超高分辨率成像技术的开发和应用

单分子示踪技术的开发和应用

三维基因组结构和功能

表观遗传调控

基因调控网络的系统生物学研究

   

083100-生物医学工程
071009-细胞生物学
0710Z2-计算生物学

超高分辨率成像技术
单分子示踪技术
三维基因组结构和功能

2009-08--2015-05   Duke University   计算生物学与生物信息学博士
2005-09--2009-07   清华大学医学院   生物学硕士
2001-09--2005-07   清华大学自动化系   工学学士

   

2023-02~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院, 研究员
2015-09~2023-02,Howard Hughes Medical Institute/Janelia Research Campus, 博士后

   

（1） Robert J. Fitzgerald Scholar Awards, 一等奖, 研究所（学校）, 2014

（ 1 ） Methods and compositions for the diagnosis and prognosis of cervical intraepithelial neoplasia and cervical cancer, 发明专利, 2015, 第 2 作者, 专利号: US8957039B2

（ 2 ） METHODS AND COMPOSITIONS FOR THE DIAGNOSIS AND PROGNOSIS OF CERVICAL INTRAEPITHELIAL NEOPLASIA AND CERVICAL CANCER, 发明专利, 2012, 第 2 作者, 专利号: US20120202872(A1)

（ 3 ） METHODS AND COMPOSITIONS FOR THE DIAGNOSIS AND PROGNOSIS OF CERVICAL INTRAEPITHELIAL NEOPLASIA AND CERVICAL CANCER, 发明专利, 2011, 第 2 作者, 专利号: WO2011015040-A1

（1） BRD2 compartmentalizes the accessible genome, NATURE GENETICS, 2022, 第 2 作者
（2） 3D ATAC-PALM: Super-resolution Imaging of the Accessible Genome, NATURE METHODS, 2020, 第 2 作者
（3） Quantifying E2F1 protein dynamics in single cells, Quantifying E2F1 protein dynamics in single cells, 定量生物学:英文版, 2020, 第 5 作者
（4） Phase separation of YAP reorganizes genome topology for long-term YAP target gene expression, NATURE CELL BIOLOGY, 2019, 第 3 作者
（5） MeCP2 nuclear dynamics in live neurons results from low and high affinity chromatin interactions, ELIFE, 2019, 第 3 作者
（6） NDP52 tunes cortical actin interaction with astral microtubules for accurate spindle orientation, NDP52 tunes cortical actin interaction with astral microtubules for accurate spindle orientation, CELL RESEARCH, 2019, 第 3 作者
（7） Imaging dynamic and selective low-complexity domain interactions thatcontrol gene transcription, SCIENCE, 2018, 第 4 作者
（8） Visualizing long-term single-molecule dynamics in vivo by stochastic protein labeling, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2018, 第 2 作者
（9） Cyclin D/CDK4/6 activity controls G1 length in mammalian cells, PLOS ONE, 2018, 第 1 作者
（10） A dynamic interplay of enhancer elements regulates Klf4 expression in naive pluripotency, GENES & DEVELOPMENT, 2017, 第 7 作者
（11） Myc Regulates Chromatin Decompaction and Nuclear Architecture during B Cell Activation, MOLECULAR CELL, 2017, 第 10 作者
（12） Shaping development by stochasticity and dynamics in gene regulation, OPEN BIOLOGY, 2017, 通讯作者
（13） Real-time imaging of Huntingtin aggregates diverting target search and gene transcription, ELIFE, 2016, 第 3 作者
（14） Bright photoactivatable fluorophores for single-molecule imaging, NATURE METHODS, 2016, 第 6 作者
（15） Division of labour between Myc and G1 cyclins in cell cycle commitment and pace control, NATURE COMMUNICATIONS, 2014, 第 1 作者
（16） MicroRNA-133b is a key promoter of cervical carcinoma development through the activation of the ERK and AKT1 pathways, ONCOGENE, 2012, 
（17） Network calisthenics Control of E2F dynamics in cell cycle entry, CELL CYCLE, 2011, 第 2 作者

   

（ 1 ） 超高分辨率荧光成像, 负责人, 国家任务, 2023-07--2026-06
（ 2 ） 超高分辨率荧光成像（2022国家自然科学基金人才项目配套）, 负责人, 中国科学院计划, 2023-07--2026-06
（ 3 ） 超高分辨率荧光成像（2022国家自然科学基金人才项目深圳先进院配套）, 负责人, 研究所自主部署, 2023-07--2026-06

（1）Single-cell E2F dynamics reveal the control logic of cell cycle entry   第七届定量生物学大会   Peng Dong   2013-08-07