基本信息
郭彩霞  女  博导  中国科学院北京基因组研究所
电子邮件: guocx@big.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路一号院
邮政编码: 100101

研究领域

DNA损伤应答与基因组稳定性、核酸代谢与疾病、肿瘤精准医学


招生信息

基因组DNA一直受到各种内源及外源的DNA损伤因素的影响,DNA损伤应答机制能帮助细胞维持基因组的完整性和稳定性,降低多种疾病(包括肿瘤、衰老和出生缺陷)的发生。本课题组成立于2009年8月,主要致力于DNA损伤修复及基因组稳定性研究。我们深度揭示了跨损伤DNA合成(TLS)通路的调控机理,发现了新的调控PCNA单泛素化的因子(Cell Mol Life Sci. 2009; Nucleic Acids Res. 2013. J Cell Sci. 2016 );与美国科学院院士杨薇研究员合作,阐明了低保真性DNA聚合酶复制DNA加合物的分子基础(Proc Natl Acad Sci U S A. 2014; J Biochem. 2016); 发现TLS聚合酶能参与DNA链断裂修复(Nucleic Acids Res. 2015;DNA Repair. 2013)、调控DNA损伤检验点激活(EMBO J. 2013);我们还与阮珏研究员合作,整合高通量测序和supF穿梭质粒突变检测系统,建立了灵敏度高的新突变检测平台,用于检测损伤诱导的哺乳动物细胞中低频突变(Scientific Report. 2016);并发表DNA损伤修复相关的综述文章(Cell. 2010)。此外,我们还与中科院动物所唐铁山研究员合作,率先构建了小鼠大脑皮层和纹状体区的全基因组5hmC修饰图谱,并系统比较了神经退行性疾病模型鼠与正常鼠大脑5hmC表观修饰谱式,揭示5hmC水平可以作为检测衰老的一个标记物 (Hum Mol Genet. 2013;Epigenetics. 2014); 阐明亨亭式舞蹈症相关基因缺失导致雄性小鼠精子发生异常机制(J Cell Sci. 2016);发现颅面胸畸形综合症的致病基因是通过诱发内质网Ca2+信号异常而致病(Cell. 2016)等。

  目前课题组重点研究内容包括:1)蛋白质翻译后修饰(泛素化、糖基化、磷酸化、乙酰化等)调控TLS通路以及肿瘤化疗耐药性;2)环境污染物、化疗药物对基因组稳定性的影响及其与疾病发生、发展关系;3)非编码RNA与RNA结合蛋白对基因组稳定性的调控;4)从天然中草药中筛选抗癌药物和化疗辅助药物等。




招生专业
071010-生物化学与分子生物学
071022-基因组学
招生方向
基因组不稳定性,肿瘤发生与耐药, 出生缺陷
衰老

教育背景

1996-09--1999-09   中科院动物所   博士
1991-09--1994-07   武汉大学   硕士
1987-09--1991-07   武汉大学   学士

教授课程

细胞生物学技术及应用
基因组生物技术前沿讲座

指导学生

已指导学生

张文靖  02  52764  

赵飞龙  02  19183  

贾艳  02  19183  

吕翎娜  01  19183  

谢成梅  02  19183  

王志峰  01  19183  

孙亚舟  01  19183  

张雪  02  19183  

李慧明  02  19183  

杨业然  01  19183  

现指导学生

马晓璐  01  19183  

孙中帅  01  19183  

黄敏  01  19183  

邢玲玉  02  19183  

孙趁义  02  19183  

姬巧  02  19183  

吴畏  02  19183  

杨飞  02  19183  

张传超  01  19183  

工作经历

2009/08-, 中国科学院北京基因组研究所,基因组变异和精准生物医学实验室,“百人计划”研究员;

2008-2009,美国西南医学研究中心,病理系,研究助理教授 ;

2004-2008,美国西南医学研究中心,病理系,讲师;

2001-2004,美国西南医学研究中心,病理系,博士后

1999-2001,美国肯塔基大学,生理系,博士后 ;

