1、灵长类比较基因组与人类起源的遗传机制

   人类区别于非人灵长类最为显著的特征是人类发达的大脑。大脑容量急剧增加和认知能力的巨大飞跃是人类起源的关键所在。然而，导致人类这一根本性变化的遗传学机制尚不清楚。宿兵研究员课题组的主要研究方向为灵长类大脑功能演化的基因组与遗传学基础研究，主要采用比较基因组学、生物信息学与功能实验相结合的研究方法，通过系统研究在灵长类中枢神经系统中发挥重要生物学功能的基因、基因家族和染色体区域在基因序列、选择性剪接、非编码RNA表达调控、基因表达谱、DNA甲基化谱等不同层次的变异模式，建立基因结构、基因表达与调控、表观遗传修饰等不同层次的分子进化模式同灵长类大脑功能演化的关系，确定在灵长类大脑功能演化过程中起关键作用的基因和基因家族，尤其是在人类起源中对人类智力发挥重要作用的基因和基因家族，从而揭示灵长类大脑功能演化的基因组与遗传学基础。 

2、东亚现代人的起源、迁徙与适应性进化 

  灵长类大脑功能演化与人类的起源与迁徙是两个密切相关的研究课题，人类从非洲起源以后在向其它地区扩散的过程中仍然发生着对温度、太阳紫外线辐射、高原缺氧等环境因素以及食物结构改变、疾病等各种因素的适应性进化。东亚地区幅员辽阔、人口密集、南北纬度跨度大，是研究人类群体遗传多样性和适应性进化最重要的地区之一。（1）通过系统分析人类mtDNA和Y-染色体DNA、以及化石和遗骸古DNA的遗传变异在东亚地区人群中的分布模式，探索东亚现代人起源的方式，重建其史前迁徙的路线，了解人类群体遗传结构的历史变迁及其与人群文化和语言分化的关系。（2）通过系统分析诸如温度、太阳紫外线辐射、高原缺氧等环境因素指标与人群基因组变异之间的相关性，探讨人群在史前迁徙过程中对环境、饮食等各类因素的适应性进化的遗传学机制，为癌症等人类重大疾病的流行病学研究提供重要信息。

   

071007-遗传学
071022-基因组学
071023-计算生物学

进化遗传学
人类遗传学

1985.9－1989.7：本科，武汉大学生物系细胞生物学专业
1991.9－1996.7：博士，中国科学院昆明动物研究所（导师：施立明院士）

博士研究生

理学博士

1994.8－1995.2：访问学生，美国加州大学圣地亚哥分校生物系
1997.9－2000.2：博士后，美国德克萨斯大学修斯顿人类遗传学中心
2000.3－2001.5：Research Fellow, 美国德克萨斯大学修斯顿人类遗传学中心
2001.5－2005.8：Assistant Professor, 美国辛辛那提大学医学院

1994.8－1995.2：访问学生，美国加州大学圣地亚哥分校生物系
1996.8－1997.8：副研究员，中国科学院昆明动物研究所
1997.9－2000.2：博士后，美国德克萨斯大学修斯顿人类遗传学中心
2000.3－2001.5：Research Fellow, 美国德克萨斯大学修斯顿人类遗传学中心
2001.5－2005.8：Assistant Professor, 美国辛辛那提大学医学院
2001.9－至今：研究员，中国科学院昆明动物所

生物信息学
进化生物学
进化生物学基础理论

   

1996： 中国科学院自然科学一等奖 (第三完成人） 中国特有珍稀动物类群的细胞和分子进化
1997：国家自然科学奖三等奖 （第三完成人） 中国特有珍稀动物类群的细胞和分子进化
2002： 云南省自然科学一等奖 （第三完成人） 滇金丝猴生物学研究
2003： 教育部科技进步一等奖 （第三完成人） 东亚人群的起源和史前迁徙研究；
2005： 云南省自然科学一等奖 （第三完成人） 中国少数民族DNA库的建立及应用研究
2007： 国家自然科学二等奖 （第二完成人） Y染色体多态性与东亚人群的起源、迁徙和遗传结构的研究
2007 ：云南省自然科学奖一等奖 （第三完成人） 基于少数民族DNA库的疾病基因及人群起源的分子遗传研究

   

