基本信息
郑小梅 女 硕导 中国科学院天津工业生物技术研究所
电子邮件: zheng_xm@tib.cas.cn
通信地址: 天津空港西七道32号
邮政编码: 300308
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招生信息
招生专业
086000-生物与医药071005-微生物学071010-生物化学与分子生物学
招生方向
合成生物学系统生物学生物工程
教育背景
2009-09--2012-06 中国农业科学院生物技术研究所 博士2006-09--2009-06 中国农业科学院生物技术研究所 硕士
工作经历
工作简历
2018-12~现在, 中国科学院天津工业生物技术研究所, 副研究员2014-07~2014-12,德国柏林工业大学, 中国科学院青年访问学者2012-09~2018-12,中国科学院天津工业生物技术研究所, 助理研究员
专利与奖励
奖励信息
(1) 中国粮油协会科技进步特等奖, 特等奖, 省级, 2019
专利成果
[1] 孙际宾, 郑小梅, 张雷达, 郑平, 赵伟, 周文娟. 一种真菌来源的启动子元件及其应用. CN: CN116515841A, 2023-08-01.[2] 郑平, 郑小梅, 孙际宾, 陈美玲, 周文娟, 卢玉丹, 马延和. 一种生产柠檬酸的工程菌及其构建方法和应用. CN202111407487.1, 2021-11-24.[3] 郑平, 郑小梅, 孙际宾, 卢玉丹, 周文娟, 张立辉, 马延和. 一种柠檬酸的生产方法及其应用. CN202111306184.0, 2021-11-05.[4] 孙际宾, 郑小梅, 郑平, 张立辉, 周文娟, 卢玉丹, 马延和. 生产柠檬酸的微生物及其构建方法和应用. CN202111235410.0, 2021-10-22.[5] 郑平, 郑小梅, 孙际宾, 卢玉丹, 周文娟, 张立辉, 马延和. 真菌来源的强启动子及其应用. CN202110268572.8, 2021-03-12.[6] 郑平, 郑小梅, 孙际宾, 卢玉丹, 周文娟, 张立辉, 马延和. 真菌来源的强启动子及其应用. CN: CN115074361A, 2022-09-20.[7] 郑平, 郑小梅, 孙际宾, 周文娟, 张立辉, 马延和. 葡萄糖转运蛋白及其在提高有机酸生产中的应用. CN: CN112250740A, 2021-01-22.[8] 孙际宾, 郑小梅, 张立辉, 周文娟, 郑平, 马延和. 有机酸产量提高的菌株及其构建方法和应用. CN: CN113265417A, 2021-08-17.[9] 孙际宾, 郑小梅, 郑平, 马延和. 一种新型向导RNA表达盒及在CRISPR/Cas系统中的应用. CN: CN107164375A, 2017-09-15.
出版信息
发表论文
[1] Front Bioeng Biotechnol.. 2023, 第 1 作者[2] Xiaomei Zheng, Timothy Cairns, Ping Zheng, Vera Meyer, Jibin Sun. Protocol for gene characterization in Aspergillus niger using 5S rRNA-CRISPR/Cas9-mediated Tet-on inducible promoter exchange. STAR PROTOCOLS[J]. 2022, 第 1 作者3(4): 101838, http://dx.doi.org/10.1016/j.xpro.2022.101838.[3] Xiaomei Zheng, Timothy C Cairns, Xiaomei Ni, Lihui Zhang, Huanhuan Zhai, Vera Meyer, Ping Zheng, Jibin Sun. Comprehensively dissecting the hub regulation of PkaC on high-productivity and pellet macromorphology in citric acid producing Aspergillus niger. Microbial Biotechnology[J]. 2022, 第 1 作者[4] 李金根, 刘倩, 刘德飞, 张永利, 郑小梅, 朱欣娜, 刘萍萍, 高乐, 王婧婷, 蔺玉萍, 张以恒, 张学礼, 田朝光, , , , , , , , , , , , , . 秸秆真菌降解转化与可再生化工. 生物工程学报[J]. 2022, 第 5 作者38(11): 4283-4310, https://cjb.ijournals.cn/cjbcn/article/abstract/gc22114283?st=article_issue.[5] 周文娟, 付刚, 齐显尼, 郑小梅, 房欢, 夏苗苗, 张大伟, 王钦宏, 郑平, 王钰, 孙际宾, , , , , , , , , , , . 发酵工业菌种的迭代创制. 生物工程学报[J]. 2022, 第 4 作者38(11): 4200-4218, https://cjb.ijournals.cn/cjbcn/article/abstract/gc22114200?st=article_issue.[6] Timothy C Cairns, Xiaomei Zheng, Claudia Feurstein, Ping Zheng, Jibin Sun, Vera Meyer. A Library of Aspergillus niger Chassis Strains for Morphology Engineering Connects Strain Fitness and Filamentous Growth With Submerged Macromorphology. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY[J]. 2022, 第 2 作者9: [7] Yudan Lu, Xiaomei Zheng, Yu Wang, Lihui Zhang, Lixian Wang, Yu Lei, Tongcun Zhang, Ping Zheng, Jibin Sun. Evaluation of Aspergillus niger Six Constitutive Strong Promoters by Fluorescent-Auxotrophic Selection Coupled with Flow Cytometry: A Case for Citric Acid Production. JOURNAL OF FUNGI[J]. 