基本信息
邓馨  女  博导  中国科学院植物研究所
电子邮件: deng@ibcas.ac.cn
通信地址: 中国科学院植物研究所
邮政编码: 100093

研究领域

植物逆境分子生物学

招生信息

硕士研究生
博士研究生
博士后
招生专业
071009-细胞生物学
071008-发育生物学
071001-植物学
招生方向
植物耐旱分子生物学

教育背景

1996-05--1999-07   中国科学院植物研究所   博士
1993-09--1996-07   沈阳农业大学   硕士
1989-09--1993-07   黑龙江八一农垦大学   学士
学历
植物研究所 19960902--19990720 研究生
学位
植物研究所 19960902--19990720 博士
出国学习工作

1999.9-2003.3
德国马普植物育种所,植物分子育种系,博士后
研究方向:转录因子对复苏植物抗旱基因表达的调控

2009.11-2010.11
美国加州大学河滨分校访问学者(国家公派)
研究方向:ABA受体调控植物抗逆的分子机理

工作经历

2003.3-至今
中科院植物所发育中心 历任副研究员、研究员
研究方向:复苏植物抗旱分子机制

2008.7-至今
植物干旱逆境适应及调控技术研究组 组长
工作简历
2011-05~现在, 中国科学院植物研究所, 博导
2009-09~现在, 中国科学院植物研究所, 研究员(资格)
2008-07~现在, 中国科学院植物研究所, 研究组组长
2003-03~现在, 中国科学院植物研究所, 副研究员
1999-09~2003-03,德国马普植物育种所, 博士后
社会兼职
   

教授课程

   

专利与奖励

1. 一个旋蒴苣苔的抗旱、耐盐相关基因及其编码蛋白与应用,邓馨等,国家发明专利,专利号200510127881.4,授权日期20071024

2. 旋蒴苣苔的肌醇半乳糖苷合成酶基因及其编码蛋白与应用 邓馨等, 国家发明专利,专利号200510112540.X,授权日期 2008123

3. 一种与植物抗旱相关的蛋白及其编码基因与应用, 邓馨等,国家发明专利,专利号200810223541.5,授权日期 2012314

4. 与植物抗逆相关的热激因子蛋白及其编码基因与应用,邓馨等,国家发明专利,专利号200910078056.8,授权日期 2013.3.20

5. 植物耐旱耐碱相关的DNA片段及其应用 邓馨等,国家发明专利,专利号ZL 201210135602.9,授权日期 2015.1.14

6. 蛋白BhHSP70-1及其编码基因与应用 邓馨等,国家发明专利,专利号201210581636.0,授权日期2016.1.20

7. 转录因子ZmbZIP17及编码基因与其在响应逆境中的应用,邓馨等,国家发明专利,专利号201310065802.6 ,授权日期 2016.5.30

8. 一种与植物耐旱相关的蛋白及其编码基因与应用,邓馨等,国家发明专利,专利号201310149496.4 ,授权日期2016.6.20

9. OsPYL9蛋白及其编码基因和应用,邓馨等。国家发明专利,专利号201310530002.7,申请日2013.11.01

10. 一种可提高植物耐旱盐碱性的蛋白BhDNAJC2及其编码基因与应用,邓馨等,国家发明专利,专利号201410176146.1 申请日2014.4.29

专利成果
( 1 ) 一个旋蒴苣苔的抗旱、耐盐相关基因及其编码蛋白与应用, 发明, 2007, 第 1 作者, 专利号: 200510127881.4
( 2 ) 旋蒴苣苔的肌醇半乳糖苷合成酶基因及其编码蛋白与应用, 发明, 2008, 第 1 作者, 专利号: 200510112540.X
( 3 ) 一种与植物抗旱相关的蛋白及其编码基因与应用, 发明, 2012, 第 1 作者, 专利号: 200810223541.5
( 4 ) 植物耐旱耐碱相关的DNA片段及其应用, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: 201210135602.9
( 5 ) 与植物抗逆性相关的热激因子蛋白及其编码基因与应用, 发明, 2013, 第 1 作者, 专利号: 200910078056.8
( 6 ) 转录因子ZmbZIP17及编码基因与其在响应逆境中的应用, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: 201310065802.6
( 7 ) 一种与植物耐旱相关的蛋白及其编码基因与应用, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: 201310149496.4
( 8 ) 蛋白BhHSP70-1及其编码基因与应用, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: 201210581636.0
( 9 ) 一种可提高植物耐旱盐碱性的蛋白BhDNAJC2及其编码基因与应用, 发明, 2014, 第 1 作者, 专利号: 201410176146.1
( 10 ) OsPYL9蛋白及其编码基因和应用, 发明, 2013, 第 1 作者, 专利号: 201310530002.7

