071004-水生生物学
083001-环境科学

环境微生物学，细菌分子遗传
应用微生物学
水污染生态学

1998-09--2002-03   中国科学院   博士研究生理学博士
1989-09--1992-06   华中师范大学   硕士研究生理学硕士
1985-09--1989-06   华中师范大学   本科学历理学学士

   

2011-11~2012-02,University of Oklahoma, 研究学者
2008-04~2011-02,美国俄克拉何马大学, 博士后/研究科学家
2005-07~2008-03,美国西弗吉尼亚州Marshall大学, 博士后
2005-04~2005-06,日本琦玉县越谷市Taitec株式会社, 会社员
2001-09~2005-03,日本庆应大学, COE研究员/学术博士
1998-09~2002-03,中国科学院, 博士研究生理学博士
1992-07~2001-08,中国科学院水生生物研究, 研究实习员助理研究员
1989-09~1992-06,华中师范大学, 硕士研究生理学硕士
1985-09~1989-06,华中师范大学, 本科学历理学学士

2018-05-07-2023-04-30,中国地质大学（武汉）兼职教授,
2018-01-01-2028-12-31,中国环境科学学会环境生物学分会副主任委员, 副主任委员
2014-01-01-2028-12-31,湖北省暨武汉市微生物学会理事, 理事

   

（1） 湖北省自然科学奖, 二等奖, 省级, 2014
（2） 中国科学院科技进步三等奖, 三等奖, 院级, 1998

（ 1 ） 一种促进希瓦氏菌EPA合成的转录调节因子PfaR及其应用, 2022, 第 1 作者, 专利号: 202210353242.3

（ 2 ） 一种海洋来源耐盐菌胶团形成菌新种及其应用, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN113249272A

（ 3 ） 一种移动式净化污水和黑臭水体的方法及装置, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN109052624B

（ 4 ） 一株高产血红素的洛伊希瓦氏菌基因工程菌及其构建方法, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN109609427A

（ 5 ） 一株高产原卟啉PPIX的希瓦氏菌基因工程菌及构建方法, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN109294963A

（ 6 ） 一种杀藻剂在控制微囊藻水华中的用途, 2014, 第 1 作者, 专利号: CN103613178A

   