（1） Trio deep-sequencing does not reveal unexpected off-target and on-target mutations in Cas9-edited monkeys, Nature Communications, 2019-10, 通讯作者
（2） De novo assembly of a Tibetan genome and identification of novel structural variations associated with high altitude adaptation, National Science Review, 2019-09, 通讯作者
（3） Long-read assembly of the Rhesus macaque genome and identification of ape-shared structural variants, Nature Communications, 2019-09, 通讯作者
（4） Transgenic rhesus monkeys carrying the human version of MCPH1 show human-like neoteny during brain development, National Science Review, 2019-03, 通讯作者
（5） Transcriptomic landscape of von Economo neurons in human anterior cingulate cortices revealed by microdissected-cell RNA sequencing, Cerebral Cortex, 2019-01, 通讯作者
（6） Darwinian Positive Selection on the Pleiotropic Effects of KITLG Explain Skin Pigmentation and Winter Temperature Adaptation in Eurasians, Molecular Biology and Evolution, 2018, 通讯作者
（7） Blunted nitric oxide regulation in Tibetans under high-altitude hypoxia, National Science Review, 2018, 通讯作者
（8） Regional selection of the brain size regulating gene CASC5 provides new insight into human brain evolution, Human Genetics, 2017, 通讯作者
（9） Down-regulation of EPAS1 and genetic adaptation of Tibetans to high altitude hypoxia, Molecular Biology and Evolution, 2017, 通讯作者
（10） Cross-altitude analysis suggests a turning point at the elevation of 4,500m for polycythemia incidence in Tibetans, American Journal of Hematology, 2017, 通讯作者
（11） Comparative methylome analyses identify epigenetic regulatory loci of human brain evolution, Molecular Biology and Evolution, 2016, 通讯作者
（12） HMOX2 Functions as a Modifier Gene for High-Altitude Adaptation in Tibetans, Human Mutation, 2016, 通讯作者
（13） A genetic mechanism for convergent skin lightening during recent human evolution, Molecular Biology and Evolution, 2016, 通讯作者
（14） A genetic mechanism for convergent skin lightening during recent human evolution, Molecular Biology and Evolution, 2016, 通讯作者
（15） A genetic mechanism for convergent skin lightening during recent human evolution, Molecular Biology and Evolution, 2016, 通讯作者
（16） Impact of a cis-associated gene expression SNP in 20q11.22 on bipolar disorder susceptibility, hippocampal structure and cognitive performance., British Journal of Psychiatry, 2015, 通讯作者
（17） Human specific hypo-methylation of CENPJ, a key brain size regulator., Molecular Biology and Evolution, 2014, 通讯作者
（18） Allelic differences between Europeans and Chinese for CREB1 SNPs and their implications in gene expression regulation, hippocampal structure and function and bipolar disorder susceptibility. , Molecular Psychiatry, 2014, 通讯作者
（19） Evolutionary origin and human-specific expansion of a cancer/testis antigen gene family., Molecular Biology and Evolution, 2014, 通讯作者
（20） Allelic differences between European and Chinese for CREB1 SNPs and their implications in gene expression regulation, hippocampal structure and function and bipolar disorder susceptibility, Molecular Psychiatry, 2013, 通讯作者
（21） Identification of a Tibetan-specific mutation in the hypoxic gene EGLN1 and its contribution to high altitude adaptation, Molecular Biology and Evolution, 2013, 通讯作者
（22） Genetic evidence of Paleolithic colonization and Neolithic expansion of modern humans on the Tibetan Plateau, Molecular Biology and Evolution, 2013, 通讯作者
（23） Functional divergence of MCPH1 during primate evolution and the origin of humans, BMC Biology, 2013, 通讯作者
（24） Genome sequence and global sequence variation map with 5.5 million SNPs in Chinese rhesus macaque, Genome Biology, 2011, 通讯作者
（25） Allelic Differences between Han Chinese and Europeans for Functional Variants in ZNF804A and Their Association With Schizophrenia, American Journal of Psychiatry, 2011, 通讯作者
（26） Analysis of common genetic variants identifies RELN as a risk gene for schizophrenia in Chinese population, World Journal of Biological Psychiatry, 2011, 通讯作者
（27） MicroRNA profiling of rhesus macaque embryonic stem cells, BMC Genomics, 2011, 通讯作者
（28） A common variant of the cardiomyopathy associated 5 (CMYA5) is associated with schizophrenia in Chinese population. , Schizophrenia Research, 2011, 通讯作者
（29） Genetic variations in Tibetan populations and high altitude adaptation at the Himalayas., Molecular Biology and Evolution, 2011, 通讯作者
（30） Extended Y Chromosome Investigation Suggests Postglacial Migrations of Modern Humans into East Asia via the, Molecular Biology and Evolution, 2011, 通讯作者
（31） Genetic evidence of rice culture driven selection on the ADH1B Arg47His polymorphism in East Asian populations , BMC Evolutionary Biology, 2010, 通讯作者
（32） Characterization and comparison of the tissue-related modules in human and mouse , PLoS One, 2010, 通讯作者
（33） Winter Temperature and UV are Tightly Linked to Genetic Changes in the p53 Tumor Suppressor Pathway in Eastern Asia, American Journal of Human Genetics, 2009, 通讯作者
（34） Functional Characterization of the Human-specific Form (Type) of Kallikrein 8, a Gene Involved in Learning and Memory., Cell Research, 2009, 通讯作者
（35） A common SNP of MCPH1 is associated with cranial volume variation in Chinese population, Human Molecular Genetics, 2008, 通讯作者
（36） MicroRNA regulation and the variability of human cortical gene expression, Nucleic Acids Research, 2008, 通讯作者
（37） Alu-mediated expansion of a primate-specific microRNA family, Molecular Biology and Evolution, 2008, 通讯作者