发表文章

通讯作者文章

  1. Yan Zhu; Bo Wang; Jonathan Phillips; Zhen-Nan Zhang; Hong Du; Tao Xu; Lian-Cheng Huang; Xiao-Fei Zhang; Guang-Hui Xu; Wen-Long Li; Zhi Wang; Ling Wang; Yong-Xiu Liu; Xin Deng* (2015) Global transcriptome analysis reveals acclimation-primed processes involved in the acquisition of desiccation tolerance in Boea hygrometrica. Plant Cell Physiol 56(7):1429-41 

  2. W Li, F Xu, S Chen, Z Zhang, Y Zhao, Y Jin, M Li, Y Zhu, Y Liu, Y Yang and Xin Deng* (2014) A comparative study on Ca content and distribution in two Gesneriaceae species reveals distinctive mechanisms to cope with high rhizospheric soluble calcium. Front Plant Sci 5: 647. doi: 10.3389/fpls.2014.00647  

  3. Yan Zhao, Tao Xu, Chun-Ying Shen, Guang-Hui Xu, Shi-Xuan Chen, Li-Zhen Song, Mei-Jing Li, Li-Li Wang, Yan Zhu, Wei-tao Lv, Zhi-Zhong Gong, Chun-Ming Liu, Xin Deng* (2014) Identification of a retroelement from the resurrection plant Boea hygrometrica that confers osmotic and alkaline tolerance in Arabidopsis thaliana. PLoS ONE 9(5): e98098. doi:10.1371/journal.pone.0098098.

  4. Yan-Ge Yang, Wei-Tao Lv, Mei-Jing Li, Bo Wang, Dong-Mei Sun*, Xin Deng* (2013). Maize membrane-bound transcription factor Zmbzip17 is a key regulator in the crosstalk of ER quality control and aba signaling. Plant Cell Physiol 54(12): 2020–2033

  5. J Mitra, G Xu, B Wang, M Li, Xin Deng* (2013) Understanding desiccation tolerance using the resurrection plant Boea hygrometrica as a model system. Front Plant Sci 4:446. doi: 10.3389/fpls.2013.00446

  6. Zhennan Zhang, Bo Wang, Dongmei Sun* , Xin Deng* (2013) Molecular cloning and differential expression of sHSP gene family members from the resurrection plant Boea hygrometrica in response to abiotic stresses. Biologia 68(4): 651-661. 

  7. HK Duan, Y Zhu, WL Li, DD Qi, YX Liu, Xin Deng * (2012) Comparative study on the expression of genes involved in carotenoid and ABA biosynthetic pathway in response to salt stress in tomato. J Integr Agr (formally: Agricultural Sciences in China), 11(7): 1093-1102.

  8. Y Zhu, Z Wang, YJ Jing, LL Wang, X Liu; YX Liu, Xin Deng * (2009) Ectopic over-expression of BhHsf1, a heat shock factor from the resurrection plant Boea hygrometrica, leads to increased thermotolerance and retarded growth in transgenic Arabidopsis and tobacco. Plant Mol Biol, 71(4-5): 451-67

  9. Zhi Wang, Yan Zhu, Lili Wang, Xia Liu, Yongxiu Liu, Jonathan Phillips, Xin Deng* (2009) A WRKY transcription factor participates in dehydration tolerance in Boea hygrometrica by binding to the W-box elements of the galactinol synthase (BhGolS1) promoter. Planta, 230(6): 1155-1166

  10. Lili Wang, Haihong Shang, Yongxiu Liu, Maozhong Zheng, Renhua Wu, Jonathan Phillips, Dorothea Bartels, Xin Deng* (2009) A role for a cell wall localized glycine-rich protein in dehydration and rehydration of the resurrection plant Boea hygrometrica. Plant Biol,11(6): 837-848

  11. Xia Liu, Zhi Wang, Lili Wang, Renhua Wu, Jonathan Phillips, Xin Deng* (2009) LEA 4 group genes from the resurrection plant Boea hygrometrica confer dehydration tolerance in transgenic tobacco. Plant Sci, 176: 90–98.