2022, 第 2 作者8(568): https://doaj.org/article/af4f7a838ae04e88b4554bb2c01b456c.[8] 孟晓建, 于建东, 郑小梅, 郑平, 李志敏, 孙际宾, 叶勤. 小分子代谢物对黑曲霉己糖激酶和丙酮酸激酶的酶活调控. 生物技术通报[J]. 2021, 第 3 作者 通讯作者 37(12): 180-190, [9] Cairns, Timothy C, Zheng, Xiaomei, Zheng, Ping, Sun, Jibin, Meyer, Vera. Turning Inside Out: Filamentous Fungal Secretion and Its Applications in Biotechnology, Agriculture, and the Clinic. JOURNAL OF FUNGI[J]. 2021, 第 2 作者7(7): http://dx.doi.org/10.3390/jof7070535.[10] 郑小梅, 郑平, 孙际宾, , , . 基于CRISPR/Cas系统的黑曲霉基因组编辑技术. 生物工程学报[J]. 2021, 第 1 作者37(3): 980-990, https://cjb.ijournals.cn/cjbcn/article/abstract/gc21030980?st=article_issue.[11] Zhang, Lihui, Zheng, Xiaomei, Cairns, Timothy C, Zhang, Zhidan, Wang, Depei, Zheng, Ping, Sun, Jibin. Disruption or reduced expression of the orotidine-5 '-decarboxylase gene pyrG increases citric acid production: a new discovery during recyclable genome editing in Aspergillus niger. MICROBIAL CELL FACTORIES[J]. 2020, 第 2 作者19(1): http://dx.doi.org/10.1186/s12934-020-01334-z.[12] Cairns, Timothy C, Zheng, Xiaomei, Zheng, Ping, Sun, Jibin, Meyer, Vera. Moulding the mould: understanding and reprogramming filamentous fungal growth and morphogenesis for next generation cell factories. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS. 2019, 第 2 作者12(1): https://doaj.org/article/bdc26abb049d48efa0720efa8fd00ad8.[13] 郑小梅, 郑平, 孙际宾, , , , . 面向工业生物技术的系统生物学. 生物工程学报[J]. 2019, 第 1 作者35(10): 1955-1973, https://cjb.ijournals.cn/cjbcn/article/abstract/gc19101955?st=article_issue.[14] Wang, Xiaowei, Li, Qinggang, Sun, Cunmin, Cai, Zhen, Zheng, Xiaomei, Guo, Xuan, Ni, Xiaomeng, Zhou, Wenjuan, Guo, Yanmei, Zheng, Ping, Chen, Ning, Sun, Jibin, Li, Yin, Ma, Yanhe. GREACE-assisted adaptive laboratory evolution in endpoint fermentation broth enhances lysine production by Escherichia coli. MICROBIAL CELL FACTORIES[J]. 2019, 第 5 作者18(1): https://doaj.org/article/ad1df27e2e594f9687f967543ad79416.[15] Timothy C Cairns, Claudia Feurstein, Xiaomei Zheng, Li Hui Zhang, Ping Zheng, Jibin Sun, Vera Meyer. Functional exploration of co-expression networks identifies a nexus for modulating protein and citric acid titres in Aspergillus niger submerged culture. FUNGAL BIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY[J]. 2019, 第 3 作者6(1): 1-18, http://dx.doi.org/10.1186/s40694-019-0081-x.[16] Cairns, Timothy C, Feurstein, Claudia, Zheng, Xiaomei, Zheng, Ping, Sun, Jibin, Meyer, Vera. A quantitative image analysis pipeline for the characterization of filamentous fungal morphologies as a tool to uncover targets for morphology engineering: a case study using aplD in Aspergillus niger. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS[J]. 2019, 第 3 作者12(1): https://doaj.org/article/fb498d170980426b83d6fa165a3d9aa7.