RNA生物学

   

071010-生物化学与分子生物学

RNA表观转录组学

2009-09--2014-07   中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）   理学博士
2005-09--2009-07   山东大学   理学学士

研究生

博士

   

2018-05~现在, 中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）, 副研究员
2014-07~2018-05,中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）, 助理研究员

2022-11-30-今,The Innovation期刊, 青年编委
2018-05-01-今,中国生物化学与分子生物学会核糖核酸协会, 青年工作委员会委员

基因组学概述
分子遗传学和表观遗传学
生物化学与分子生物学实验

   

（1） 科睿唯安2022年度高被引学者, 其他, 2022
（2） 中国科学院大学2020年校级研究生优秀课程, 部委级, 2020
（3） 中国科学院大学2019年学院级研究生优秀课程, , 部委级, 2019
（4） 第三届中国科协优秀科技论文, 国家级, 2018
（5） 2017年中国生命科学研究领域十大进展, , 国家级, 2017
（6） 2017年Sanofi-Cell Research杰出研究文章奖, 其他, 2017

（ 1 ） RNA 5mC重亚硫酸盐测序的文库构建方法及其应用, 发明专利, 2018, 第 2 作者, 专利号: ZL201510557083.9

   

（1） MYC promotes cancer progression by modulating m(6)A modifications to suppress target gene translation, EMBO REPORTS, 2021, 第 3 作者
（2） RNA methylations in human cancers, SEMINARS IN CANCER BIOLOGY, 2021, 通讯作者
（3） N-6-methyladenosine regulates RNA abundance of SARS-CoV-2, CELL DISCOVERY, 2021, 第 2 作者
（4） OsNSUN2-mediated 5-methylcytidine mRNA modification enhances rice adaptation to high-temperature., Developmental Cell, 2020, 
（5） m(6)A Regulates Liver Metabolic Disorders and Hepatogenous Diabetes, GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2020, 通讯作者
（6） RNA structural dynamics regulates early embryogenesis through controlling transcriptome fate and function, Genome Biology, 2020, 第 1 作者
（7） 5-methylcytosine analysis by RNA-BisSeq, Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.), 2019, 第 1 作者
（8） Dynamic methylome of internal mRNA N-7-methylguanosine and its regulatory role in translation, CELL RESEARCH, 2019, 通讯作者
（9） 5-methylcytosine promotes pathogenesis of bladder cancer through stabilizing mRNAs, NATURE CELL BIOLOGY, 2019, 第 4 作者
（10） More than one antibody of individual B cells revealed by single-cell immune profiling, CELL DISCOVERY, 2019, 第 4 作者
（11） m(6)A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination, CELL RESEARCH, 2019, 第 5 作者
（12） m 6 A modification suppresses ocular melanoma through modulating HINT2 mRNA translation, MOLECULAR CANCER, 2019, 第 6 作者
（13） Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma, CELL RESEARCH, 2019, 第11作者
（14） Interplay of LIS1 and MeCP2: Interactions and Implications With the Neurodevelopmental Disorders Lissencephaly and Rett Syndrome, FRONTIERS IN CELLULAR NEUROSCIENCE, 2019, 第 7 作者
（15） Yang X, Liu QL, Xu W, Zhang YC, Yang Y, Ju LF, Chen J, Chen YS, Li K, Ren J#, Sun QW# & Yang YG# (# co-corresponding author). m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination., Cell Research, 2019, 
（16） Insight into novel RNA-binding activities via large-scale analysis of lncRNA-bound proteome and IDH1-bound transcriptome, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2019, 第11作者
（17） RNA 5-Methylcytosine Facilitates the Maternal-to-Zygotic Transition by Preventing Maternal mRNA Decay, MOLECULAR CELL, 2019, 第 1 作者
（18） m6A Regulates Neurogenesis and Neuronal Development by Modulating Histone Methyltransferase Ezh2, m6A Regulates Neurogenesis and Neuronal Development by Modulating Histone Methyltransferase Ezh2, Genomics, 2019, 通讯作者
（19） Dynamic transcriptomic m^6A decoration: writers, erasers, readers and functions in RNA metabolism, Dynamic transcriptomic m^6A decoration: writers, erasers, readers and functions in RNA metabolism, CELL RESEARCH, 2018, 第 1 作者
（20） RNA修饰类型及调控蛋白, Types and regulatory enzymes of RNA modifications, 生命科学, 2018, 第 2 作者
（21） METTL3-mediated N^6-methyladenosine mRNA modification enhances long-term memory consolidation, METTL3-mediated N^6-methyladenosine mRNA modification enhances long-term memory consolidation, 细胞研究：英文版, 2018, 第 6 作者
（22） RNA甲基化修饰调控和规律, RNA methylation:regulations and mechanisms, 遗传, 2018, 第 1 作者
（23） METTL3-mediated m6A modification is required for cerebellar development, PLOS BIOLOGY, 2018, 
（24） 5-methylcytosine promotes mRNA export — NSUN2 as the methyltransferase and ALYREF as an m~5C reader, CELL RESEARCH, 2017, 第 2 作者
（25） Cytoplasmic m6A reader YTHDF3 promotes mRNA translation, Cell Research, 2017, 第 1 作者
（26） Mettl3-Mediated m6A Regulates Spermatogonial Differentiation and Meiosis Initiation, CELL RESEARCH, 2017, 第 2 作者
（27） m(6)A modulates haematopoietic stem and progenitor cell specification, NATURE, 2017, 第 5 作者
（28） 细胞核内m6A读码器YTHDC1调控mRNA选择性剪接机制研究, Nuclear m6A Reader YTHDC1 Regulates mRNA Splicing, 2016, 
（29） Immune Regulator MCPIP1 Modulates TET Expression During Early Neocortical Development, STEM CELL REPORTS, 2016, 第 4 作者
（30） Dynamic m6A modification and its emerging regulatory role in mRNA splicing, SCIENCE BULLETIN, 2015, 第 1 作者
（31） FTO-dependent demethylation of N6-methyladenosine regulates mRNA splicing and is required for adipogenesis, CELL RESEARCH, 2014, 第 2 作者
（32） Mammalian WTAP is a regulatory subunit of the RNA N6-methyladenosine methyltransferase., CELL RESEARCH, 2014, 第 13 作者
（33） Redox-active quinones induces genome-wide DNA methylation changes by an iron-mediated and Tet-dependent mechanism, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2014, 第 2 作者
（34） FTO and Obesity: Mechanisms of Association, CURRENT DIABETES REPORTS, 2014, 第 2 作者
（35） Ascorbic Acid Enhances Tet-Mediated 5-Methylcytosine Oxidation and Promotes DNA Demethylation in Mammals, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2013, 第 5 作者
（36） Methylated nuclear RNA is the main substrate of the obesity-associated FTO protein, Nature Chemical Biology, 2011, 第 1 作者
（37） N6-methyladenosine RNA modification suppresses antiviral innate sensing pathways via reshaping double-stranded RNA, Springer, 第 2 作者
（38） METTL3-dependent m6A modification programs T follicular helper cell differentiation, Springer, 第 1 作者