1994-1996,天津农业生物工程研究中心,研究实习员(在中国农业科学院畜牧所客座)

奖励

 中国科学院朱李月华优秀教师奖, 院级, 2016


近年来发表文章

1 Liu H, Li X, Ning G, Zhu S, Ma X, Liu X, Liu C, Huang M, Schmitt I, Wüllner U, Niu Y, Guo C*, Wang Q*, Tang TS*. The Machado-Joseph Disease Deubiquitinase Ataxin-3 Regulates the Stability and Apoptotic Function of p53. PLOS Biol. (2016). 14(11):e2000733. doi: 10.1371/journal.pbio.2000733.

2 Zhang H, Zhang C, Yan J, Sun Z, Song S, Sun Y, Guo C*. Transcriptome analysis of the responses to methyl methanesulfonate treatment in mouse pachytene spermatocytes and round spermatids. Gene. (2016). pii: S0378-1119(16)30800-9.

3 Wang QC, Zheng Q, Tan H, Zhang B, Li X, Yang Y, Yu J, Liu Y, Chai H, Wang X, Sun Z, Wang JQ, Zhu S, Wang F, Yang M, Guo C, Wang H, Zheng Q, Li Y, Chen Q, Zhou A, Tang TS. TMCO1 Is an ER Ca(2+) Load-Activated Ca(2+) Channel. Cell. (2016). 165(6):1454-66.

4 Wang K, Ma X, Zhang X, Wu D, Sun C, Sun Y, Lu X, Wu CI, Guo C*, Ruan J*. Using ultra-sensitive next generation sequencing to dissect DNA damage-induced mutagenesis. Sci Rep. (2016). 6:25310.

5 Sun Y, Yang Y, Shen H, Huang M, Wang Z, Liu Y, Zhang H, Tang TS, Guo C*. iTRAQ-based chromatin proteomic screen reveals CHD4-dependent recruitment of MBD2 to sites of DNA damage. Biochem Biophys Res Commun. (2016). 471(1):142-8.

6 Wang Z, Huang M, Ma X, Li H, Tang T, Guo C*. REV1 promotes PCNA monoubiquitination through interacting with ubiquitinated RAD18. J Cell Sci. (2016). 129:1223-1233.

7 Yan J, Zhang H, Liu Y, Zhao F, Zhu S, Xie C, Tang TS, Guo C*. Germline Deletion of Huntingtin Causes Male Infertility and Arrested Spermiogenesis in Mice. J Cell Sci. (2016). 129: 492-501.

8 Dai K, Qin F, Zhang H, Liu X, Guo C, Zhang M, Gu F, Fu L, Ma Y. Low expression of BMPRIB indicates poor prognosis of breast cancer and is insensitive to taxane-anthracycline chemotherapy. Oncotarget. (2016). 7(4):4770-84.

9 Liu Y, Ma X, Guo C*. Effects of the N terminus of mouse DNA polymerase κ on the bypass of a guanine-benzo[a]pyrenyl adduct. J Biochem. (2016).159(4):471-9.

10 Yang Y, Liu Z, Wang F, Temviriyanukul P, Ma X, Tu Y,  Lv L, Lin Y, Huang M, Zhang T, Pei H, Chen B, Jansen JG, Wind N, Fischhaber P, Friedberg EC, Tang TS and Guo C*. FANCD2 and REV1 cooperate in the protection of nascent DNA strands in response to replication stress. Nucleic Acids Res. 43, 8325-8339 (2015).

11 Qin Y, Guo T, Li G, Tang TS, Zhao S, Jiao X, Gong J, Gao F, Guo C, Simpson JL, Chen ZJ. CSB-PGBD3 Mutations Cause Premature Ovarian Failure. PLoS Genet. 11(7):e1005419. doi: 10.1371/journal.pgen.1005419 ( 2015).

12 Dong S, Han J, Chen H, Liu T, Huen MS, Yang Y, Guo C, Huang J. The Human SRCAP Chromatin Remodeling Complex Promotes DNA-End Resection. Curr Biol. 24(18):2097-110. (2014).