[17] Zheng, Xiaomei, Zheng, Ping, Zhang, Kun, Cairns, Timothy C, Meyer, Vera, Sun, Jibin, Ma, Yanhe. 5S rRNA Promoter for Guide RNA Expression Enabled Highly Efficient CRISPR/Cas9 Genome Editing in Aspergillus niger. ACS SYNTHETIC BIOLOGY[J]. 2019, 第 1 作者8(7): 1568-1574, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000476957300012.[18] Zheng, Xiaomei, Yu, Jiandong, Cairns, Timothy C, Zhang, Lihui, Zhang, Zhidan, Zhang, Qiongqiong, Zheng, Ping, Sun, Jibin, Ma, Yanhe. Comprehensive Improvement of Sample Preparation Methodologies Facilitates Dynamic Metabolomics of Aspergillus niger. BIOTECHNOLOGY JOURNAL[J]. 2019, 第 1 作者14(3): [19] Tong, Zhenyu, Zheng, Xiaomei, Tong, Yi, Shi, YongCheng, Sun, Jibin. Systems metabolic engineering for citric acid production by Aspergillus niger in the post-genomic era. MICROBIAL CELL FACTORIES[J]. 2019, 第 2 作者18(1): https://doaj.org/article/b1171a93f9f84feaa9aa178e03b6bac7.[20] Xiaomei Zheng, Ping Zheng, Jibin Sun, Zhang Kun, Yanhe Ma. Heterologous and endogenous U6 snRNA promoters enable CRISPR/Cas9 mediated genome editing in Aspergillus niger. FUNGAL BIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY[J]. 2018, 第 1 作者5(1): 1-9, https://doaj.org/article/9db51e78ab3f422c80a6e32039f85a96.[21] Wang, Yu, Liu, Ye, Liu, Jiao, Guo, Yanmei, Fan, Liwen, Ni, Xiaomeng, Zheng, Xiaomei, Wang, Meng, Zheng, Ping, Sun, Jibin, Ma, Yanhe. MACBETH: Multiplex automated Corynebacterium glutamicum base editing method. METABOLIC ENGINEERING[J]. 2018, 第 7 作者47: 200-210, http://dx.doi.org/10.1016/j.ymben.2018.02.016.[22] Zhang, Qiongqiong, Zheng, Xiaomei, Wang, Yu, Yu, Jiandong, Zhang, Zhidan, DeleOsibanjo, Taiwo, Zheng, Ping, Sun, Jibin, Jia, Shiru, Ma, Yanhe. Comprehensive optimization of the metabolomic methodology for metabolite profiling of Corynebacterium glutamicum. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY[J]. 2018, 第 2 作者102(16): 7113-7121, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000440109200029.[23] 饶德明, 张良程, 陈久洲, 孙德虎, 孙村民, 郑小梅, 郑平, 刁爱坡. 谷氨酸棒状杆菌合成5-氨基乙酰丙酸的途径构建与发酵优化. 生物技术通报[J]. 2017, 第 6 作者33(1): 148-156, https://d.wanfangdata.com.cn/periodical/swjstb201701018.[24] 杨静, 李庆刚, 徐国栋, 郑小梅, 郑平, 牟海津. 产O-乙酰高丝氨酸的大肠杆菌构建与发酵测试. 生物技术通报[J]. 2017, 第 4 作者33(9): 200-209, https://d.wanfangdata.com.cn/periodical/swjstb201709026.[25] Wanka, Franziska, Cairns, Timothy, Boecker, Simon, Berens, Christian, Happel, Anna, Zheng, Xiaomei, Sun, Jibin, Krappmann, Sven, Meyer, Vera. Tet-on, or Tet-off, that is the question: Advanced conditional gene expression in Aspergillus. FUNGAL GENETICS AND BIOLOGY[J]. 2016, 第 6 作者89: 72-83, http://dx.doi.org/10.1016/j.fgb.2015.11.003.[26] 郑小梅, 张晓立, 于建东, 郑平, 孙际宾. CRISPR-Cas9介导的基因组编辑技术的研究进展. 生物技术进展[J]. 2015, 第 1 作者5(1): 1-9, http://lib.cqvip.com/Qikan/Article/Detail?id=663551668.[27] 张晓立, 郑小梅, 满云, 罗虎, 于建东, 郑平, 刘浩, 孙际宾. 