071005-微生物学

微生物生理学, 代谢工程

2002-09--2006-03   中国科学院微生物研究所   博士学位
1999-09--2002-06   南开大学   硕士学位
1994-09--1998-06   南开大学   学士学位

   

2014-02~现在, 中国科学院天津工业生物技术研究所, 研究员
2010-07~2013-12,美国西奈山医学院, 研究助理教授
2006-03~2010-06,美国西奈山医学院, 博士后
2002-09~2006-03,中国科学院微生物研究所, 博士学位
1999-09~2002-06,南开大学, 硕士学位
1994-09~1998-06,南开大学, 学士学位

2021-06-30-2026-07-01,委员, 中国生物发酵产业标准化技术委员会氨基酸分委会委员
2018-10-31-今,委员, 中国生物工程学会合成生物学专业委员会委员
2017-03-09-今,Review editor (Frontier in Extreme Microbiology),
2011-06-01-今,审稿编辑(Reviewing Editor for Frontiers in Antimicrobials, Resistance and Chemotherapy),

   

（ 1 ） 一种酶活提高的谷氨酸脱羧酶突变体构建及其应用, 2023, 第 1 作者, 专利号: CN116376886A

（ 2 ） 一种酶活性和热稳定性提高的3-磷酸甘油酸脱氢酶突变体, 2023, 第 1 作者, 专利号: CN116376857A

（ 3 ） 可控高突变率谷氨酸棒杆菌工程菌构建及在抗逆育种中应用, 2023, 第 1 作者, 专利号: CN115725631A

（ 4 ） 基于动态调控硫回收利用的L-半胱氨酸工程菌的构建方法与应用, 2023, 第 1 作者, 专利号: CN115651882B

（ 5 ） 生产L-半胱氨酸的基因工程菌, 2022, 第 1 作者, 专利号: CN114958704A

（ 6 ） 一种L-半胱氨酸生物传感器及其应用, 2022, 第 1 作者, 专利号: CN113980992B

（ 7 ） 半胱氨酸转运蛋白突变体及其在生产L-半胱氨酸中的应用, 2022, 第 1 作者, 专利号: CN113788881B

（ 8 ） 一种L-半胱氨酸生物传感器及其应用, 2022, 第 1 作者, 专利号: CN113980992A

（ 9 ） 半胱氨酸转运蛋白突变体及其在生产L-半胱氨酸中的应用, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN113788881A

（ 10 ） 一种生产L-高丝氨酸的基因工程菌及其应用, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN112779204A

（ 11 ） 一种谷氨酸脱羧酶基因的克隆及其应用, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN106566823B

（ 12 ） 高丝氨酸乙酰转移酶突变体及其在生产O-乙酰高丝氨酸中的应用, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN112501144A

（ 13 ） 一种高丝氨酸生物传感器及其构建方法和应用, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN112375771A

（ 14 ） 一种谷氨酸脱羧酶突变体及其在生产γ-氨基丁酸中的应用, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN112251428A

（ 15 ） 谷氨酸脱羧酶突变体及其在制备γ-氨基丁酸中的应用, 2020, 第 1 作者, 专利号: CN111635898A

（ 16 ） 一种利用电子载体快速去除六价铬污染物的方法, 2020, 第 1 作者, 专利号: CN111320286A

（ 17 ） 一种高效筛选、设计和改造电子载体的实现方法, 2020, 第 1 作者, 专利号: CN111261220A

（ 18 ） 一种代谢工程改造谷氨酸棒杆菌高产L-半胱氨酸的方法, 2020, 第 1 作者, 专利号: CN111040979A

（ 19 ） 一种谷氨酸棒杆菌人工启动子文库, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN110317807A

（ 20 ） 谷氨酸氧化酶突变体、双酶共表达载体及其应用, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN110283800A

（ 21 ） 利用甘油生产γ-氨基丁酸的重组菌及其构建方法, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN110283763A

（ 22 ） 一种半胱氨酸单细胞生物传感器的构建及应用, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN110283764A

（ 23 ） 一种高酶活性L-谷氨酸氧化酶突变体及其制备方法, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN110283837A

（ 24 ） 一种全细胞转化生产γ-氨基丁酸的方法, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN109722402A

