基本信息
刘杰  男  硕导  中国科学院昆明植物研究所
电子邮件: liujie@mail.kib.ac.cn
通信地址: 云南省昆明市盘龙区蓝黑路132号
邮政编码: 650201
部门/实验室:中国科学院东亚植物多样性与生物地理学重点实验室

研究领域

群体遗传学、景观遗传学、生物地理学、全球变化生物学

招生信息

硕士研究生导师

招生专业
071001-植物学
招生方向
植物多样性起源演化
植物多样性格局及成因
栽培作物起源与扩散

教育背景

2006-09--2011-07   中国科学院昆明植物研究所   博士
2002-09--2006-07   云南大学   学士
1999-09--2002-07   云南省保山市第一中学   学生
学历
研究生

学位

理学博士

工作经历

2015.1-至今 中国科学院昆明植物研究所 副研究员

2016.9-2017.10 Aberystwyth University, UK 访问学者

2013.8-2013.12 Queen's University Belfast, UK Research Fellow

2011.7-2014.12 中国科学院昆明植物研究所 助理研究员

工作简历
2016-09~2017-10,Aberystwyth University, UK, 访问学者
2015-01~现在, 中国科学院昆明植物研究所, 副研究员
2013-08~2013-12,Queen's University Belfast, UK, Research Fellow
2011-07~2014-12,中国科学院昆明植物研究所, 助理研究员
社会兼职
2015-01-01-今,审稿人, Journal of Biogeography审稿人
2014-01-01-今,审稿人, Journal of Systematics and Evolution审稿人
2013-01-01-今,审稿人, Plant diversity审稿人

