基本信息
严军  男  博导  中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心
电子邮件: junyan@ion.ac.cn
通信地址: 上海岳阳路320号神经科学研究所
邮政编码: 200031

招生信息

   
招生专业
071006-神经生物学
0710Z2-计算生物学
招生方向
神经生物学,计算生物学

教育背景

1998-09--2003-07   纽约大学   博士
1994-09--1998-07   复旦大学   学士

工作经历

   
工作简历
2015-09~现在, 中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所, 研究员
2006-07~2015-08,中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所, 研究员
2003-07~2006-07,阿拉斯加大学费尔班克斯分校北极生物研究所, 博士后
1998-09~2003-07,纽约大学, 博士
1994-09~1998-07,复旦大学, 学士

教授课程

神经科学研究方法
实验生物学
神经生物学
脑活动调控技术
高等计算生物学
生物统计

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 朱李月华优秀教师奖, 一等奖, 专项, 2010
专利成果
( 1 ) 一种基于全脑光学成像数据的神经元重构方法及装置, 2022, 第 2 作者, 专利号: CN114626513A

出版信息

   
发表论文
(1) Gapr for large-scale collaborative single-neuron reconstruction, NATURE METHODS, 2024, 第 11 作者  通讯作者
(2) Single-neuron analysis of dendrites and axons reveals the network organization in mouse prefrontal cortex, NATURE NEUROSCIENCE, 2023, 第 6 作者  通讯作者
(3) Cholecystokinin neurons in mouse suprachiasmatic nucleus regulate the robustness of circadian clock, NEURON, 2023, 第 7 作者
(4) Single-neuron projectome of mouse prefrontal cortex, NATURE NEUROSCIENCE, 2022, 第 28 作者  通讯作者
(5) Spatiotemporal single-cell analysis of gene expression in the mouse suprachiasmatic nucleus, NATURE NEUROSCIENCE, 2020, 第 10 作者  通讯作者
(6) Transcriptome Response and Spatial Pattern of Gene Expression in the Primate Subventricular Zone Neurogenic Niche After Cerebral Ischemia, FRONTIERS IN CELL AND DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 2020, 第 10 作者
(7) Single-cell in vivo imaging of cellular circadian oscillators in zebrafish, PLOS BIOLOGY, 2020, 第 8 作者  通讯作者
(8) TIP60/KAT5 is required for neuronal viability in hippocampal CA1, SCIENTIFIC REPORTS, 2019, 第 8 作者
(9) Evolution of an X-Linked miRNA Family Predominantly Expressed in Mammalian Male Germ Cells, MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 2019, 第 6 作者
(10) TIP60, SCIENTIFIC REPORTS, 2019, 第 8 作者
(11) A class of circadian long non-coding RNAs mark enhancers modulating long-range circadian gene regulation, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2017, 第 10 作者  通讯作者
(12) Oscillating primary transcripts harbor miRNAs with circadian functions, SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 第 9 作者  通讯作者
(13) Long-Range Chromosome Interactions Mediated by Cohesin Shape Circadian Gene Expression, PLOS GENETICS, 2016, 第 8 作者  通讯作者
(14) Reconstruction of the Gene Regulatory Network Involved in the Sonic Hedgehog Pathway with a Potential Role in Early Development of the Mouse Brain., PLoS computational biology, 2015, 第 1 作者  通讯作者
(15) Integrative Analysis of Circadian Transcriptome and Metabolic Network Reveals the Role of de novo Purine Synthesis in Circadian Control of Cell Cycle., PLoS computational biology, 2014, 第 1 作者  通讯作者
(16) Cold-induced RNA-binding proteins regulate circadian gene expression by controlling alternative polyadenylation, SCIENTIFIC REPORTS, 2013, 第 7 作者  通讯作者
(17) Analysis of a Gene Regulatory Cascade Mediating Circadian Rhythm in Zebrafish, PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2013, 第 5 作者  通讯作者
(18) Genomic analysis of miRNAs in an extreme mammalian hibernator, the Arctic ground squirrel, PHYSIOLOGICAL GENOMICS, 2010, 第 14 作者  通讯作者
(19) Shotgun Proteomics Analysis of Hibernating Arctic Ground Squirrels, MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, 2010, 第 11 作者  通讯作者
(20) Computational analysis of gene regulation in animal sleep deprivation, PHYSIOLOGICAL GENOMICS, 2010, 第 4 作者  通讯作者
(21) Genomic analysis of expressed sequence tags in American black bear Ursus americanus, BMC GENOMICS, 2010, 第 9 作者
(22) Modulation of gene expression in hibernating arctic ground squirrels, PHYSIOLOGICAL GENOMICS, 2008, 第 1 作者  通讯作者
(23) Analysis of Gene Regulatory Networks in the Mammalian Circadian Rhythm, PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2008, 第 1 作者  通讯作者
(24) Detection of differential gene expression in brown adipose tissue of hibernating arctic ground squirrels with mouse microarrays, PHYSIOLOGICAL GENOMICS, 2006, 
(25) Computational analysis of 3���-ends of ESTs shows four classes of alternative polyadenylation in human, mouse, and rat, GENOME RESEARCH, 2005, 

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 感知认知的神经机制及调控, 负责人, 国家任务, 2022-12--2029-12
( 2 ) 空间环境对生物节律与睡眠觉醒的影响机制, 负责人, 国家任务, 2022-10--2027-11
( 3 ) 全脑输入输出环路同步成像和三维重构新方法, 负责人, 国家任务, 2021-12--2029-11
( 4 ) 基于脑图谱的功能认知建模, 负责人, 国家任务, 2021-12--2029-11
( 5 ) 松果体神经元在昼夜节律中的作用和调控机制, 负责人, 国家任务, 2019-01--2021-12
( 6 ) RNA 结合蛋白在昼夜节律中的功能研究, 负责人, 国家任务, 2016-01--2019-12
( 7 ) 脑网络数据分析和类脑计算模型, 负责人, 中国科学院计划, 2015-09--2017-12