（ 25 ） 一种利用共表达重组菌株转化生产α‑酮戊二酸的方法, 2018, 第 1 作者, 专利号: CN107686850A

（ 26 ） 一种新型谷氨酸脱羧酶基因的克隆及其应用, 2017, 第 1 作者, 专利号: CN106566823A

（ 27 ） 一种编码钠氢泵蛋白基因的核苷酸序列及其应用, 2007, 第 2 作者, 专利号: CN1958796A

   

（1） Reprogramming the sulfur recycling network to improve l-cysteine production in Corynebacterium glutamicum., Green Chem, 2023, 
（2） DRAGON: Harnessing the power of DNA repair for accelerating genome evolution in Corynebacterium glutamicum, METABOLIC ENGINEERING, 2023, 第 5 作者
（3） 双酶偶联法测定发酵液中L-高丝氨酸的含量, Determination of L-homoserine concentration in fermentation broth using double-enzyme coupling method, 食品与发酵工业, 2023, 第 5 作者
（4） 谷氨酸棒杆菌中L-半胱氨酸外排蛋白的鉴定及应用, Identification and application of L-cysteine exporter from Corynebacterium glutamicum, 食品与发酵工业, 2023, 第 9 作者
（5） 谷氨酸棒杆菌人工核糖体结合位点（RBS）文库的建立与应用, Construction and application of an artificial ribosomal binding site(RBS)library in Corynebacterium glutamicum, 食品与发酵工业, 2023, 第 5 作者
（6） Transcription factor OxyR regulates sulfane sulfur removal and L-cysteine biosynthesis in Corynebacterium glutamicum, Appl Environ Microbiol, 2023, 
（7） Identification and engineering efflux transporters for improved L-homoserine production in Escherichia coli, JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY, 2023, 第 6 作者
（8） Developing a PAM-Flexible CRISPR-Mediated Dual-Deaminase Base Editor to Regulate Extracellular Electron Transport in Shewanella oneidensis, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2023, 第 7 作者  通讯作者
（9） DRAGON: Harnessing the power of DNA repair for accelerating genome evolution in Corynebacterium glutamicum, Metab Eng., 2023, 第 5 作者
（10） Balancing Redox Homeostasis to Improve l-Cysteine Production in Corynebacterium glutamicum., J Agric Food Chem, 2023, 
（11） α-酮戊二酸分离提取工艺的优化, Separation,purification and process optimization of��-ketoglutaric acid, 食品与发酵工业, 2022, 第 8 作者
（12） Engineering of Corynebacterium glutamicum for high-level ��-aminobutyric acid production from glycerol by dynamic metabolic control, Metabolic Engineering, 2022, 第 11 作者  通讯作者
（13） Design of a genetically encoded biosensor to establish a high-throughput screening platform for L-cysteine overproduction, METABOLIC ENGINEERING, 2022, 第 9 作者  通讯作者
（14） Transcriptome profiles of high-lysine adaptation reveal insights into osmotic stress response in Corynebacterium glutamicum, FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY, 2022, 第 7 作者
（15） Tuning Redox Potential of Anthraquinone-2-Sulfonate (AQS) by Chemical Modification to Facilitate Electron Transfer From Electrodes in Shewanella oneidensis., Front Bioeng Biotechnol, 2021, 第 6 作者  通讯作者
（16） Combining protein and metabolic engineering to construct efficient microbial cell factories, CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY, 2020, 第 4 作者  通讯作者
（17） 谷氨酸棒杆菌过氧化氢酶的异源表达、纯化以及酶学性质, Expression, purification and characterization of catalase from Corynebacterium glutamicum, 生物工程学报, 2020, 第 5 作者
（18） Engineering of L-glutamate oxidase as the whole-cell biocatalyst for the improvement of ��-ketoglutarate production, ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY, 2020, 第 7 作者
（19） Engineering an electroactive Escherichia coli for the microbial electrosynthesis of succinate from glucose and CO 2, MICROBIAL CELL FACTORIES, 2019, 第 3 作者
（20） Combining Protein and Metabolic Engineering Strategies for High-Level Production of O-Acetylhomoserine in Escherichia coli, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2019, 第 8 作者  通讯作者
（21） Recent advances of pH homeostasis mechanisms in Corynebacterium glutamicum, WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 2019, 第 6 作者
（22） Recent advances in the applications of promoter engineering for the optimization of metabolite biosynthesis, WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 2019, 第 3 作者  通讯作者
（23） Deletion of cg1360 Affects ATP Synthase Function and Enhances Production of L-Valine in Corynebacterium glutamicum, JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2019, 第 4 作者
（24） Impaired oxidative stress and sulfur assimilation contribute to acid tolerance of Corynebacterium glutamicum, APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2019, 第 6 作者  通讯作者
（25） Metabolic engineering of Corynebacterium glutamicum for l-cysteine production, APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2019, 第 6 作者  通讯作者
（26） 半胱氨酸单细胞生物传感器的构建及应用, Construction and application of a single-cell biosensor for detection of cysteine, 中国食品添加剂, 2018, 第 5 作者