黑曲霉柠檬酸工业菌株原生质体制备与转化. 生物技术通报[J]. 2015, 第 2 作者31(3): [28] 韩玲玉, 成宝琨, 郑小梅, 孙际宾, 袁景淇. 黑曲霉生产柠檬酸的控制论模型. 化工学报[J]. 2015, 第 3 作者66(11): 4534-4539, http://lib.cqvip.com/Qikan/Article/Detail?id=666436455.[29] Zheng, Xiaomei, Tian, Jian, Wu, Ningfeng, Fan, Yunliu. Probing the molecular determinant of the lipase-specific foldase Lif26 for the interaction with its cognate Lip26. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES[J]. 2013, 第 1 作者53: 54-61, http://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2012.11.007.[30] 吴新阳, 裴广胜, 郑小梅, 曹国强, 刘娇, 郑平, 王敏, 孙际宾. 不同抑制剂对谷氨酸棒状杆菌磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶酶活的影响. 生物技术通报[J]. 2013, 第 3 作者172-178, http://sciencechina.cn/gw.jsp?action=detail.jsp&internal_id=4895212&detailType=1.[31] Zheng, Xiaomei, Wu, Ningfeng, Fan, Yunliu. Characterization of a novel lipase and its specific foldase from Acinetobacter sp XMZ-26. PROCESS BIOCHEMISTRY[J]. 2012, 第 1 作者47(4): 643-650, http://dx.doi.org/10.1016/j.procbio.2012.01.005.[32] Yunliu Fan, Ningfeng Wu, Jian Tian, Xiaoyu Chu, Xiaomei Zheng, Li Xu, Wen Sun, Shuangyu Zhang. Identification of the para-nitrophenol catabolic pathway, and characterization of three enzymes involved in the hydroquinone pathway, in pseudomonas sp. 1-7. 2012, 第 5 作者http://oa.las.ac.cn/oainone/service/browseall/read1?ptype=JA&workid=JA201706298394005ZK.[33] 郑小梅. A novel cold-adapted lipase from Acinetobacter sp. XMZ-26: gene cloning and characterization.. Applied Microbiology and Biotechnology. 2011, 第 1 作者[34] Xiaomei Zheng, Timothy Cairns, Ping Zheng, Vera Meyer, Jibin Sun. Protocol for gene characterization in Aspergillus niger using 5S rRNA-CRISPR/Cas9 mediated Tet-on inducible promoter exchange. STAR PROTOCOLS. 第 1 作者http://dx.doi.org/10.1016/j.xpro.2022.101838.
科研活动
科研项目
( 1 ) 基于5S rRNA的黑曲霉CRISPR-Cas9高效多位点无痕基因组编辑系统研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2020-12( 2 ) 黑曲霉糖代谢途径中关键酶与小分子相互作用的系统研究, 参与, 国家任务, 2014-01--2017-12( 3 ) 黑曲霉中央代谢与调控动态建模与柠檬酸高产机理研究, 参与, 国家任务, 2014-01--2017-12( 4 ) 基于高通量CRISPR/Cas9基因组编辑的黑曲霉葡萄糖转运系统协同调控机制研究, 负责人, 国家任务, 2021-01--2024-12( 5 ) 工业丝状真菌形态控制分子机理研究, 负责人, 国家任务, 2019-07--2024-06( 6 ) 高通量丝状真菌基因组编辑技术, 负责人, 地方任务, 2019-10--2022-09( 7 ) 系统生物学方法解析黑曲霉生长与产物合成相关联的形态遗传网络, 参与, 国家任务, 2020-01--2022-12( 8 ) 新一代葡萄糖酸钠生产菌株的构建, 负责人, 企业委托, 2020-03--2024-03( 9 ) 高效能核心工业酶--核心及新型工业酶挖掘与高产菌株的构建, 负责人, 地方任务, 2022-11--2025-12
参与会议
(1)黑曲霉形态发育调控机制研究 第十四届中国模式真菌研讨会 2023-05-13(2)Dissecting the hub regulation network on high-productivity and macromorphology in Aspergillus niger 2022-03-16(3)Morphological engineering in Aspergillus niger cell factory 中国生物工程学会第五届青年科技论坛 2021-07-02(4)黑曲霉形态代谢工程 2019年中国微生物学会年会 2019-10-13(5)黑曲霉基因组编辑技术 第十二届模式真菌研讨会 2019-05-10(6)黑曲霉细胞工厂 第六届有机氮源会议 2019-04-19(7)黑曲霉新型高效CRISPR/Cas9基因编辑系统 2018年中国微生物学会年会 2018-10-19(8)A novel CRISPR/Cas9 system in Aspergillus niger 2017-10-17