13 Wang F, Fischhaber PL, Guo C, Tang TS. Epigenetic modifications as novel therapeutic targets for Huntington's disease. Epigenomics. 6(3):287-97. (2014).

14 Li X, Qu F, Xie W, Wang F, Liu H, Song S, Chen T, Zhang Y, Zhu S, Wang Y, Guo C, Tang TS*. Transcriptomic analyses of neurotoxic effects in mouse brain after intermittent neonatal administration of thimerosal. Toxicol Sci. 139(2):452-65 (2014)

15 Gao M, Wei W, Li MM, Wu YS, Ba Z, Jin KX, Li MM, Liao YQ, Adhikari S, Chong Z, Zhang T, Guo C, Tang TS, Zhu BT, Xu XZ, Mailand N, Yang YG, Qi Y, Rendtlew Danielsen JM. Ago2 facilitates Rad51 recruitment and DNA double-strand break repair by homologous recombination. Cell Res. 24(5):532-41. (2014).

16 Liu Y, Yang Y, Tang TS, Zhang H, Wang Z, Friedberg EC, Yang W, Guo C*. Variants of mouse DNA polymerase κ reveal a mechanism of efficient and accurate translesion synthesis past a benzo[a]pyrene dG adduct. Proc Natl Acad Sci USA. 111(5): 1789-1794. (2014).

17 Lv L, Wang F, Ma X, Yang Y, Wang Z, Liu H, Li X, Liu Z, Zhang T, Huang M, Friedberg E, Tang TS, Guo C*. Mismatch repair protein MSH2 regulates translesion DNA synthesis following exposure of cells to UV radiation. Nucleic Acid Res. 41(22):10312-10322. (2013).

18  Bétous R, Pillaire MJ, Pierini L, van der Laan S, Recolin B, Ohl-Séguy E, Guo C, Niimi N, Grúz P, Nohmi T, Friedberg E, Cazaux C, Maiorano D, Hoffmann JS. DNA polymerase κ- dependent DNA synthesis at stalled replication forks is important for CHK1 activation. EMBO J. 32(15):2172-2185. (2013).

19 Wang F, Yang Y, Lin X, Wang JQ, Wu YS, Xie W, Wang D, Zhu S, Liao YQ, Sun Q, Yang YG, Luo HR, Guo C*, Han C*, Tang TS*. Genome-wide loss of 5-hmC is a novel epigenetic feature of Huntington's disease. Human Mol Genet 22(18):3641-3653. (2013).

20  Wang J, Chen Q, Wang X, Wang Q, Wang Y, Cheng H, Guo C, Sun Q, Chen Q, Tang TS. Dysregulation of Mitochondrial Calcium Signaling and Superoxide Flashes Cause Mitochondrial Genomic DNA Damage in Huntington’s Disease.  J. Biol. Chem. 288(5): 3070-3084. (2013).

21 Zhang X, Lv L, Chen Q, Yuan F, Zhang T, Yang Y, Zhang H, Wang Y, Jia Y, Qian L, Chen B, Zhang Y, Friedberg C, Tang T and Guo C*. Mouse DNA polymerase kappa has a functional role in the repair of DNA strand breaks. DNA Repair. 12(5):377-88. (2013).

22  Wang Z,Wang F, Tang T, Guo C*.  The role of PARP1 in the DNA damage response and its application in tumor therapy. Front Med. 6(2):156-164 (2012).

科研项目

1,国家自然科学基金面上项目, 错配修复蛋白MSH2调控跨损伤DNA合成与疾病发生研究,2015年1月到2018年12月,在研,项目负责人。

2,国家自然科学基金重点项目,非编码RNA及其互作因子表观调控DNA损伤修复研究, 2017年1月到2021年12月,在研,项目负责人。

3,国家自然科学基金面上项目, DNA聚合酶 O-GlcNAc糖基化修饰对其功能的调控研究,2017年1月到2020年12月,在研,项目负责人。

 4,国家重大科学研究计划项目子课题,生殖细胞与体细胞的相互作用,2013年1月到2017年12月,在研,骨干。