  12. Renhua Wu, Lili Wang, Zhi Wang, Haihong Shang, Xia Liu, Yan Zhu, Dongdong Qi, Xin Deng* (2009) Cloning and expression analysis of a dirigent protein gene from the resurrection plant Boea hygrometrica, Prog Nat Sci: 193: 347-353. [中文版]吴仁花,王丽丽,王智,商海红,刘霞,朱燕,亓岽东,邓馨* (2008) 复苏植物牛耳草引导蛋白基因的克隆与表达 自然科学进展 1810),1111-1118.

  13. G Jiang, Z Wang, H Shang, W Yang, Z Hu, J Phillips, Xin Deng * (2007) Proteome analysis of leaves from the resurrection plant Boea hygrometrica in response to dehydration and rehydration. Planta, 225 (6): 1405-1420 

  14. 张晓飞, 段礼新, 龚月桦*, 邓馨* (2014) 基于GC-MS的复苏植物牛耳草代谢物提取方法的比较. 生物工程学报, 302):294-304

  15. 杨艳歌, 吕维涛, 孙冬梅*, 凌毅*, 邓馨* (2013) 玉米D亚族bZIP转录因子基因的数据库挖掘、分析、克隆与表达. 作物学报, 39 (12): 2115-2122 

  16. 王智,刘永秀,魏建华,邓馨* (2012) 复苏植物牛耳草中棉子糖系列寡糖及棉子糖合酶基因的研究。植物学报,2012,47(1),44-54.

  17. 张兰军,姬飞腾,王丽丽,亓岽东,朱燕,邓馨* (2012) 复苏植物旋蒴苣苔C2结构域小蛋白BhC2DP1以依赖于Ca2+的方式参与植物对ABA的反应。植物学报,2012, 47(1), 11-27.

  18. 姬飞腾,李楠,邓馨* (2009) 喀斯特地区植物钙含量特征与高钙适应方式分析。植物生态学报 33(5)926-935.

  19. 刘霞,邓馨* (2009) 复苏植物牛耳草BhLEA2基因启动子的分离和基因表达模式研究。自然科学进展, 1939-44

第一作者文章

  1. Xin Deng, J Phillips, A Brautigam, P Engström, H Johannesson, P Ouwerkerk, I Ruberti, J Salinas, P Vera, R Iannacone, A Meijer, D Bartels (2006) A homeodomain leucine zipper gene from Craterostigma plantagineum regulates abscisic acid responsive gene expression and physiological responses. Plant Mol Biol 61(3): 469-489.

  2. Xin Deng, J Phillips, A Meijer, F Salamini, D Bartels (2002) Characterization of five novel dehydration-responsive homeodomain leucine zipper genes from the resurrection plant Craterostigma plantagineum. Plant Mol Biol 49 (6): 601-610.

  3. Xin Deng, Z Hu, H Wang, X Wen, T Kuang (2003) Changes in Photosynthetic Functions of a Resurrection Angiosperm Boea hygrometrica (Bunge) R.Br. (Gesneriaceae) during dessication and rehydration. Plant Sci 165(4): 851-861.          

  4. Xin Deng, Z Hu, H Wang (1999) mRNA differential display visualized by silver staining tested on gene expression in resurrection plant Boea hygrometrica. Plant Mol Biol Rep 17: 279.  

合作作者文章

  1. Zhi Wang, Fengying Chen, Xiaoying Li, Hong Cao, Meng Ding, Cun Zhang, Jinghong Zuo, Chaonan Xu, Jimei Xu, Xin Deng, Yong Xiang, Wim J. J. Soppe Yongxiu Liu*. Arabidopsis seed germination speed is controlled by SNL histone deacetylase-binding factor-mediated regulation of AUX1 Nature Communications 7, Article number: 13412 (2016) doi:10.1038/ncomms13412

  2. Dechang Cao, Huimin Xu, Yuanyuan Zhao, Xin Deng, Yongxiu Liu, Wim Soppe, and Jinxing Lin* Transcriptome and Degradome Sequencing Reveals Dormancy Mechanisms of Cunninghamia lanceolata Seeds. Plant Physiology 2016 : pp.16.00384v1-pp.00384.2016.