（27） Roles of Staphylococcus aureus Mnh1 and Mnh2 Antiporters in Salt Tolerance, Alkali Tolerance, and Pathogenesis, JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 2018, 第 4 作者
（28） Promoter library-based module combination (PLMC) technology for optimization of threonine biosynthesis in Corynebacterium glutamicum, APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2018, 第 7 作者  通讯作者
（29） The Lysine 299 Residue Endows the Multisubunit Mrp1 Antiporter with Dominant Roles in Na + Resistance and pH Homeostasis in Corynebacterium glutamicum, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2018, 第 6 作者  通讯作者
（30） 巨大芽孢杆菌谷氨酸脱羧酶的表达及其酶活性研究, The expression of glutamate decarboxylase from bacillus megaterium and its enzymatic activity, 中国食品添加剂, 2017, 第 6 作者
（31） 外源精氨酸对谷氨酸棒杆菌在高葡萄糖胁迫下生长和发酵特性的影响, Effects of exogenous arginine on the growth and fermentation performance of Corynebacterium glutamicum under high glucose stress, 微生物学通报, 2017, 第 5 作者
（32） Biotechnological advances and perspectives of gamma-aminobutyric acid production, WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 2017, 第 3 作者  通讯作者
（33） Co-expression of (L)-glutamate oxidase and catalase in Escherichia coli to produce alpha-ketoglutaric acid by whole-cell biocatalyst, BIOTECHNOLOGY LETTERS, 2017, 第 5 作者  通讯作者
（34） Expression, characterization and mutagenesis of a novel glutamate decarboxylase from Bacillus megaterium, BIOTECHNOLOGY LETTERS, 2016, 第 5 作者  通讯作者
（35） In vitro functional characterization of the Na+/H+ antiporters in Corynebacterium glutamicum, FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 2016, 第 5 作者  通讯作者
（36） 合成生物与生物安全, Synthetic Life and Biosecurity, 中国科学院院刊, 2016, 第 4 作者
（37） 细菌Na+/H+逆向转运蛋白的研究进展, Research progress of the Na+/H+ antiporters in bacteria, 微生物学通报, 2015, 第 4 作者
（38） Cardiolipin Is Dispensable for Oxidative Phosphorylation and Non-fermentative Growth of Alkaliphilic Bacillus pseudofirmus OF4, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2014, 第 1 作者
（39） The c-ring ion-binding site of the ATP synthase from Bacillus pseudofirmus OF4 is adapted to alkaliphilic lifestyle, MOLECULAR MICROBIOLOGY, 2014, 第 4 作者
（40） The c-ring stoichiometry of ATP synthase is adapted to cell physiological requirements of alkaliphilic Bacillus pseudofirmus OF4, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2013, 第 4 作者
（41） Roles of AtpI and Two YidC-Type Proteins from Alkaliphilic Bacillus pseudofirmus OF4 in ATP Synthase Assembly and Nonfermentative Growth, JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 2013, 第 1 作者
（42） Mutations in a Helix-1 Motif of the ATP Synthase c-Subunit of Bacillus pseudofirmus OF4 Cause Functional Deficits and Changes in the c-Ring Stability and Mobility on Sodium Dodecyl Sulfate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis, BIOCHEMISTRY, 2011, 第 1 作者
（43） The genome of alkaliphilic Bacillus pseudofirmus OF4 reveals adaptations that support the ability to grow in an external pH range from 7.5 to 11.4, ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2011, 第 4 作者
（44） The ATP Synthase a-subunit of Extreme Alkaliphiles Is a Distinct Variant: MUTATIONS IN THE CRITICAL ALKALIPHILE-SPECIFIC RESIDUE LYS-180 AND OTHER RESIDUES THAT SUPPORT ALKALIPHILE OXIDATIVE PHOSPHORYLATION, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2010, 第 3 作者
（45） F1F0-ATP synthases of alkaliphilic bacteria: Lessons from their adaptations, BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS, 2010, 第 2 作者
（46） Characterization of the Functionally Critical AXAXAXA and PXXEXXP Motifs of the ATP Synthase c-Subunit from an Alkaliphilic Bacillus, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2009, 第 1 作者
（47） Purification of two putative type II NADH dehydrogenases with different substrate specificities from alkaliphilic Bacillus pseudofirmus OF4, BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA, 2008, 第 1 作者
（48） Three putative cation/proton antiporters from the soda lake alkaliphile Alkalimonas amylolytica N10 complement an alkali-sensitive Escherichia coli mutant, MICROBIOLOGY-SGM, 2007, 第 2 作者
（49） Activity profile of the nhad-type na+(li+)/h+ antiporter from the soda lake haloalkaliphile alkalimonas amylolytica is adaptive for the extreme environment, JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 2005, 
（50） Design of a genetically encoded biosensor to establish a high-throughput screening platform for L-cysteine overproduction, METABOLIC ENGINEERING, 第 9 作者