   

（ 1 ） 灵长类大脑进化关键基因的功能研究, 主持, 国家级, 2012-01--2016-12
（ 2 ） 藏族人群高原低氧适应关键基因EPAS1和EGLN1互作的分子 机制及功能验证研究, 主持, 国家级, 2017-01--2019-12
（ 3 ） 动物复杂性状的进化解析与调控, 主持, 国家级, 2014-07--2019-06
（ 4 ） 云南省云岭学者人才计划, 主持, 省级, 2015-01--2019-12
（ 5 ） 基因组中新遗传结构的起源与动物的适应进化, 主持, 国家级, 2014-01--2019-12
（ 6 ） 灵长类大脑进化分子机制的转基因猕猴研究, 主持, 国家级, 2018-01--2022-12
（ 7 ） 云南省万人计划科技领军人才项目, 主持, 省级, 2019-01--2023-12

已指导学生

李易  博士研究生  071002-动物学  

王银秋  博士研究生  071002-动物学  

徐怀亮  博士研究生  071002-动物学  

廖承红  博士研究生  071002-动物学  

石宏  博士研究生  071002-动物学  

刘颖  硕士研究生  071009-细胞生物学  

罗虹  硕士研究生  071009-细胞生物学  

杨苏  硕士研究生  071009-细胞生物学  

禹晓晶  博士研究生  071002-动物学  

杨若林  博士研究生  071002-动物学  

卢志祥  博士研究生  071002-动物学  

吴海辉  博士研究生  071002-动物学  

张锐  博士研究生  071002-动物学  

罗雄剑  博士研究生  071007-遗传学  

韩冷  博士研究生  071007-遗传学  

王金凯  博士研究生  071007-遗传学  

黄琳  硕士研究生  071009-细胞生物学  

孙正华  博士研究生  071007-遗传学  

彭应梅  博士研究生  071007-遗传学  

牛傲蕾  博士研究生  071007-遗传学  

曹向宇  硕士研究生  071007-遗传学  

石磊  博士研究生  071007-遗传学  

张雁峰  博士研究生  071007-遗传学  

彭忆  博士研究生  071007-遗传学  

王毅  硕士研究生  430139-生物工程  

李明  博士研究生  071007-遗传学  

杨立新  博士研究生  071007-遗传学  

张晓明  博士研究生  071007-遗传学  

杨召辉  博士研究生  071007-遗传学  

杨德英  博士研究生  071007-遗传学  

张煦  博士研究生  071007-遗传学  

向坤  博士研究生  071007-遗传学  

何一博  硕士研究生  071007-遗传学  

虎恩志  硕士研究生  071007-遗传学  

林强  博士研究生  071007-遗传学  

黄俊  硕士研究生  071007-遗传学  

李敏  硕士研究生  085238-生物工程  

杨晏冬  博士研究生  071007-遗传学  

刘杰伟  博士研究生  071007-遗传学  

周亚楠  硕士研究生  085238-生物工程  

罗鑫  博士研究生  071007-遗传学  

胡艳  硕士研究生  071007-遗传学  

姜瑾  博士研究生  071007-遗传学  

和耀喜  博士研究生  071007-遗传学  

胡庭  硕士研究生  071007-遗传学  

现指导学生

曾雪芮  硕士研究生  085238-生物工程  

袁佳妙  博士研究生  071007-遗传学  

郑王山  博士研究生  071007-遗传学  

张凤云  硕士研究生  071007-遗传学  

王永琴  硕士研究生  071007-遗传学  

郭永博  博士研究生  071007-遗传学  

孟晓宇  博士研究生  071007-遗传学  

吴海旭  硕士研究生  071007-遗传学  

张悦  硕士研究生  071007-遗传学  

岳天  博士研究生  071007-遗传学  

周斌  博士研究生  071007-遗传学