  3. Lin Sen, Zhao Yuanyuan, Zhu Yingfang, Gosney Michael, Deng Xin, Wang Xiaohua, Lin Jinxing. An Effective and Inducible System of TAL Effector-Mediated Transcriptional Repression in Arabidopsis. Mol Plant 2016, 9(11):1546-1549.

    Chan Z*, Wang Y, Cao M, Gong Y, Mu Z, Wang H, Hu Y, Deng X, He X-J, Zhu J-K* (2016) RDM4 modulates cold stress resistance in Arabidopsis partially through the CBF-mediated pathway. New Phytol, doi: 10.1111/nph.13727.

  4. Zhao Y§, Chan Z§, Gao J, Xing L, Cao M, Yu C, Hu Y, You J, Shi H, Zhu Y, Gong Y, Mu Z, Wang H, Deng X, Wang P, Bressan RA, Zhu JK* (2016) The ABA receptor PYL9 promotes drought resistance and leaf senescence. Proc Natl Acad Sci U S A, doi:10.1073/pnas.1522840113.

  5. Xiao, Lihong; Yang, Ge; Zhang, Liechi; Yang, Xinhua; Zhao, Shuang; Ji, Zhongzhong; Zhou, Qing; Hu, Min; Wang, Yu; Chen, Ming; Xu, Yu; Jin, Haijing; Xiao, Xuan; Hu, Guipeng; Bao, Fang; Hu, Yong; Wan, Ping; Li, Legong; Deng, Xin; Kuang, Tingyun; Xiang, Chengbin; Zhu, Jian-Kang*; Oliver, Melvin J.*; He, Yikun* (2016) The resurrection genome of Boea hygrometrica: A blueprint for survival of dehydration. Proc Natl Acad Sci U S A. 112(18):5833-5837

  6. Wenlong Li, Huikun Duan, Fengying Chen, Zhi Wang, Xueqing Huang, Xin Deng, Yongxiu Liu* (2014) Identification of Quantitative Trait Loci Controlling High Calcium Response in Arabidopsis thaliana. PLoS ONE 9(11): e112511.

  7. Zhi Wang, Hong Cao, Yongzhen Sun, Xiaoying Li, Fengying Chen, Annaick Carles, Yong Li, Meng Ding, Cun Zhang, Xin Deng, Wim J.J. Soppe, Yong-Xiu Liu* 2013 Arabidopsis paired amphipathic helix proteins SNL1and SNL2 redundantly regulate primary seed dormancy via abscisic acid-ethylene antagonism mediated by histone deacetylation. Plant Cell, 25:149-166.

  8. Zheng J, Chen FY, Wang Z, Cao H, Li XY, Deng X, Soppe Wim JJ, Li Y and Liu YX*. 2012. A novel role for histone methyltransferase KYP⁄SUVH4 in the control of Arabidopsis primary seed dormancy. New Phytol 193: 605–616.

  9. Jun Liu, Ge Bai, Cuijun Zhang, Wei Chen, Jinxing Zhou, Suwei Zhang, Qing Chen, Xin Deng, Xin-Jian He *, Jian-Kang Zhu. An atypical component of RNA-directed DNA methylation machinery has both DNA methylation- dependent and -independent roles in locus-specific transcriptional gene silencing. Cell Res (2011) 21:1691-1700.

  10. Tongwu Zhang, Yongjun Fang, Xumin Wang, Xin Deng, Xiaowei Zhang, Songnian Hu, Jun Yu*. (2011) The complete chloroplast and mitochondrial genome sequences of Boea hygrometrica: insights into the evolution of plant organellar genomes. PLoS ONE 7(1): e30531. doi:10.1371/journal.pone.0030531

  11. Xuchu WangXiaofang LiXin DengHeping HanWuliang ShiYinxin Li* (2007) A protein extraction method compatible with proteomic analysis for euhalophyte Salicornia europaea. Electrophoresis, 28(21):3976-3987 

  12. Tian S., Yao H., Deng X., et al. (2007) Characterization and expression of ß-1, 3-glucanase genes in jujube fruit induced by biocontrol microbial agent. Phytopathology 97, 260-268

  13. Li Y, Hu Z, Zhang Q, Deng X, and Wang H (2000) Genetic variation in wild soybean (Glycine soja Sieb. & Zucc.) populations revealed with simple sequence repeat marders. Soybean genetics newsletter 27: 17.