（ 1 ） 极端嗜碱菌的适应机制(极端微生物书章节), Adaptive mechanisms of extreme alkaliphiles. In: Extremophiles Handbook, Springer, 2010-02, 第 2 作者

   

（ 1 ） 发酵法生产L-高丝氨酸, 负责人, 境内委托项目, 2021-11--2026-11
（ 2 ） 重要大宗工业化学品合成新模块与新途径的挖掘及组装, 负责人, 国家任务, 2021-07--2024-06
（ 3 ） 重要农药及中间体的合成生物制造及示范, 负责人, 地方任务, 2021-03--2024-02
（ 4 ） 生物转化法生产γ-氨基丁酸, 负责人, 境内委托项目, 2020-05--2022-05
（ 5 ） 多策略调控谷氨酸棒杆菌发酵生产L-半胱氨酸的研究, 负责人, 国家任务, 2020-01--2023-12
（ 6 ） 谷氨酸棒杆菌抗高渗机理解析和改造优化, 负责人, 地方任务, 2019-10--2022-09
（ 7 ） 工业底盘细胞人工设计与合成---人工电能细胞合成, 负责人, 地方任务, 2019-10--2020-09
（ 8 ） 电能细胞设计与构建, 参与, 国家任务, 2019-07--2024-06
（ 9 ） 谷氨酸棒杆菌ATP合成酶c环的组装及其功能研究, 负责人, 地方任务, 2017-04--2020-03
（ 10 ） 二氧化碳的人工生物转化（人工电子载体的设计与优化）, 参与, 中国科学院计划, 2016-03--2019-03
（ 11 ） 微生物耐受胁迫环境的生理机制, 负责人, 中国科学院计划, 2015-10--2018-09

（1）代谢工程改造谷氨酸棒杆菌生成半胱氨酸   2023年中国微生物学会学术年会   2023-10-20
（2）谷氨酸棒杆菌抵御环境胁迫的生理机制解析   中国微生物学会学术年会   2017-10-20
（3）Cardiolipin is not essential for respiration-dependent ATP synthesis that supports malate growth of an alkaliphilic Bacillus at pH 7.5 to 10.5    113届微生物学年会(美国)   Liu J, Ryabichko S, Fackelmayer OJ, Bogdanov M, Dowhan W, Krulwich TA   2013-05-18
（4）YidC-homologues in Bacillus pseudofirmus OF4 show different pH profiles for their roles   Liu J   2012-02-19
（5）Effects of deletions in the atp locus and yidC-like genes on the ATP synthase in an alkaliphilic Bacillus   Liu J   2011-07-17