出版信息

   
发表论文
(1) Characteristics and mutational hotspots of plastomes in Debregeasia (Urticaceae), Frontiers in Genetics, 2020, 通讯作者
(2) Development of 32 novel microsatellite loci in Juglans sigillata using genomic data, Applications in Plant Sciences, 2020, 通讯作者
(3) Evolutionary legacy of a forest plantations tree species (Pinus armandii): Implications for widespread afforestation, Evolutionary Applications, 2020, 通讯作者
(4) Prevalence of isomeric plastomes and effectiveness of plastome super-barcodes in yews (Taxus) worldwide, Scientific Reports, 2019, 第 5 作者
(5) Taxonomic importance of SEM and LM foliar epidermal micro-morphology: A tool for robust identification of gymnosperms, Flora, 2019, 第 6 作者
(6) Taxonomic importance of SEM and LM foliar epidermal micro-morphology: A tool for robust identification of gymnosperms, Flora, 2019, 第 5 作者
(7) Forest community assembly is driven by different strata-dependent mechanisms along an elevational gradient, Journal of Biogeography, 2019, 第 4 作者
(8) Greater than the sum of the parts: How the species composition in different forest strata influence ecosystem function, Ecology Letters, 2019, 第 4 作者
(9) Where does Juglans regia L. (Juglandaceae) grow in Sikkim and Darjeeling Himalaya? Juglans sigillata Dode needs attention!, Pleione, 2019, 第 3 作者
(10) Protect Third Pole's fragile ecosystem, Science, 2018, 第 1 作者
(11) Integrating a comprehensive DNA barcode reference library with a global map of yews (Taxus L.) for forensic identification, Molecular Ecology Resources, 2018, 第 1 作者
(12) Testing Darwin's transoceanic dispersal hypothesis for the inland nettle family (Urticaceae), Ecology Letters, 2018, 第 2 作者
(13) Characterization of the complete plastid genome of a Chinese endemic species Carya kweichowensis, Mitochondrial DNA Part B, 2018, 通讯作者
(14) Palyno-morphological characteristics of gymnosperm flora of pakistan and its taxonomic implications with LM and SEM methods, Microscopy Research and Technique, 2018, 第 5 作者
(15) Domestication origin and breeding history of the tea plant (Camellia sinensis) in China and India based on nuclear microsatellites and cpDNA sequence data, Frontiers in Plant Science, 2018, 第 9 作者
(16) Complete chloroplast genome sequences of two Boehmeria species (Urticaceae), Mitochondrial DNA Part B, 2018, 第 4 作者
(17) Using MiddRAD-seq data to develop polymorphic microsatellite markers for an endangered yew species, Plant Diversity, 2017, 通讯作者
(18) Multiple origins and a narrow genepool characterise the African tea germplasm: Concordant patterns revealed by nuclear and plastid DNA markers, Scientific Reports, 2017, 第 6 作者
(19) Characterization of the complete chloroplast genome sequence of Cecropia pachystachya, Mitochondrial DNA Part B, 2017, 第 4 作者
(20) 青藏高原及毗邻区植物多样性演化与维持机制: 进展及展望, 生物多样性, 2017, 第 1 作者
(21) Trait-based community assembly along an elevational gradient in subalpine forests: Quantifying the roles of environmental factors in inter- and intraspecific variability, PLoS ONE, 2016, 第 2 作者
(22) Trait variation and functional diversity maintenance of understory herbaceous species coexisting along an elevational gradient in Yulong Mountain, Southwest China, Plant Diversity, 2016, 第 2 作者
(23) Indications for three independent domestication events for the tea plant (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) and new insights into the origin of tea germplasm in China and India revealed by nuclear microsatellites, PLoS ONE, 2016, 第 10 作者
(24) Nuclear microsatellites reveal the genetic architecture and breeding history of tea germplasm of East Africa, Tree Genetics & Genomes, 2016, 第 7 作者
(25) Insights into the genetic relationships and breeding patterns of the African tea germplasm based on nSSR markers and cpDNA sequences, Frontiers in Plant Science, 2016, 第 6 作者
(26) Molecular identification and allopatric divergence of the white pine species in China based on the cytoplasmic DNA variation, Biochemical Systematics and Ecology, 2015, 第 5 作者
(27) Ancestral state reconstruction reveals rampant homoplasy of diagnostic morphological characters in Urticaceae, conflicting with current classification schemes, PLoS ONE, 2015, 第 4 作者
(28) DNA barcoding of Rhododendron (Ericaceae), the largest Chinese plant genus in biodiversity hotspots of the Himalaya–Hengduan Mountains, Molecular Ecology Resources, 2015, 第 2 作者
(29) 核基因组微卫星标记揭示大理茶参与了普洱茶的驯化过程, 植物分类与资源学报, 2015, 第 3 作者
(30) Low genetic diversity and high inbreeding of the endangered yews in Central Himalaya: Implications for conservation of their highly fragmented populations, Diversity and Distributions, 2014, 第 3 作者
(31) Geological and ecological factors drive cryptic speciation of yews in a biodiversity hotspot, New Phytologist, 2013, 第 1 作者
(32) A multidisciplinary approach reveals hidden taxonomic diversity in the morphologically challenging Taxus wallichiana complex, Taxon, 2013, 第 4 作者
(33) Yews (Taxus) along the Hindu Kush-Himalayan region: Exploring the ethnopharmacological relevance among communities of Mongol and Caucasian origins, Journal of Ethnopharmacology, 2013, 第 6 作者
(34) Molecular phylogeny of the nettle family (Urticaceae) inferred from multiple loci of three genomes and extensive generic sampling, Molecular Phylogenetics and Evolution, 2013, 第 6 作者
(35) DNA 条形码在生态学研究中的应用与展望, 植物分类与资源学报, 2013, 第 2 作者
(36) Sampling strategy and potential utility of indels for DNA barcoding of closely related plant species: A case study in Taxus, International Journal of Molecular Sciences, 2012, 第 1 作者
(37) Using morphological, molecular and climatic data to delimitate yews along the Hindu Kush-Himalaya and adjacent regions, PLoS ONE, 2012, 第 6 作者
(38) 关于植物 DNA 条形码研究技术规范, 植物分类与资源学报, 2012, 第 2 作者
(39) Cross-species amplification and development of new microsatellite loci for Taxus wallichiana (Taxaceae), American Journal of Botany, 2011, 第 1 作者
(40) DNA barcoding for the discrimination of Eurasian yews (Taxus L., Taxaceae) and the discovery of cryptic species, Molecular Ecology Resources, 2011, 第 1 作者
(41) 红豆杉属植物三种不同总DNA提取方法的分析比较, 广西植物, 2011, 第 1 作者
(42) Isolation and characterization of microsatellite markers in the endangered species Taxus wallichiana using the FIASCO method, Hortscience, 2011, 第 4 作者
(43) High variation and strong phylogeographic pattern among cpDNA haplotypes in Taxus wallichiana (Taxaceae) in China and North Vietnam, Molecular Ecology, 2007, 第 5 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 西南山地及毗邻区特有经济树种泡核桃种质资源格局动因及栽培起源, 主持, 国家级, 2018-01--2021-12
( 2 ) 中国西南纵向岭谷区植物遗传格局成因及其维持机制, 主持, 国家级, 2016-01--2019-12
( 3 ) 喜马拉雅-横断山地区红豆杉属同倍体杂交物种形成研究, 主持, 国家级, 2013-01--2015-12
( 4 ) 西南山地典型生态系统植物多样性对气候变化的响应, 主持, 国家级, 2014-01--2018-08
( 5 ) 云南省泡核桃遗传资源评价及分子鉴定, 主持, 省级, 2017-06--2020-05
( 6 ) 核桃DNA条形码及SSR分子鉴定技术构建, 主持, 省级, 2016-06--2017-12
( 7 ) 红豆杉属植物中紫杉醇及其衍生物多样性演化及制约因素, 主持, 市地级, 2017-01--2018-12
( 8 ) 云南核桃品种DNA鉴定技术研究, 主持, 省级, 2016-09--2017-07
( 9 ) 云南核桃品种DNA鉴定技术研究与示范, 主持, 省级, 2016-12--2017-12
( 10 ) 云南省万人计划“青年拔尖人才”项目, 主持, 省级, 2019-01--2022-12
( 11 ) 第三极植物遗传格局的时空动态及其保护, 主持, 国家级, 2020-01--2023-12
( 12 ) 气候变化对第三极植物遗传多样性的影响机制及其保护, 主持, 部委级, 2019-09--2024-09
参与会议
(1)DNA barcoding of Taxus: From theory to application   2019-07-01
(2)DNA barcoding of Taxus: From theory to application   中国植物学会85 周年学术年会   2018-10-10
(3)基于标本信息解析气候变化对红豆杉属植物分布格局的影响   第四届全国生物多样性信息学研讨会   2015-11-05

合作情况

合作者 研究机构 合作方向

Dr. Richard Milne The University of Edinburgh, UK; Biogeography

Dr. Jim Provan Aberystwyth University, UK; Evolutionary genetics

Dr. Michael Möller Royal Botanic Garden Edinburgh, UK; Speciation and taxonomy

Prof. Alistair Jump University of Stirling, UK; Climate change biology

Prof. Marc Cadotte University of Toronto, CAN; Ecology

指导学生