  14. Zhang Q, Yun R, Hu Z-A, Zhong M, Deng X. (1999) Cloning and characterization of a molecu-lar marker associated with salt tolerance from soybean cultivars. Soybean Genetics Newsletter 26:14.

  15. 陈世璇,张振南,王波,朱燕*,龚月桦*,孙冬梅,邓馨. 2015复苏植物旋蒴苣苔 J 结构域蛋白编码基因 BhDNAJC2 的克隆、表达与功能分析. 植物学报50(2):180-190.

  16. 策,杨艳歌,吕维涛* 周春菊* 孙冬梅,邓馨 (2014)  玉米A亚族bZIP转录因子基因ZmbZIP81的克隆、表达与功能分析. 作物学报40: 1549-1556.

  17. 黄连成, 胡鸢雷, 邓馨 孙冬梅* (2011) GA_3 诱导时间及诱导后不同培养条件对匍匐剪股颖愈伤组织形成的影响. 黑龙江八一农垦大学学报, 2011(5),9-12

  18. 胡志昂*,姜国强,邓馨,王洪新(2007)野大豆种群转座子和转录因子的多样性和分子适应。植物生态学报2007315952-959

  19. 邓馨,胡志昂*, 王洪新, 温晓刚,匡廷云 (2000) 脱水和复水对更苏植物牛耳草离体叶片光合作用的影响。植物学报42(3): 321-323. IF 0.671

  20. 邓馨,胡文玉* (2000)草莓离体叶片脱分化与再分化过程中的生理生变化。植物生理学通讯36(3): 209-211.

  21. 邓馨,胡文玉*  (2000) 草莓叶片再生芽及遗传转化系统的建立。植物学通报17(2): 174-178.

  22. 高丽锋 邓馨 王洪新 胡志昂* (2004) 毛乌素沙地中间锦鸡儿根瘤菌的多样性及其抗逆性。应用生态学报. 015(001): 44-48.

  23. 高丽锋 邓馨 王洪新 胡志昂* (2002)毛乌素沙地中间锦鸡儿根瘤菌遗传多样性及16S rDNA全序列分析,微生物学报. 042(006): 649-656.

  24. 王文和,邓馨 (1999) 草莓叶片愈伤组织形成及再生芽分化的组织学研究。沈阳农业大学学报.30(4): 430-433.

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 作物水分高效利用机理与调控的基础研究-子课题, 参与, 国家级, 2012-01--2016-08
( 2 ) 高通量玉米基因转化和功能鉴定技术体系研究, 主持, 国家级, 2016-01--2020-12
( 3 ) 基于大片段基因组 DNA 植物表达文库的复苏植物牛耳草耐脱水功能基因组学研究, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
( 4 ) 质膜CYBDOM蛋白促进活性氧产生、侧根发育和抗旱性的机理, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12
参与会议
   

合作情况

科技部 中非合作项目复苏植物旋蒴苣苔与非复苏植物唇柱苣苔细胞壁差异的分子机理的高通量分析”

科技部 中保合作项目保加利亚与中国的苦苣苔科复苏植物抗脱水机制的比较研究

项目协作单位
   

指导学生

已指导学生

王智  01  19174  

刘霞  02  19181  

吴仁花  02  19181  

朱燕  01  19181  

姬飞腾  02  19181  

段会坤  02  19181  

张兰军  02  19181  

赵燕  01  19181  

李美静  02  19181  

徐广惠  02  19181  

李文龙  01  19181  

沈春颖  02  19181  

刘璐  02  19181  

现指导学生

许韬  01  19181  

杜红  01  19181  

张潇雅  02  19182  

马金英  02  19182  

靳松松  01  19182  

赵通  02  19182  

刘杨  01  19182