（1） Parachitinimonas caeni gen. nov., sp. nov., a novel member of family Burkholderiaceae isolated from activated sludge collected in Shenzhen, PR China., Int J Syst Evol Microbiol., 2024, 
（2） Characterization of the Positive Transcription Regulator PfaR for Improving Eicosapentaenoic Acid Production in Shewanella putrefaciens W3-18-1, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2023, 第 6 作者  通讯作者
（3） An RpoN-dependent PEP-CTERM gene is involved in floc formation of an Aquincola tertiaricarbonis strain, BMC MICROBIOLOGY, 2023, 第 8 作者  通讯作者
（4） Sulfamethoxazole degradation by Pseudomonas silesiensis F6a isolated from bioelectrochemical technology-integrated constructed wetlands, ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY, 2022, 第 7 作者  通讯作者
（5） Biodegradation of phthalate acid esters by a versatile PAE-degrading strain Rhodococcus sp. LW-XY12 and associated genomic analysis, INTERNATIONAL BIODETERIORATION & BIODEGRADATION, 2022, 第 11 作者  通讯作者
（6） Cellulose-mediated floc formation by the activated sludge bacterium Shinella zoogloeoides ATCC 19623, BMC MICROBIOLOGY, 2022, 第 7 作者  通讯作者
（7） DNRA and denitrification pathways are leveraged by cyclic AMP receptor protein (CRP) paralogues based on electron donor/acceptor limitation in Shewanella loihica PV-4., Applied and Environmental Microbiology, 2021, 第 3 作者  通讯作者
（8） Changes of microbial community structure during the initial stage of biological clogging in horizontal subsurface flow constructed wetlands, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 2021, 第 8 作者
（9） European eel (Anguilla anguilla) GI tract conserves a unique metagenomics profile in the recirculation aquaculture system (RAS), AQUACULTURE INTERNATIONAL, 2021, 第 3 作者  通讯作者
（10） Dissimilatory Nitrate Reduction to Ammonium (DNRA) and Denitrification Pathways Are Leveraged by Cyclic AMP Receptor Protein (CRP) Paralogues Based on Electron Donor/Acceptor Limitation in Shewanella loihica PV-4, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2021, 第 8 作者  通讯作者
（11） Tropical and temperate wastewater treatment plants assemble different and diverse microbiomes, APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2021, 第 10 作者
（12） Dysbiosis of the shrimp (Penaeus monodon) gut microbiome with AHPND outbreaks revealed by 16S rRNA metagenomics analysis, AQUACULTURE RESEARCH, 2021, 第 3 作者  通讯作者
（13） Carbon-negative and high-rate nutrient removal using mixotrophic microalgae, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 2021, 第 7 作者
（14） 活性污泥菌胶团/生物絮团形成菌的分离鉴定及基因组分析, ISOLATION, IDENTIFICATION AND GENOMICS ANALYSIS OF ACTIVATED SLUDGE FLOC/BIOFLOC FORMINGPSEUDODUGANELLAEBURNEASTRAINS, 水生生物学报, 2020, 第 5 作者
（15） Effects of maifanite on growth, physiological and phytochemical process of submerged macrophytes Vallisneria spiralis, ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY, 2020, 第 7 作者
（16） Disodium 2-oxoglutarate promotes carbon flux into astaxanthin and fatty acid biosynthesis pathways in Haematococcus, BIORESOURCE TECHNOLOGY, 2020, 第 6 作者
（17） Gene expression abundance dictated exopolysaccharide modification in Rhizobium radiobacter SZ4S7S14 as the cell's response to salt stress, INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES, 2020, 第 7 作者
（18） Azoarcus halotolerans sp. nov., a novel member of Rhodocyclaceae isolated from activated sludge collected in Hong Kong, INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2020, 第 7 作者  通讯作者
（19） 蓝藻胞外多聚物生物合成、群体形成与微囊藻水华, BIOSYNTHESIS PATHWAY OF EXTRACELLULAR POLYMERIC SUBSTANCES AND COLONIAL FORMATION OF CYANOBACTERIA UNDERLYING WATER BLOOMS OFMICROCYSTIS, 水生生物学报, 2020, 第 1 作者
（20） Production of Highly Active Extracellular Amylase and Cellulase From Bacillus subtilis ZIM3 and a Recombinant Strain With a Potential Application in Tobacco Fermentation, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2020, 第 10 作者  通讯作者
（21） 活性污泥菌胶团/生物絮团形成菌Pseudoduganella eburnean 的分离鉴定及基因组分析, 水生生物学报, 2020, 第 1 作者  通讯作者
（22） 活性污泥微生物解壳聚糖松江菌中菌胶团形成相关大型基因簇的鉴定和分析, Identification and analysis of a large gene cluster involved in floc formation of activated sludge bacterium Mitsuaria chitosanitabida, 微生物学通报, 2019, 第 6 作者
（23） 活性污泥微生物胞外多聚物生物合成途径与菌胶团形成的调控机制, Biosynthesis pathway of extracellular polymeric substance and regulatory mechanism underlying floc formation of activated sludge bacteria, 微生物学通报, 2019, 第 1 作者
（24） Differential gene content and gene expression for bacterial evolution and speciation of Shewanella in terms of biosynthesis of heme and heme-requiring proteins, BMC MICROBIOLOGY, 2019, 第 8 作者  通讯作者
（25） Both widespread PEP-CTERM proteins and exopolysaccharides are required for floc formation of Zoogloea resiniphila and other activated sludge bacteria, ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2018, 第 14 作者  通讯作者
（26） RpoN (sigma(54)) Is Required for Floc Formation but Not for Extracellular Polysaccharide Biosynthesis in a Floc-Forming Aquincola tertiaricarbonis Strain, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2017, 第 13 作者  通讯作者
（27） RpoN (�� 54 ) Is Required for Floc Formation but Not for Extracellular Polysaccharide Biosynthesis in a Floc-Forming Aquincola tertiaricarbonis Strain, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2017, 第 13 作者
