科学院计划, 2018-01--2020-12
( 9 ) 器官原位再生(功能红细胞的再生), 参与, 中国科学院计划, 2018-01--2019-12
( 10 ) DBA骨髓微环境的单细胞图谱解析及其对红系造血发育缺陷的影响机制研究, 负责人, 国家任务, 2019-01--2022-12
( 11 ) hsa-mir-6850-5p在肺腺癌脑转移过程中作用的研究, 负责人, 其他任务, 2019-01--2020-12
( 12 ) 精准医疗临床决策支持系统的共性技术与平台研发, 负责人, 国家任务, 2018-07--2020-12
( 13 ) 基于多组学数据的滤泡树突细胞肉瘤机制研究与PDX模型解析, 参与, 中国科学院计划, 2020-07--2021-06
( 14 ) 组学技术分析肿瘤组织的分子特征, 负责人, 地方任务, 2021-01--2021-12
参与会议
(1)Regulatory mechanism of DANCR in erythropoiesis by associating with chromatin accessibility   中国病理生理学会第十八届全国实验血液学学术会议   2021-09-24
(2)Comprehensive Investigation of the Molecular Mechanism of Primitive Hematopoiesis Regulating by KLF3   Zhang Z#, Xiong Q, Wang S, Wang H, Zhang Q, Qi H, Li Y, Sun H, Chang K- H, Stamatoyannopoulos G, Stamatoyannopoulos J, Fang X*   2012-12-08