基本信息

杨莹  女  硕导  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
电子邮件: yingyang@big.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路一号院104号楼
邮政编码:100101

研究领域

RNA生物学

招生信息

   
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
招生方向
RNA表观转录组学

教育背景

2009-09--2014-07   中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)   理学博士
2005-09--2009-07   山东大学   理学学士
学历
研究生

学位
博士

工作经历

   
工作简历
2018-05~现在, 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心), 副研究员
2014-07~2018-05,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心), 助理研究员
社会兼职
2022-11-30-今,The Innovation期刊, 青年编委
2018-05-01-今,中国生物化学与分子生物学会核糖核酸协会, 青年工作委员会委员

教授课程

基因组学概述
分子遗传学和表观遗传学
生物化学与分子生物学实验

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 科睿唯安2022年度高被引学者, 其他, 2022
(2) 中国科学院大学2020年校级研究生优秀课程, 部委级, 2020
(3) 中国科学院大学2019年学院级研究生优秀课程, , 部委级, 2019
(4) 第三届中国科协优秀科技论文, 国家级, 2018
(5) 2017年中国生命科学研究领域十大进展, , 国家级, 2017
(6) 2017年Sanofi-Cell Research杰出研究文章奖, 其他, 2017
专利成果
( 1 ) RNA 5mC重亚硫酸盐测序的文库构建方法及其应用, 发明专利, 2018, 第 2 作者, 专利号: ZL201510557083.9