（28） Differential Regulation of the Two Ferrochelatase Paralogues in Shewanella loihica PV-4 in Response to Environmental Stresses, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2016, 第 1 作者
（29） Functional roles of CymA and NapC in reduction of nitrate and nitrite by Shewanella putrefaciens W3-18-1, MICROBIOLOGY-SGM, 2016, 第 11 作者  通讯作者
（30） Comparative genomics analyses on EPS biosynthesis genes required for floc formation of Zoogloea resiniphila and other activated sludge bacteria, WATER RESEARCH, 2016, 第 17 作者  通讯作者
（31） 动胶菌属系统分类、生理特征及其在活性污泥中的作用, 应用与环境生物学报, 2016, 第 6 作者
（32） Truncated type IV pilin PilA(108) activates the intramembrane protease AlgW to cleave MucA and PilA(108) itself in vitro, ARCHIVES OF MICROBIOLOGY, 2016, 第 13 作者  通讯作者
（33） Effects of intermediate metabolite carboxylic acids of TCA cycle on Microcystis with overproduction of phycocyanin, ENVIRONMENTAL SCIENCE AND POLLUTION RESEARCH, 2015, 第 11 作者  通讯作者
（34） An extracytoplasmic function sigma factor-dependent periplasmic glutathione peroxidase is involved in oxidative stress response of Shewanella oneidensis, BMC MICROBIOLOGY, 2015, 第 6 作者
（35） An extracytoplasmic function sigma factor-dependent periplasmic glutathione peroxidase is involved in oxidative stress response of Shewanella oneidensis, 2015, 第 1 作者
（36） Roles of UndA and MtrC of Shewanella putrefaciens W3-18-1 in iron reduction, 2013, 第 2 作者
（37） Combined Genomics and Experimental Analyses of Respiratory Characteristics of Shewanella putrefaciens W3-18-1, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2013, 第 1 作者
（38） 枯草芽孢杆菌中多聚-γ-谷氨酸的生物合成及其调控机制, 应用与环境生物学报, 2013, 第 6 作者
（39） 枯草芽孢杆菌中多聚-D-谷氨酸生物合成及调控机制, 应用与环境生物学报, 2013, 第 1 作者  通讯作者
（40） Roles of UndA and MtrC of Shewanella putrefaciens W3-18-1 in iron reduction, BMC MICROBIOLOGY, 2013, 第 3 作者
（41） 细菌必需基因、最小基因组和合成细胞, Essential genes, minimal genome and synthetic cell of bacteria: a review, 生物工程学报, 2012, 第 1 作者
（42） The Pseudomonas aeruginosa Sensor Kinase KinB Negatively Controls Alginate Production through AlgW-Dependent MucA Proteolysis ���, JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 2009, 第 2 作者
（43） A series of PBAD-based shuttle vectors for functional analysis of toxic and highly-regulated genes in Pseudomonas and Burkholderia spp. and other bacteria., Applied and Environmental Microbiology, 2008, 第 1 作者
（44） ClpXP proteases positively regulate overexpression of alginate and mucoid conversion in Pseudomonas aeruginosa., Microbiology, 2008, 第 1 作者
（45） Regulated proteolysis controls mucoid conversion in Pseudomonas aeruginosa, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2007, 第 1 作者
（46） Comparative analysis of the physical maps of four Bacillus subtilis (natto) genomes., Applied and Environmental Microbiology, 2004, 第 1 作者
（47） Sustained MAPK activation depends on continual stimulation of NGF receptors., Development, Growth and Differentiation, 2004, 第 1 作者
（48） 沉水植物重建对富营养水体氮磷营养水平的影响, Effects of rehabilitation of submerged macrophytes on nutrient level of a eutrophic lake, 应用生态学报, 2003, 第 2 作者
（49） 武汉东湖水生植被现状调查及群落演替分析, 重庆环境科学, 2003, 第 3 作者
（50） 复合构建湿地运动初期理化性质及氮的变化, Phys-chemical character and nitrogen changes in integrated constructed wetland at the initial stage of operation, 长江流域资源与环境, 2002, 第 7 作者
（51） 荧光原位杂交技术（FISH）及其在环境微生物学中的应用, 生命科学, 2002, 第 2 作者
（52） 东湖围隔中菹草与藻类生化他感作用的初步研究, ALLELOPATHIC EFFECTS BETWEEN AQUATIC PLANT(POTAMOGETON CRISPUS)AND ALGAE(SCENEDESMUS OBLIQUUS)IN THE ENCLOSURES AT DONGHU LAKE, 水生生物学报, 2002, 第 3 作者
（53） 复合垂直流构建湿地基质酶活性与污水净化效果, 生态学报, 2002, 第 3 作者
（54） 复合构建湿地运行初期理化性质及氮的变化, 长江流域资源与环境, 2002, 第 7 作者
（55） 水生植物对富营养水体水质净化作用研究, 武汉植物学研究, 2001, 第 2 作者
（56） 人工湿地系统对污水磷的净化效果, PRIMARYSTUDIESONTHEPURIFICATIONEFFICIENCYOFPHOSPHORUSBYMEANSOFCONSTRUCTEDWETLANDSYSTEM, 水生生物学报, 2001, 第 7 作者
（57） 内分泌扰乱化学品活性筛选和测试方法, 环境科学研究, 2001, 第 1 作者
（58） The restoration of aquatic macrophytes for improving water quality in a hytertrophic shallow lake in Hubei province, China., 2001, 第 1 作者
（59） 内分泌扰乱化学品对动物的影响和作用机制, 环境科学研究, 2000, 第 1 作者
（60） 二噁对人体和动物的毒性作用和内分泌干扰, 生物学通报, 2000, 第 1 作者
（61） 激素对油蓖5号外植体愈伤组织的诱导效率, 适用技术市场, 1999, 第 3 作者
（62） 生物操纵、营养级联反应和下行影响, On the Biomanipulation, Trophic Cascade Interactions and Top-down Forces, 生态学杂志, 1998, 第 1 作者
（63） 不同生活型大型植物对浮游植物群落的影响, Effects of Aquatic Macrophytes of Various Life Form on Phytoplankton, 生态学杂志, 1998, 第 1 作者
（64） 武汉东湖水生植物生态学研究：Ⅲ沉水植被重建的可行性研究, 长江流域资源与环境, 1998, 第 1 作者
（65） 武汉东湖湖水和底泥对黄丝草生长的影响, 植物资源与环境, 1997, 第 1 作者
（66） 富营养浅湖水生植被重建对底栖动物的影响, 应用与环境生物学报, 1997, 第 2 作者
（67） Studies on the correlations between macrophytes and algae in artificial simulated ecosystem, ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA, 1997, 第 3 作者
（68） 富营养化浅水湖泊沉水水生植被的衰退与恢复, 湖泊科学, 1997, 第 1 作者
（69） 人工模拟生态系统中水生植物与藻类的相关性研究, STUDIES ON THE CORRELATIONS BETWEEN MACROPHYTES AND ALGAE IN ARTIFICIAL SIMULATED ECOSYSTEM, 水生生物学报, 1997, 第 4 作者
（70） 环境雌激素对动物和人体的影响及其作用机制, EFFECTS OF ENVIRONMENTAL ESTROGENS ON ANIMALS AND HUMANS, 水生生物学报, 1997, 第 1 作者
（71） 武汉东湖水生植被的恢复试验研究, 湖泊科学, 1997, 第 1 作者
（72） 鄂东南幕阜山区种子植物区系研究, 广西植物, 1997, 第 2 作者
（73） 武汉东湖水生植物群落演替的研究, 植物生态学报, 1997, 第 3 作者
（74） 武汉东湖湖水和底泥对黄丝草生长的影响, 植物资源与环境学报, 1997, 第 1 作者
（75） 武汉东湖水生植物生态学研究：Ⅱ.后湖水生植被动态与水体性质, 武汉植物学研究, 1997, 第 1 作者
（76） 富营养浅水湖泊的退化与生态恢复, 长江流域资源与环境, 1996, 第 1 作者
（77） PCR技术在环境生物学上的应用, 生物学通报, 1996, 第 1 作者
（78） 武汉东湖水生植物生态学研究I.水生植被现状与演替动态, 水生生物学报, 1995, 第 1 作者

