071006-神经生物学
0710Z2-计算生物学

神经科学，功能基因组学

1998-09--2003-07   纽约大学   博士
1994-09--1998-07   复旦大学   学士

   

2015-09~现在, 中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所, 研究员
2006-07~2015-08,中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所, 研究员
2003-07~2006-07,阿拉斯加大学费尔班克斯分校北极生物研究所, 博士后
1998-09~2003-07,纽约大学, 博士
1994-09~1998-07,复旦大学, 学士

神经科学研究方法
实验生物学
神经生物学
脑活动调控技术
高等计算生物学
生物统计

   

（1） 朱李月华优秀教师奖, 一等奖, 专项, 2010

（ 1 ） 一种太字节量级全脑光学成像数据的神经元重构工具, 2020, 第 2 作者, 专利号: 202011435907.2

   

（1） Spatiotemporal single-cell analysis of gene expression in the mouse suprachiasmatic nucleus, Nature Neuroscience, 2020, 通讯作者
（2） Single-cell in vivo imaging of cellular circadian oscillators in zebrafish, PLoS Biology, 2020, 通讯作者
（3） A class of circadian long non-coding RNAs mark enhancers modulating long-range circadian gene regulation., Nucleic. Acids. Res, 2017, 通讯作者
（4） Long-range chromosome interactions mediated by cohesin shape circadian gene expression, PLOS Genetics, 2016, 通讯作者
（5） Oscillating primary transcripts harbor miRNAs with circadian functions, Scientific reports, 2016, 通讯作者
（6） Reconstruction of the Gene Regulatory Network Involved in the Sonic Hedgehog Pathway with a Potential Role in Early Development of the Mouse Brain., PLoS computational biology, 2015, 通讯作者
（7） Integrative Analysis of Circadian Transcriptome and Metabolic Network Reveals the Role of de novo Purine Synthesis in Circadian Control of Cell Cycle., PLoS computational biology, 2014, 通讯作者
（8） Analysis of a gene regulatory cascade mediating circadian rhythm in zebrafish, PLoS computational biology, 2013, 通讯作者
（9） Cold-induced RNA-binding proteins regulate circadian gene expression by controlling alternative polyadenylation, Scientific reports, 2013, 通讯作者
（10） Computational analysis of gene regulation in animal sleep deprivation, Physiol Genomics, 2010, 通讯作者
（11） Genomic analysis of miRNAs in an extreme mammalian hibernator, the Arctic ground squirrel, Physiol Genomics, 2010, 通讯作者
（12） Shotgun proteomics analysis of hibernating arctic ground squirrels, Mol Cell Proteomics, 2010, 通讯作者
（13） Genomic analysis of expressed sequence tags in American black bear Ursus americanus, BMC Genomics, 2010, 通讯作者
（14） Modulation of gene expression in hibernating arctic ground squirrels, Physiol Genomics, 2008, 第 1 作者
（15） Analysis of gene regulatory networks in the mammalian circadian rhythm, PLoS Comput Biol, 2008, 第 1 作者
（16） Detection of differential gene expression in brown adipose tissue of hibernating arctic ground squirrels with mouse microarrays, Physiol Genomics, 2006, 第 1 作者
（17） Computational analysis of 3-ends of ESTs shows four classes of alternative polyadenylation in human, mouse, and rat, Genome Res, 2005, 第 1 作者

   

（ 1 ） 脑网络数据分析和类脑计算模型, 负责人, 中国科学院计划, 2015-09--2017-12
（ 2 ） RNA 结合蛋白在昼夜节律中的功能研究, 负责人, 国家任务, 2016-01--2019-12
（ 3 ） 松果体神经元在昼夜节律中的作用和调控机制, 负责人, 国家任务, 2019-01--2021-12