出版信息

   
发表论文
(1) MYC promotes cancer progression by modulating m(6)A modifications to suppress target gene translation, EMBO REPORTS, 2021, 第 3 作者
(2) RNA methylations in human cancers, SEMINARS IN CANCER BIOLOGY, 2021, 通讯作者
(3) N-6-methyladenosine regulates RNA abundance of SARS-CoV-2, CELL DISCOVERY, 2021, 第 2 作者
(4) OsNSUN2-mediated 5-methylcytidine mRNA modification enhances rice adaptation to high-temperature., Developmental Cell, 2020, 
(5) m(6)A Regulates Liver Metabolic Disorders and Hepatogenous Diabetes, GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2020, 通讯作者
(6) RNA structural dynamics regulates early embryogenesis through controlling transcriptome fate and function, Genome Biology, 2020, 第 1 作者
(7) 5-methylcytosine analysis by RNA-BisSeq, Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.), 2019, 第 1 作者
(8) Dynamic methylome of internal mRNA N-7-methylguanosine and its regulatory role in translation, CELL RESEARCH, 2019, 通讯作者
(9) 5-methylcytosine promotes pathogenesis of bladder cancer through stabilizing mRNAs, NATURE CELL BIOLOGY, 2019, 第 4 作者
(10) More than one antibody of individual B cells revealed by single-cell immune profiling, CELL DISCOVERY, 2019, 第 4 作者
(11) m(6)A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination, CELL RESEARCH, 2019, 第 5 作者
(12) m 6 A modification suppresses ocular melanoma through modulating HINT2 mRNA translation, MOLECULAR CANCER, 2019, 第 6 作者
(13) Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma, CELL RESEARCH, 2019, 第11作者
(14) Interplay of LIS1 and MeCP2: Interactions and Implications With the Neurodevelopmental Disorders Lissencephaly and Rett Syndrome, FRONTIERS IN CELLULAR NEUROSCIENCE, 2019, 第 7 作者
(15) Yang X, Liu QL, Xu W, Zhang YC, Yang Y, Ju LF, Chen J, Chen YS, Li K, Ren J#, Sun QW# & Yang YG# (# co-corresponding author). m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination., Cell Research, 2019, 
(16) Insight into novel RNA-binding activities via large-scale analysis of lncRNA-bound proteome and IDH1-bound transcriptome, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2019, 第11作者
(17) RNA 5-Methylcytosine Facilitates the Maternal-to-Zygotic Transition by Preventing Maternal mRNA Decay, MOLECULAR CELL, 2019, 第 1 作者
(18) m6A Regulates Neurogenesis and Neuronal Development by Modulating Histone Methyltransferase Ezh2, m6A Regulates Neurogenesis and Neuronal Development by Modulating Histone Methyltransferase Ezh2, Genomics, 2019, 通讯作者
(19) Dynamic transcriptomic m^6A decoration: writers, erasers, readers and functions in RNA metabolism, Dynamic transcriptomic m^6A decoration: writers, erasers, readers and functions in RNA metabolism, CELL RESEARCH, 2018, 第 1 作者
(20) RNA修饰类型及调控蛋白, Types and regulatory enzymes of RNA modifications, 生命科学, 2018, 第 2 作者
(21) METTL3-mediated N^6-methyladenosine mRNA modification enhances long-term memory consolidation, METTL3-mediated N^6-methyladenosine mRNA modification enhances long-term memory consolidation, 细胞研究:英文版, 2018, 第 6 作者
(22) RNA甲基化修饰调控和规律, RNA methylation:regulations and mechanisms, 遗传, 2018, 第 1 作者
(23) METTL3-mediated m6A modification is required for cerebellar development, PLOS BIOLOGY, 2018, 
(24) 5-methylcytosine promotes mRNA export — NSUN2 as the methyltransferase and ALYREF as an m~5C reader, CELL RESEARCH, 2017, 第 2 作者
(25) Cytoplasmic m6A reader YTHDF3 promotes mRNA translation, Cell Research, 2017, 第 1 作者
(26) Mettl3-Mediated m6A Regulates Spermatogonial Differentiation and Meiosis Initiation, CELL RESEARCH, 2017, 第 2 作者
(27) m(6)A modulates haematopoietic stem and progenitor cell specification, NATURE, 2017, 第 5 作者
(28) 细胞核内m6A读码器YTHDC1调控mRNA选择性剪接机制研究, Nuclear m6A Reader YTHDC1 Regulates mRNA Splicing, 2016, 
(29) Immune Regulator MCPIP1 Modulates TET Expression During Early Neocortical Development, STEM CELL REPORTS, 2016, 第 4 作者
(30) Dynamic m6A modification and its emerging regulatory role in mRNA splicing, SCIENCE BULLETIN, 2015, 第 1 作者
(31) FTO-dependent demethylation of N6-methyladenosine regulates mRNA splicing and is required for adipogenesis, CELL RESEARCH, 2014, 第 2 作者
(32) Mammalian WTAP is a regulatory subunit of the RNA N6-methyladenosine methyltransferase., CELL RESEARCH, 2014, 第 13 作者
(33) Redox-active quinones induces genome-wide DNA methylation changes by an iron-mediated and Tet-dependent mechanism, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2014, 第 2 作者
(34) FTO and Obesity: Mechanisms of Association, CURRENT DIABETES REPORTS, 2014, 第 2 作者
(35) Ascorbic Acid Enhances Tet-Mediated 5-Methylcytosine Oxidation and Promotes DNA Demethylation in Mammals, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2013, 第 5 作者
(36) Methylated nuclear RNA is the main substrate of the obesity-associated FTO protein, Nature Chemical Biology, 2011, 第 1 作者
(37) N6-methyladenosine RNA modification suppresses antiviral innate sensing pathways via reshaping double-stranded RNA, Springer, 第 2 作者
(38) METTL3-dependent m6A modification programs T follicular helper cell differentiation, Springer, 第 1 作者
发表著作
(1) 《精准医学基础系列》(第11章. RNA修饰与疾病的精准医疗), 上海交通大学出版社有限公司, 2018-03, 第 其他 作者
(2) RNA甲基化表观转录组学, 浙江大学出版社, 2021-02, 第 其他 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 日本三角涡虫再生RNA表观遗传学研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12
( 2 ) RNA甲基化修饰调控血液血管发育机制研究, 参与, 国家任务, 2019-09--2024-08
( 3 ) RNA新型修饰调控多能性干细胞初始态和始发态转变机制研究, 参与, 国家任务, 2018-07--2022-12
( 4 ) 中国科学院青年创新促进会, 负责人, 中国科学院计划, 2018-01--2021-12
( 5 ) 基因组修饰多维组学分析技术与标准化研究, 参与, 中国科学院计划, 2020-01--2024-12
( 6 ) 新冠病毒基因组序列的演化分析, 参与, 国家任务, 2020-05--2021-06
( 7 ) 单细胞RNA甲基化测序技术开发与应用, 负责人, 地方任务, 2020-09--2023-08
( 8 ) 单细胞RNA m5C测序技术研发, 负责人, 国家任务, 2021-01--2023-12
参与会议
(1)WTAP-mediated cell-cell communication controls planarian regeneration   中国生物化学与分子生物学会2021年全国学术大会   2021-11-24
(2)m6A-mediated cell-cell communication controls planarian regeneration   第十一届全国核糖核酸(RNA)会议   2021-07-04
(3)RNA methylation regulates regeneration of the planarian Schmidtea mediterranea   中科院青促会第三届青年生命科学论坛   2021-06-06
(4)Mettl3-mediated N6-methylcytosine regulates RNA abundance of SARS-CoV-2   2020-12-19
(5)RNA 5-Methylcytosine Facilitates Maternal-to-zygotic Transition through Preventing Maternal RNA Decay   第一届全国核糖核酸(RNA)青年学术会议   2019-05-11
(6)RNA m5C修饰影响斑马鱼胚胎发育的分子机制   首届群英汇智青年学者论坛   2019-05-10
(7)RNA m5C修饰的分布及功能研究   中国细胞生物学学会2018年全国学术大会   2018-04-10

指导学生

已指导学生

郭静云  硕士研究生  085238-生物工程  

梁承志  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

陈静  硕士研究生  085238-生物工程  

普俊铭  硕士研究生  071007-遗传学  

现指导学生

梁道博  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

夏双燕  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

古烨  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

钟帅  硕士研究生  0710Z1-基因组学