   

（ 1 ） 鱼类生态育种及健康养殖研究, 负责人, 地方任务, 2024-01--2028-12
（ 2 ） 可生化性低和耐毒性高微生物技术和菌种研发, 负责人, 境内委托项目, 2023-01--2025-12
（ 3 ） 酱香型白酒酿造废水水质特征与处理工艺研究, 参与, 其他, 2023-01--2025-12
（ 4 ） 气候变化环境下热带海岛流域水资源综合利用与CKDu环境致病因子生物防治研究, 负责人, 中国科学院计划, 2021-01--2023-12
（ 5 ） 表面活性剂、阻燃剂、POPs降解元件挖掘, 负责人, 国家任务, 2020-01--2024-12
（ 6 ） 解聚酶克隆, 负责人, 国家任务, 2020-01--2024-12
（ 7 ） 长江干流陆向岸线污染拦截及生态修复技术, 参与, 中国科学院计划, 2019-01--2023-12
（ 8 ） 细菌反硝化脱氮与异化型硝酸盐还原氨化的分子决定机制研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2020-12
（ 9 ） 活性污泥功能状态评估, 负责人, 中国科学院计划, 2017-10--2019-09
（ 10 ） 清洁水技术及水务合作计划, 负责人, 中国科学院计划, 2016-01--2020-12
（ 11 ） 一泓清水出污泥——活性污泥处理技术百年祭, 负责人, 中国科学院计划, 2015-01--2016-12
（ 12 ） 中科院“****”择优资助, 负责人, 中国科学院计划, 2012-03--2016-12
（ 13 ） 细菌低温适应与无氧呼吸研究, 负责人, 研究所自主部署, 2011-05--2013-04