（1） 《精准医学基础系列》（第11章. RNA修饰与疾病的精准医疗）, 上海交通大学出版社有限公司, 2018-03, 第 其他 作者
（2） RNA甲基化表观转录组学, 浙江大学出版社, 2021-02, 第 其他 作者

   

（ 1 ） 日本三角涡虫再生RNA表观遗传学研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12
（ 2 ） RNA甲基化修饰调控血液血管发育机制研究, 参与, 国家任务, 2019-09--2024-08
（ 3 ） RNA新型修饰调控多能性干细胞初始态和始发态转变机制研究, 参与, 国家任务, 2018-07--2022-12
（ 4 ） 中国科学院青年创新促进会, 负责人, 中国科学院计划, 2018-01--2021-12
（ 5 ） 基因组修饰多维组学分析技术与标准化研究, 参与, 中国科学院计划, 2020-01--2024-12
（ 6 ） 新冠病毒基因组序列的演化分析, 参与, 国家任务, 2020-05--2021-06
（ 7 ） 单细胞RNA甲基化测序技术开发与应用, 负责人, 地方任务, 2020-09--2023-08
（ 8 ） 单细胞RNA m5C测序技术研发, 负责人, 国家任务, 2021-01--2023-12

（1）WTAP-mediated cell-cell communication controls planarian regeneration   中国生物化学与分子生物学会2021年全国学术大会   2021-11-24
（2）m6A-mediated cell-cell communication controls planarian regeneration   第十一届全国核糖核酸（RNA）会议   2021-07-04
（3）RNA methylation regulates regeneration of the planarian Schmidtea mediterranea   中科院青促会第三届青年生命科学论坛   2021-06-06
（4）Mettl3-mediated N6-methylcytosine regulates RNA abundance of SARS-CoV-2   2020-12-19
（5）RNA 5-Methylcytosine Facilitates Maternal-to-zygotic Transition through Preventing Maternal RNA Decay   第一届全国核糖核酸（RNA）青年学术会议   2019-05-11
（6）RNA m5C修饰影响斑马鱼胚胎发育的分子机制   首届群英汇智青年学者论坛   2019-05-10
（7）RNA m5C修饰的分布及功能研究   中国细胞生物学学会2018年全国学术大会   2018-04-10

已指导学生

郭静云  硕士研究生  085238-生物工程  

梁承志  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

陈静  硕士研究生  085238-生物工程  

普俊铭  硕士研究生  071007-遗传学  

现指导学生

梁道博  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

夏双燕  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

古烨  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

钟帅  硕士研究生  0710Z1-基因组学